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Lista de obras de Paul W O'Toole

A Profile Hidden Markov Model to investigate the distribution and frequency of LanB-encoding lantibiotic modification genes in the human oral and gut microbiome

artículo científico publicado en 2017

A clinician's guide to microbiome analysis.

artículo científico publicado en 2017

A high-risk gut microbiota configuration associates with fatal hyperinflammatory immune and metabolic responses to SARS-CoV-2

artículo científico publicado en 2022

A synthetic consortium of 100 gut commensals modulates the composition and function in a colon model of the microbiome of elderly subjects

artículo científico publicado en 2021

Adjusting for age improves identification of gut microbiome alterations in multiple diseases

artículo científico publicado en 2020

Allelic variation of bile salt hydrolase genes in Lactobacillus salivarius does not determine bile resistance levels.

artículo científico publicado en 2009

Alterations in intestinal microbiota of elderly Irish subjects post-antibiotic therapy

article by Orla O'Sullivan et al published 4 September 2012 in Journal of Antimicrobial Chemotherapy

An irritable bowel syndrome subtype defined by species-specific alterations in faecal microbiota.

artículo científico publicado en 2011

Archaea and the human gut: new beginning of an old story.

artículo científico publicado en 2014

Archaebiotics: proposed therapeutic use of archaea to prevent trimethylaminuria and cardiovascular disease

artículo científico publicado en 2013

Bacteriocin production as a mechanism for the antiinfective activity of Lactobacillus salivarius UCC118.

artículo científico publicado en 2007

Beneficial modulation of the gut microbiota.

artículo científico publicado en 2014

Bifidobacterium breve with α-linolenic acid and linoleic acid alters fatty acid metabolism in the maternal separation model of irritable bowel syndrome

artículo científico publicado en 2012

Carbohydrate catabolic diversity of bifidobacteria and lactobacilli of human origin.

artículo científico publicado en 2015

Catabolic flexibility of mammalian-associated lactobacilli ⬇️

artículo científico publicado el 16 de mayo de 2013

Categorization of the gut microbiota: enterotypes or gradients?

artículo científico publicado en 2012

Changes in the intestinal microbiota from adulthood through to old age ⬇️

artículo científico publicado el 1 de julio de 2012

Characterization of endogenous plasmids from Lactobacillus salivarius UCC118.

artículo científico

Characterization of pro-inflammatory flagellin proteins produced by Lactobacillus ruminis and related motile Lactobacilli

artículo científico publicado en 2012

Cloning and expression of an oligopeptidase, PepO, with novel specificity from Lactobacillus rhamnosus HN001 (DR20).

artículo científico publicado en 2002

Colorectal microbiota after removal of colorectal cancer

artículo científico publicado en 2022

Comparative analysis of pyrosequencing and a phylogenetic microarray for exploring microbial community structures in the human distal intestine

artículo científico publicado en 2009

Comparative and functional analysis of sortase-dependent proteins in the predicted secretome of Lactobacillus salivarius UCC118

artículo científico publicado en 2006

Comparative genomics and proteomics of Helicobacter mustelae, an ulcerogenic and carcinogenic gastric pathogen.

artículo científico publicado en 2010

Comparative genomics and transcriptional analysis of prophages identified in the genomes of Lactobacillus gasseri, Lactobacillus salivarius, and Lactobacillus casei

artículo científico publicado en 2006

Comparative genomics highlights the unique biology of Methanomassiliicoccales, a Thermoplasmatales-related seventh order of methanogenic archaea that encodes pyrrolysine

artículo científico publicado en 2014

Comparison of two next-generation sequencing technologies for resolving highly complex microbiota composition using tandem variable 16S rRNA gene regions

artículo científico publicado en 2010

Composition and energy harvesting capacity of the gut microbiota: relationship to diet, obesity and time in mouse models.

artículo científico publicado en 2010

Composition and temporal stability of the gut microbiota in older persons

artículo científico publicado en 2015

Composition, variability, and temporal stability of the intestinal microbiota of the elderly

artículo científico publicado en 2010

Core fecal microbiota of domesticated herbivorous ruminant, hindgut fermenters, and monogastric animals

artículo científico

Correlation of rRNA gene amplicon pyrosequencing and bacterial culture for microbial compositional analysis of faecal samples from elderly Irish subjects

artículo científico publicado en 2011

Corrigendum to "unique characteristics of the pyrrolysine system in the 7th order of methanogens: implications for the evolution of a genetic code expansion cassette".

artículo científico publicado en 2015

Detection and genomic characterization of motility in Lactobacillus curvatus: confirmation of motility in a species outside the Lactobacillus salivarius clade

artículo científico publicado en 2015

Detection and isolation of Helicobacter mustelae from stoats in New Zealand.

