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Lista de obras de Gerben Menschaert

A Role for Human N-alpha Acetyltransferase 30 (Naa30) in Maintaining Mitochondrial Integrity

artículo científico publicado en 2016

A hybrid, de novo based, genome-wide database search approach applied to the sea urchin neuropeptidome

artículo científico publicado en 2010

A proteogenomics approach integrating proteomics and ribosome profiling increases the efficiency of protein identification and enables the discovery of alternative translation start sites

artículo científico publicado en 2014

An update on LNCipedia: a database for annotated human lncRNA sequences

scientific article published on 31 March 2015

An update on LNCipedia: a database for annotated human lncRNA sequences.

artículo científico publicado en 2014

Antigenic peptides: Reviving nuclear translation

artículo científico publicado en 2013

Beyond Genes: Re-Identifiability of Proteomic Data and Its Implications for Personalized Medicine

scientific article published on 05 September 2019

Bioinformatics solutions for MS/MS interpretation tailored to the peptidomics field.

artículo científico publicado en 2009

Colorado potato beetle (Coleoptera) gut transcriptome analysis: expression of RNA interference-related genes.

artículo científico publicado en 2013

Combining in silico prediction and ribosome profiling in a genome-wide search for novel putatively coding sORFs

artículo científico publicado en 2013

Deep proteome coverage based on ribosome profiling aids mass spectrometry-based protein and peptide discovery and provides evidence of alternative translation products and near-cognate translation initiation events

artículo científico publicado en 2013

DeepRibo: a neural network for precise gene annotation of prokaryotes by combining ribosome profiling signal and binding site patterns

article

Deletion 6q Drives T-cell Leukemia Progression by Ribosome Modulation

scientific article published on 28 September 2018

Diversity in protein glycosylation among insect species

artículo científico publicado en 2011

Fast and Reliable Quantitative Peptidomics with labelpepmatch.

artículo científico publicado en 2016

Identification of Small Novel Coding Sequences, a Proteogenomics Endeavor

artículo científico publicado en 2016

Improving the identification rate of endogenous peptides using electron transfer dissociation and collision-induced dissociation.

artículo científico publicado en 2013

In Search of Lost Small Peptides

artículo científico publicado en 2017

Interaction of the tobacco lectin with histone proteins

artículo científico publicado en 2011

Linking mass spectrometric imaging and traditional peptidomics: a validation in the obese mouse model

artículo científico publicado en 2011

Little things make big things happen: A summary of micropeptide encoding genes

artículo científico publicado en 2014

N-terminal proteomics and ribosome profiling provide a comprehensive view of the alternative translation initiation landscape in mice and men

artículo científico publicado en 2014

Noncoding after All: Biases in Proteomics Data Do Not Explain Observed Absence of lncRNA Translation Products

artículo científico publicado en 2017

PIUS: peptide identification by unbiased search.

artículo científico publicado en 2013

PROTEOFORMER 2.0: Further Developments in the Ribosome Profiling-assisted Proteogenomic Hunt for New Proteoforms

artículo científico publicado en 2019

PROTEOFORMER: deep proteome coverage through ribosome profiling and MS integration

artículo científico publicado en 2014

Peptidomics coming of age: a review of contributions from a bioinformatics angle.

scientific article published on May 2010

Proteogenomics from a bioinformatics angle: A growing field.

artículo científico

PubMeth: a cancer methylation database combining text-mining and expert annotation

artículo científico publicado en 2008

Quality evaluation of methyl binding domain based kits for enrichment DNA-methylation sequencing

artículo científico publicado en 2013

REPARATION: ribosome profiling assisted (re-)annotation of bacterial genomes

artículo científico publicado en 2017

Spectral clustering in peptidomics studies allows homology searching and modification profiling: HomClus, a versatile tool.

artículo científico publicado en 2012

Spectral clustering in peptidomics studies helps to unravel modification profile of biologically active peptides and enhances peptide identification rate

artículo científico publicado en 2009

The Proteomics Standards Initiative: Fifteen Years of Progress and Future Work.

artículo científico publicado en 2017

The Salivary Protein Repertoire of the Polyphagous Spider Mite Tetranychus urticae: A Quest for Effectors.

artículo científico publicado en 2016

The proBAM and proBed standard formats: enabling a seamless integration of genomics and proteomics data

eIF1 modulates the recognition of suboptimal translation initiation sites and steers gene expression via uORFs

artículo científico publicado en 2017

proBAMconvert: A Conversion Tool for proBAM/proBed.

artículo científico publicado en 2017

sORFs.org: a repository of small ORFs identified by ribosome profiling.

artículo científico publicado en 2015

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