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Lista de obras de Tiziana Bonaldi

"Chromatomics" the analysis of the chromatome

artículo científico publicado en 2005

A Super-SILAC Strategy for the Accurate and Multiplexed Profiling of Histone Posttranslational Modifications.

artículo científico publicado en 2016

A combination of different mass spectroscopic techniques for the analysis of dynamic changes of histone modifications.

artículo científico publicado en 2004

A role for CENP-A/Cse4 phosphorylation on serine 33 in deposition at the centromere

artículo científico publicado en 2017

ARGONAUTE2 cooperates with SWI/SNF complex to determine nucleosome occupancy at human Transcription Start Sites

artículo científico publicado en 2015

Alternative digestion approaches improve histone modification mapping by mass spectrometry in clinical samples

artículo científico publicado en 2018

Biochemical systems approaches for the analysis of histone modification readout

artículo científico publicado en 2014

Cell reprogramming requires silencing of a core subset of polycomb targets

artículo científico publicado en 2013

Chromatin proteomics reveals novel combinatorial histone modification signatures that mark distinct subpopulations of macrophage enhancers.

artículo científico publicado en 2017

Combined use of RNAi and quantitative proteomics to study gene function in Drosophila

artículo científico publicado en 2008

DEPDC1B coordinates de-adhesion events and cell-cycle progression at mitosis

artículo científico publicado en 2014

Design of KDM4 Inhibitors with Antiproliferative Effects in Cancer Models.

artículo científico publicado en 2017

Dual role of PRMT1-dependent arginine methylation in cellular responses to genotoxic stress

scientific article published on 07 April 2020

Epigenetic drug target deconvolution by mass spectrometry-based technologies

artículo científico

Extensive and systematic rewiring of histone post-translational modifications in cancer model systems.

artículo científico publicado en 2018

Extracellular vesicle-mediated transfer of CLIC1 protein is a novel mechanism for the regulation of glioblastoma growth

artículo científico publicado en 2015

FAM46C and FNDC3A are multiple myeloma tumor suppressors that act in concert to impair clearing of protein aggregates and autophagy

scientific article published on 22 September 2020

Functional Landscape of PCGF Proteins Reveals Both RING1A/B-Dependent-and RING1A/B-Independent-Specific Activities

scientific article published on 24 April 2019

High constitutive activity of a broad panel of housekeeping and tissue-specific cis-regulatory elements depends on a subset of ETS proteins

artículo científico publicado en 2017

Identification of a specific inhibitor of the histone methyltransferase SU(VAR)3-9.

artículo científico publicado en 2005

Improved bottom-up strategy to efficiently separate hypermodified histone peptides through ultra-HPLC separation on a bench top Orbitrap instrument

artículo científico publicado en 2014

Iodoacetamide-induced artifact mimics ubiquitination in mass spectrometry

artículo científico publicado en 2008

Label-Free Mass Spectrometry-Based Quantification of Linker Histone H1 Variants in Clinical Samples

artículo científico publicado en 2020

Loss of acetylation at Lys16 and trimethylation at Lys20 of histone H4 is a common hallmark of human cancer

artículo científico publicado en 2005

MS-analysis of SILAC-labeled MYC-driven B lymphoma cells overexpressing miR-17-19b

artículo científico publicado en 2016

MYC/miR-17-92 interplay maintains B-lymphoma cell homeostasis.

artículo científico publicado en 2016

Mass Spectrometry-Based Proteomics to Unveil the Non-coding RNA World

artículo científico publicado en 2018

Mass spectrometry-based characterization of histones in clinical samples: applications, progresses and challenges

artículo científico publicado en 2021

Mass spectrometry-based identification and characterisation of lysine and arginine methylation in the human proteome.

artículo científico publicado en 2013

Mass spectrometry-based proteomics for the analysis of chromatin structure and dynamics.

artículo científico publicado en 2013

Mass-spectrometry analysis of histone post-translational modifications in pathology tissue using the PAT-H-MS approach.

artículo científico publicado en 2016

Methylation of CenH3 arginine 37 regulates kinetochore integrity and chromosome segregation

artículo científico publicado en 2012

Microbiota derived short chain fatty acids promote histone crotonylation in the colon through histone deacetylases

artículo científico publicado en 2018

Monocytic cells hyperacetylate chromatin protein HMGB1 to redirect it towards secretion

artículo científico publicado en 2003

New EMBO members' review: the double life of HMGB1 chromatin protein: architectural factor and extracellular signal

artículo científico publicado en 2001

PARP14 Controls the Nuclear Accumulation of a Subset of Type I IFN–Inducible Proteins

artículo científico publicado en 2018

PAT-H-MS coupled with laser microdissection to study histone post-translational modifications in selected cell populations from pathology samples

artículo científico publicado en 2017

PTMs on H3 variants before chromatin assembly potentiate their final epigenetic state

artículo científico publicado en 2006

Pathology Tissue-quantitative Mass Spectrometry Analysis to Profile Histone Post-translational Modification Patterns in Patient Samples

artículo científico publicado en 2015

Polycomb-dependent H3K27me1 and H3K27me2 regulate active transcription and enhancer fidelity

artículo científico publicado en 2013

Profiling of Epigenetic Features in Clinical Samples Reveals Novel Widespread Changes in Cancer.

