Filtros de búsqueda

Lista de obras de Frederick P Roth

A C. elegans genome-scale microRNA network contains composite feedback motifs with high flux capacity.

artículo científico publicado en 2008

A Protein Domain-Based Interactome Network for C. elegans Early Embryogenesis

A Resource of Quantitative Functional Annotation for Homo sapiens Genes

artículo científico publicado en 2012

A common class of transcripts with 5'-intron depletion, distinct early coding sequence features, and N1-methyladenosine modification

artículo científico publicado en 2016

A critical assessment of Mus musculus gene function prediction using integrated genomic evidence

artículo científico publicado en 2008

A framework for exhaustively mapping functional missense variants.

artículo científico publicado en 2017

A genome-wide gene function prediction resource for Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2010

A highly conserved program of neuronal microexons is misregulated in autistic brains

artículo científico publicado en 2014

A map of the interactome network of the metazoan C. elegans

artículo científico publicado en 2004

A proactive genotype-to-patient-phenotype map for cystathionine beta-synthase

artículo científico publicado en 2020

A protein domain-based interactome network for C. elegans early embryogenesis

artículo científico publicado en 2008

A proteome-scale map of the human interactome network

artículo científico publicado en 2014

A race through the maze of genomic evidence

artículo científico publicado en 2008

A reference map of the human binary protein interactome

scientific article published on 08 April 2020

Absence of evidence for MHC-dependent mate selection within HapMap populations

artículo científico publicado en 2010

An empirical framework for binary interactome mapping

artículo científico publicado en 2009

An en masse phenotype and function prediction system for Mus musculus

artículo científico publicado en 2008

An experimentally derived confidence score for binary protein-protein interactions

artículo científico publicado en 2008

An extended set of yeast-based functional assays accurately identifies human disease mutations

artículo científico publicado en 2016

An inter-species protein-protein interaction network across vast evolutionary distance

artículo científico publicado en 2016

An open-source platform to distribute and interpret data from multiplexed assays of variant effect

Assessing experimentally derived interactions in a small world

artículo científico publicado en 2003

Assessing predictions of fitness effects of missense mutations in SUMO-conjugating enzyme UBE2I.

artículo científico publicado en 2017

Bringing out the best features of expression data.

artículo científico publicado en 2001

CNTN5-/+ or EHMT2-/+ iPSC-Derived Neurons from Individuals with Autism Develop Hyperactive Neuronal Networks

CRISPR/Cas9 System as a Valuable Genome Editing Tool for Wine Yeasts with Application to Decrease Urea Production.

artículo científico publicado en 2017

Challenges in translating plasma proteomics from bench to bedside: update from the NHLBI Clinical Proteomics Programs.

artículo científico publicado en 2008

Characterizing gene sets with FuncAssociate

artículo científico

Chemical substructures that enrich for biological activity

artículo científico publicado en 2008

ChromoZoom: a flexible, fluid, web-based genome browser

artículo científico publicado en 2012

Combining biological networks to predict genetic interactions

scholarly article

Combining guilt-by-association and guilt-by-profiling to predict Saccharomyces cerevisiae gene function

artículo científico publicado en 2008

Confirmation of organized modularity in the yeast interactome

artículo científico publicado en 2007

Cross-species protein interactome mapping reveals species-specific wiring of stress response pathways

artículo científico publicado en 2013

Defining genetic interaction

artículo científico publicado en 2008

Discovering functional relationships: biochemistry versus genetics

article

Discovering the targets of drugs via computational systems biology

artículo científico publicado en 2011

Empirically controlled mapping of the Caenorhabditis elegans protein-protein interactome network

artículo científico publicado en 2009

Erratum: Addendum: Literature-curated protein interaction datasets

scholarly article published in Nature Methods

Finding DNA regulatory motifs within unaligned noncoding sequences clustered by whole-genome mRNA quantitation

artículo científico publicado en 1998

FuncBase: a resource for quantitative gene function annotation

artículo científico publicado en 2010

Functional specificity among ribosomal proteins regulates gene expression

artículo científico publicado en 2007

Genetic interaction screens advance in reverse

artículo científico publicado en 2007

Genome analysis reveals interplay between 5'UTR introns and nuclear mRNA export for secretory and mitochondrial genes

artículo científico publicado en 2011

Genome rearrangements caused by depletion of essential DNA replication proteins in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2012

