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Lista de obras de Juan M Vaquerizas

A census of human transcription factors: function, expression and evolution

artículo científico publicado en 2009

A molecular roadmap for the emergence of early-embryonic-like cells in culture

artículo científico publicado en 2017

BABELOMICS: a suite of web tools for functional annotation and analysis of groups of genes in high-throughput experiments.

artículo científico publicado en 2005

BABELOMICS: a systems biology perspective in the functional annotation of genome-scale experiments.

artículo científico publicado en 2006

CHESS enables quantitative comparison of chromatin contact data and automatic feature extraction

artículo científico publicado en 2020

Cell-matrix signals specify bone endothelial cells during developmental osteogenesis.

artículo científico publicado en 2017

Chromatin Architecture Emerges during Zygotic Genome Activation Independent of Transcription.

artículo científico publicado en 2017

Chromatin architecture transitions from zebrafish sperm through early embryogenesis

artículo científico publicado en 2021

Chromatin conformation analysis of primary patient tissue using a low input Hi-C method

artículo científico publicado en 2018

Comprehensive reanalysis of transcription factor knockout expression data in Saccharomyces cerevisiae reveals many new targets

artículo científico publicado en 2010

DNA-binding specificities of human transcription factors

scientific journal article

DNMAD: web-based diagnosis and normalization for microarray data

artículo científico publicado en 2004

Developmental biology: Panoramic views of the early epigenome

artículo científico publicado en 2016

Dual randomization of oligonucleotides to reduce the bias in ribosome-profiling libraries.

artículo científico publicado en 2016

Early embryonic-like cells are induced by downregulating replication-dependent chromatin assembly.

artículo científico publicado en 2015

Endothelial EphB4 maintains vascular integrity and transport function in adult heart

artículo científico publicado en 2019

Exploring the reasons for the large density of triplex-forming oligonucleotide target sequences in the human regulatory regions

artículo científico publicado en 2006

FAN-C: a feature-rich framework for the analysis and visualisation of chromosome conformation capture data

artículo científico publicado en 2020

GEPAS, an experiment-oriented pipeline for the analysis of microarray gene expression data

artículo científico publicado en 2005

GEPAS: A web-based resource for microarray gene expression data analysis

artículo científico publicado en 2003

Genome-wide analysis reveals MOF as a key regulator of dosage compensation and gene expression in Drosophila

artículo científico publicado en 2008

Germ cell differentiation requires Tdrd7-dependent chromatin and transcriptome reprogramming marked by germ plasm relocalization

artículo científico publicado en 2021

Heterochromatin establishment during early mammalian development is regulated by pericentromeric RNA and characterized by non-repressive H3K9me3

scientific article published on 29 June 2020

Highly specific and accurate selection of siRNAs for high-throughput functional assays

artículo científico publicado en 2004

How do you find transcription factors? Computational approaches to compile and annotate repertoires of regulators for any genome

artículo científico

Identification of conserved domains in the promoter regions of nitric oxide synthase 2: implications for the species-specific transcription and evolutionary differences

artículo científico publicado en 2007

Independence of chromatin conformation and gene regulation during Drosophila dorsoventral patterning

artículo científico publicado en 2021

Large-scale nuclear architecture and transcriptional control

artículo científico publicado en 2011

Lima1 mediates the pluripotency control of membrane dynamics and cellular metabolism

artículo científico publicado en 2022

Multiplexed massively parallel SELEX for characterization of human transcription factor binding specificities

artículo científico publicado en 2010

New challenges in gene expression data analysis and the extended GEPAS

artículo científico publicado en 2004

Next station in microarray data analysis: GEPAS.

artículo científico publicado en 2006

PupaSNP Finder: a web tool for finding SNPs with putative effect at transcriptional level.

artículo científico publicado en 2004

PupaSuite: finding functional single nucleotide polymorphisms for large-scale genotyping purposes

artículo científico publicado en 2006

PupasView: a visual tool for selecting suitable SNPs, with putative pathological effect in genes, for genotyping purposes

artículo científico publicado en 2005

Response to Comments on "Drosophila Dosage Compensation Involves Enhanced Pol II Recruitment to Male X-Linked Promoters".

artículo científico publicado en 2013

Ronin governs the metabolic capacity of the embryonic lineage for post-implantation development

artículo científico publicado en 2021

SpeCond: a method to detect condition-specific gene expression

artículo científico publicado en 2011

TADtool: visual parameter identification for TAD-calling algorithms

artículo científico publicado en 2016

The Birth of the 3D Genome during Early Embryonic Development

article

The MOF chromobarrel domain controls genome-wide H4K16 acetylation and spreading of the MSL complex.

artículo científico publicado en 2012

The NSL complex regulates housekeeping genes in Drosophila.

artículo científico publicado en 2012

The nonspecific lethal complex is a transcriptional regulator in Drosophila

artículo científico publicado en 2010

Transcriptional regulation of endothelial cell behavior during sprouting angiogenesis

artículo científico publicado en 2017

Visualising three-dimensional genome organisation in two dimensions

scientific article published on 26 September 2019

genetically interacts with the ALS-associated orthologue and mediates its toxicity

article

m:Explorer: multinomial regression models reveal positive and negative regulators of longevity in yeast quiescence

artículo científico publicado en 2012

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