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Lista de obras de Valmir C Barbosa

A graph model for the evolution of specificity in humoral immunity

scientific article published on 01 August 2004

A multi-protease, multi-dissociation, bottom-up-to-top-down proteomic view of the Loxosceles intermedia venom

artículo científico publicado en 2017

A quantitation module for isotope-labeled peptides integrated into PatternLab for proteomics

scientific article published on 26 April 2019

A scoring model for phosphopeptide site localization and its impact on the question of whether to use MSA.

artículo científico publicado en 2015

A string-matching algorithm for the CREW PRAM

Analyzing marginal cases in differential shotgun proteomics

artículo científico publicado el 11 de noviembre de 2010

Analyzing shotgun proteomic data with PatternLab for proteomics

artículo científico publicado en 2010

Are gastric cancer resection margin proteomic profiles more similar to those from controls or tumors?

artículo científico publicado en 2012

Can the false-discovery rate be misleading?

artículo científico publicado en 2011

Characterization of homodimer interfaces with cross-linking mass spectrometry and isotopically labeled proteins.

artículo científico publicado en 2018

Charge prediction machine: tool for inferring precursor charge states of electron transfer dissociation tandem mass spectra

artículo científico publicado en 2009

Descents and nodal load in scale-free networks

artículo científico publicado en 2008

DiagnoProt: a tool for discovery of new molecules by mass spectrometry

artículo científico publicado en 2017

Differential proteomic comparison of breast cancer secretome using a quantitative paired analysis workflow

scientific article published on 18 April 2019

Dissemination strategy for immunizing scale-free networks

artículo científico publicado en 2006

Dynamic proteomic overview of glioblastoma cells (A172) exposed to perillyl alcohol

artículo científico publicado en 2010

Early appraisal of the fixation probability in directed networks

artículo científico publicado el 22 de octubre de 2010

Early detection of epilepsy seizures based on a weightless neural network.

artículo científico publicado en 2015

Effectively addressing complex proteomic search spaces with peptide spectrum matching

artículo científico publicado en 2013

Emergence of scale-free networks from local connectivity and communication trade-offs.

artículo científico publicado en 2006

Exploring the proteomic landscape of a gastric cancer biopsy with the shotgun imaging analyzer

artículo científico publicado en 2013

GO Explorer: A gene-ontology tool to aid in the interpretation of shotgun proteomics data

artículo científico publicado en 2009

Improving the TFold test for differential shotgun proteomics

artículo científico publicado el 26 de abril de 2012

Information Integration from Distributed Threshold-Based Interactions

Information-theoretic signatures of biodiversity in the barcoding gene

artículo científico publicado en 2018

Integrated analysis of shotgun proteomic data with PatternLab for proteomics 4.0.

artículo científico publicado en 2015

Learning in the combinatorial neural model

artículo científico publicado en 1998

Mixed-data acquisition: Next-generation quantitative proteomics data acquisition

artículo científico publicado en 2020

Network algorithmics and the emergence of information integration in cortical models

artículo científico publicado el 8 de julio de 2011

Network algorithmics and the emergence of the cortical synaptic-weight distribution

artículo científico publicado en 2010

Network conduciveness with application to the graph-coloring and independent-set optimization transitions

artículo científico publicado en 2010

Network growth for enhanced natural selection

artículo científico publicado en 2009

On best practices in the development of bioinformatics software

artículo científico publicado en 2014

PatternLab for proteomics: a tool for differential shotgun proteomics

artículo científico publicado en 2008

PatternLab: from mass spectra to label-free differential shotgun proteomics

scientific article published on 01 December 2012

PepExplorer: a similarity-driven tool for analyzing de novo sequencing results

artículo científico publicado en 2014

Quasispecies dynamics with network constraints

artículo científico publicado en 2012

SIM-XL: A powerful and user-friendly tool for peptide cross-linking analysis

artículo científico publicado en 2015

Search engine processor: Filtering and organizing peptide spectrum matches

artículo científico publicado en 2012

The conduciveness of CA-rule graphs

artículo científico publicado en 2013

Top-Down Garbage Collector: a tool for selecting high-quality top-down proteomics mass spectra

scientific article published on 01 September 2019

Using PepExplorer to Filter and Organize De Novo Peptide Sequencing Results

artículo científico publicado en 2015

V-like Formations in Flocks of Artificial Birds

XDIA: improving on the label-free data-independent analysis

artículo científico publicado en 2010

YADA: a tool for taking the most out of high-resolution spectra.

artículo científico publicado en 2009