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Lista de obras de Alfonso Jaramillo

Accelerated evolution of a minimal 63-amino acid dual transcription factor

artículo científico publicado en 2020

An automated approach for single-cell tracking in epifluorescence microscopy applied to E. coli growth analysis on microfluidics biochips

scholarly article published 23 March 2012

Asmparts: assembly of biological model parts.

artículo científico publicado en 2007

AutoBioCAD: Full Biodesign Automation of Genetic Circuits ⬇️

artículo científico publicado el 26 de noviembre de 2012

Automated extraction of meaningful pathways from quantitative proteomics data.

artículo científico publicado en 2008

Automatic sequence design of major histocompatibility complex class I binding peptides impairing CD8+ T cell recognition

artículo científico publicado en 2002

Challenges in the computational design of proteins

scientific article published on 11 March 2009

Changes in the gene expression profile of Arabidopsis thaliana after infection with Tobacco etch virus

artículo científico publicado en 2008

Comparison of CRISPR and Marker-Based Methods for the Engineering of Phage T7

artículo científico publicado en 2020

Computational design and evolution of the oscillatory response under light-dark cycles

artículo científico publicado en 2008

Computational design of digital and memory biological devices.

artículo científico publicado en 2007

Computational design of genomic transcriptional networks with adaptation to varying environments

artículo científico publicado en 2012

Computational design of synthetic regulatory networks from a genetic library to characterize the designability of dynamical behaviors

artículo científico publicado en 2011

Computational protein design is a challenge for implicit solvation models

artículo científico publicado en 2004

Computational protein design with side-chain conformational entropy.

artículo científico publicado en 2009

Correction

DESHARKY: automatic design of metabolic pathways for optimal cell growth

artículo científico publicado en 2008

Editorial: Focus on synthetic biology

scientific article published on 01 October 2009

Editorial: Synthetic Biology – applying new paradigms at the interface of fundamental research and innovation ⬇️

artículo científico publicado el 1 de julio de 2011

Empirical model and in vivo characterization of the bacterial response to synthetic gene expression show that ribosome allocation limits growth rate.

artículo científico publicado en 2011

Engineering Bacteria to Produce Pure Phage-like Particles for Gene Delivery

artículo científico publicado en 2020

Engineering CRISPR guide RNA riboswitches for in vivo applications

scholarly article by Roberto Galizi et al published February 2019 in Current Opinion in Biotechnology

Engineering a Circular Riboregulator in <i>Escherichia coli</i>

artículo científico publicado en 2020

Engineering of a Promoter Repressed by a Light-Regulated Transcription Factor in <i>Escherichia coli</i>

artículo científico publicado en 2021

Engineering orthogonal dual transcription factors for multi-input synthetic promoters.

artículo científico publicado en 2016

Evolutionary mechanisms of circadian clocks

Fine-tuning tomato agronomic properties by computational genome redesign

artículo científico publicado en 2012

Folding free energy function selects native-like protein sequences in the core but not on the surface

artículo científico publicado en 2002

Functionalization of an Antisense Small RNA.

artículo científico publicado en 2016

Genetdes: automatic design of transcriptional networks

artículo científico publicado en 2007

Genetically modified bacteriophages.

artículo científico publicado en 2016

Integral control of plant gravitropism through the interplay of hormone signaling and gene regulation.

artículo científico

Intracellular directed evolution of proteins from combinatorial libraries based on conditional phage replication

artículo científico publicado en 2017

Optimal viral strategies for bypassing RNA silencing

artículo científico publicado en 2010

PROTDES: CHARMM toolbox for computational protein design.

artículo científico publicado en 2008

Pareto optimization in computational protein design with multiple objectives

artículo científico publicado en 2008

Perspectives on the automatic design of regulatory systems for synthetic biology.

artículo científico publicado en 2012

Protein design based on parallel dimensional reduction

artículo científico publicado en 2009

Pushing the limits of automatic computational protein design: design, expression, and characterization of a large synthetic protein based on a fungal laccase scaffold.

artículo científico publicado en 2011

Reverse-engineering the Arabidopsis thaliana transcriptional network under changing environmental conditions

artículo científico publicado en 2009

Robust dynamical pattern formation from a multifunctional minimal genetic circuit

artículo científico publicado en 2010

Synthetic biology gains momentum in Europe

artículo científico publicado en 2010

Towards the automated engineering of a synthetic genome.

artículo científico publicado en 2009

Using multi-objective computational design to extend protein promiscuity

artículo científico publicado en 2010

Using promoter libraries to reduce metabolic burden due to plasmid-encoded proteins in recombinant Escherichia coli.

artículo científico publicado en 2015

Vanillin cell sensor

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