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Lista de obras de Debashish Bhattacharya

A genome-wide investigation of the effect of farming and human-mediated introduction on the ubiquitous seaweed Undaria pinnatifida

artículo científico publicado en 2021

A molecular timeline for the origin of photosynthetic eukaryotes

artículo científico publicado en 2004

A phylogenomic approach for studying plastid endosymbiosis.

artículo científico publicado en 2008

A single origin of the peridinin- and fucoxanthin-containing plastids in dinoflagellates through tertiary endosymbiosis

artículo científico publicado en 2002

A single origin of the photosynthetic organelle in different Paulinella lineages

artículo científico publicado en 2009

A three-gene dinoflagellate phylogeny suggests monophyly of prorocentrales and a basal position for amphidinium and heterocapsa

artículo científico publicado en 2007

ALGAE CONTAINING CHLOROPHYLLS a + c ARE PARAPHYLETIC: MOLECULAR EVOLUTIONARY ANALYSIS OF THE CHROMOPHYTA.

artículo científico publicado en 1992

ANALYSIS OF ALEXANDRIUM TAMARENSE (DINOPHYCEAE) GENES REVEALS THE COMPLEX EVOLUTIONARY HISTORY OF A MICROBIAL EUKARYOTE().

artículo científico publicado en 2012

Active host response to algal symbionts in the sea slug Elysia chlorotica.

artículo científico publicado en 2018

Adaptation through horizontal gene transfer in the cryptoendolithic red alga Galdieria phlegrea.

artículo científico publicado en 2013

Adaptation to Extreme Antarctic Environments Revealed by the Genome of a Sea Ice Green Alga

artículo científico publicado en 2020

Adenosine deamination in human transcripts generates novel microRNA binding sites

artículo científico publicado en 2009

Advances in Fungal Phylogenomics and Their Impact on Fungal Systematics

artículo científico publicado en 2017

Algal Phylogeny and the Origin of Land Plants

artículo científico publicado en 1998

Algal endosymbionts as vectors of horizontal gene transfer in photosynthetic eukaryotes

scientific article published on 19 September 2013

Amoeba genome reveals dominant host contribution to plastid endosymbiosis

scientific article published on 13 August 2020

Analysis of Gambierdiscus transcriptome data supports ancient origins of mixotrophic pathways in dinoflagellates

artículo científico publicado en 2016

Analysis of Porphyra membrane transporters demonstrates gene transfer among photosynthetic eukaryotes and numerous sodium-coupled transport systems

artículo científico publicado en 2012

Analysis of an improved Cyanophora paradoxa genome assembly

scientific article published on 01 August 2019

Analysis of horizontal genetic transfer in red algae in the post-genomics age.

artículo científico publicado en 2013

Analysis of the draft genome of the red seaweed Gracilariopsis chorda provides insights into genome size evolution in Rhodophyta.

artículo científico publicado en 2018

Ancestral germen/soma distinction in microbes: Expanding the disposable soma theory of aging to all unicellular lineages

scientific article published on 05 April 2020

Ancient gene paralogy may mislead inference of plastid phylogeny.

artículo científico publicado en 2012

Ancient recruitment by chromists of green algal genes encoding enzymes for carotenoid biosynthesis

artículo científico publicado en 2008

Applications of next-generation sequencing to unravelling the evolutionary history of algae

artículo científico

As an evolutionary biologist. Debashish Bhattacharya

artículo científico publicado en 2011

Assessing the bacterial contribution to the plastid proteome

artículo científico publicado en 2013

Biochemical diversity of glycosphingolipid biosynthesis as a driver of Coccolithovirus competitive ecology

artículo científico publicado en 2019

Biotic Host-Pathogen Interactions As Major Drivers of Plastid Endosymbiosis

artículo científico publicado en 2017

Biotic interactions as drivers of algal origin and evolution.