Genome-scale analysis of in vivo spatiotemporal promoter activity in Caenorhabditis elegans.

artículo científico publicado en 2007

Genome-wide functional analysis of human 5' untranslated region introns

artículo científico publicado en 2010

Genomewide identification of Sko1 target promoters reveals a regulatory network that operates in response to osmotic stress in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2005

Global mapping of the yeast genetic interaction network

artículo científico publicado en 2004

GoFish finds genes with combinations of Gene Ontology attributes

artículo científico publicado en 2003

High-Resolution CRISPR Screens Reveal Fitness Genes and Genotype-Specific Cancer Liabilities.

artículo científico publicado en 2015

High-quality binary protein interaction map of the yeast interactome network

artículo científico publicado en 2008

Identification of neuronal RNA targets of TDP-43-containing ribonucleoprotein complexes

artículo científico publicado en 2011

Identifying pathogenicity of human variants via paralog-based yeast complementation.

artículo científico publicado en 2017

Independently evolved virulence effectors converge onto hubs in a plant immune system network

artículo científico publicado en 2011

Intensity-based protein identification by machine learning from a library of tandem mass spectra.

artículo científico publicado en 2004

Interpreting cancer genomes using systematic host network perturbations by tumour virus proteins

scientific journal article

Interpreting metabolomic profiles using unbiased pathway models

artículo científico publicado en 2010

Introns in UTRs: why we should stop ignoring them

artículo científico publicado en 2012

Isoform discovery by targeted cloning, 'deep-well' pooling and parallel sequencing.

artículo científico publicado en 2008

Judging the quality of gene expression-based clustering methods using gene annotation

artículo científico publicado en 2002

Knocking out multigene redundancies via cycles of sexual assortment and fluorescence selection

artículo científico publicado en 2011

Large-scale RACE approach for proactive experimental definition of C. elegans ORFeome.

artículo científico publicado en 2009

Large-scale identification and analysis of suppressive drug interactions

artículo científico publicado en 2014

Latent herpes simplex virus infection of sensory neurons alters neuronal gene expression

artículo científico publicado en 2003

List of Contributors

Literature-curated protein interaction datasets.

artículo científico publicado en 2009

Mammalian ultraconserved elements are strongly depleted among segmental duplications and copy number variants

artículo científico publicado en 2006

Mapping DNA damage-dependent genetic interactions in yeast via party mating and barcode fusion genetics.

artículo científico publicado en 2018

MaveRegistry: a collaboration platform for multiplexed assays of variant effect

scientific article published in 2021

Metabolic signatures of exercise in human plasma

artículo científico publicado en 2010

Metabolite profiling of blood from individuals undergoing planned myocardial infarction reveals early markers of myocardial injury

artículo científico publicado en 2008

Metabolomic identification of novel biomarkers of myocardial ischemia

artículo científico publicado en 2005

Modeling the impact of drug interactions on therapeutic selectivity

scientific article published in Nature Communications

Motifs, themes and thematic maps of an integrated Saccharomyces cerevisiae interaction network

artículo científico publicado en 2005

Multiplexed assays of variant effects contribute to a growing genotype-phenotype atlas

Multiplexed measurement of variant abundance and activity reveals VKOR topology, active site and human variant impact

artículo científico publicado en 2020

Next generation software for functional trend analysis

artículo científico publicado en 2009

Next-generation sequencing to generate interactome datasets

artículo científico publicado en 2011

Novel cardiovascular gene functions revealed via systematic phenotype prediction in zebrafish

artículo científico publicado en 2014

Numerous conserved and divergent microRNAs expressed by herpes simplex viruses 1 and 2.

