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Lista de obras de Andrés Aguilera

A Meiotic Checkpoint Alters Repair Partner Bias to Permit Inter-sister Repair of Persistent DSBs

article

A genome-wide function of THSC/TREX-2 at active genes prevents transcription-replication collisions

artículo científico publicado en 2014

A new connection of mRNP biogenesis and export with transcription-coupled repair

artículo científico publicado en 2007

A new role for Rrm3 in repair of replication-born DNA breakage by sister chromatid recombination

artículo científico publicado en 2017

A novel assay identifies transcript elongation roles for the Nup84 complex and RNA processing factors.

artículo científico publicado en 2011

A novel class of mRNA-containing cytoplasmic granules are produced in response to UV-irradiation

artículo científico publicado en 2008

A novel yeast gene, THO2, is involved in RNA pol II transcription and provides new evidence for transcriptional elongation-associated recombination.

artículo científico publicado en 1998

A novel yeast mutation, rad52-L89F, causes a specific defect in Rad51-independent recombination that correlates with a reduced ability of Rad52-L89F to interact with Rad59.

artículo científico publicado en 2004

A reduction in RNA polymerase II initiation rate suppresses hyper-recombination and transcription-elongation impairment of THO mutants

artículo científico publicado en 2008

A unified nomenclature for protein subunits of mediator complexes linking transcriptional regulators to RNA polymerase II

artículo científico publicado en 2004

AID induces double-strand breaks at immunoglobulin switch regions and c-MYC causing chromosomal translocations in yeast THO mutants

artículo científico publicado en 2011

Activation-induced cytidine deaminase action is strongly stimulated by mutations of the THO complex

artículo científico publicado en 2007

An hpr1 point mutation that impairs transcription and mRNP biogenesis without increasing recombination.

artículo científico publicado en 2006

Architecture and nucleic acids recognition mechanism of the THO complex, an mRNP assembly factor

artículo científico publicado en 2012

BRCA2 prevents R-loop accumulation and associates with TREX-2 mRNA export factor PCID2.

artículo científico publicado en 2014

BRCA2 promotes DNA-RNA hybrid resolution by DDX5 helicase at DNA breaks to facilitate their repair‡

artículo científico publicado en 2021

Biogenesis of mRNPs: integrating different processes in the eukaryotic nucleus

artículo científico publicado en 2008

CDK targets Sae2 to control DNA-end resection and homologous recombination

artículo científico publicado en 2008

Causes of genome instability

artículo científico

Characterization of two highly similar Rad51 homologs of Physcomitrella patens

artículo científico publicado en 2002

Chromosomal translocations caused by either pol32-dependent or pol32-independent triparental break-induced replication

artículo científico publicado en 2009

Cleavage factor I links transcription termination to DNA damage response and genome integrity maintenance in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2014

Competing roles of DNA end resection and non-homologous end joining functions in the repair of replication-born double-strand breaks by sister-chromatid recombination.

artículo científico publicado en 2013

Complex Chromosomal Rearrangements Mediated by Break-Induced Replication Involve Structure-Selective Endonucleases ⬇️

artículo científico publicado el 27 de septiembre de 2012

Control of cross-over by single-strand DNA resection

artículo científico publicado en 2003

Control of the function of the transcription and repair factor TFIIH by the action of the cochaperone Ydj1.

artículo científico publicado en 2011

Coordinated Activity of Y Family TLS Polymerases and EXO1 Protects Non-S Phase Cells from UV-Induced Cytotoxic Lesions

artículo científico publicado en 2018

Coordinated Activity of Y Family TLS Polymerases and EXO1 Protects Non-S Phase Cells from UV-Induced Cytotoxic Lesions

artículo científico publicado en 2018

Coordinated control of replication and transcription by a SAPK protects genomic integrity.

artículo científico publicado en 2013

Correction for Muñoz-Galván et al., "Distinct Roles of Mus81, Yen1, Slx1-Slx4, and Rad1 Nucleases in the Repair of Replication-Born Double-Strand Breaks by Sister Chromatid Exchange"

artículo científico publicado en 2017

Correction: The Caenorhabditis elegans THO Complex Is Required for the Mitotic Cell Cycle and Development.

artículo científico publicado en 2016

Cotranscriptional mRNP assembly: from the DNA to the nuclear pore

artículo científico publicado en 2005

Cotranscriptionally Formed DNA:RNA Hybrids Mediate Transcription Elongation Impairment and Transcription-Associated Recombination ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2003

DNA repair in mammalian cells: DNA double-strand break repair: how to fix a broken relationship.

artículo científico publicado en 2009

DNA repair: From molecular mechanism to human disease

artículo científico publicado en 2006

DNA-RNA hybrids: the risks of DNA breakage during transcription

artículo científico publicado en 2017

Deletion of the phosphoglucose isomerase structural gene makes growth and sporulation glucose dependent in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 1986

