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Lista de obras de Tudor I Oprea

2D QSAR and similarity studies on cruzain inhibitors aimed at improving selectivity over cathepsin L.

artículo científico publicado en 2007

A Novel Pharmacologic Activity of Ketorolac for Therapeutic Benefit in Ovarian Cancer Patients

artículo científico publicado en 2015

A Scaffold-Tree-Merging Strategy for Prospective Bioactivity Annotation of γ-Pyrones

artículo científico publicado en 2010

A Selective Ligand for Estrogen Receptor Proteins Discriminates Rapid and Genomic Signaling

scientific article published on 06 November 2019

A Workflow of Integrated Resources to Catalyze Network Pharmacology Driven COVID-19 Research

artículo científico publicado en 2020

A chemogenomic analysis of ionization constants--implications for drug discovery

artículo científico publicado en 2013

A competitive nucleotide binding inhibitor: in vitro characterization of Rab7 GTPase inhibition

artículo científico publicado en 2012

A comprehensive map of molecular drug targets.

artículo científico publicado en 2016

A critical overview of computational approaches employed for COVID-19 drug discovery

publication published on 02 July 2021

A crowdsourcing evaluation of the NIH chemical probes

artículo científico publicado en 2009

A non-peptide receptor inhibitor with selectivity for one of the neutrophil formyl peptide receptors, FPR 1.

artículo científico publicado en 2012

A novel approach for predicting P-glycoprotein (ABCB1) inhibition using molecular interaction fields

artículo científico publicado en 2011

A novel flow cytometric HTS assay reveals functional modulators of ATP binding cassette transporter ABCB6

artículo científico publicado en 2012

A novel receptor cross-talk between the ATP receptor P2Y2 and formyl peptide receptors reactivates desensitized neutrophils to produce superoxide

artículo científico publicado en 2014

A pepducin designed to modulate P2Y2R function interacts with FPR2 in human neutrophils and transfers ATP to an NADPH-oxidase-activating ligand through a receptor cross-talk mechanism

artículo científico publicado en 2016

A selective ATP-binding cassette subfamily G member 2 efflux inhibitor revealed via high-throughput flow cytometry

artículo científico publicado en 2012

A systems chemical biology study of malate synthase and isocitrate lyase inhibition in Mycobacterium tuberculosis during active and NRP growth

artículo científico publicado en 2013

Activation of Rho Family GTPases by Small Molecules.

artículo científico publicado en 2018

Activation of dioxin response element (DRE)-associated genes by benzo(a)pyrene 3,6-quinone and benzo(a)pyrene 1,6-quinone in MCF-10A human mammary epithelial cells

artículo científico publicado en 2007

Advancing Biological Understanding and Therapeutics Discovery with Small-Molecule Probes

artículo científico publicado en 2015

An Overview of the Challenges in Designing, Integrating, and Delivering BARD: A Public Chemical-Biology Resource and Query Portal for Multiple Organizations, Locations, and Disciplines

artículo científico publicado en 2014

An automated PLS search for biologically relevant QSAR descriptors

artículo científico publicado en 2004

An automated high-throughput cell-based multiplexed flow cytometry assay to identify novel compounds to target Candida albicans virulence-related proteins

artículo científico publicado en 2014

Antibacterial activity of pepducins, allosterical modulators of formyl peptide receptor signaling

artículo científico publicado en 2014

Artificial intelligence, drug repurposing and peer review

scientific article published on 14 September 2020

Associating Drugs, Targets and Clinical Outcomes into an Integrated Network Affords a New Platform for Computer-Aided Drug Repurposing.

artículo científico publicado en 2011

BDDCS applied to over 900 drugs

artículo científico publicado en 2011

BDDCS class prediction for new molecular entities

artículo científico publicado en 2012

BDDCS, the Rule of 5 and drugability

artículo científico publicado en 2016

Badapple: promiscuity patterns from noisy evidence

artículo científico publicado en 2016

Bioactivity-guided mapping and navigation of chemical space.

