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Lista de obras de Andrew D Smith

A geometric interpretation for local alignment-free sequence comparison

artículo científico publicado en 2013

A transition probability model for amino acid substitutions from blocks

artículo científico publicado en 2003

An integrative genomics approach identifies Hypoxia Inducible Factor-1 (HIF-1)-target genes that form the core response to hypoxia.

scientific article published on 02 June 2009

Analysis of the vertebrate insulator protein CTCF-binding sites in the human genome

artículo científico publicado en 2007

Before It Gets Started: Regulating Translation at the 5' UTR.

artículo científico publicado en 2012

Challenges in Understanding Genome-Wide DNA Methylation

artículo científico publicado en 2010

Computational prediction of novel components of lung transcriptional networks

artículo científico publicado en 2006

DNA motifs in human and mouse proximal promoters predict tissue-specific expression

artículo científico publicado en 2006

DWE: discriminating word enumerator

artículo científico publicado en 2004

De novo DNA demethylation and noncoding transcription define active intergenic regulatory elements.

artículo científico publicado en 2013

Directional DNA methylation changes and complex intermediate states accompany lineage specificity in the adult hematopoietic compartment

artículo científico publicado en 2011

Diverse endonucleolytic cleavage sites in the mammalian transcriptome depend upon microRNAs, Drosha, and additional nucleases

artículo científico publicado en 2010

Empirical Models for Substitution in Ribosomal RNA

artículo científico publicado en 2004

Gene set-based module discovery in the breast cancer transcriptome

artículo científico publicado en 2009

Genome-wide mapping and analysis of active promoters in mouse embryonic stem cells and adult organs

artículo científico publicado en 2007

Genomic analyses of the RNA-binding protein Hu antigen R (HuR) identify a complex network of target genes and novel characteristics of its binding sites

artículo científico publicado en 2011

Genomic analyses reveal broad impact of miR-137 on genes associated with malignant transformation and neuronal differentiation in glioblastoma cells

artículo científico publicado en 2014

Genomic landscape of human allele-specific DNA methylation.

artículo científico publicado en 2012

High definition profiling of mammalian DNA methylation by array capture and single molecule bisulfite sequencing

artículo científico publicado en 2009

Identifying dispersed epigenomic domains from ChIP-Seq data ⬇️

artículo científico publicado el 16 de febrero de 2011

Identifying tissue-selective transcription factor binding sites in vertebrate promoters

artículo científico publicado en 2005

Insights into the role of DNA methylation in diatoms by genome-wide profiling in Phaeodactylum tricornutum

artículo científico publicado en 2013

Integrative bioinformatics analysis of transcriptional regulatory programs in breast cancer cells

artículo científico publicado en 2008

Mining ChIP-chip data for transcription factor and cofactor binding sites

artículo científico publicado en 2005

Molecular hierarchy of mammary differentiation yields refined markers of mammary stem cells.

artículo científico publicado en 2013

Multiple sequence assembly from reads alignable to a common reference genome

artículo científico publicado en 2011

On the complexity of finding common approximate substrings

artículo científico publicado en 2003

RNA-Binding Protein Musashi1 Is a Central Regulator of Adhesion Pathways in Glioblastoma

artículo científico publicado en 2015

Regionally specific and genome-wide analyses conclusively demonstrate the absence of CpG methylation in human mitochondrial DNA.

artículo científico publicado en 2013

SIMPROT: using an empirically determined indel distribution in simulations of protein evolution

artículo científico publicado en 2005

Site identification in high-throughput RNA-protein interaction data

artículo científico publicado en 2012

Sperm methylation profiles reveal features of epigenetic inheritance and evolution in primates

artículo científico publicado en 2011

Statistical significance of cis-regulatory modules

artículo científico publicado en 2007

The RNA-binding protein Musashi1 affects medulloblastoma growth via a network of cancer-related genes and is an indicator of poor prognosis

artículo científico publicado en 2012

The maize methylome influences mRNA splice sites and reveals widespread paramutation-like switches guided by small RNA.

artículo científico publicado en 2013

The oncogenic RNA-binding protein Musashi1 is regulated by tumor suppressor miRNAs

artículo científico publicado en 2011

Tissue-specific regulatory elements in mammalian promoters

artículo científico

Transcription start site evolution in Drosophila.

artículo científico publicado en 2013

Updates to the RMAP short-read mapping software

artículo científico publicado en 2009

Using quality scores and longer reads improves accuracy of Solexa read mapping

artículo científico publicado en 2008

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