Depletion of the MFAP1/SPP381 Splicing Factor Causes R-Loop-Independent Genome Instability

scientific article published on 01 August 2019

Detection of DNA-RNA Hybrids In Vivo

artículo científico publicado en 2018

Different genetic requirements for repair of replication-born double-strand breaks by sister-chromatid recombination and break-induced replication

artículo científico publicado en 2007

Different physiological relevance of yeast THO/TREX subunits in gene expression and genome integrity

artículo científico publicado en 2008

Differential effect of the overexpression of Rad2/XPG family endonucleases on genome integrity in yeast and human cells

artículo científico publicado en 2017

Differential expression of THOC1 and ALY mRNP biogenesis/export factors in human cancers

artículo científico publicado en 2011

Differential intrachromosomal hyper-recombination phenotype of spt4 and spt6 mutants of S. cerevisiae

artículo científico publicado en 1996

Distinct roles of Mus81, Yen1, Slx1-Slx4, and Rad1 nucleases in the repair of replication-born double-strand breaks by sister chromatid exchange

artículo científico publicado en 2012

Double-strand breaks arising by replication through a nick are repaired by cohesin-dependent sister-chromatid exchange.

artículo científico publicado en 2006

Elongation Factor TFIIS Prevents Transcription Stress and R-Loop Accumulation to Maintain Genome Stability

artículo científico publicado en 2019

Epigenetic features of human telomeres.

artículo científico publicado en 2018

Ethanol-sensitive mutants of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 1986

Excess of Yra1 RNA-Binding Factor Causes Transcription-Dependent Genome Instability, Replication Impairment and Telomere Shortening

artículo científico publicado en 2016

FANCD2 Facilitates Replication through Common Fragile Sites.

artículo científico publicado en 2016

Gene gating at nuclear pores prevents the formation of R loops

artículo científico publicado en 2017

Genetic and Molecular Analysis of Mitotic Recombination in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2011

Genetic evidence for different RAD52-dependent intrachromosomal recombination pathways in Saccharomyces cerevisiae

article

Genetic stability and DNA rearrangements associated with a 2 × 1.1-Kb perfect palindrome in Escherichia coli

artículo científico publicado en 1998

Genome instability and transcription elongation impairment in human cells depleted of THO/TREX

artículo científico publicado en 2011

Genome instability: a mechanistic view of its causes and consequences

artículo científico publicado en 2008

Genome-wide analysis of factors affecting transcription elongation and DNA repair: a new role for PAF and Ccr4-not in transcription-coupled repair.

artículo científico publicado en 2009

Genome-wide function of THO/TREX in active genes prevents R-loop-dependent replication obstacles

artículo científico

Guidelines and recommendations on yeast cell death nomenclature.

artículo científico publicado en 2018

Guidelines for DNA recombination and repair studies: Cellular assays of DNA repair pathways

artículo científico publicado en 2019

Harmful DNA:RNA hybrids are formed in cis and in a Rad51-independent manner

artículo científico publicado en 2020

Harmful R-loops are prevented via different cell cycle-specific mechanisms

artículo científico publicado en 2021

High levels of chromosome instability in polyploids of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 1990

High-Resolution Mapping of Homologous Recombination Events in rad3 Hyper-Recombination Mutants in Yeast

artículo científico publicado en 2016

Histone H3K56 acetylation, Rad52, and non-DNA repair factors control double-strand break repair choice with the sister chromatid

scientific journal article

Histone Mutants Separate R Loop Formation from Genome Instability Induction

artículo científico publicado en 2017

Histone deacetylases facilitate the accurate repair of broken forks

artículo científico publicado en 2020

Homologous recombination and Mus81 promote replication completion in response to replication fork blockage

artículo científico publicado en 2020

How to exchange your partner. Workshop on recombination mechanisms and the maintenance of genomic stability

artículo científico publicado en 2006

Hpr1 is preferentially required for transcription of either long or G+C-rich DNA sequences in Saccharomyces cerevisiae.

artículo científico publicado en 2001

Human THO-Sin3A interaction reveals new mechanisms to prevent R-loops that cause genome instability.

artículo científico publicado en 2017

Human mitochondrial degradosome prevents harmful mitochondrial R loops and mitochondrial genome instability

article published in the Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Impairment of replication fork progression mediates RNA polII transcription-associated recombination

artículo científico publicado en 2005

Impairment of transcription elongation by R-loops in vitro

artículo científico publicado en 2007

Increase in incidence of chromosome instability and non-conservative recombination between repeats in Saccharomyces cerevisiae hpr1? strains

artículo científico publicado en 1994

Instability of Saccharomyces cerevisiae heterokaryons

artículo científico publicado en 1984

Interdependence between Transcription and mRNP Processing and Export, and Its Impact on Genetic Stability

scientific article published on 01 June 2005

Interdependence of the rad50 hook and globular domain functions

artículo científico publicado en 2015

Isolation and molecular analysis of the phosphoglucose isomerase structural gene of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 1986

