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Lista de obras de Mart Krupovic

2020 taxonomic update for phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirales

artículo científico publicado en 2020

50 years of the International Committee on Taxonomy of Viruses: progress and prospects.

artículo científico publicado en 2017

A classification system for virophages and satellite viruses

artículo científico publicado en 2015

A highly divergent archaeo-eukaryotic primase from the Thermococcus nautilus plasmid, pTN2.

artículo científico publicado en 2014

A network perspective on the virus world

artículo científico publicado en 2017

A new proposed taxon for double-stranded DNA viruses, the order "Ligamenvirales"

artículo científico publicado en 2012

A novel family of tyrosine integrases encoded by the temperate pleolipovirus SNJ2.

artículo científico publicado en 2018

A novel group of diverse Polinton-like viruses discovered by metagenome analysis

artículo científico publicado en 2015

A packing for A-form DNA in an icosahedral virus

artículo científico publicado en 2019

A thaumarchaeal provirus testifies for an ancient association of tailed viruses with archaea

artículo científico publicado en 2011

A virus of hyperthermophilic archaea with a unique architecture among DNA viruses

artículo científico publicado en 2016

Abolishment of morphology-based taxa and change to binomial species names: 2022 taxonomy update of the ICTV bacterial viruses subcommittee

artículo científico publicado en 2023

Accelerating expansion of the viral universe

artículo científico publicado en 2013

Additional changes to taxonomy ratified in a special vote by the International Committee on Taxonomy of Viruses (October 2018)

artículo científico publicado en 2019

Annual (2023) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota)

artículo científico publicado en 2023

Archaeal proviruses TKV4 and MVV extend the PRD1-adenovirus lineage to the phylum Euryarchaeota

artículo científico publicado en 2008

Archaeal tetrathionate hydrolase goes viral: secretion of a sulfur metabolism enzyme in the form of virus-like particles

artículo científico publicado en 2012

Archaeal virus with exceptional virion architecture and the largest single-stranded DNA genome ⬇️

artículo científico publicado el 23 de julio de 2012

Assessment of viral community functional potential from viral metagenomes may be hampered by contamination with cellular sequences.

artículo científico publicado en 2013

Author Correction: Cryptic inoviruses revealed as pervasive in bacteria and archaea across Earth's biomes

scientific article published on 01 March 2020

Bacterial Viruses Subcommittee and Archaeal Viruses Subcommittee of the ICTV: update of taxonomy changes in 2021

Binomial nomenclature for virus species: a consultation

scientific article published on 01 February 2020

Bipartite Network Analysis of the Archaeal Virosphere: Evolutionary Connections between Viruses and Capsidless Mobile Elements

artículo científico publicado en 2016

Calcium ion-dependent entry of the membrane-containing bacteriophage PM2 into its Pseudoalteromonas host

artículo científico publicado en 2010

Casposon integration shows strong target site preference and recapitulates protospacer integration by CRISPR-Cas systems

artículo científico publicado en 2016

Casposons: a new superfamily of self-synthesizing DNA transposons at the origin of prokaryotic CRISPR-Cas immunity

artículo científico publicado en 2014

Casposons: mobile genetic elements that gave rise to the CRISPR-Cas adaptation machinery

artículo científico publicado en 2017

Cellular domains and viral lineages

artículo científico publicado en 2014

Cellular origin of the viral capsid-like bacterial microcompartments

artículo científico publicado en 2017

Changes to taxonomy and the International Code of Virus Classification and Nomenclature ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2017).

artículo científico publicado en 2017

Changes to taxonomy and the International Code of Virus Classification and Nomenclature ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2018).

artículo científico publicado en 2018

Changes to virus taxonomy and the International Code of Virus Classification and Nomenclature ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2019)

scientific article published on 01 September 2019

Changes to virus taxonomy and the Statutes ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2020)

artículo científico publicado en 2020

Chimeric viruses blur the borders between the major groups of eukaryotic single-stranded DNA viruses

artículo científico publicado en 2013

Classify viruses - the gain is worth the pain

scientific article published on 01 February 2019

Comparative analysis of the mosaic genomes of tailed archaeal viruses and proviruses suggests common themes for virion architecture and assembly with tailed viruses of bacteria.