artículo científico publicado en 2010

Pathways of the heart

artículo científico publicado en 2009

Pooled-matrix protein interaction screens using Barcode Fusion Genetics

scientific journal article

Predicting co-complexed protein pairs using genomic and proteomic data integration

artículo científico publicado en 2004

Predicting gene function from patterns of annotation

artículo científico

Predicting phenotype from patterns of annotation

artículo científico

Predicting protein complex membership using probabilistic network reliability

artículo científico publicado en 2004

Prediction of similarly acting cis-regulatory modules by subsequence profiling and comparative genomics in Drosophila melanogaster and D.pseudoobscura

artículo científico publicado en 2004

Predictive models of molecular machines involved in Caenorhabditis elegans early embryogenesis.

artículo científico publicado en 2005

Prioritizing causal disease genes using unbiased genomic features

artículo científico publicado en 2014

Protein domain-level landscape of cancer-type-specific somatic mutations

artículo científico publicado en 2015

Protein interaction network of alternatively spliced isoforms from brain links genetic risk factors for autism.

scientific article published on 11 April 2014

Q&A: epistasis

artículo científico publicado en 2009

Quantifying Immune-Based Counterselection of Somatic Mutations

Quantifying immune-based counterselection of somatic mutations

scientific article published on 25 July 2019

Quantitative analysis of protein interaction network dynamics in yeast.

artículo científico publicado en 2017

Quantitative phenotyping via deep barcode sequencing.

artículo científico publicado en 2009

Query Chem: a Google-powered web search combining text and chemical structures

artículo científico

RanBP2/Nup358 potentiates the translation of a subset of mRNAs encoding secretory proteins

artículo científico publicado en 2013

Reconstitution of human RNA interference in budding yeast

artículo científico publicado en 2011

Response to "MHC-dependent mate choice in humans: Why genomic patterns from the HapMap European American data set support the hypothesis". HapMap genotypes do not confidently support a role for the MHC locus in human mate selection

artículo científico publicado en 2012

SELPHI: correlation-based identification of kinase-associated networks from global phospho-proteomics data sets.

artículo científico publicado en 2015

SILVER helps assign peptides to tandem mass spectra using intensity-based scoring.

artículo científico publicado en 2004

Selecting causal genes from genome-wide association studies via functionally coherent subnetworks

artículo científico publicado en 2014

Systematic analysis of bypass suppression of essential genes

scientific article published on 01 September 2020

Systematic exploration of synergistic drug pairs

artículo científico publicado en 2011

Systematic genetics swims forward elegantly

artículo científico publicado en 2006

Systematic pathway analysis using high-resolution fitness profiling of combinatorial gene deletions

artículo científico publicado en 2007

Systems analysis of RhoGEF and RhoGAP regulatory proteins reveals spatially organized RAC1 signalling from integrin adhesions

artículo científico publicado en 2020

Systems biology and the analysis of genetic variation

artículo científico publicado en 2013

Taking Exception to Human Eugenics

artículo científico publicado en 2016

Target-independent prediction of drug synergies using only drug lipophilicity

artículo científico publicado en 2014

The Impact of Oncogenic EGFRvIII on the Proteome of Extracellular Vesicles Released from Glioblastoma Cells

artículo científico publicado en 2018

The Synergizer service for translating gene, protein and other biological identifiers

artículo científico publicado en 2008

The genetic landscape of a cell

artículo científico publicado en 2010

The genome-wide localization of Rsc9, a component of the RSC chromatin-remodeling complex, changes in response to stress

artículo científico publicado en 2002

The green monster process for the generation of yeast strains carrying multiple gene deletions

artículo científico publicado en 2012

The insertion Green Monster (iGM) method for expression of multiple exogenous genes in yeast

artículo científico publicado en 2014

The tandem inversion duplication in Salmonella enterica: selection drives unstable precursors to final mutation types

artículo científico publicado en 2010

Towards a proteome-scale map of the human protein–protein interaction network

artículo científico publicado en 2005

Transcriptional compensation for gene loss plays a minor role in maintaining genetic robustness in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2005

Using high-throughput screening data to discriminate compounds with single-target effects from those with side effects

artículo científico publicado en 2006

Viral perturbations of host networks reflect disease etiology

artículo científico publicado en 2012

Widespread Expansion of Protein Interaction Capabilities by Alternative Splicing

artículo científico publicado en 2016

Widespread macromolecular interaction perturbations in human genetic disorders

scientific journal article