Methods to study transcription-coupled repair in chromatin

artículo científico publicado en 2015

Mitotic gene conversion of large DNA heterologies in Saccharomyces cerevisiae

article

Molecular analysis of RGP1, a new yeast gene required for proper mitotic growth

artículo científico publicado en 1990

Molecular evidence for a positive role of Spt4 in transcription elongation

artículo científico publicado en 2003

Molecular evidence indicating that the yeast PAF complex is required for transcription elongation

artículo científico publicado en 2004

Molecular evidence that the eukaryotic THO/TREX complex is required for efficient transcription elongation

artículo científico publicado en 2003

Multiple signaling kinases target Mrc1 to prevent genomic instability triggered by transcription-replication conflicts.

artículo científico publicado en 2018

Mutations suppressing the effects of a deletion of the Phosphoglucose isomerase gene PGI1 in Saccharomyces cerevisiae

article

Nab2 functions in the metabolism of RNA driven by polymerases II and III.

artículo científico publicado en 2011

Nab2p and the Thp1p-Sac3p complex functionally interact at the interface between transcription and mRNA metabolism

artículo científico publicado en 2003

New clues to understand the role of THO and other functionally related factors in mRNP biogenesis

artículo científico

New in-vivo cloning methods by homologous recombination in yeast

artículo científico publicado en 1994

New suppressors of THO mutations identify Thp3 (Ypr045c)-Csn12 as a protein complex involved in transcription elongation

artículo científico publicado en 2011

Npl3, a new link between RNA-binding proteins and the maintenance of genome integrity.

artículo científico publicado en 2014

Nucleotide sequence and characterization of temperature-sensitive pol1 mutants of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 1990

Origin matters: spontaneous DNA-RNA hybrids do not form in trans as a source of genome instability

scientific article published on 23 October 2020

Partial depletion of histone H4 increases homologous recombination-mediated genetic instability

artículo científico publicado en 2005

Physical proximity of chromatin to nuclear pores prevents harmful R loop accumulation contributing to maintain genome stability

artículo científico publicado en 2017

Polycomb RING1A- and RING1B-dependent histone H2A monoubiquitylation at pericentromeric regions promotes S-phase progression

artículo científico publicado en 2015

R Loops: From Physiological to Pathological Roles

scientific article published on 10 October 2019

R Loops: From Transcription Byproducts to Threats to Genome Stability ⬇️

artículo científico publicado el 27 de abril de 2012

R loops are linked to histone H3 S10 phosphorylation and chromatin condensation

artículo científico publicado en 2013

R loops: new modulators of genome dynamics and function

artículo científico

R-Loops as Promoters of Antisense Transcription

artículo científico publicado en 2019

R-loop mediated transcription-associated recombination in trf4Δ mutants reveals new links between RNA surveillance and genome integrity

artículo científico publicado en 2013

R-loops cause replication impairment and genome instability during meiosis

artículo científico publicado en 2012

R-loops do not accumulate in transcription-defective hpr1-101 mutants: implications for the functional role of THO/TREX.

artículo científico publicado en 2009

RNA polymerase II contributes to preventing transcription-mediated replication fork stalls

artículo científico publicado en 2014

Recombination between DNA repeats in yeast hpr1delta cells is linked to transcription elongation

artículo científico publicado en 1997

Relationship between G+C content, ORF-length and mRNA concentration in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2003

Relationship between growth, fermentation, and respiration rates inSaccharomyces cerevisiae: A study based on the analysis of the yield Ypx

artículo científico publicado en 1988

Replication fork progression is impaired by transcription in hyperrecombinant yeast cells lacking a functional THO complex

artículo científico publicado en 2006

Replication stress and cancer

artículo científico publicado en 2015

Role for RNA:DNA hybrids in origin-independent replication priming in a eukaryotic system.

artículo científico publicado en 2015

Role of mitochondria in ethanol tolerance of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 1985

Roles of human POLD1 and POLD3 in genome stability

artículo científico publicado en 2016

Rpd3L and Hda1 histone deacetylases facilitate repair of broken forks by promoting sister chromatid cohesion

artículo científico publicado en 2019

Sem1 is a functional component of the nuclear pore complex-associated messenger RNA export machinery

artículo científico publicado en 2009

Smc5-Smc6 mediate DNA double-strand-break repair by promoting sister-chromatid recombination.

artículo científico publicado en 2006

Spontaneous DNA-RNA hybrids: differential impacts throughout the cell cycle

scientific article published on 16 February 2020

Stimulation of direct-repeat recombination by RNA polymerase III transcription.

