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Lista de obras de James L. Manley

A SUMO-dependent interaction between Senataxin and the exosome, disrupted in the neurodegenerative disease AOA2, targets the exosome to sites of transcription-induced DNA damage

artículo científico publicado en 2013

A UV-crosslinkable interaction in human U6 snRNA.

artículo científico publicado en 1998

A complex protein assembly catalyzes polyadenylation of mRNA precursors

artículo científico publicado en 1995

A complex signaling pathway regulates SRp38 phosphorylation and pre-mRNA splicing in response to heat shock

artículo científico publicado en 2007

A human homologue of theEscherichia coliDnaJ heatshock protein ⬇️

artículo científico publicado el 11 de diciembre de 1991

A journey to the end of the message

artículo científico

A negative element in SMN2 exon 7 inhibits splicing in spinal muscular atrophy

scientific article published on 01 August 2003

A nuclear micrococcal-sensitive, ATP-dependent exoribonuclease degrades uncapped but not capped RNA substrates

artículo científico publicado en 1991

A protein factor, ASF, controls cell-specific alternative splicing of SV40 early pre-mRNA in vitro

artículo científico publicado en 1990

A rational nomenclature for serine/arginine-rich protein splicing factors (SR proteins)

artículo científico publicado en 2010

A role for Chk1 in blocking transcriptional elongation of p21 RNA during the S-phase checkpoint

artículo científico publicado en 2009

ALS mutations in TLS/FUS disrupt target gene expression

artículo científico publicado en 2015

ASAP, a novel protein complex involved in RNA processing and apoptosis

artículo científico publicado en 2003

Accurate and specific polyadenylation of mRNA precursors in a soluble whole-cell lysate ⬇️

artículo científico publicado el 1 de junio de 1983

Activation-induced cytidine deaminase (AID)-dependent somatic hypermutation requires a splice isoform of the serine/arginine-rich (SR) protein SRSF1

artículo científico publicado en 2012

Allosteric regulation of even-skipped repression activity by phosphorylation

artículo científico publicado en 1999

Alternative cleavage and polyadenylation: the long and short of it

artículo científico publicado en 2013

Alternative polyadenylation blooms

artículo científico publicado en 2010

Alternative polyadenylation of mRNA precursors.

artículo científico publicado en 2016

Alternative pre-mRNA splicing regulation in cancer: pathways and programs unhinged

artículo científico publicado en 2010

An intronic element contributes to splicing repression in spinal muscular atrophy.

artículo científico publicado en 2007

An unexpected binding mode for a Pol II CTD peptide phosphorylated at Ser7 in the active site of the CTD phosphatase Ssu72

artículo científico publicado en 2012

Autoubiquitination of the BRCA1*BARD1 RING ubiquitin ligase

artículo científico publicado en 2002

BRCA1/BARD1 inhibition of mRNA 3' processing involves targeted degradation of RNA polymerase II.

artículo científico publicado en 2005

Base substitution in an intervening sequence of a beta+-thalassemic human globin gene

artículo científico publicado en 1981

CPSF30 and Wdr33 directly bind to AAUAAA in mammalian mRNA 3' processing

artículo científico publicado en 2014

Cell signalling and the control of pre-mRNA splicing.

artículo científico publicado en 2004

Cell-cycle related regulation of poly(A) polymerase by phosphorylation

artículo científico publicado en 1996

Cell-free synthesis of SU + 3 tyrosyl transfer RNA: characterization of the 4S product

artículo científico publicado en 1973

Chain termination and inhibition of mammalian poly(A) polymerase by modified ATP analogues

artículo científico publicado en 2009

Characterization of the catalytic activity of U2 and U6 snRNAs

artículo científico publicado en 2003

Chromatin binding of SRp20 and ASF/SF2 and dissociation from mitotic chromosomes is modulated by histone H3 serine 10 phosphorylation

artículo científico publicado en 2009

Chromosomal localization of mouse and human genes encoding the splicing factors ASF/SF2 (SFRS1) and SC-35 (SFRS2)

artículo científico publicado en 1995

Concentration-dependent control of pyruvate kinase M mutually exclusive splicing by hnRNP proteins

artículo científico publicado en 2012

Concurrent splicing and transcription are not sufficient to enhance splicing efficiency

artículo científico publicado en 2007

Cooperation between core promoter elements influences transcriptional activity in vivo

artículo científico publicado en 1995

Core promoter elements and TAFs contribute to the diversity of transcriptional activation in vertebrates

artículo científico publicado en 2003

Cotranscriptional processes and their influence on genome stability.

