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Lista de obras de Shujiro Okuda

A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes

artículo científico publicado en 2012

Autophagy regulates lipid metabolism through selective turnover of NCoR1

scientific article published on 05 April 2019

BRAF V600E and SRC mutations as molecular markers for predicting prognosis and conversion surgery in Stage IV colorectal cancer

scientific article published on 21 February 2019

BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research

artículo científico publicado en 2020

BioHackathon series in 2011 and 2012: penetration of ontology and linked data in life science domains

artículo científico publicado en 2014

Characterisation of N-glycans in the epithelial-like tissue of the rat cochlea

artículo científico publicado en 2019

Characterization of relationships between transcriptional units and operon structures in Bacillus subtilis and Escherichia coli

artículo científico publicado en 2007

Comprehensive analysis of glycosyltransferases in eukaryotic genomes for structural and functional characterization of glycans

artículo científico publicado en 2009

Cytotoxic Glycosylated Fatty Acid Amides from a Stelletta sp. Marine Sponge.

artículo científico publicado en 2015

Direct observation and analysis of bacterial growth on an antimicrobial surface.

artículo científico publicado en 2010

Elucidation of the evolutionary expansion of phosphorylation signaling networks using comparative phosphomotif analysis

artículo científico publicado en 2014

Enhanced translocation and growth of Rhodococcus erythropolis PR4 in the alkane phase of aqueous-alkane two phase cultures were mediated by GroEL2 overexpression

artículo científico publicado en 2014

Extracting Sequence Motifs and the Phylogenetic Features of SNARE-Dependent Membrane Traffic

scholarly article by Akiyasu C. Yoshizawa et al published 16 June 2006 in Traffic

Extraction and Analysis of Chemical Modification Patterns in Drug Development

article

GlycoRDF: an ontology to standardize glycomics data in RDF

artículo científico publicado en 2015

Human T-cell leukemia virus type 1 Tax oncoprotein represses the expression of the BCL11B tumor suppressor in T-cells

artículo científico publicado en 2015

IMSindel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis.

artículo científico publicado en 2018

Impact of Concurrent Genomic Alterations Detected by Comprehensive Genomic Sequencing on Clinical Outcomes in East-Asian Patients with EGFR-Mutated Lung Adenocarcinoma.

artículo científico publicado en 2018

In silico study on the substrate binding manner in human myo-inositol monophosphatase 2

artículo científico publicado en 2011

Introducing glycomics data into the Semantic Web.

artículo científico publicado en 2013

KEGG Atlas mapping for global analysis of metabolic pathways

artículo científico publicado en 2008

KEGG OC: a large-scale automatic construction of taxonomy-based ortholog clusters

artículo científico publicado en 2012

KEGG for linking genomes to life and the environment

artículo científico publicado en 2008

Knowledge base toward understanding actionable alterations and realizing precision oncology.

artículo científico publicado en 2019

Large-scale analysis of the evolutionary histories of phosphorylation motifs in the human genome

artículo científico

Novel gene fusions found in cervical cancer

artículo científico publicado en 2018

Novel kinase fusion transcripts found in endometrial cancer

artículo científico publicado en 2015

Novel therapeutic strategy for cervical cancer harboring FGFR3-TACC3 fusions

artículo científico publicado en 2018

ODB: a database for operon organizations, 2011 update

artículo científico publicado en 2011

ODB: a database of operons accumulating known operons across multiple genomes

artículo científico publicado en 2006

Open Agile text mining for bioinformatics: the PubAnnotation ecosystem

scientific article published on 01 November 2019

Phosphoproteomic and bioinformatic methods for analyzing signaling in vertebrate axon growth and regeneration

scientific article published on 08 April 2020

Publisher Correction: IMSindel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis

artículo científico publicado en 2018

RNA Sequencing Revealed Numerous Polyketide Synthase Genes in the Harmful Dinoflagellate Karenia mikimotoi

artículo científico publicado en 2015

Resequencing and Association Analysis of CLN8 with Autism Spectrum Disorder in a Japanese Population

artículo científico publicado en 2015

Sharing of human milk oligosaccharides degradants within bifidobacterial communities in faecal cultures supplemented with Bifidobacterium bifidum

artículo científico publicado en 2018

Species-function relationships shape ecological properties of the human gut microbiome

artículo científico publicado en 2016

The 2nd DBCLS BioHackathon: interoperable bioinformatics Web services for integrated applications

artículo científico publicado en 2011

The Fifth ACGG-DB Meeting Report: Towards an International Glycan Structure Repository

artículo científico publicado en 2013

The GlyCosmos Portal: a unified and comprehensive web resource for the glycosciences

artículo científico publicado en 2020

The ProteomeXchange consortium at 10 years: 2023 update

artículo científico publicado en 2022

The ProteomeXchange consortium in 2017: supporting the cultural change in proteomics public data deposition

artículo científico publicado en 2017

The ProteomeXchange consortium in 2020: enabling 'big data' approaches in proteomics

artículo científico publicado en 2020

The Third ACGG-DB Meeting Report: Towards an international collaborative infrastructure for glycobioinformatics

artículo científico publicado en 2013

The repertoire of desaturases and elongases reveals fatty acid variations in 56 eukaryotic genomes

artículo científico publicado en 2007

Towards a standardized bioinformatics infrastructure for N- and O-glycomics

scientific article published on 22 July 2019

Unique transcriptional profile of native persisters in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2017

Virtual metagenome reconstruction from 16S rRNA gene sequences

artículo científico publicado en 2012

XCL1 expression correlates with CD8-positive T cells infiltration and PD-L1 expression in squamous cell carcinoma arising from mature cystic teratoma of the ovary

artículo científico publicado en 2020

iPath2.0: interactive pathway explorer

artículo científico publicado en 2011

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