artículo científico publicado en 2010

Consensus statement: Virus taxonomy in the age of metagenomics

artículo científico publicado en 2017

Conservation of major and minor jelly-roll capsid proteins in Polinton (Maverick) transposons suggests that they are bona fide viruses

artículo científico publicado en 2014

Correction to: Binomial nomenclature for virus species: a consultation

artículo científico publicado en 2020

Crenarchaeal CdvA forms double-helical filaments containing DNA and interacts with ESCRT-III-like CdvB

artículo científico publicado en 2011

Cressdnaviricota: a virus phylum unifying 7 families of Rep-encoding viruses with single-stranded, circular DNA genomes

scientific article published on 08 April 2020

Cryptic inoviruses revealed as pervasive in bacteria and archaea across Earth's biomes

artículo científico publicado en 2019

DNA topoisomerase VIII: a novel subfamily of type IIB topoisomerases encoded by free or integrated plasmids in Archaea and Bacteria.

artículo científico publicado en 2014

Dark matter in archaeal genomes: a rich source of novel mobile elements, defense systems and secretory complexes.

artículo científico publicado en 2014

Deep Roots and Splendid Boughs of the Global Plant Virome

scientific article published on 27 May 2020

Discovery of an expansive bacteriophage family that includes the most abundant viruses from the human gut.

artículo científico publicado en 2017

Diversity, taxonomy, and evolution of archaeal viruses of the class Caudoviricetes

artículo científico publicado en 2021

Does the evolution of viral polymerases reflect the origin and evolution of viruses?

artículo científico publicado en 2009

Double-stranded DNA viruses: 20 families and only five different architectural principles for virion assembly ⬇️

artículo científico publicado el 2 de julio de 2011

Doubling of the known set of RNA viruses by metagenomic analysis of an aquatic virome

artículo científico publicado en 2020

Eukaryotic-Like Virus Budding in Archaea

artículo científico publicado en 2016

Evolution and diversity of the Microviridae viral family through a collection of 81 new complete genomes assembled from virome reads

artículo científico publicado en 2012

Evolution of adaptive immunity from transposable elements combined with innate immune systems

artículo científico publicado en 2014

Evolution of an archaeal virus nucleocapsid protein from the CRISPR-associated Cas4 nuclease

artículo científico publicado en 2015

Evolution of double-stranded DNA viruses of eukaryotes: from bacteriophages to transposons to giant viruses

artículo científico publicado en 2015

Evolution of eukaryotic single-stranded DNA viruses of the Bidnaviridae family from genes of four other groups of widely different viruses

artículo científico publicado en 2014

Evolution of replicative DNA polymerases in archaea and their contributions to the eukaryotic replication machinery

artículo científico publicado en 2014

Evolutionary entanglement of mobile genetic elements and host defence systems: guns for hire

artículo científico publicado en 2019

Expanding the type IIB DNA topoisomerase family: identification of new topoisomerase and topoisomerase-like proteins in mobile genetic elements

artículo científico publicado en 2019

Extracellular membrane vesicles harbouring viral genomes

artículo científico publicado en 2013

Fake virus particles generated by fluorescence microscopy.

artículo científico publicado en 2012

First insights into the entry process of hyperthermophilic archaeal viruses.

artículo científico publicado en 2013

Fusion of a superfamily 1 helicase and an inactivated DNA polymerase is a signature of common evolutionary history of Polintons, polinton-like viruses, Tlr1 transposons and transpovirons

artículo científico publicado en 2016

Gammasphaerolipovirus, a newly proposed bacteriophage genus, unifies viruses of halophilic archaea and thermophilic bacteria within the novel family Sphaerolipoviridae.

