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Lista de obras de Kristof Engelen

1alpha,25-Dihydroxyvitamin D3-induced down-regulation of the checkpoint proteins, Chk1 and Claspin, is mediated by the pocket proteins p107 and p130.

artículo científico publicado en 2006

A Comparative Transcriptome Analysis of Rhizobium etli Bacteroids: Specific Gene Expression During Symbiotic Nongrowth

article

A nonlinear mixed-effects model for estimating calibration intervals for unknown concentrations in two-color microarray data with spike-ins

artículo científico publicado en 2009

Alternative experimental design with an applied normalization scheme can improve statistical power in 2D-DIGE experiments.

artículo científico publicado en 2010

Balancing false positives and false negatives for the detection of differential expression in malignancies.

artículo científico publicado en 2004

CALIB: a Bioconductor package for estimating absolute expression levels from two-color microarray data.

artículo científico publicado en 2007

COLOMBOS v2.0: an ever expanding collection of bacterial expression compendia

artículo científico publicado en 2013

COLOMBOS v3.0: leveraging gene expression compendia for cross-species analyses

artículo científico publicado en 2015

COLOMBOS: Access Port for Cross-Platform Bacterial Expression Compendia ⬇️

artículo científico publicado el 14 de julio de 2011

COMODO: an adaptive coclustering strategy to identify conserved coexpression modules between organisms.

artículo científico publicado en 2010

Canonical and non-canonical EcfG sigma factors control the general stress response in Rhizobium etli

scientific article published on 28 October 2013

Characterization of the condensin component Cnap1 and protein kinase Melk as novel E2F target genes down-regulated by 1,25-dihydroxyvitamin D3.

artículo científico publicado en 2005

Comparative analysis of gene expression: uncovering expression conservation and divergence between Salmonella enterica serovar Typhimurium strains LT2 and 14028S.

artículo científico publicado en 2015

DISTILLER: a data integration framework to reveal condition dependency of complex regulons in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2009

DNA structural properties in the classification of genomic transcription regulation elements

artículo científico

Delineation of the Salmonella enterica serovar Typhimurium HilA regulon through genome-wide location and transcript analysis

artículo científico

Directed module detection in a large-scale expression compendium

artículo científico publicado en 2012

Discovering transcriptional modules from motif, chip-chip and microarray data.

artículo científico publicado en 2005

Draft Genome Sequence of Lysobacter capsici AZ78, a Bacterium Antagonistic to Plant-Pathogenic Oomycetes.

artículo científico publicado en 2014

Evaluation of time profile reconstruction from complex two-color microarray designs

artículo científico publicado en 2008

Evolution of Intra-specific Regulatory Networks in a Multipartite Bacterial Genome

artículo científico publicado en 2015

Expression divergence between Escherichia coli and Salmonella enterica serovar Typhimurium reflects their lifestyles

artículo científico publicado en 2013

Expression profiling to predict the clinical behaviour of ovarian cancer fails independent evaluation

artículo científico publicado en 2008

Genome-wide detection of predicted non-coding RNAs in Rhizobium etli expressed during free-living and host-associated growth using a high-resolution tiling array

artículo científico publicado en 2010

Genome-wide expression analysis reveals TORC1-dependent and -independent functions of Sch9.

artículo científico publicado en 2008

Identifying differentially expressed genes in the absence of replication.

artículo científico publicado en 2013

Inferring the transcriptional network of Bacillus subtilis

scientific article published on 28 July 2009

Inferring transcriptional modules from ChIP-chip, motif and microarray data

artículo científico publicado en 2006

Joint mapping of genes and conditions via multidimensional unfolding analysis

artículo científico publicado en 2007

MAGIC: access portal to a cross-platform gene expression compendium for maize.

artículo científico publicado en 2014

MARAN: normalizing micro-array data ⬇️

artículo científico publicado el 1 de mayo de 2003

Meta Analysis of Gene Expression Data within and Across Species

artículo científico publicado en 2008

Microarray analysis and motif detection reveal new targets of the Salmonella enterica serovar Typhimurium HilA regulatory protein, including hilA itself.

artículo científico publicado en 2005

Microarray analysis of MCF-7 breast cancer cells treated with 1,25-dihydroxyvitamin D3 or a 17-methyl-D-ring analog.

artículo científico publicado en 2009

PKA and Sch9 control a molecular switch important for the proper adaptation to nutrient availability.

artículo científico publicado en 2005

Phenotypical and molecular responses of Arabidopsis thaliana roots as a result of inoculation with the auxin-producing bacterium Azospirillum brasilense

artículo científico publicado en 2013

Predicting the clinical behavior of ovarian cancer from gene expression profiles.

artículo científico publicado en 2006

Query-based biclustering of gene expression data using Probabilistic Relational Models.

artículo científico publicado en 2011

Stress response regulators identified through genome-wide transcriptome analysis of the (p)ppGpp-dependent response in Rhizobium etli

artículo científico publicado en 2011

Structural properties of prokaryotic promoter regions correlate with functional features

artículo científico publicado en 2014

The AI-2-dependent regulator LsrR has a limited regulon in Salmonella Typhimurium

artículo científico publicado en 2010

The Effect of a Sertoli Cell-Selective Knockout of the Androgen Receptor on Testicular Gene Expression in Prepubertal Mice

article

The condition-dependent transcriptional network in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2009

The potential for pathogenicity was present in the ancestor of the Ascomycete subphylum Pezizomycotina

artículo científico publicado en 2010

Transcriptome analysis of the rhizosphere bacterium Azospirillum brasilense reveals an extensive auxin response

artículo científico publicado en 2011

Use of structural DNA properties for the prediction of transcription-factor binding sites in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2010

Using ribosomal protein genes as reference: a tale of caution

artículo científico publicado en 2008

ViTraM: visualization of transcriptional modules

artículo científico publicado en 2009

Whole-genome comparative analysis of virulence genes unveils similarities and differences between endophytes and other symbiotic bacteria

artículo científico publicado en 2015

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