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Lista de obras de José Luís Oliveira

A Cloud Architecture for Teleradiology-as-a-Service.

artículo científico

A Cytoscape-Based Web Tool for Representing Protein Networks

A De-Identification Pipeline for Ultrasound Medical Images in DICOM Format.

artículo científico publicado en 2017

A Microarray Information Database

A Nanopublishing Architecture for Biomedical Data

article by Pedro Sernadela et al published 2014 in Advances in Intelligent Systems and Computing

A PACS archive architecture supported on cloud services.

artículo científico publicado en 2011

A RESTful image gateway for multiple medical image repositories

artículo científico publicado en 2011

A centralized platform for geo-distributed PACS management

artículo científico publicado en 2014

A document processing pipeline for annotating chemical entities in scientific documents

artículo científico publicado en 2015

A machine learning methodology for medical imaging anonymization

artículo científico publicado en 2015

A modular framework for biomedical concept recognition

artículo científico publicado en 2013

An Overview of Biomolecular Event Extraction from Scientific Documents

artículo científico publicado en 2015

An integrative approach for codon repeats evolutionary analyses

artículo científico publicado en 2012

Analysing Relevant Diseases from Iberian Tweets

artículo científico publicado en 2013

Ann2RDF

artículo científico publicado en 2015

Automatic filtering and substantiation of drug safety signals

artículo científico publicado en 2012

BeCAS: biomedical concept recognition services and visualization

artículo científico publicado en 2013

BioCreative V BioC track overview: collaborative biocurator assistant task for BioGRID.

artículo científico publicado en 2016

Challenges Storing and Representing Biomedical Data

Challenges and Opportunities for Exploring Patient-Level Data

artículo científico publicado en 2015

Clustering of distinct PACS archives using a cooperative peer-to-peer network ⬇️

artículo científico publicado el 15 de junio de 2012

Codon-triplet context unveils unique features of the Candida albicans protein coding genome

artículo científico publicado en 2007

Computational Discovery of Putative Leads for Drug Repositioning through Drug-Target Interaction Prediction

artículo científico publicado en 2016

Computational methodology for predicting the landscape of the human-microbial interactome region level influence

artículo científico publicado en 2015

Computational prediction of the human-microbial oral interactome

artículo científico publicado en 2014

Concept-based query expansion for retrieving gene related publications from MEDLINE.

artículo científico publicado en 2010

Conserved and highly expressed tRNA derived fragments in zebrafish.

artículo científico publicado en 2015

Correction: Species-Specific Codon Context Rules Unveil Non-Neutrality Effects of Synonymous Mutations

artículo científico publicado en 2015

DICOM relay over the cloud.

artículo científico

Data Integration Solution for Organ-Specific Studies: An Application for Oral Biology

Design, development, exploitation and assessment of a Cardiology Web PACS.

artículo científico publicado en 2008

Dicoogle - an open source peer-to-peer PACS

artículo científico publicado en 2011

Drug-induced acute myocardial infarction: identifying 'prime suspects' from electronic healthcare records-based surveillance system

artículo científico publicado en 2013

Dynamic service integration using web-based workflows

DynamicFlow: A Client-Side Workflow Management System

Egas: a collaborative and interactive document curation platform

artículo científico publicado en 2014

Endomyocardial Biopsy as Risk Factor in the Development of Tricuspid Insufficiency After Heart Transplantation

article

EuGene: maximizing synthetic gene design for heterologous expression.

artículo científico publicado en 2012

Expanding Gene-Based PubMed Queries

artículo científico publicado en 2010

Extracting Sentences Describing Biomolecular Events from the Biomedical Literature

artículo científico publicado en 2014

From protein-protein interactions to rational drug design: are computational methods up to the challenge?

artículo científico publicado en 2013

From the salivary proteome to the OralOme: comprehensive molecular oral biology

artículo científico

Gathering and exploring scientific knowledge in pharmacovigilance

artículo científico publicado en 2013

GeneBrowser 2: an application to explore and identify common biological traits in a set of genes

artículo científico publicado en 2010

General guidelines for biomedical software development.

artículo científico publicado en 2017

Gimli: open source and high-performance biomedical name recognition ⬇️

artículo científico publicado el 15 de febrero de 2013

Handling Noise in Protein Interaction Networks

artículo científico publicado en 2019

Harmonization of gene/protein annotations: towards a gold standard MEDLINE.