artículo científico publicado en 2017

Broadly sampled multigene trees of eukaryotes

artículo científico publicado en 2008

Building consensus around the assessment and interpretation of Symbiodiniaceae diversity

artículo científico publicado en 2023

Chimeric plastid proteome in the Florida "red tide" dinoflagellate Karenia brevis

artículo científico publicado en 2006

Chlamydiae has contributed at least 55 genes to Plantae with predominantly plastid functions

artículo científico publicado en 2008

Chloroplast phylogenomic analyses reveal the deepest-branching lineage of the Chlorophyta, Palmophyllophyceae class. nov

artículo científico publicado en 2016

Cladogramly Dull versus Cladogramly Interesting

artículo científico publicado en 1998

Cloning and characterization of four novel coral acid-rich proteins that precipitate carbonates in vitro

artículo científico publicado en 2013

Commentary: Plastid establishment did not require a chlamydial partner

artículo científico publicado en 2016

Comparative analysis of the complete plastid genome sequence of the red alga Gracilaria tenuistipitata var. liui provides insights into the evolution of rhodoplasts and their relationship to other plastids

artículo científico publicado en 2004

Comparative genomics explains the evolutionary success of reef-forming corals

artículo científico publicado en 2016

Comparison of 15 dinoflagellate genomes reveals extensive sequence and structural divergence in family Symbiodiniaceae and genus Symbiodinium

artículo científico publicado en 2021

Complex phylogeographic patterns in the freshwater alga Synura provide new insights into ubiquity vs. endemism in microbial eukaryotes

artículo científico publicado en 2010

Contemporary minimally invasive approaches to the management of acute cholecystitis: a review and appraisal

artículo científico publicado en 2005

Convergent evolution of polysaccharide debranching defines a common mechanism for starch accumulation in cyanobacteria and plants.

artículo científico publicado en 2013

Core genes in diverse dinoflagellate lineages include a wealth of conserved dark genes with unknown functions

artículo científico publicado en 2018

Correction to: Potential causes and consequences of rapid mitochondrial genome evolution in thermoacidophilic Galdieria (Rhodophyta)

scientific article published on 07 October 2020

Correlation between organelle genetic variation and RNA editing in dinoflagellates associated with the coral Acropora digitifera

artículo científico publicado en 2020

Cyanobacterial contribution to algal nuclear genomes is primarily limited to plastid functions

artículo científico publicado en 2006

Cyanobacterial ribosomal RNA genes with multiple, endonuclease-encoding group I introns

artículo científico publicado en 2007

Cyanophora paradoxa Genome Elucidates Origin of Photosynthesis in Algae and Plants

artículo científico publicado en 2012

Deciphering primordial cyanobacterial genome functions from protein network analysis

artículo científico publicado en 2015

Defining the major lineages of red algae (Rhodophyta)

article

Development of a dinoflagellate-oriented PCR primer set leads to detection of picoplanktonic dinoflagellates from Long Island Sound

artículo científico publicado en 2006

Differential gene retention in plastids of common recent origin.

artículo científico publicado en 2010

Dinoflagellates: a remarkable evolutionary experiment

artículo científico publicado en 2004

Discovery of SCORs: Anciently derived, highly conserved gene-associated repeats in stony corals

artículo científico publicado en 2017

Divergence time estimates and the evolution of major lineages in the florideophyte red algae

artículo científico publicado en 2016

Divergent evolutionary histories of DNA markers in a Hawaiian population of the coral Montipora capitata

artículo científico publicado en 2017

Divergent histories of rDNA group I introns in the lichen family Physciaceae.

artículo científico publicado en 2005

Dozens of toxin-related genes are expressed in a nontoxic strain of the dinoflagellate Heterocapsa circularisquama

artículo científico publicado en 2012

Draft assembly of the Symbiodinium minutum nuclear genome reveals dinoflagellate gene structure.

artículo científico publicado en 2013

ENDOSYMBIOTIC AND HORIZONTAL GENE TRANSFER IN CHROMALVEOLATES(1).

artículo científico publicado en 2008

EST analysis of Ostreococcus lucimarinus, the most compact eukaryotic genome, shows an excess of introns in highly expressed genes

artículo científico publicado en 2008

EVOLUTION. Pathogen to powerhouse

artículo científico publicado en 2016

Electrical impedance as an indicator of microalgal cell health

scientific article published on 27 January 2020

Emergence of Xin demarcates a key innovation in heart evolution

artículo científico publicado en 2008

Endosymbiont or host: who drove mitochondrial and plastid evolution?

artículo científico publicado el 19 de febrero de 2011

Endosymbiotic and horizontal gene transfer in microbial eukaryotes: Impacts on cell evolution and the tree of life

artículo científico publicado en 2012

Establishment of endolithic populations of extremophilic Cyanidiales (Rhodophyta).