artículo científico publicado en 2009

Biomolecular screening of formylpeptide receptor ligands with a sensitive, quantitative, high-throughput flow cytometry platform

Black Swans and white tablets

article

Bradycardic effects mediated by activation of G protein-coupled estrogen receptor in rat nucleus ambiguus

artículo científico publicado en 2012

CFP-10 from Mycobacterium tuberculosis selectively activates human neutrophils through a pertussis toxin-sensitive chemotactic receptor

artículo científico publicado en 2014

CHEMICAL AND BIOLOGICAL DESCRIPTOR INTEGRATION IMPROVES COMPUTATIONAL MODELING OF IN VIVO RAT TOXICITY.

artículo científico publicado en 2015

COVIDomic: A multi-modal cloud-based platform for identification of risk factors associated with COVID-19 severity

artículo científico publicado en 2021

Can BDDCS illuminate targets in drug design?

scientific article published on 01 October 2019

Chapter 2. Drug-Like Physicochemical Properties

Chapter 8. Early ADME/T Predictions: Toy or Tool?

Characterization of a Cdc42 protein inhibitor and its use as a molecular probe

artículo científico publicado en 2013

Characterization of a Cdc42 protein inhibitor and its use as a molecular probe.

artículo científico publicado en 2014

ChemProt-2.0: visual navigation in a disease chemical biology database

artículo científico publicado en 2012

ChemProt-3.0: a global chemical biology diseases mapping

artículo científico publicado en 2016

ChemProt: a disease chemical biology database

artículo científico publicado en 2011

Chemical database preparation for compound acquisition or virtual screening

artículo científico publicado en 2006

Chemical information management in drug discovery: optimizing the computational and combinatorial chemistry interfaces.

artículo científico publicado en 2000

Chemical space navigation in lead discovery

artículo científico publicado en 2002

Cheminformatics and drug discovery

Cheminformatics: a tool for decision-makers in drug discovery.

artículo científico publicado en 2001

Chemography: the art of navigating in chemical space.

artículo científico publicado en 2001

Chemoinformatics and the Quest for Leads in Drug Discovery

Chemoinformatics in Lead Discovery

Chronic obstructive pulmonary disease phenotypes using cluster analysis of electronic medical records.

artículo científico publicado en 2016

Comparison of 71 bipolar disorder pharmacotherapies for kidney disorder risk: The potential hazards of polypharmacy

scientific article published on 08 April 2019

Compound Collection Preparation for Virtual Screening ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Computational and Practical Aspects of Drug Repositioning

artículo científico publicado en 2015

Computational systems chemical biology

artículo científico publicado en 2011

Conformational mAb as a tool for integrin ligand discovery

artículo científico publicado en 2009

Correction: QSAR without borders

scientific article published on 22 May 2020

Cross-pharmacology analysis of G protein-coupled receptors

artículo científico publicado en 2011

Current trends in lead discovery: are we looking for the appropriate properties?

artículo científico publicado en 2002

Current trends in lead discovery: are we looking for the appropriate properties?

artículo científico publicado en 2002

Deciphering the Plasma Proteome of Type 2 Diabetes

scientific article published on 14 September 2020

Defining the microbial effluxome in the content of the host-microbiome interaction

artículo científico publicado en 2015

Descriptor collision and confusion: toward the design of descriptors to mask chemical structures

artículo científico publicado en 2005

Detection of intracellular granularity induction in prostate cancer cell lines by small molecules using the HyperCyt high-throughput flow cytometry system

artículo científico publicado en 2009

Diabetes mellitus risk for 102 drugs and drug combinations used in patients with bipolar disorder

artículo científico publicado en 2019

Discovery of a novel selective PPARγ ligand with partial agonist binding properties by integrated in silico/in vitro work flow.