artículo científico publicado en 2006

Crystal structure of murine CstF-77: dimeric association and implications for polyadenylation of mRNA precursors

artículo científico publicado en 2007

Crystal structure of the human symplekin-Ssu72-CTD phosphopeptide complex

artículo científico publicado en 2010

DNA-dependent transcription of adenovirus genes in a soluble whole-cell extract.

artículo científico publicado en 1980

DNA-protein complexes spread on N2-discharged carbon film and characterized by molecular weight and its projected distribution

artículo científico publicado en 1982

Delineating the structural blueprint of the pre-mRNA 3'-end processing machinery

artículo científico publicado en 2014

Determinants of SR protein specificity.

artículo científico publicado en 1999

Disease-associated mutation in SRSF2 misregulates splicing by altering RNA-binding affinities

artículo científico publicado en 2015

Drosophila Pelle phosphorylates Dichaete protein and influences its subcellular distribution in developing oocytes

artículo científico publicado en 2010

Ectopic expression of the Drosophila tramtrack gene results in multiple embryonic defects, including repression of even-skipped and fushi tarazu

artículo científico publicado en 1992

Evidence that polyadenylation factor CPSF-73 is the mRNA 3' processing endonuclease.

artículo científico publicado en 2004

Evolutionarily conserved interaction between CstF-64 and PC4 links transcription, polyadenylation, and termination

artículo científico publicado en 2001

Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing repression ⬇️

artículo científico publicado el 16 de julio de 2013

From transcription to mRNA: PAF provides a new path.

artículo científico publicado en 2005

Function and control of RNA polymerase II C-terminal domain phosphorylation in vertebrate transcription and RNA processing

artículo científico publicado en 2014

Generation and functional analyses for base-substitution mutants of the adenovirus 2 major late promoter.

artículo científico publicado en 1984

Heat shock-induced SRSF10 dephosphorylation displays thermotolerance mediated by Hsp27.

artículo científico publicado en 2010

Heterozygous disruption of the TATA-binding protein gene in DT40 cells causes reduced cdc25B phosphatase expression and delayed mitosis.

artículo científico publicado en 2001

HnRNP proteins controlled by c-Myc deregulate pyruvate kinase mRNA splicing in cancer

artículo científico publicado en 2009

How bidirectional becomes unidirectional

artículo científico publicado en 2013

Hsp27 enhances recovery of splicing as well as rephosphorylation of SRp38 after heat shock.

artículo científico publicado en 2005

Human Tra2 Proteins Are Sequence-Specific Activators of Pre-mRNA Splicing ⬇️

artículo científico publicado el 3 de abril de 1998

Human capping enzyme promotes formation of transcriptional R loops in vitro

artículo científico publicado en 2007

Identification and functional characterization of neo-poly(A) polymerase, an RNA processing enzyme overexpressed in human tumors

artículo científico publicado en 2001

Identification of an snRNP-associated kinase activity that phosphorylates arginine/serine rich domains typical of splicing factors

artículo científico publicado en 1993

In vitro analysis of transcriptional activators and polyadenylation

artículo científico publicado en 2014

In vitro splicing of simian virus 40 early pre mRNA.

artículo científico publicado en 1986

In vitro sumoylation of recombinant proteins and subsequent purification for use in enzymatic assays

artículo científico publicado en 2009

In vitro transcription: whole-cell extract

artículo científico publicado en 1983

Inactivation of the SR protein splicing factor ASF/SF2 results in genomic instability

artículo científico publicado en 2005

Inhibition of poly(A) polymerase requires p34cdc2/cyclin B phosphorylation of multiple consensus and non-consensus sites

artículo científico publicado en 1998

Intrinsic metal binding by a spliceosomal RNA

artículo científico publicado en 2002

Kub5-Hera, the human Rtt103 homolog, plays dual functional roles in transcription termination and DNA repair.

artículo científico publicado en 2014

Loss of splicing factor ASF/SF2 induces G2 cell cycle arrest and apoptosis, but inhibits internucleosomal DNA fragmentation

artículo científico publicado en 2005

Mdm2 and MdmX as Regulators of Gene Expression ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 2012