artículo científico publicado en 2006

Eukaryotic algal phytochromes span the visible spectrum

scientific article published on 24 February 2014

Evaluating support for the current classification of eukaryotic diversity

artículo científico publicado en 2006

Evidence That Inconsistent Gene Prediction Can Mislead Analysis of Dinoflagellate Genomes

artículo científico publicado en 2020

Evidence for widespread exonic small RNAs in the glaucophyte alga Cyanophora paradoxa

artículo científico publicado en 2013

Evidence of a chimeric genome in the cyanobacterial ancestor of plastids

artículo científico publicado en 2008

Evidence of ancient genome reduction in red algae (Rhodophyta).

artículo científico publicado en 2015

Evolution of Pleopsidium (lichenized Ascomycota) S943 group I introns and the phylogeography of an intron-encoded putative homing endonuclease

artículo científico publicado en 2007

Evolution of a novel function: nutritive milk in the viviparous cockroach, Diploptera punctata

artículo científico publicado en 2004

Evolution of salt tolerance in a laboratory reared population of Chlamydomonas reinhardtii

artículo científico publicado en 2014

Evolution of saxitoxin synthesis in cyanobacteria and dinoflagellates

artículo científico publicado en 2012

Evolutionary Dynamics of Cryptophyte Plastid Genomes

artículo científico

Evolutionary dynamics of the chromatophore genome in three photosynthetic Paulinella species

Evolutionary history of redox metal-binding domains across the tree of life

artículo científico publicado en 2014

Expansion of phycobilisome linker gene families in mesophilic red algae

artículo científico publicado en 2019

Exploring biotic interactions within protist cell populations using network methods

artículo científico publicado en 2014

Expressed sequence tags: normalization and subtraction of cDNA libraries expressed sequence tags\ normalization and subtraction of cDNA libraries

artículo científico publicado en 2009

Extensive horizontal gene transfers between plant pathogenic fungi.

artículo científico publicado en 2016

Foreign gene recruitment to the fatty acid biosynthesis pathway in diatoms.

artículo científico publicado en 2013

Formation of chimeric genes with essential functions at the origin of eukaryotes.

artículo científico publicado en 2018

GENOMIC INSIGHTS INTO EVOLUTIONARY RELATIONSHIPS AMONG HETEROKONT LINEAGES EMPHASIZING THE PHAEOPHYCEAE(1).

artículo científico publicado en 2008

Gene transfers from diverse bacteria compensate for reductive genome evolution in the chromatophore of Paulinella chromatophora

scientific article published on 10 October 2016

Genome Evolution of Coral Reef Symbionts as Intracellular Residents

scientific article published on 10 May 2019

Genome analysis of Elysia chlorotica Egg DNA provides no evidence for horizontal gene transfer into the germ line of this Kleptoplastic Mollusc

artículo científico publicado en 2013

Genome analysis of the rice coral Montipora capitata

Genome of the halotolerant green alga Picochlorum sp. reveals strategies for thriving under fluctuating environmental conditions

artículo científico publicado en 2014

Genome of the red alga Porphyridium purpureum

artículo científico publicado en 2013

Genome wide analysis of the transition to pathogenic lifestyles in Magnaporthales fungi.

artículo científico publicado en 2018

Genomes of the dinoflagellate Polarella glacialis encode tandemly repeated single-exon genes with adaptive functions

scientific article published on 24 May 2020

Genomic Analysis of Picochlorum Species Reveals How Microalgae May Adapt to Variable Environments

scientific article published on 01 November 2018

Genomic footprints of a cryptic plastid endosymbiosis in diatoms

artículo científico publicado en 2009

Glaucophyta

Good to the bone: microbial community thrives within bone cavities of a bison carcass at Yellowstone National Park

artículo científico publicado el 2 de noviembre de 2010

Heterogeneity of intron presence or absence in rDNA genes of the lichen species Physcia aipolia and P. stellaris

artículo científico publicado en 2005

Hidden biodiversity of the extremophilic Cyanidiales red algae

artículo científico publicado en 2004

High phenolics Rutgers Scarlet Lettuce improves glucose metabolism in high fat diet-induced obese mice