artículo científico publicado en 2013

Discovery of a specific inhibitor of human GLUT5 by virtual screening and in vitro transport evaluation

artículo científico publicado en 2016

Discovery of selective probes and antagonists for G-protein-coupled receptors FPR/FPRL1 and GPR30

artículo científico publicado en 2009

Diseases 2.0: a weekly updated database of disease–gene associations from text mining and data integration

artículo científico publicado en 2022

Dissociation of I domain and global conformational changes in LFA-1: refinement of small molecule-I domain structure-activity relationships

artículo científico publicado en 2005

Distant collaboration in drug discovery: the LINK3D project

artículo científico publicado en 2002

Distribution and characterization of estrogen receptor G protein-coupled receptor 30 in the rat central nervous system

artículo científico publicado en 2007

Drug Repurposing from an Academic Perspective

artículo científico publicado en 2011

Drug Repurposing: Far Beyond New Targets for Old Drugs ⬇️

artículo científico publicado el 24 de julio de 2012

Drug target ontology to classify and integrate drug discovery data

artículo científico publicado en 2017

DrugCentral 2018: an update

artículo científico publicado en 2019

DrugCentral 2021 supports drug discovery and repositioning

artículo científico publicado en 2020

DrugCentral: online drug compendium

artículo científico publicado en 2016

Duplex high-throughput flow cytometry screen identifies two novel formylpeptide receptor family probes

artículo científico publicado en 2009

Efficient calculation of molecular properties from simulation using kernel molecular dynamics.

artículo científico publicado en 2008

Emerging trends in the discovery of natural product antibacterials

artículo científico

Erratum to: Impact of similarity threshold on the topology of molecular similarity networks and clustering outcomes

artículo científico publicado en 2016

Erratum: A crowdsourcing evaluation of the NIH chemical probes

article

Erratum: Corrigendum: Interactive exploration of chemical space with Scaffold Hunter

scholarly article published in Nature Chemical Biology

Estimation of Maximum Recommended Therapeutic Dose Using Predicted Promiscuity and Potency

artículo científico publicado en 2016

Estrogen rapidly modulates 5-hydroxytrytophan-induced visceral hypersensitivity via GPR30 in rats

artículo científico publicado en 2009

Estrogen signaling through the transmembrane G protein-coupled receptor GPR30.

artículo científico publicado en 2008

Exemestane's 17-hydroxylated metabolite exerts biological effects as an androgen

artículo científico publicado en 2007

Exploring the dark genome: implications for precision medicine

scientific article published on 04 July 2019

Expression of estrogen receptor GPR30 in the rat spinal cord and in autonomic and sensory ganglia

artículo científico publicado en 2009

FRET detection of lymphocyte function-associated antigen-1 conformational extension.

artículo científico publicado en 2014

Far away from the lamppost

artículo científico publicado en 2018

Fitting the complexity of GPCRs modulation into simple hypotheses of ligand design

artículo científico publicado en 2012

Flow cytometry for high-throughput, high-content screening

artículo científico publicado en 2004

Fluorescent substrates for flow cytometric evaluation of efflux inhibition in ABCB1, ABCC1, and ABCG2 transporters

artículo científico publicado en 2013

Formalizing drug indications on the road to therapeutic intent.

artículo científico publicado en 2017

G protein-coupled estrogen receptor 1-mediated effects in the rat myometrium

artículo científico publicado en 2011

G protein-coupled receptor 30 (GPR30) mediates gene expression changes and growth response to 17beta-estradiol and selective GPR30 ligand G-1 in ovarian cancer cells

artículo científico publicado en 2007

GPR30: a novel therapeutic target in estrogen-related disease

artículo científico publicado en 2008

Glossary of terms used in computational drug design, part II (IUPAC Recommendations 2015)

artículo científico publicado en 2016

High-Throughput Flow Cytometry

High-Throughput Flow Cytometry Screening of Multidrug Efflux Systems.

