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Lista de obras de Gemma L. Holliday

A global analysis of function and conservation of catalytic residues in enzymes

scientific article published on 03 December 2019

A global view of structure-function relationships in the tautomerase superfamily.

artículo científico publicado en 2017

Addressing sex bias in biological databases worldwide

Atlas of the Radical SAM Superfamily: Divergent Evolution of Function Using a “Plug and Play” Domain

scientific article published on 24 July 2018

Biocuration in the structure-function linkage database: the anatomy of a superfamily

artículo científico publicado en 2017

Biocuration in the structure-function linkage database: the anatomy of a superfamily.

artículo científico publicado en 2017

CMLSnap: Animated Reaction Mechanisms ⬇️

scientific article from 2004

Characterizing the complexity of enzymes on the basis of their mechanisms and structures with a bio-computational analysis.

artículo científico publicado en 2011

ChemInform Abstract: Evolution of Enzymes and Pathways for the Biosynthesis of Cofactors

Chemical Markup, XML, and the World Wide Web. 6. CMLReact, an XML Vocabulary for Chemical Reactions

artículo científico publicado en 2006

Creating a specialist protein resource network: a meeting report for the protein bioinformatics and community resources retreat

artículo científico publicado en 2015

EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions

artículo científico publicado en 2014

Evaluating Functional Annotations of Enzymes Using the Gene Ontology

artículo científico

Evolution of enzymes and pathways for the biosynthesis of cofactors

artículo científico publicado en 2007

Exploring the biological and chemical complexity of the ligases

artículo científico publicado en 2014

Exploring the evolution of novel enzyme functions within structurally defined protein superfamilies

artículo científico publicado en 2012

First examples of M–Se–P–N–N heterocycles

FunTree: a resource for exploring the functional evolution of structurally defined enzyme superfamilies

artículo científico publicado en 2011

InterPro in 2017-beyond protein family and domain annotations

artículo científico publicado en 2016

Key challenges for the creation and maintenance of specialist protein resources

artículo científico publicado en 2015

MACiE (Mechanism, Annotation and Classification in Enzymes): novel tools for searching catalytic mechanisms

artículo científico publicado en 2007

MACiE: a database of enzyme reaction mechanisms

artículo científico publicado en 2005

MACiE: exploring the diversity of biochemical reactions

artículo científico publicado en 2011

Mechanism and Catalytic Site Atlas (M-CSA): a database of enzyme reaction mechanisms and active sites

artículo científico publicado en 2017

Metal ions in biological catalysis: from enzyme databases to general principles

artículo científico publicado en 2008

Metal-MACiE: a database of metals involved in biological catalysis

scholarly article by Claudia Andreini et al published 15 April 2009 in Bioinformatics

Reaction Decoder Tool (RDT): extracting features from chemical reactions

artículo científico publicado en 2016

Small Molecule Subgraph Detector (SMSD) toolkit

artículo científico publicado en 2009

The Catalytic Site Atlas 2.0: cataloging catalytic sites and residues identified in enzymes

artículo científico publicado en 2013

The CoFactor database: organic cofactors in enzyme catalysis

artículo científico publicado en 2010

The Confidence Information Ontology: a step towards a standard for asserting confidence in annotations

artículo científico publicado en 2015

The EBI enzyme portal

artículo científico publicado en 2012

The NAD Binding Domain and the Short-Chain Dehydrogenase/Reductase (SDR) Superfamily

The Structure-Function Linkage Database

artículo científico publicado en 2013

The chemistry of protein catalysis.

artículo científico publicado en 2007

The geometry of interactions between catalytic residues and their substrates

artículo científico publicado en 2007

The structures and physicochemical properties of organic cofactors in biocatalysis

artículo científico publicado en 2010

Understanding the functional roles of amino acid residues in enzyme catalysis.

artículo científico publicado en 2009

Using reaction mechanism to measure enzyme similarity.

artículo científico publicado en 2007

[FeFe]-hydrogenase maturation: insights into the role HydE plays in dithiomethylamine biosynthesis

artículo científico publicado en 2015

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