artículo científico publicado en 2016

Highly Conserved Mitochondrial Genomes among Multicellular Red Algae of the Florideophyceae

artículo científico publicado en 2015

Horizontal gene transfer in chromalveolates

artículo científico publicado en 2007

Horizontal gene transfer of the algal nuclear gene psbO to the photosynthetic sea slug Elysia chlorotica

artículo científico publicado en 2008

Host origin of plastid solute transporters in the first photosynthetic eukaryotes

artículo científico publicado en 2007

How do endosymbionts become organelles? Understanding early events in plastid evolution

article

Hypothesis: Gene-rich plastid genomes in red algae may be an outcome of nuclear genome reduction

artículo científico publicado en 2017

Identification of a Marine Cyanophage in a Protist Single-cell Metagenome Assembly

artículo científico publicado en 2013

Impact of light intensity and quality on chromatophore and nuclear gene expression in Paulinella chromatophora, an amoeba with nascent photosynthetic organelles

artículo científico publicado en 2017

Improved Cladocopium goreaui Genome Assembly Reveals Features of a Facultative Coral Symbiont and the Complex Evolutionary History of Dinoflagellate Genes

artículo científico publicado en 2022

Infection and the first eukaryotes--Response

artículo científico publicado en 2016

Insights into a dinoflagellate genome through expressed sequence tag analysis

artículo científico publicado en 2005

Insights into the Evolution of Multicellularity from the Sea Lettuce Genome

scientific article published on 13 September 2018

Insights into the red algae and eukaryotic evolution from the genome of Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta)

artículo científico publicado en 2017

Interrelationships of chromalveolates within a broadly sampled tree of photosynthetic protists

artículo científico publicado en 2009

Introducing Trait Networks to Elucidate the Fluidity of Organismal Evolution Using Palaeontological Data

artículo científico publicado en 2019

Kingdom-wide comparison reveals the evolution of diurnal gene expression in Archaeplastida

artículo científico publicado en 2019

Long-term evolution of the S788 fungal nuclear small subunit rRNA group I introns

artículo científico publicado en 2004

Metabolic connectivity as a driver of host and endosymbiont integration

artículo científico publicado en 2015

Metabolic effectors secreted by bacterial pathogens: essential facilitators of plastid endosymbiosis?

scientific article published on 31 January 2013

Migration of the plastid genome to the nucleus in a peridinin dinoflagellate.

artículo científico publicado en 2004

Minimal plastid genome evolution in the Paulinella endosymbiont

scientific article published on 01 September 2006

Mitochondrial and plastid evolution in eukaryotes: an outsiders' perspective

artículo científico publicado en 2009

Mitochondrial and plastid genomes from coralline red algae provide insights into the incongruent evolutionary histories of organelles

artículo científico publicado en 2018

Mitochondrial cob and cox1 genes and editing of the corresponding mRNAs in Dinophysis acuminata from Narragansett Bay, with special reference to the phylogenetic position of the genus Dinophysis

artículo científico publicado en 2007

Molecular characterization of the Calvin cycle enzyme phosphoribulokinase in the stramenopile alga Vaucheria litorea and the plastid hosting mollusc Elysia chlorotica

artículo científico publicado en 2009

Multiple genes of apparent algal origin suggest ciliates may once have been photosynthetic.

artículo científico publicado en 2008

Non-random sharing of Plantae genes

artículo científico publicado en 2011

Origin of saxitoxin biosynthetic genes in cyanobacteria

artículo científico publicado en 2009

PHYLOGENETIC EVIDENCE FOR THE CRYPTOPHYTE ORIGIN OF THE PLASTID OF DINOPHYSIS (DINOPHYSIALES, DINOPHYCEAE)1

article

PULSED-FIELD GEL ELECTROPHORESIS ANALYSIS OF GENOME SIZE AND STRUCTURE IN<i>PAVLOVA GYRANS</i>AND<i>DIACRONEMA</i>SP. (HAPTOPHYTA)<sup>1</sup>

artículo científico publicado en 2007

Parallel evolution of highly conserved plastid genome architecture in red seaweeds and seed plants

artículo científico publicado en 2016

Paulinella, a model for understanding plastid primary endosymbiosis

scientific article published on 14 April 2020

Photosynthetic eukaryotes unite: endosymbiosis connects the dots

artículo científico publicado en 2004

PhySortR: a fast, flexible tool for sorting phylogenetic trees in R.

