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Lista de obras de Mattia Pelizzola

A critical role for lipophosphoglycan in proinflammatory responses of dendritic cells to Leishmania mexicana

artículo científico publicado en 2005

A power law global error model for the identification of differentially expressed genes in microarray data

artículo científico publicado en 2004

A type I IFN-dependent pathway induced by Schistosoma mansoni eggs in mouse myeloid dendritic cells generates an inflammatory signature

artículo científico publicado en 2004

AMDA: an R package for the automated microarray data analysis

artículo científico publicado en 2006

Comparison of sequencing-based methods to profile DNA methylation and identification of monoallelic epigenetic modifications.

artículo científico publicado en 2010

Compensatory RNA polymerase 2 loading determines the efficacy and transcriptional selectivity of JQ1 in Myc-driven tumors.

artículo científico publicado en 2016

Computational and experimental methods to decipher the epigenetic code

artículo científico publicado en 2014

Computational epigenomics: challenges and opportunities

artículo científico publicado en 2015

Computational methods for RNA modification detection from nanopore direct RNA sequencing data

publication published on 24 September 2021

DNA methylation dynamics during embryonic development and postnatal maturation of the mouse auditory sensory epithelium

artículo científico publicado en 2018

DNA methylation variations are required for epithelial-to-mesenchymal transition induced by cancer-associated fibroblasts in prostate cancer cells.

artículo científico publicado en 2017

DOTS-Finder: a comprehensive tool for assessing driver genes in cancer genomes.

artículo científico publicado en 2014

Degradation dynamics of microRNAs revealed by a novel pulse-chase approach.

artículo científico publicado en 2016

Dendritic cells in pathogen recognition and induction of immune responses: a functional genomics approach.

artículo científico publicado en 2006

Distinct epigenomic landscapes of pluripotent and lineage-committed human cells.

artículo científico publicado en 2010

Dynamics of transcriptional regulation from total RNA-seq experiments: Supplemental Figures and Methods

article

Effects of dexamethazone on LPS-induced activationand migration of mouse dendritic cells revealed by a genome-wide transcriptional analysis

artículo científico publicado en 2006

Genome-wide dynamics of RNA synthesis, processing, and degradation without RNA metabolic labeling

scientific article published on 25 September 2020

Genome-wide screen of promoter methylation identifies novel markers in melanoma.

artículo científico publicado en 2009

Germline competency of parthenogenetic embryonic stem cells from immature oocytes of adult mouse ovary

artículo científico publicado en 2011

Global DNA hypomethylation coupled to repressive chromatin domain formation and gene silencing in breast cancer

artículo científico publicado en 2011

Hotspots of aberrant epigenomic reprogramming in human induced pluripotent stem cells

artículo científico publicado en 2011

Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences

artículo científico publicado en 2009

INSPEcT: a computational tool to infer mRNA synthesis, processing and degradation dynamics from RNA- and 4sU-seq time course experiments.

artículo científico publicado en 2015

Integrated Systems for NGS Data Management and Analysis: Open Issues and Available Solutions

artículo científico publicado en 2016

Integrative analysis of RNA polymerase II and transcriptional dynamics upon MYC activation.

artículo científico publicado en 2017

Integrative analysis of epigenetic modulation in melanoma cell response to decitabine: clinical implications

artículo científico publicado en 2009

Integrative classification of human coding and noncoding genes through RNA metabolism profiles

artículo científico publicado en 2016

LowMACA: exploiting protein family analysis for the identification of rare driver mutations in cancer

artículo científico publicado en 2016

MEDME: an experimental and analytical methodology for the estimation of DNA methylation levels based on microarray derived MeDIP-enrichment.

artículo científico publicado en 2008

Macrophages fine tune satellite cell fate in dystrophic skeletal muscle of mdx mice

artículo científico publicado en 2019

Methylated DNA immunoprecipitation genome-wide analysis

artículo científico publicado en 2011

Mycobacterium tuberculosis exploits the formation of new blood vessels for its dissemination

artículo científico publicado en 2016

Ontology-based annotations and semantic relations in large-scale (epi)genomics data

artículo científico publicado en 2016

Ontology-driven integrative analysis of omics data through Onassis

artículo científico publicado en 2020

Patterns of population epigenomic diversity.

artículo científico publicado en 2013

Probing host pathogen cross-talk by transcriptional profiling of both Mycobacterium tuberculosis and infected human dendritic cells and macrophages

artículo científico publicado en 2008

Relationship between genome and epigenome--challenges and requirements for future research

artículo científico publicado en 2014

Selective transcriptional regulation by Myc in cellular growth control and lymphomagenesis.

artículo científico publicado en 2014

Selective transcriptional regulation by Myc: Experimental design and computational analysis of high-throughput sequencing data

artículo científico publicado en 2015

Statistical similarities between transcriptomics and quantitative shotgun proteomics data

artículo científico publicado en 2007

Systematic mapping of occluded genes by cell fusion reveals prevalence and stability of cis-mediated silencing in somatic cells.

artículo científico publicado en 2013

Temporal gene expression profile of the hippocampus following trace fear conditioning

artículo científico publicado en 2009

Temporal transcriptional response to ethylene gas drives growth hormone cross-regulation in Arabidopsis.

artículo científico publicado en 2013

The DNA methylome

artículo científico publicado en 2010

The genopolis microarray database

artículo científico publicado en 2007

Transcription of Mammalian cis-Regulatory Elements Is Restrained by Actively Enforced Early Termination.

artículo científico publicado en 2015

Translation is required for miRNA-dependent decay of endogenous transcripts

scientific article published on 10 December 2020

Widespread dynamic DNA methylation in response to biotic stress ⬇️

artículo científico publicado el 25 de junio de 2012

m6A-Dependent RNA Dynamics in T Cell Differentiation

article

methylPipe and compEpiTools: a suite of R packages for the integrative analysis of epigenomics data

artículo científico publicado en 2015

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