artículo científico publicado en 2012

Heart transplantation in arrhythmogenic right ventricular dysplasia: case reports

artículo científico publicado en 2009

Improving Cross Mapping in Biomedical Databases

artículo científico publicado en 2010

Improving Literature Searches in Gene Expression Studies

article

Improving data and knowledge management to better integrate health care and research.

artículo científico publicado en 2013

Improving the accuracy of recombinant protein production through integration of bioinformatics, statistical and mass spectrometry methodologies.

artículo científico publicado en 2015

Indexing and retrieving DICOM data in disperse and unstructured archives

artículo científico publicado en 2008

Integration of Genetic and Medical Information Through a Web Crawler System

Large scale comparative codon-pair context analysis unveils general rules that fine-tune evolution of mRNA primary structure.

artículo científico publicado en 2007

Linked Registries: Connecting Rare Diseases Patient Registries through a Semantic Web Layer.

artículo científico publicado en 2017

Long-Term Pulmonary Vascular Reactivity After Orthotopic Heart Transplantation by the Biatrial Versus the Bicaval Technique

artículo científico publicado en 2011

Mining clinical attributes of genomic variants through assisted literature curation in Egas

artículo científico

Normalizing Heterogeneous Medical Imaging Data to Measure the Impact of Radiation Dose

artículo científico publicado en 2015

Open-Source Electronic Health Record Systems for Low-Resource Settings: Systematic Review.

artículo científico publicado en 2017

OralCard: a bioinformatic tool for the study of oral proteome

artículo científico publicado en 2013

Parallel DNA pyrosequencing unveils new zebrafish microRNAs

artículo científico publicado en 2009

Passive Sensing of Health Outcomes Through Smartphones: Systematic Review of Current Solutions and Possible Limitations

artículo científico publicado en 2019

Patient data discovery platforms as enablers of biomedical and translational research: A systematic review

scientific article published on 25 March 2019

Prioritizing Literature Search Results Using a Training Set of Classified Documents

artículo científico publicado en 2011

Quantitative Characterization of Protein Networks of the Oral Cavity

RecRWR: a recursive random walk method for improved identification of diseases

artículo científico publicado en 2015

Recommendations for use of marginal donors in heart transplantation: Brazilian Association of Organs Transplantation guideline

artículo científico publicado en 2011

Representation learning for mammography mass lesion classification with convolutional neural networks.

artículo científico publicado en 2016

SCALEUS-FD: A FAIR Data Tool for Biomedical Applications

scientific article published on 26 August 2020

SCALEUS: Semantic Web Services Integration for Biomedical Applications

artículo científico

Sensor-based architecture for medical imaging workflow analysis

artículo científico publicado en 2014

Species-specific codon context rules unveil non-neutrality effects of synonymous mutations

artículo científico publicado en 2011

Syntactic Parsing for Bio-molecular Event Detection from Scientific Literature

artículo científico publicado en 2009

TASKA: A modular task management system to support health research studies

artículo científico publicado en 2019

Telecardiology through ubiquitous internet services.

artículo científico

The EU-ADR Web Platform: delivering advanced pharmacovigilance tools

artículo científico publicado en 2012

The landscape of protein biomarkers proposed for periodontal disease: markers with functional meaning

artículo científico publicado en 2014

TrigNER: automatically optimized biomedical event trigger recognition on scientific documents.

artículo científico publicado en 2014

Twitter: a good place to detect health conditions

artículo científico publicado en 2014

Uncovering microbial duality within human microbiomes: A novel algorithm for the analysis of host-pathogen interactions

artículo científico publicado en 2015

WAVe: web analysis of the variome.

artículo científico publicado en 2011

Weighted Gene Co-expression Network Analysis Applied to Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Data

article

XDS-I outsourcing proxy: ensuring confidentiality while preserving interoperability

artículo científico

geneCommittee: a web-based tool for extensively testing the discriminatory power of biologically relevant gene sets in microarray data classification

artículo científico publicado en 2014

mRNA secondary structure optimization using a correlated stem-loop prediction

artículo científico publicado en 2016

mRNA secondary structure optimization using a correlated stem-loop prediction.

artículo científico publicado en 2013

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