artículo científico publicado en 2009

TDP-43 mutations link Amyotrophic Lateral Sclerosis with R-loop homeostasis and R loop-mediated DNA damage

scientific article published on 10 December 2020

TREX is a conserved complex coupling transcription with messenger RNA export

artículo científico publicado en 2002

The Antitumor Drugs Trabectedin and Lurbinectedin Induce Transcription-Dependent Replication Stress and Genome Instability

artículo científico publicado en 2018

The Caenorhabditis elegans THO complex is required for the mitotic cell cycle and development

artículo científico publicado en 2012

The DNA damage response acts as a safeguard against harmful DNA-RNA hybrids of different origins

artículo científico publicado en 2019

The Dot1 histone methyltransferase and the Rad9 checkpoint adaptor contribute to cohesin-dependent double-strand break repair by sister chromatid recombination in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2009

The Fanconi Anemia Pathway Protects Genome Integrity from R-loops

artículo científico publicado en 2015

The Npl3 hnRNP prevents R-loop-mediated transcription-replication conflicts and genome instability

artículo científico publicado en 2013

The Nup84 complex coordinates the DNA damage response to warrant genome integrity

artículo científico publicado en 2019

The Rad50 coiled-coil domain is indispensable for Mre11 complex functions

artículo científico publicado en 2011

The Role of Replication-Associated Repair Factors on R-Loops

artículo científico publicado en 2017

The S-phase checkpoint is required to respond to R-loops accumulated in THO mutants

artículo científico publicado en 2009

The Smc5/6 complex regulates the yeast Mph1 helicase at RNA-DNA hybrid-mediated DNA damage

artículo científico publicado en 2017

The THO complex as a key mRNP biogenesis factor in development and cell differentiation

artículo científico publicado en 2010

The THP1-SAC3-SUS1-CDC31 complex works in transcription elongation-mRNA export preventing RNA-mediated genome instability.

artículo científico publicado en 2008

The absence of the yeast chromatin assembly factor Asf1 increases genomic instability and sister chromatid exchange

artículo científico publicado en 2004

The connection between transcription and genomic instability

artículo científico publicado en 2002

The interface between transcription and mRNP export: from THO to THSC/TREX-2.

scientific article published on 19 June 2010

The need to regulate replication fork speed.

artículo científico publicado en 2017

The phosphofructokinase genes of yeast evolved from two duplication events

artículo científico publicado en 1989

The rem mutations in the ATP-binding groove of the Rad3/XPD helicase lead to Xeroderma pigmentosum-Cockayne syndrome-like phenotypes

artículo científico publicado en 2014

The replication checkpoint protects fork stability by releasing transcribed genes from nuclear pores.

artículo científico

The stress-activated protein kinase Hog1 mediates S phase delay in response to osmostress

artículo científico publicado en 2009

The yeast THO complex and mRNA export factors link RNA metabolism with transcription and genome instability

artículo científico publicado en 2002

The yeast and human FACT chromatin-reorganizing complexes solve R-loop-mediated transcription-replication conflicts

artículo científico publicado en 2014

Tho1, a novel hnRNP, and Sub2 provide alternative pathways for mRNP biogenesis in yeast THO mutants

artículo científico publicado en 2006

Topological constraints impair RNA polymerase II transcription and causes instability of plasmid-borne convergent genes ⬇️

artículo científico publicado el 13 de octubre de 2011

Transcription and recombination: when RNA meets DNA.

artículo científico

Transcription as a Threat to Genome Integrity

artículo científico publicado en 2016

Transcription at the proximity of the nuclear pore: a role for the THP1-SAC3-SUS1-CDC31 (THSC) complex

artículo científico publicado en 2009

Transcription coupled repair at the interface between transcription elongation and mRNP biogenesis ⬇️

artículo científico publicado el 6 de octubre de 2012

Transcription-associated genome instability

artículo científico

Transcription-coupled nucleotide excision repair factors promote R-loop-induced genome instability

artículo científico publicado en 2014

Transcription-mediated replication hindrance: a major driver of genome instability

scientific article published on 23 May 2019

Transcription-replication conflicts: how they occur and how they are resolved

artículo científico publicado en 2016

What causes an RNA-DNA hybrid to compromise genome integrity?

artículo científico publicado en 2019

Yeast Sen1 helicase protects the genome from transcription-associated instability.

artículo científico publicado en 2011

Yeast pol4 promotes tel1-regulated chromosomal translocations

artículo científico publicado en 2013

Yra1-bound RNA-DNA hybrids cause orientation-independent transcription-replication collisions and telomere instability

artículo científico publicado en 2018

Zim17/Tim15 links mitochondrial iron-sulfur cluster biosynthesis to nuclear genome stability

artículo científico publicado en 2011

mRNA processing and genomic instability

scientific article published on 01 September 2005

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