artículo científico publicado en 2014

Geminiviruses: a tale of a plasmid becoming a virus

artículo científico publicado en 2009

Genetics for Pseudoalteromonas provides tools to manipulate marine bacterial virus PM2.

artículo científico publicado en 2007

Genome characterization of lipid-containing marine bacteriophage PM2 by transposon insertion mutagenesis.

artículo científico publicado en 2006

Genomics and biology of Rudiviruses, a model for the study of virus-host interactions in Archaea

artículo científico

Genomics of Bacterial and Archaeal Viruses: Dynamics within the Prokaryotic Virosphere

artículo científico publicado en 2011

Genomoviridae: a new family of widespread single-stranded DNA viruses.

artículo científico publicado en 2016

Global Organization and Proposed Megataxonomy of the Virus World

artículo científico publicado en 2020

Guidance for creating individual and batch latinized binomial virus species names

artículo científico publicado en 2022

History of CRISPR-Cas from encounter with a mysterious repeated sequence to genome editing technology

artículo científico publicado en 2018

Holin of bacteriophage lambda: structural insights into a membrane lesion.

artículo científico publicado en 2008

Homologous Capsid Proteins Testify to the Common Ancestry of Retroviruses, Caulimoviruses, Pseudoviruses, and Metaviruses

artículo científico publicado en 2017

Identification and functional analysis of the Rz/Rz1-like accessory lysis genes in the membrane-containing bacteriophage PRD1

artículo científico publicado en 2008

Insights into dynamics of mobile genetic elements in hyperthermophilic environments from five new Thermococcus plasmids

artículo científico publicado en 2013

Integrated mobile genetic elements in Thaumarchaeota.

artículo científico publicado en 2019

Isolation and Characterization of Bacteriophages That Infect Citrobacter rodentium, a Model Pathogen for Intestinal Diseases

scientific article published on 08 July 2020

Living side by side with a virus: characterization of two novel plasmids from Thermococcus prieurii, a host for the spindle-shaped virus TPV1.

artículo científico publicado en 2013

Membrane vesicles in natural environments: a major challenge in viral ecology

artículo científico publicado en 2015

Microviridae goes temperate: microvirus-related proviruses reside in the genomes of Bacteroidetes

artículo científico publicado en 2011

Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)

artículo científico publicado en 2018

Model for a novel membrane envelope in a filamentous hyperthermophilic virus

artículo científico publicado en 2017

Multiple layers of chimerism in a single-stranded DNA virus discovered by deep sequencing

artículo científico publicado en 2015

Multiple origins of prokaryotic and eukaryotic single-stranded DNA viruses from bacterial and archaeal plasmids

artículo científico publicado en 2019

Multiple origins of viral capsid proteins from cellular ancestors

artículo científico publicado en 2017

Mysterious hexagonal pyramids on the surface of Pyrobaculum cells

artículo científico publicado en 2015

Nanohaloarchaea as beneficiaries of xylan degradation by haloarchaea

artículo científico publicado en 2023

Networks of evolutionary interactions underlying the polyphyletic origin of ssDNA viruses ⬇️

artículo científico publicado el 10 de julio de 2013

New archaeal viruses discovered by metagenomic analysis of viral communities in enrichment cultures

article

New virus isolates from Italian hydrothermal environments underscore the biogeographic pattern in archaeal virus communities

artículo científico publicado en 2020

Novel haloarchaeal viruses from Lake Retba infecting Haloferax and Halorubrum species

artículo científico publicado en 2019

Numerous cultivated and uncultivated viruses encode ribosomal proteins

artículo científico publicado en 2019

Order to the viral universe

artículo científico publicado en 2010

Origin of programmed cell death from antiviral defense?