artículo científico publicado en 2003

Diet-Microbiota Interactions and Their Implications for Healthy Living ⬇️

artículo científico publicado el 17 de enero de 2013

Diet-microbiota-health interactions in older subjects: implications for healthy aging.

artículo científico publicado en 2014

Dietary glycaemic load associated with cognitive performance in elderly subjects.

artículo científico publicado en 2014

Disturbance of the gut microbiota in early-life selectively affects visceral pain in adulthood without impacting cognitive or anxiety-related behaviors in male rats.

artículo científico publicado en 2014

Divergent metabolic outcomes arising from targeted manipulation of the gut microbiota in diet-induced obesity.

artículo científico publicado en 2012

Diversity of bifidobacteria within the infant gut microbiota

artículo científico publicado en 2012

Diversity of the genus Lactobacillus revealed by comparative genomics of five species

article

Draft genome sequences of Helicobacter pylori strains 17874 and P79

artículo científico publicado en 2012

Effect of FliK mutation on the transcriptional activity of the {sigma}54 sigma factor RpoN in Helicobacter pylori

artículo científico publicado en 2009

Effect of Lactobacillus salivarius bacteriocin Abp118 on the mouse and pig intestinal microbiota

artículo científico publicado en 2012

Effect of room temperature transport vials on DNA quality and phylogenetic composition of faecal microbiota of elderly adults and infants.

artículo científico publicado en 2016

Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition.

artículo científico publicado en 2017

Erratum to: signatures of early frailty in the gut microbiota

artículo científico publicado en 2016

Essentiality of the early transcript in the replication origin of the lactococcal prolate phage c2.

artículo científico publicado en 2004

Examination of lactococcal bacteriophage c2 DNA replication using two-dimensional agarose gel electrophoresis

scientific article published on 01 October 2001

Expanding the biotechnology potential of lactobacilli through comparative genomics of 213 strains and associated genera

artículo científico publicado en 2015

Failure of surface ring mutant strains of Helicobacter mustelae to persistently infect the ferret stomach

artículo científico publicado en 2003

Food and nutrient intake of Irish community-dwelling elderly subjects: who is at nutritional risk?

artículo científico publicado en 2014

Forgotten fungi-the gut mycobiome in human health and disease

artículo científico publicado en 2017

From Culture to High-Throughput Sequencing and Beyond: A Layperson's Guide to the "Omics" and Diagnostic Potential of the Microbiome.

artículo científico publicado en 2017

Functional genome analysis of Bifidobacterium breve UCC2003 reveals type IVb tight adherence (Tad) pili as an essential and conserved host-colonization factor

artículo científico publicado en 2011

Genome Sequence of "Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis" Issoire-Mx1, a Third Thermoplasmatales-Related Methanogenic Archaeon from Human Feces.

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of "Candidatus Methanomethylophilus alvus" Mx1201, a methanogenic archaeon from the human gut belonging to a seventh order of methanogens

artículo científico publicado en 2012

Genome-scale analyses of health-promoting bacteria: probiogenomics

artículo científico publicado en 2008

Genomic diversity of Lactobacillus salivarius.

artículo científico publicado en 2010

Genomics and metagenomics of trimethylamine-utilizing Archaea in the human gut microbiome.

artículo científico publicado en 2017

Glycomacropeptide Sustains Microbiota Diversity and Promotes Specific Taxa in an Artificial Colon Model of Elderly Gut Microbiota.

artículo científico publicado en 2017

Gut microbiota and aging.

artículo científico publicado en 2015

HP0958 is an essential motility gene in Helicobacter pylori

artículo científico publicado en 2005

Helicobacter pylori flagellar hook-filament transition is controlled by a FliK functional homolog encoded by the gene HP0906.

artículo científico publicado en 2005

High-level adherence to a Mediterranean diet beneficially impacts the gut microbiota and associated metabolome

artículo científico publicado en 2015

High-resolution structures of Lactobacillus salivarius transketolase in the presence and absence of thiamine pyrophosphate

artículo científico publicado en 2015

High-throughput metataxonomic characterization of the raw milk microbiota identifies changes reflecting lactation stage and storage conditions

artículo científico publicado en 2017

HorB (HP0127) is a gastric epithelial cell adhesin.