artículo científico publicado en 2018

High-throughput flow cytometry for drug discovery

artículo científico publicado en 2007

High-throughput flow cytometry to detect selective inhibitors of ABCB1, ABCC1, and ABCG2 transporters

artículo científico publicado en 2008

High-throughput multiplex flow cytometry screening for botulinum neurotoxin type a light chain protease inhibitors

artículo científico publicado en 2010

High-throughput screen for the chemical inhibitors of antiapoptotic bcl-2 family proteins by multiplex flow cytometry

artículo científico publicado en 2011

High-throughput screening for daunorubicin-mediated drug resistance identifies mometasone furoate as a novel ABCB1-reversal agent

artículo científico publicado en 2008

High-throughput screening with HyperCyt flow cytometry to detect small molecule formylpeptide receptor ligands

artículo científico publicado en 2005

Highly efficient synthesis and characterization of the GPR30-selective agonist G-1 and related tetrahydroquinoline analogs

artículo científico publicado en 2010

How many rare diseases are there?

artículo científico publicado en 2020

How to Illuminate the Druggable Genome Using Pharos

artículo científico publicado en 2020

How to Prepare a Compound Collection Prior to Virtual Screening

artículo científico publicado en 2019

Identification of a GPER/GPR30 antagonist with improved estrogen receptor counterselectivity

artículo científico publicado en 2011

Identification of a functional water channel in cytochrome P450 enzymes.

artículo científico publicado en 1997

Impact of similarity threshold on the topology of molecular similarity networks and clustering outcomes

artículo científico publicado en 2016

Improving the prediction of the brain disposition for orally administered drugs using BDDCS.

artículo científico publicado en 2011

In memoriam: Francisc Schneider (1933‐2017)

In silico toxicology protocols

artículo científico publicado en 2018

In vitro differentiation of human mesenchymal stem cells to epithelial lineage

scientific article published on May 2007

In vivo effects of a GPR30 antagonist

artículo científico publicado en 2009

InContext: curation of medical context for drug indications

artículo científico publicado en 2021

Integrating virtual screening in lead discovery

artículo científico publicado en 2004

Integration of virtual and physical screening

Integration of virtual screening with high-throughput flow cytometry to identify novel small molecule formylpeptide receptor antagonists

artículo científico publicado en 2005

Interactive exploration of chemical space with Scaffold Hunter

artículo científico publicado en 2009

Intracellular cannabinoid type 1 (CB1) receptors are activated by anandamide

artículo científico publicado en 2011

Is there a difference between leads and drugs? A historical perspective

artículo científico publicado en 2001

Lead-like, drug-like or "Pub-like": how different are they?

artículo científico publicado en 2007

Leaving us with fond memories, smiles, SMILES and, alas, tears: a tribute to David Weininger, 1952-2016.

artículo científico publicado en 2018

Ligand-based identification of environmental estrogens

artículo científico publicado en 1996

Ligand-based virtual screening by novelty detection with self-organizing maps

artículo científico publicado en 2007

Ligand-directed profiling of organelles with internalizing phage libraries

artículo científico publicado en 2015

Ligand-directed targeting of lymphatic vessels uncovers mechanistic insights in melanoma metastasis

artículo científico publicado en 2015

Linking Pharmacology to Clinical Reports: Cyclobenzaprine and Its Possible Association With Serotonin Syndrome ⬇️

artículo científico publicado el 5 de octubre de 2011

MTD-ADJ: a multiconformational minimal topologic difference for determining bioactive conformers using adjusted biological activities

artículo científico publicado en 1998

MTD-PLS: A PLS-based variant of the MTD method. 2. Mapping ligand-receptor interactions. Enzymatic acetic acid esters hydrolysis

scientific article published on 01 July 2002

MTD-PLS: a PLS variant of the minimal topologic difference method. III. Mapping interactions between estradiol derivatives and the alpha estrogenic receptor.