MdmX is required for p53 interaction with and full induction of the Mdm2 promoter after cellular stress

artículo científico publicado en 2012

Mechanisms and consequences of alternative polyadenylation

artículo científico publicado en 2011

Messenger RNA polyadenylylation: a universal modification

artículo científico publicado en 1995

Misregulation of pre-mRNA alternative splicing in cancer

artículo científico publicado en 2013

Molecular architecture of the human pre-mRNA 3' processing complex

artículo científico publicado en 2009

Multiple properties of the splicing repressor SRp38 distinguish it from typical SR proteins.

artículo científico publicado en 2005

Mutant p53 cooperates with the SWI/SNF chromatin remodeling complex to regulate VEGFR2 in breast cancer cells

artículo científico publicado en 2015

New links between mRNA polyadenylation and diverse nuclear pathways

artículo científico publicado en 2014

Nuclear coupling: RNA processing reaches back to transcription

artículo científico publicado en 2002

Nucleotide binding by the Mdm2 RING domain facilitates Arf-independent Mdm2 nucleolar localization

artículo científico publicado en 2003

PARP1 represses PAP and inhibits polyadenylation during heat shock

artículo científico publicado en 2012

PP1/PP2A phosphatases are required for the second step of Pre-mRNA splicing and target specific snRNP proteins

artículo científico publicado en 2006

Phosphorylation switches the general splicing repressor SRp38 to a sequence-specific activator.

artículo científico publicado en 2008

Phosphorylation-dephosphorylation differentially affects activities of splicing factor ASF/SF2 ⬇️

artículo científico publicado el 2 de noviembre de 1998

Physical and functional interactions between Drosophila TRAF2 and Pelle kinase contribute to Dorsal activation.

scientific article published on 10 July 2001

Pin1 modulates RNA polymerase II activity during the transcription cycle

artículo científico publicado en 2007

Pin1 modulates the structure and function of human RNA polymerase II.

artículo científico publicado en 2003

Poly(A) polymerase phosphorylation is dependent on novel interactions with cyclins

artículo científico publicado en 2000

Polyadenylation of mRNA precursors

artículo científico publicado en 1988

Polyoma virus small tumor antigen pre-mRNA splicing requires cooperation between two 3' splice sites

artículo científico publicado en 1990

Protein-free spliceosomal snRNAs catalyze a reaction that resembles the first step of splicing

artículo científico publicado en 2007

R Loops and Links to Human Disease

artículo científico publicado en 2016

RBBP6 isoforms regulate the human polyadenylation machinery and modulate expression of mRNAs with AU-rich 3' UTRs

artículo científico publicado en 2014

RNA polymerase II is an essential mRNA polyadenylation factor ⬇️

artículo científico publicado el 3 de septiembre de 1998

RNA polymerase II terminates transcription in vitro in the SV40 origin region

artículo científico publicado en 1987

RNA splicing. Question of commitment

artículo científico publicado en 1993

RNA synthesis in isolated nuclei: identification and comparison of adenovirus 2 encoded transcripts synthesized in vitro and vivo

scientific article published on 01 November 1979

RNAP II CTD phosphorylated on threonine-4 is required for histone mRNA 3' end processing

artículo científico publicado en 2011

RNAP II CTD tyrosine 1 performs diverse functions in vertebrate cells.

artículo científico publicado en 2014

Recognition of trimethylated histone H3 lysine 4 facilitates the recruitment of transcription postinitiation factors and pre-mRNA splicing

artículo científico publicado en 2007

Regulation and substrate specificity of the SR protein kinase Clk/Sty

artículo científico publicado en 2003

Regulation of adenovirus mRNA synthesis

artículo científico publicado en 1980

Regulation of plant developmental processes by a novel splicing factor

artículo científico publicado en 2007

Regulation of pre-mRNA splicing in metazoa

artículo científico publicado en 1997

Repression of simian virus 40 early transcription by viral DNA replication in human 293 cells

artículo científico publicado en 1985

Requirements of the RNA polymerase II C-terminal domain for reconstituting pre-mRNA 3' cleavage.