artículo científico publicado en 2019

Proteomics meets genetics: SILAC labeling of Drosophila melanogaster larvae and cells for in vivo functional studies.

artículo científico publicado en 2014

Proteomics profiling of arginine methylation defines PRMT5 substrate specificity

artículo científico publicado en 2019

Quantitative assessment of chemical artefacts produced by propionylation of histones prior to mass spectrometry analysis

artículo científico publicado en 2016

Quantitative chemical proteomics identifies novel targets of the anti-cancer multi-kinase inhibitor E-3810.

artículo científico publicado en 2014

Quantitative proteomics as a new piece of the systems biology puzzle

artículo científico publicado en 2008

Recent advances in mass spectrometry analysis of histone post-translational modifications: potential clinical impact of the PAT-H-MS approach

artículo científico publicado en 2016

Reply to "Chaetocin is a nonspecific inhibitor of histone lysine methyltransferases"

article published in 2013

Reticulon 3-dependent ER-PM contact sites control EGFR nonclathrin endocytosis.

artículo científico publicado en 2017

SILAC-Based Quantitative Strategies for Accurate Histone Posttranslational Modification Profiling Across Multiple Biological Samples.

artículo científico publicado en 2017

SILAC-based proteomic analysis to dissect the "histone modification signature" of human breast cancer cells

artículo científico publicado en 2010

Site-specific acetylation of ISWI by GCN5.

artículo científico publicado en 2007

Spatial epi-proteomics enabled by histone post-translational modification analysis from low-abundance clinical samples

artículo científico publicado en 2021

Spatiotemporal plasticity of miRNAs functions: The miR-17-92 case.

artículo científico publicado en 2016

Substantial histone reduction modulates genomewide nucleosomal occupancy and global transcriptional output

artículo científico publicado en 2011

Systems biology "on-the-fly": SILAC-based quantitative proteomics and RNAi approach in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2010

Systems-wide analysis of a phosphatase knock-down by quantitative proteomics and phosphoproteomics

artículo científico publicado en 2009

Targeting the scaffolding role of LSD1 (KDM1A) poises acute myeloid leukemia cells for retinoic acid-induced differentiation

artículo científico publicado en 2020

Tet proteins connect the O-linked N-acetylglucosamine transferase Ogt to chromatin in embryonic stem cells

artículo científico publicado en 2013

The ChroP approach combines ChIP and mass spectrometry to dissect locus-specific proteomic landscapes of chromatin

artículo científico publicado en 2014

The DNA chaperone HMGB1 facilitates ACF/CHRAC-dependent nucleosome sliding

artículo científico publicado en 2002

The EGFR-specific antibody cetuximab combined with chemotherapy triggers immunogenic cell death.

artículo científico publicado en 2016

The HP1alpha-CAF1-SetDB1-containing complex provides H3K9me1 for Suv39-mediated K9me3 in pericentric heterochromatin

artículo científico publicado en 2009

The Long Acidic Tail of High Mobility Group Box 1 (HMGB1) Protein Forms an Extended and Flexible Structure That Interacts with Specific Residues within and between the HMG Boxes†

artículo científico publicado en 2004

The N-terminus of Drosophila SU(VAR)3-9 mediates dimerization and regulates its methyltransferase activity

artículo científico publicado en 2004

The RAG1 homeodomain recruits HMG1 and HMG2 to facilitate recombination signal sequence binding and to enhance the intrinsic DNA-bending activity of RAG1-RAG2

artículo científico publicado en 1999

The contribution of mass spectrometry-based proteomics to understanding epigenetics

artículo científico publicado en 2015

The high mobility group (HMG) boxes of the nuclear protein HMG1 induce chemotaxis and cytoskeleton reorganization in rat smooth muscle cells

scientific journal article

The kinetochore module Okp1/Ame1 is a reader for N-terminal modifications on the centromeric histone Cse4

artículo científico publicado en 2018

The proteomic investigation of chromatin functional domains reveals novel synergisms among distinct heterochromatin components

artículo científico publicado en 2013

The use of mass spectrometry for the analysis of histone modifications.

artículo científico publicado en 2004

Therapeutic Targeting of RNA Splicing Catalysis through Inhibition of Protein Arginine Methylation

artículo científico publicado en 2019

Threshold-controlled ubiquitination of the EGFR directs receptor fate

artículo científico publicado en 2013

Yin Yang 1 extends the Myc-related transcription factors network in embryonic stem cells.

artículo científico publicado en 2011

Zc3h10 is a novel mitochondrial regulator.

artículo científico publicado en 2018

hSWATH: Unlocking SWATH's Full Potential for an Untargeted Histone Perspective

artículo científico publicado en 2019

hmSEEKER: Identification of hmSILAC Doublets in MaxQuant Output Data

scientific article published on 18 February 2019

miR-17-92 fine-tunes MYC expression and function to ensure optimal B cell lymphoma growth ⬇️

artículo científico publicado en 2015

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