artículo científico publicado en 2016

PhyloSort: a user-friendly phylogenetic sorting tool and its application to estimating the cyanobacterial contribution to the nuclear genome of Chlamydomonas

artículo científico publicado en 2008

Phylogenetic analyses suggest reverse splicing spread of group I introns in fungal ribosomal DNA.

artículo científico publicado en 2005

Phylogenetic analysis of LSU and SSU rDNA group I introns of lichen photobionts associated with the genera Xanthoria and Xanthomendoza (Teloschistaceae, lichenized Ascomycetes).

artículo científico publicado en 2013

Phylogenetic origins of Lophocereus (Cactaceae) and the senita cactus-senita moth pollination mutualism

artículo científico publicado en 2002

Phylogenomic analysis identifies red algal genes of endosymbiotic origin in the chromalveolates

artículo científico publicado en 2005

Phylogenomic analysis supports the monophyly of cryptophytes and haptophytes and the association of rhizaria with chromalveolates

artículo científico publicado en 2007

Phylogenomic analysis uncovers the evolutionary history of nutrition and infection mode in rice blast fungus and other Magnaporthales

artículo científico publicado en 2015

Phylogeny and self-splicing ability of the plastid tRNA-Leu group I Intron.

artículo científico publicado en 2003

Phylogeny of Calvin cycle enzymes supports Plantae monophyly

scientific article published on 04 March 2007

Phylogeny of nuclear-encoded plastid-targeted proteins supports an early divergence of glaucophytes within Plantae

artículo científico publicado en 2007

Phytoplankton pangenome reveals extensive prokaryotic horizontal gene transfer of diverse functions

artículo científico publicado en 2020

Plastid origin and evolution: new models provide insights into old problems

artículo científico publicado en 2011

Ploidy Variation and Its Implications for Reproduction and Population Dynamics in Two Sympatric Hawaiian Coral Species

artículo científico publicado en 2023

Porphyra (Bangiophyceae) Transcriptomes Provide Insights Into Red Algal Development And Metabolism

artículo científico publicado en 2012

Primary endosymbiosis and the evolution of light and oxygen sensing in photosynthetic eukaryotes

artículo científico publicado en 2014

Propofol compared with general anesthesia for pediatric GI endoscopy: is propofol better?

artículo científico publicado en 2002

Propofol decreases waste anesthetic gas exposure during pediatric bronchoscopy

artículo científico publicado en 2004

Protein networks identify novel symbiogenetic genes resulting from plastid endosymbiosis

artículo científico publicado en 2016

Proteomic analysis of skeletal organic matrix from the stony coral Stylophora pistillata

artículo científico publicado en 2013

Proteomic analysis of the Cyanophora paradoxa muroplast provides clues on early events in plastid endosymbiosis

artículo científico publicado en 2012

Pyropia yezoensis genome reveals diverse mechanisms of carbon acquisition in the intertidal environment

artículo científico publicado en 2020

Recent mobility of plastid encoded group II introns and twintrons in five strains of the unicellular red alga Porphyridium

artículo científico publicado en 2015

Reconstructing the complex evolutionary history of mobile plasmids in red algal genomes

artículo científico publicado en 2016

Red Algal Phylogenomics Provides a Robust Framework for Inferring Evolution of Key Metabolic Pathways

artículo científico publicado en 2016

Red and green algal monophyly and extensive gene sharing found in a rich repertoire of red algal genes

artículo científico publicado en 2011

Red and green algal origin of diatom membrane transporters: insights into environmental adaptation and cell evolution

artículo científico publicado en 2011

Remodeling of intermediate metabolism in the diatom Phaeodactylum tricornutum under nitrogen stress

artículo científico publicado en 2015

Reply to Ramos-Silva et al.: Regarding coral skeletal proteome

artículo científico publicado en 2013

Reshaping Darwin's Tree: Impact of the Symbiome

artículo científico publicado en 2017

Residency evaluation and adherence design study: Young ophthalmologists' perception of their residency programs - Clinical and surgical skills

artículo científico publicado en 2017

Revaluating the evolution of the Toc and Tic protein translocons

scientific article published on 29 November 2008

Rhodophyta

Robust Dinoflagellata phylogeny inferred from public transcriptome databases

artículo científico publicado en 2017

Sea slug kleptoplasty and plastid maintenance in a metazoan

artículo científico publicado en 2011

Sequence similarity network reveals the imprints of major diversification events in the evolution of microbial life

article

Sex in Symbiodiniaceae dinoflagellates: genomic evidence for independent loss of the canonical synaptonemal complex

scientific article published on 17 June 2020

Single cell genome analysis of an uncultured heterotrophic stramenopile.