artículo científico publicado en 2002

Rna synthesis in isolated nuclei processing of adenovirus serotype 2 late messenger rna precursors

artículo científico publicado en 1982

Roles of Sumoylation in mRNA Processing and Metabolism

artículo científico publicado en 2017

SELEX to identify protein-binding sites on RNA.

artículo científico publicado en 2013

SRSF10 Connects DNA Damage to the Alternative Splicing of Transcripts Encoding Apoptosis, Cell-Cycle Control, and DNA Repair Factors

artículo científico publicado en 2016

SUMO functions in constitutive transcription and during activation of inducible genes in yeast.

artículo científico publicado en 2010

SUMOylation Is an Inhibitory Constraint that Regulates the Prion-like Aggregation and Activity of CPEB3

scientific journal article

SV40 T-antigen-binding sites within the 5'-flanking regions of human U1 and U2 genes

artículo científico publicado en 1991

Separation and characterization of a poly(A) polymerase and a cleavage/specificity factor required for pre-mRNA polyadenylation

scientific article published on 01 March 1988

Splicing of SV40 early pre-mRNA to large T and small t mRNAs utilizes different patterns of lariat branch sites

scientific article published on 01 July 1987

Splicing of mRNA precursors: the role of RNAs and proteins in catalysis

artículo científico publicado en 2009

Splicing pathways of SV40 mRNAs in X. laevis oocytes differ in their requirements for snRNPs

artículo científico publicado en 1984

Splicing-related catalysis by protein-free snRNAs

artículo científico publicado en 2001

Stability of a PKCI-1-related mRNA is controlled by the splicing factor ASF/SF2: a novel function for SR proteins

artículo científico publicado en 2002

Structural and biochemical studies of the 5′→3′ exoribonuclease Xrn1

artículo científico publicado en 2011

Structural basis for dimerization and activity of human PAPD1, a noncanonical poly(A) polymerase

artículo científico publicado en 2011

Structural basis for signal transduction by the Toll/interleukin-1 receptor domains

artículo científico publicado en 2000

Structure and function of the 5′→3′ exoribonuclease Rat1 and its activating partner Rai1

artículo científico publicado en 2009

Structure and function of the S1 nuclease-sensitive site in the adenovirus late promoter

artículo científico publicado en 1986

Sub1 functions in osmoregulation and in transcription by both RNA polymerases II and III

artículo científico publicado en 2009

Sub1 globally regulates RNA polymerase II C-terminal domain phosphorylation.

artículo científico publicado en 2010

Sumoylation controls the timing of Tup1-mediated transcriptional deactivation.

artículo científico publicado en 2015

Sumoylation modulates the assembly and activity of the pre-mRNA 3' processing complex

artículo científico publicado en 2007

Sumoylation of transcription factor Gcn4 facilitates its Srb10-mediated clearance from promoters in yeast

artículo científico publicado en 2012

Sumoylation regulates multiple aspects of mammalian poly(A) polymerase function

artículo científico publicado en 2008

Suppression of amber mutants in vitro induced by low temperature

artículo científico publicado en 1978

Synthesis and degradation of termination and premature-termination fragments of β-galactosidase in vitro and in vivo ⬇️

artículo científico publicado el 15 de noviembre de 1978

Synthesis in vitro of an exceptionally long RNA transcript promoted by an AluI sequence

scientific article published on 01 November 1982

Synthesis of internal re-initiation fragments of β-galactosidase in vitro and in vivo ⬇️

artículo científico publicado el 15 de noviembre de 1978

Systematic profiling of poly(A)+ transcripts modulated by core 3' end processing and splicing factors reveals regulatory rules of alternative cleavage and polyadenylation

artículo científico publicado en 2015

TLS inhibits RNA polymerase III transcription

artículo científico publicado en 2010

TLS/FUS (translocated in liposarcoma/fused in sarcoma) regulates target gene transcription via single-stranded DNA response elements ⬇️

artículo científico publicado el 29 de marzo de 2012

TLS/FUS: a protein in cancer and ALS.

artículo científico publicado en 2012

Target specificity among canonical nuclear poly(A) polymerases in plants modulates organ growth and pathogen response ⬇️

artículo científico publicado el 5 de agosto de 2013

Tehao functions in the Toll pathway in Drosophila melanogaster: possible roles in development and innate immunity

artículo científico publicado en 2001

The C-terminal domain of RNA polymerase II functions as a phosphorylation-dependent splicing activator in a heterologous protein

artículo científico publicado en 2005

The C9ORF72 GGGGCC expansion forms RNA G-quadruplex inclusions and sequesters hnRNP H to disrupt splicing in ALS brains.

