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Lista de obras de James A. Cotton

An expressed, endogenous Nodavirus-like element captured by a retrotransposon in the genome of the plant parasitic nematode Bursaphelenchus xylophilus

artículo científico publicado en 2016

Analytical methods for detecting paralogy in molecular datasets

artículo científico publicado en 2005

Cetaceans on a molecular fast track to ultrasonic hearing

artículo científico publicado en 2010

Characterization and comparative analysis of the complete Haemonchus contortus β-tubulin gene family and implications for benzimidazole resistance in strongylid nematodes.

artículo científico publicado en 2013

Comparative genomics of canine-isolated Leishmania (Leishmania) amazonensis from an endemic focus of visceral leishmaniasis in Governador Valadares, southeastern Brazil.

artículo científico publicado en 2017

Comparative genomics of the apicomplexan parasites Toxoplasma gondii and Neospora caninum: Coccidia differing in host range and transmission strategy

artículo científico publicado en 2012

Convergent sequence evolution between echolocating bats and dolphins.

artículo científico publicado en 2010

Discriminating supported and unsupported relationships in supertrees using triplets

artículo científico publicado en 2006

Ecological divergence and hybridization of Neotropical Leishmania parasites

artículo científico publicado en 2020

Eukaryotic genes of archaebacterial origin are more important than the more numerous eubacterial genes, irrespective of function

artículo científico publicado en 2010

Evaluation of DNA Extraction Methods on Individual Helminth Egg and Larval Stages for Whole-Genome Sequencing

artículo científico publicado en 2019

Evolutionary genomics of epidemic visceral leishmaniasis in the Indian subcontinent

artículo científico publicado en 2016

Experimental design in caecilian systematics: phylogenetic information of mitochondrial genomes and nuclear rag1

artículo científico publicado en 2009

Experimental design in phylogenetics: testing predictions from expected information

artículo científico publicado en 2012

Gene tree parsimony vs uninode coding for phylogenetic reconstruction

artículo científico publicado en 2003

Genetic analysis of the cytoplasmic dynein subunit families

artículo científico publicado en 2006

Genome-wide signatures of convergent evolution in echolocating mammals

artículo científico publicado en 2013

Genomes of Leishmania parasites directly sequenced from patients with visceral leishmaniasis in the Indian subcontinent

scientific article published on 12 December 2019

Genomic analysis of natural intra-specific hybrids among Ethiopian isolates of Leishmania donovani

artículo científico publicado en 2020

Genomic and Molecular Characterization of Miltefosine Resistance in Leishmania infantum Strains with Either Natural or Acquired Resistance through Experimental Selection of Intracellular Amastigotes

artículo científico publicado en 2016

Genomic confirmation of hybridisation and recent inbreeding in a vector-isolated Leishmania population

artículo científico publicado en 2014

Genomic insights into the origin of parasitism in the emerging plant pathogen Bursaphelenchus xylophilus

artículo científico publicado en 2011

Global genome diversity of the Leishmania donovani complex

artículo científico publicado en 2020

Going nuclear: gene family evolution and vertebrate phylogeny reconciled

artículo científico publicado en 2002

Haemonchus contortus: Genome Structure, Organization and Comparative Genomics.

artículo científico publicado en 2016

In vitro selection of miltefosine resistance in promastigotes of Leishmania donovani from Nepal: genomic and metabolomic characterization.

artículo científico publicado en 2015

Linked surveillance and genetic data uncovers programmatically relevant geographic scale of Guinea worm transmission in Chad

artículo científico publicado en 2021

Majority-rule supertrees

artículo científico publicado en 2007

Measuring support and finding unsupported relationships in supertrees

artículo científico publicado en 2005

Modelling the effects of mass drug administration on the molecular epidemiology of schistosomes

artículo científico publicado en 2015

Modulation of Aneuploidy in Leishmania donovani during Adaptation to Different In Vitro and In Vivo Environments and Its Impact on Gene Expression.