artículo científico publicado en 2007

Identification and molecular characterization of a major ring-forming surface protein from the gastric pathogen Helicobacter mustelae

artículo científico publicado en 1994

Identification of Gut Bacteria such as Lactobacillus johnsonii that Disseminate to Systemic Tissues of Wild Type and MyD88-/- Mice

publication published on 01 January 2022

Identification of Yersinia-infected blood donors by anti-Yop IgA immunoassay

artículo científico publicado en 2001

Impacts of Seasonal Housing and Teat Preparation on Raw Milk Microbiota: a High-Throughput Sequencing Study

artículo científico publicado en 2016

In silico identification of bacteriocin gene clusters in the gastrointestinal tract, based on the Human Microbiome Project's reference genome database

artículo científico publicado en 2015

In-vitro model for studying methanogens in human gut microbiota.

artículo científico publicado en 2015

Influence of adhesion and bacteriocin production by Lactobacillus salivarius on the intestinal epithelial cell transcriptional response

artículo científico publicado en 2012

Intestinal microbiota, diet and health.

artículo científico publicado en 2013

Isolation and characterization of bacteriocin-producing bacteria from the intestinal microbiota of elderly Irish subjects.

artículo científico publicado en 2012

Isolation of Helicobacter mustelae from ferrets in New Zealand

artículo científico publicado en 2000

Isolation of lactobacilli with probiotic properties from the human stomach

artículo científico publicado en 2008

Isolation of lactococcal prolate phage-phage recombinants by an enrichment strategy reveals two novel host range determinants.

artículo científico publicado en 2005

Lactobacillus phylogenomics--towards a reclassification of the genus

artículo científico publicado en 2008

Lactobacillus ruminis strains cluster according to their mammalian gut source.

artículo científico publicado en 2015

Lactobacillus salivarius modulates cytokine induction and virulence factor gene expression in Helicobacter pylori

artículo científico publicado en 2009

Many group A streptococcal strains express two different immunoglobulin-binding proteins, encoded by closely linked genes: characterization of the proteins expressed by four strains of different M-type

artículo científico publicado en 1992

Mechanism of protection of transepithelial barrier function by Lactobacillus salivarius: strain dependence and attenuation by bacteriocin production.

artículo científico publicado en 2012

Mediterranean diet intervention alters the gut microbiome in older people reducing frailty and improving health status: the NU-AGE 1-year dietary intervention across five European countries

scientific article published on 17 February 2020

Metagenomic analysis reveals distinct patterns of gut lactobacillus prevalence, abundance, and geographical variation in health and disease

artículo científico publicado en 2020

Microbiome-health interactions in older people

artículo científico publicado en 2017

Model for substrate interactions in C5a peptidase from Streptococcus pyogenes: A 1.9 A crystal structure of the active form of ScpA

artículo científico publicado en 2009

Molecular Characterization of H. pylori Surface Antigens

artículo científico publicado en 1997

Molecular basis of the interaction between the flagellar export proteins FliI and FliH from Helicobacter pylori

scientific journal article

Molecular cloning and expression of the epidermolytic toxin A gene of Staphylococcus aureus

artículo científico publicado en 1986

Molecular dialogue between the human gut microbiota and the host: a Lactobacillus and Bifidobacterium perspective

artículo científico publicado en 2013

Multireplicon genome architecture of Lactobacillus salivarius

artículo científico publicado en 2006

Next-generation probiotics: the spectrum from probiotics to live biotherapeutics

scientific article published on 25 April 2017

Next-generation sequencing technologies and their impact on microbial genomics.

artículo científico publicado en 2013

Non-motile mutants of Helicobacter pylori and Helicobacter mustelae defective in flagellar hook production.

artículo científico publicado en 1994

Novel chromosomally encoded multidrug efflux transporter MdeA in Staphylococcus aureus

artículo científico publicado en 2004

Nucleotide sequence and characterization of the cell envelope proteinase plasmid in Lactococcus lactis subsp. cremoris HP.

artículo científico publicado en 2001

Phenotypic Variation ofHelicobacter pyloriIsolates from Geographically Distinct Regions Detected by Lectin Typing ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2002

Polyphasic analysis indicates that Lactobacillus salivarius subsp. salivarius and Lactobacillus salivarius subsp. salicinius do not merit separate subspecies status

artículo científico publicado en 2006

Posttranscriptional regulation of flagellin synthesis in Helicobacter pylori by the RpoN chaperone HP0958.

artículo científico publicado en 2008

Potentiation of methicillin activity against methicillin-resistant Staphylococcus aureus by diterpenes

scientific article published on 01 October 1999

Prevalence and characterization of Clostridium perfringens from the faecal microbiota of elderly Irish subjects

scientific article published on 06 December 2012

Pro-inflammatory flagellin proteins of prevalent motile commensal bacteria are variably abundant in the intestinal microbiome of elderly humans

artículo científico publicado en 2013

Probiotic properties of Lactobacillus salivarius and closely related Lactobacillus species.