artículo científico publicado en 2016

The RNA binding protein RNPS1 alleviates ASF/SF2 depletion-induced genomic instability

artículo científico publicado en 2007

The RNA polymerase II C-terminal domain promotes splicing activation through recruitment of a U2AF65-Prp19 complex

artículo científico publicado en 2011

The RNA polymerase II CTD coordinates transcription and RNA processing.

artículo científico publicado en 2012

The SR protein SRp38 represses splicing in M phase cells

artículo científico publicado en 2002

The end of the message--another link between yeast and mammals.

artículo científico publicado en 1996

The ends of the affair: capping and polyadenylation.

artículo científico publicado en 2000

The graded distribution of the dorsal morphogen is initiated by selective nuclear transport in Drosophila

artículo científico publicado en 1989

The human papillomavirus type 16 negative regulatory RNA element interacts with three proteins that act at different posttranscriptional levels.

artículo científico publicado en 2000

The mammalian RNA polymerase II C-terminal domain interacts with RNA to suppress transcription-coupled 3' end formation

artículo científico publicado en 2005

The multifunctional protein p54nrb/PSF recruits the exonuclease XRN2 to facilitate pre-mRNA 3' processing and transcription termination

artículo científico publicado en 2007

The polyadenylation factor CstF-64 regulates alternative processing of IgM heavy chain pre-mRNA during B cell differentiation

artículo científico publicado en 1996

The prolyl isomerase Pin1 functions in mitotic chromosome condensation

artículo científico publicado en 2007

The search for alternative splicing regulators: new approaches offer a path to a splicing code

artículo científico publicado en 2008

The splicing regulator Sam68 binds to a novel exonic splicing silencer and functions in SMN2 alternative splicing in spinal muscular atrophy

artículo científico publicado en 2010

The transcriptional coactivator PC4/Sub1 has multiple functions in RNA polymerase II transcription.

artículo científico publicado en 2005

The use of simple model systems to study spliceosomal catalysis

artículo científico publicado en 2008

The yeast regulator of transcription protein Rtr1 lacks an active site and phosphatase activity ⬇️

artículo científico publicado el 10 de julio de 2012

Threonine-4 of the budding yeast RNAP II CTD couples transcription with Htz1-mediated chromatin remodeling.

artículo científico publicado en 2014

Transcription of methylated eukaryotic viral genes in a solublein vitrosystem ⬇️

artículo científico publicado el 11 de junio de 1984

Transcription termination by nuclear RNA polymerases

artículo científico publicado en 2009

Transcriptional activators enhance polyadenylation of mRNA precursors.

artículo científico publicado en 2011

Transcriptional regulators of Drosophila embryogenesis.

artículo científico publicado en 1992

Transcriptional repression by p53 involves molecular interactions distinct from those with the TATA box binding protein

artículo científico publicado en 1996

Transcriptional repression of eukaryotic promoters

artículo científico publicado en 1989

Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reveals position-dependent splicing modulation

scientific article published on 17 January 2014

Tumor metabolism: hnRNP proteins get in on the act

artículo científico publicado en 2010

Turning on a fuel switch of cancer: hnRNP proteins regulate alternative splicing of pyruvate kinase mRNA.

artículo científico publicado en 2010

U1 snRNP-ASF/SF2 interaction and 5' splice site recognition: characterization of required elements.

artículo científico publicado en 1995

Unexpected similarities between C9ORF72 and sporadic forms of ALS/FTD suggest a common disease mechanism

artículo científico publicado en 2018

Variations in intracellular levels of TATA binding protein can affect specific genes by different mechanisms.

artículo científico publicado en 2007

Why Is p53 Acetylated? ⬇️

artículo científico publicado el 28 de diciembre de 2001

XRN2 Links Transcription Termination to DNA Damage and Replication Stress

artículo científico publicado en 2016

cFLIP expression is altered in severe corticosteroid-resistant asthma

artículo científico publicado en 2014

hnRNP A1 functions with specificity in repression of SMN2 exon 7 splicing

artículo científico publicado en 2007

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