artículo científico publicado en 2017

Mosaic aneuploidy in Leishmania: the perspective of whole genome sequencing

artículo científico publicado en 2014

New approaches for unravelling reassortment pathways

artículo científico publicado en 2013

Phylogenomic analyses elucidate the evolutionary relationships of bats

artículo científico publicado en 2013

Plasmodium malariae and P. ovale genomes provide insights into malaria parasite evolution ⬇️

artículo científico publicado en 2017

Population genomic evidence that human and animal infections in Africa come from the same populations of Dracunculus medinensis

scientific article published on 30 November 2020

Properties of supertree methods in the consensus setting

artículo científico publicado en 2007

Rates and patterns of gene duplication and loss in the human genome

artículo científico publicado en 2005

Reduced Efficacy of Praziquantel Against Schistosoma mansoni Is Associated With Multiple Rounds of Mass Drug Administration

artículo científico publicado en 2016

Relative time scales reveal multiple origins of parallel disjunct distributions of African caecilian amphibians

artículo científico publicado en 2007

Speciation processes in putative island endemic sister bat species: false impressions from mitochondrial DNA and microsatellite data

artículo científico publicado en 2015

Stage-Specific Transcriptome and Proteome Analyses of the Filarial Parasite Onchocerca volvulus and Its Wolbachia Endosymbiont

artículo científico publicado en 2016

Stops making sense: translational trade-offs and stop codon reassignment

artículo científico publicado en 2011

Supertrees disentangle the chimerical origin of eukaryotic genomes

artículo científico publicado en 2007

Supertrees join the mainstream of phylogenetics

artículo científico publicado en 2008

Tempo and mode of diversification of lake Tanganyika cichlid fishes

artículo científico publicado en 2008

The Ediacaran emergence of bilaterians: congruence between the genetic and the geological fossil records

artículo científico publicado en 2008

The Expanding World of Human Leishmaniasis

artículo científico publicado en 2017

The evolution of bat vestibular systems in the face of potential antagonistic selection pressures for flight and echolocation

artículo científico publicado en 2013

The evolution of color vision in nocturnal mammals

artículo científico publicado en 2009

The genome and life-stage specific transcriptomes of Globodera pallida elucidate key aspects of plant parasitism by a cyst nematode

artículo científico publicado en 2014

The genome and transcriptome of Haemonchus contortus, a key model parasite for drug and vaccine discovery

artículo científico publicado en 2013

The genome of Leishmania adleri from a mammalian host highlights chromosome fission in Sauroleishmania

artículo científico publicado en 2017

The genome of Onchocerca volvulus, agent of river blindness

artículo científico publicado en 2016

The genome of the yellow potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, reveals insights into the basis of parasitism and virulence. ⬇️

artículo científico publicado en 2016

The genomic basis of parasitism in the Strongyloides clade of nematodes

artículo científico publicado en 2016

The hearing gene Prestin reunites echolocating bats

artículo científico publicado en 2008

The information content of trees and their matrix representations

artículo científico publicado en 2004

The peculiar epidemiology of dracunculiasis in Chad

artículo científico publicado en 2013

The prokaryotic tree of life: past, present... and future?

artículo científico publicado en 2008

The role of Notch signalling and numb function in mechanosensory organ formation in the spider Cupiennius salei

artículo científico publicado en 2008

The shape of human gene family phylogenies

artículo científico publicado en 2006

The shape of supertrees to come: tree shape related properties of fourteen supertree methods

artículo científico publicado en 2005

The tree of genomes: an empirical comparison of genome-phylogeny reconstruction methods

artículo científico publicado en 2008

Transcriptional and genomic parallels between the monoxenous parasite Herpetomonas muscarum and Leishmania

scientific article published on 11 November 2019

Whipworm genome and dual-species transcriptome analyses provide molecular insights into an intimate host-parasite interaction

artículo científico publicado en 2014

Whole genome resequencing of the human parasite Schistosoma mansoni reveals population history and effects of selection

artículo científico publicado en 2016

Whole genome sequencing of experimental hybrids supports meiosis-like sexual recombination in Leishmania

scientific article published on 15 May 2019

Whole genome sequencing of multiple Leishmania donovani clinical isolates provides insights into population structure and mechanisms of drug resistance

artículo científico publicado en 2011

Whole-genome sequencing of Schistosoma mansoni reveals extensive diversity with limited selection despite mass drug administration

artículo científico publicado en 2021

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