artículo científico publicado en 2014

Single cell genome analysis supports a link between phagotrophy and primary plastid endosymbiosis.

artículo científico publicado en 2012

Single, ancient origin of a plastid metabolite translocator family in Plantae from an endomembrane-derived ancestor

artículo científico publicado en 2006

Single-cell genomics reveals organismal interactions in uncultivated marine protists.

artículo científico publicado en 2011

Temporal and spatial expression patterns of biomineralization proteins during early development in the stony coral Pocillopora damicornis.

artículo científico publicado en 2016

Terpene Biosynthesis in Red Algae Is Catalyzed by Microbial Type But Not Typical Plant Terpene Synthases

article

Tertiary endosymbiosis driven genome evolution in dinoflagellate algae

artículo científico publicado en 2005

The Algal Revolution

artículo científico publicado en 2017

The American cranberry: first insights into the whole genome of a species adapted to bog habitat

artículo científico publicado en 2014

The Evolution of Homing Endonuclease Genes and Group I Introns in Nuclear rDNA

artículo científico publicado el 31 de octubre de 2003

The Florida red tide dinoflagellate Karenia brevis: New insights into cellular and molecular processes underlying bloom dynamics

artículo científico publicado en 2008

The exon context and distribution of Euascomycetes rRNA spliceosomal introns

artículo científico publicado el 25 de abril de 2003

The first genetic map of the American cranberry: exploration of synteny conservation and quantitative trait loci

artículo científico publicado en 2012

The genomes of polyextremophilic cyanidiales contain 1% horizontally transferred genes with diverse adaptive functions

artículo científico publicado en 2019

The making of a photosynthetic animal.

artículo científico publicado en 2011

The mitochondrial genome of Grateloupia taiwanensis (Halymeniaceae, Rhodophyta) and comparative mitochondrial genomics of red algae

artículo científico publicado en 2014

The natural history of group I introns

artículo científico publicado en 2005

The origin and establishment of the plastid in algae and plants.

artículo científico publicado en 2007

The plastid genome of the red macroalga Grateloupia taiwanensis (Halymeniaceae).

artículo científico publicado en 2013

The single, ancient origin of chromist plastids

artículo científico publicado en 2002

The spread of LAGLIDADG homing endonuclease genes in rDNA.

artículo científico publicado en 2004

The unexpected extremophile: Tolerance to fluctuating salinity in the green alga Picochlorum

Transcriptome analysis provides a blueprint of coral egg and sperm functions

artículo científico publicado en 2020

Transcriptome profiling of a toxic dinoflagellate reveals a gene-rich protist and a potential impact on gene expression due to bacterial presence

artículo científico publicado en 2010

Turtle: identifying frequent k-mers with cache-efficient algorithms

artículo científico publicado en 2014

Unexpected conservation of the RNA splicing apparatus in the highly streamlined genome of Galdieria sulphuraria.

artículo científico publicado en 2018

Unexpected dynamic gene family evolution in algal actins

artículo científico publicado en 2008

Uniting sex and eukaryote origins in an emerging oxygenic world

artículo científico publicado en 2010

Unknown to Known: Advancing Knowledge of Coral Gene Function

scientific article published on 24 December 2019

Using complementary approaches to identify trans-domain nuclear gene transfers in the extremophile Galdieria sulphuraria (Rhodophyta).

artículo científico publicado en 2016

Using natural selection to explore the adaptive potential of Chlamydomonas reinhardtii.

artículo científico publicado en 2014

Vertical evolution and intragenic spread of lichen-fungal group I introns

artículo científico publicado en 2002

Whole-genome duplication in an algal symbiont bolsters coral heat tolerance

artículo científico publicado en 2024

Why we need more algal genomes

artículo científico publicado en 2015