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Lista de obras de Peter A. DiMaggio

A Mixed-Integer Optimization Framework for De Novo Peptide Identification.

artículo científico publicado en 2007

A chemical probe selectively inhibits G9a and GLP methyltransferase activity in cells

artículo científico publicado en 2011

A hybrid method for peptide identification using integer linear optimization, local database search, and quadrupole time-of-flight or OrbiTrap tandem mass spectrometry

artículo científico publicado en 2008

A mixed integer linear optimization framework for the identification and quantification of targeted post-translational modifications of highly modified proteins using multiplexed electron transfer dissociation tandem mass spectrometry

artículo científico publicado en 2009

A novel approach for untargeted post-translational modification identification using integer linear optimization and tandem mass spectrometry.

artículo científico publicado en 2010

A novel framework for predicting in vivo toxicities from in vitro data using optimal methods for dense and sparse matrix reordering and logistic regression

artículo científico publicado en 2010

An Integrated Chemical Proteomics Approach for Quantitative Profiling of Intracellular ADP-Ribosylation

artículo científico publicado en 2019

Biclustering via optimal re-ordering of data matrices in systems biology: rigorous methods and comparative studies

artículo científico publicado en 2008

Biologically-active laminin-111 fragment that modulates the epithelial-to-mesenchymal transition in embryonic stem cells

artículo científico publicado en 2014

Collective mass spectrometry approaches reveal broad and combinatorial modification of high mobility group protein A1a.

artículo científico publicado en 2010

Descriptor-free molecular discovery in large libraries by adaptive substituent reordering

artículo científico publicado en 2008

Fullerene oxidation and clustering in solution induced by light.

artículo científico publicado en 2015

Global turnover of histone post-translational modifications and variants in human cells

artículo científico publicado el 6 de diciembre de 2010

High throughput characterization of combinatorial histone codes

artículo científico publicado en 2009

Histone H3 lysine 56 methylation regulates DNA replication through its interaction with PCNA

artículo científico publicado en 2012

Novel phosphorylation sites in the S. cerevisiae Cdc13 protein reveal new targets for telomere length regulation.

artículo científico publicado en 2012

Novel protein identification methods for biomarker discovery via a proteomic analysis of periodontally healthy and diseased gingival crevicular fluid samples.

artículo científico publicado en 2011

On the histone lysine methyltransferase activity of fungal metabolite chaetocin.

artículo científico publicado en 2013

PILOT_PROTEIN: identification of unmodified and modified proteins via high-resolution mass spectrometry and mixed-integer linear optimization.

artículo científico publicado en 2012

Proteogenomic characterization and mapping of nucleosomes decoded by Brd and HP1 proteins.

artículo científico publicado en 2012

Quantitative dynamics of the link between cellular metabolism and histone acetylation.

artículo científico publicado en 2013

Quantitative proteomic discovery of dynamic epigenome changes that control human cytomegalovirus (HCMV) infection

artículo científico publicado en 2014

Selecting high quality protein structures from diverse conformational ensembles.

artículo científico publicado en 2009

The significance, development and progress of high-throughput combinatorial histone code analysis

artículo científico publicado en 2010

Unbiased Mass Spectrometry Elucidation of the Targets and Mechanisms of Activity-Based Probes: A Case Study Involving Sulfonyl Fluorides

artículo científico publicado en 2018