artículo científico publicado en 2010

Production of multiple bacteriocins from a single locus by gastrointestinal strains of Lactobacillus salivarius

artículo científico publicado en 2011

Publisher Correction: Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition

artículo científico publicado en 2018

Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies

artículo científico publicado en 2023

Resource partitioning in relation to cohabitation of Lactobacillus species in the mouse forestomach

artículo científico publicado en 2011

Selected aspects of the human gut microbiota

artículo científico publicado en 2017

Sequence and antigenic variability of the Helicobacter mustelae surface ring protein Hsr.

artículo científico publicado en 2001

Sequence diversity and functional conservation of the origin of replication in lactococcal prolate phages.

artículo científico publicado en 2003

Signatures of early frailty in the gut microbiota

artículo científico publicado en 2016

SpeB-Spi: a novel protease-inhibitor pair from Streptococcus pyogenes

artículo científico publicado en 2005

Special issue: The Human Intestinal Microbiota

artículo científico publicado en 2010

Strain-specific inhibition of Helicobacter pylori by Lactobacillus salivarius and other lactobacilli.

artículo científico publicado en 2008

Structure of ribose 5-phosphate isomerase from the probiotic bacterium Lactobacillus salivarius UCC118

artículo científico publicado en 2012

Studying the Microbiome: "Omics" Made Accessible

artículo científico publicado en 2016

Targeting the microbiota to address diet-induced obesity: a time dependent challenge.

artículo científico publicado en 2013

Techniques used to characterize the gut microbiota: a guide for the clinician.

artículo científico publicado en 2012

The 2.2-Å structure of the HP0958 protein from Helicobacter pylori reveals a kinked anti-parallel coiled-coil hairpin domain and a highly conserved ZN-ribbon domain

artículo científico publicado en 2010

The Bifidobacterium dentium Bd1 genome sequence reflects its genetic adaptation to the human oral cavity

artículo científico publicado en 2009

The Composition of Human Milk and Infant Faecal Microbiota Over the First Three Months of Life: A Pilot Study

artículo científico publicado en 2017

The FliK protein and flagellar hook-length control.

artículo científico publicado en 2007

The HP0256 gene product is involved in motility and cell envelope architecture of Helicobacter pylori

artículo científico publicado en 2010

The contribution of microbial biotechnology to sustainable development goals: microbiome therapies

artículo científico publicado en 2017

The dissemination of C10 cysteine protease genes in Bacteroides fragilis by mobile genetic elements

artículo científico publicado en 2010

The effect of environmental conditions on expression of Bacteroides fragilis and Bacteroides thetaiotaomicron C10 protease genes.

artículo científico publicado en 2012

The genus Lactobacillus--a genomic basis for understanding its diversity

artículo científico publicado en 2007

The gut microbiota composition in dichorionic triplet sets suggests a role for host genetic factors

artículo científico publicado en 2015

The gut virome in Irritable Bowel Syndrome differs from that of controls

artículo científico publicado en 2021

The human gut chip "HuGChip", an explorative phylogenetic microarray for determining gut microbiome diversity at family level

artículo científico publicado en 2013

The microbiota of the mother at birth and its influence on the emerging infant oral microbiota from birth to 1 year of age: a cohort study

scientific article published on 26 April 2019

The neonatal gut harbours distinct bifidobacterial strains

artículo científico publicado en 2015

The probiotic L. casei LC-XCAL™ improves metabolic health in a diet-induced obesity mouse model without altering the microbiome

artículo científico publicado en 2020

The role of the microbiota in ageing: current state and perspectives ⬇️

artículo científico publicado en 2015

The rumen microbiome: a crucial consideration when optimising milk and meat production and nitrogen utilisation efficiency

scientific article published on 12 September 2018

The viability of probiotics in water, breast milk, and infant formula

artículo científico publicado en 2018

Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies.

artículo científico publicado en 2017

Transcriptional and metabolomic consequences of LuxS inactivation reveal a metabolic rather than quorum-sensing role for LuxS in Lactobacillus reuteri 100-23.

artículo científico publicado en 2012

Tumour-associated and non-tumour-associated microbiota in colorectal cancer

artículo científico publicado en 2016

Unique characteristics of the pyrrolysine system in the 7th order of methanogens: implications for the evolution of a genetic code expansion cassette

artículo científico publicado en 2014

Unusual genome complexity in Lactobacillus salivarius JCM1046.

artículo científico publicado en 2014

Vitamin K status and inflammation are associated with cognition in older Irish adults

artículo científico publicado en 2018

γ-Aminobutyric acid production by culturable bacteria from the human intestine.

artículo científico publicado en 2012

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