artículo científico publicado en 2005

MTD-PLS: a PLS-based variant of the MTD method. A 3D-QSAR analysis of receptor affinities for a series of halogenated dibenzoxin and biphenyl derivatives

artículo científico publicado en 2001

Mechanisms of G protein-coupled estrogen receptor-mediated spinal nociception

artículo científico publicado en 2012

Microbial efflux pump inhibition: tactics and strategies

artículo científico publicado en 2011

Model-free drug-likeness from fragments

artículo científico publicado en 2010

Modulation of bitter taste perception by a small molecule hTAS2R antagonist

artículo científico publicado en 2010

Mondo: Unifying diseases for the world, by the world

Next-generation QSAR

artículo científico publicado en 2011

Next-generation therapeutics

Novel Activities of Select NSAID R-Enantiomers against Rac1 and Cdc42 GTPases

artículo científico publicado en 2015

Novel chemical space exploration via natural products

artículo científico publicado en 2009

Novel derivatives of 1,3,4-oxadiazoles are potent mitostatic agents featuring strong microtubule depolymerizing activity in the sea urchin embryo and cell culture assays

artículo científico publicado en 2010

Novel drug targets in 2018

scientific article published on 26 March 2019

Novel drug targets in 2019

scientific article published on 09 April 2020

Obituary: Toshio Fujita, QSAR pioneer.

artículo científico publicado en 2017

Of possible cheminformatics futures

artículo científico publicado en 2011

Off-patent drug repositioning

scientific article published on 02 September 2020

Oncology exploration: charting cancer medicinal chemistry space

artículo científico publicado en 2006

Optimization of CAMD techniques 3. Virtual screening enrichment studies: a help or hindrance in tool selection?

artículo científico publicado en 2008

P2Y2 receptor signaling in neutrophils is regulated from inside by a novel cytoskeleton-dependent mechanism

artículo científico publicado en 2015

Pharmacokinetically based mapping device for chemical space navigation

artículo científico publicado en 2002

Pharos: Collating protein information to shed light on the druggable genome

artículo científico publicado en 2016

Post-high-throughput screening analysis: an empirical compound prioritization scheme

artículo científico publicado en 2005

Profiling a Selective Probe for RTG Branch of Yeast TORC1 Signaling Pathway

artículo científico publicado en 2013

Property distribution of drug-related chemical databases.

artículo científico publicado en 2000

Protein biomarker druggability profiling.

artículo científico publicado en 2017

Proteomic analysis defines kinase taxonomies specific for subtypes of breast cancer.

artículo científico publicado en 2018

Publisher Correction: Therapies for rare diseases: therapeutic modalities, progress and challenges ahead

scientific article published on 01 April 2020

Pursuing the leadlikeness concept in pharmaceutical research.

artículo científico publicado en 2004

QSAR modeling of the blood-brain barrier permeability for diverse organic compounds

artículo científico publicado en 2008

QSAR without borders

artículo científico publicado en 2020

Quantifying the relationships among drug classes

artículo científico publicado en 2008

REDIAL-2020: A Suite of Machine Learning Models to Estimate Anti-SARS-CoV-2 Activities

artículo científico publicado en 2020

Rapid Estimation of Hydrophobicity for Virtual Combinatorial Library Analysis ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2001

Rapid evaluation of synthetic and molecular complexity for in silico chemistry

artículo científico publicado en 2005

Scaffold topologies. 1. Exhaustive enumeration up to eight rings

artículo científico publicado en 2008

Scaffold topologies. 2. Analysis of chemical databases

artículo científico publicado en 2008

Selective Bcl-2 Inhibitor Probes

artículo científico publicado en 2013

Selective Efflux Inhibition of ATP-binding Cassette Sub-family G Member 2

artículo científico publicado en 2013

Small molecule inhibitors of hantavirus infection

artículo científico publicado en 2010

SmartGraph: a network pharmacology investigation platform

scholarly article by Gergely Zahoránszky-Kőhalmi et al published 21 January 2020 in Journal of Cheminformatics

Solid-phase synthesis of libraries generated from a 4-phenyl-2-carboxy-piperazine scaffold.

artículo científico publicado en 2001

Steroid-binding G-protein-coupled receptors: new drug discovery targets for old ligands

artículo científico

Strategies for compound selection

artículo científico publicado en 2004

Supervised learning with word embeddings derived from PubMed captures latent knowledge about protein kinases and cancer

scientific article published on 08 December 2021

Surface descriptors for protein-ligand affinity prediction

artículo científico publicado en 2003

Surrogate data--a secure way to share corporate data

artículo científico publicado en 2005

Systems chemical biology

artículo científico publicado en 2007

TCRD and Pharos 2021: mining the human proteome for disease biology

artículo científico publicado en 2020

TIN-X: target importance and novelty explorer

artículo científico

Targeting the transposase domain of the DNA repair component Metnase to enhance chemotherapy

artículo científico publicado en 2012

Temporal disease trajectories condensed from population-wide registry data covering 6.2 million patients

artículo científico publicado en 2014

The CARLSBAD database: a confederated database of chemical bioactivities

artículo científico publicado en 2013

The Design of Leadlike Combinatorial Libraries

artículo científico publicado en 1999

The G protein-coupled receptor GPR30 inhibits proliferation of estrogen receptor-positive breast cancer cells.

artículo científico publicado en 2010

The University of New Mexico Center for Molecular Discovery

artículo científico publicado en 2014

The human endogenous metabolome as a pharmacology baseline for drug discovery

scientific article published on 19 June 2019

The ins and outs of GPR30: a transmembrane estrogen receptor

artículo científico publicado en 2008

The leukocyte chemotactic receptor FPR2, but not the closely related FPR1, is sensitive to cell-penetrating pepducins with amino acid sequences descending from the third intracellular receptor loop

artículo científico publicado en 2013

The significance of acid/base properties in drug discovery

artículo científico

Therapies for rare diseases: therapeutic modalities, progress and challenges ahead

scientific article published on 13 December 2019

Three small molecule pan activator families of Ras-related GTPases

Three-dimensional QSAR of human immunodeficiency virus (I) protease inhibitors. 1. A CoMFA study employing experimentally-determined alignment rules

artículo científico publicado en 1993

Three-dimensional model of a selective theophylline-binding RNA molecule

artículo científico publicado en 1996

Three-dimensional quantitative structure-activity relationship of human immunodeficiency virus (I) protease inhibitors. 2. Predictive power using limited exploration of alternate binding modes

artículo científico publicado en 1994

Three-dimensional quantitative structure-activity relationships of steroid aromatase inhibitors

artículo científico

Toward minimalistic modeling of oral drug absorption

artículo científico publicado en 1999

Transporter-mediated Efflux Influences CNS Side Effects: ABCB1, from Antitarget to Target

artículo científico publicado en 2010

Understanding drug-likeness

Understanding virulence mechanisms in M. tuberculosis infection via A circuit-based simulation framework

artículo científico publicado en 2008

Unexplored therapeutic opportunities in the human genome

scientific article published on 23 March 2018

Unexplored therapeutic opportunities in the human genome.

artículo científico publicado en 2018

Virtual Screening in Lead Discovery: A Viewpoint

artículo científico publicado en 2002

Virtual and <i>In Vitro</i> Antiviral Screening Revive Therapeutic Drugs for COVID-19

artículo científico publicado en 2020

Virtual and biomolecular screening converge on a selective agonist for GPR30.

artículo científico publicado en 2006

Virtual screening applications: a study of ligand-based methods and different structure representations in four different scenarios

artículo científico publicado en 2007

WOMBAT: World of Molecular Bioactivity

Will Artificial Intelligence for Drug Discovery Impact Clinical Pharmacology?

artículo científico publicado en 2020

hERG classification model based on a combination of support vector machine method and GRIND descriptors

artículo científico publicado en 2008

iPHACE: integrative navigation in pharmacological space

artículo científico publicado en 2010

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