artículo científico publicado en 2019

Origin of viruses: primordial replicators recruiting capsids from hosts

artículo científico publicado en 2019

Origins and Evolution of the Global RNA Virome

artículo científico publicado en 2018

Origins and Evolution of the Global RNA Virome

artículo científico publicado en 2018

Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity

artículo científico publicado en 2015

Ortervirales: A new viral order unifying five families of reverse-transcribing viruses

artículo científico publicado en 2018

Pervasive Chimerism in the Replication-Associated Proteins of Uncultured Single-Stranded DNA Viruses.

artículo científico publicado en 2018

Phages build anti-defence barriers

artículo científico publicado en 2020

Plant virus movement proteins originated from jelly-roll capsid proteins

artículo científico publicado en 2023

Plant viruses of the Amalgaviridae family evolved via recombination between viruses with double-stranded and negative-strand RNA genomes

artículo científico publicado en 2015

Polintons, virophages and transpovirons: a tangled web linking viruses, transposons and immunity.

artículo científico publicado en 2017

Polintons: a hotbed of eukaryotic virus, transposon and plasmid evolution

artículo científico publicado en 2014

Polymyxin B induces lysis of marine pseudoalteromonads

artículo científico publicado en 2007

Postcards from the edge: structural genomics of archaeal viruses

artículo científico

Protein A33 responsible for antibody-resistant spread of Vaccinia virus is homologous to C-type lectin-like proteins

artículo científico publicado en 2010

Protein-protein interactions leading to recruitment of the host DNA sliding clamp by the hyperthermophilic Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2

artículo científico publicado en 2014

Putative prophages related to lytic tailless marine dsDNA phage PM2 are widespread in the genomes of aquatic bacteria

artículo científico publicado en 2007

Recent Mobility of Casposons, Self-Synthesizing Transposons at the Origin of the CRISPR-Cas Immunity

artículo científico publicado en 2016

Recent changes to virus taxonomy ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2022)

artículo científico publicado en 2022

Recombination between RNA viruses and plasmids might have played a central role in the origin and evolution of small DNA viruses.

artículo científico publicado en 2012

Reply to Holmes and Duchêne, "Can Sequence Phylogenies Safely Infer the Origin of the Global Virome?": Deep Phylogenetic Analysis of RNA Viruses Is Highly Challenging but Not Meaningless

scientific article published on 16 April 2019

Self-synthesizing transposons: unexpected key players in the evolution of viruses and defense systems

artículo científico publicado en 2016

Sequence motifs recognized by the casposon integrase of Aciduliprofundum boonei

artículo científico publicado en 2019

Single-stranded DNA viruses employ a variety of mechanisms for integration into host genomes

artículo científico publicado en 2015

Smacoviridae: a new family of animal-associated single-stranded DNA viruses

artículo científico publicado en 2018

Spindle-shaped archaeal viruses evolved from rod-shaped ancestors to package a larger genome

artículo científico publicado en 2022

Spindle-shaped viruses infect marine ammonia-oxidizing thaumarchaea

scientific article published on 16 July 2019

Structural conservation in a membrane-enveloped filamentous virus infecting a hyperthermophilic acidophile

artículo científico publicado en 2018

Structures of filamentous viruses infecting hyperthermophilic archaea explain DNA stabilization in extreme environments

scientific article published on 05 August 2020

Sulfolobus Spindle-Shaped Virus 1 Contains Glycosylated Capsid Proteins, a Cellular Chromatin Protein, and Host-Derived Lipids

artículo científico publicado en 2015

Taxonomic assignment of uncultivated prokaryotic virus genomes is enabled by gene-sharing networks

artículo científico publicado en 2019

Taxonomy of prokaryotic viruses: 2016 update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee

artículo científico publicado en 2016

Taxonomy of prokaryotic viruses: 2017 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee.

artículo científico publicado en 2018

Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee

scientific article published on 11 March 2020

Taxonomy of prokaryotic viruses: update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee

artículo científico publicado en 2016

Taxonomy of the family Arenaviridae and the order Bunyavirales: update 2018.

artículo científico publicado en 2018

Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2018.

artículo científico publicado en 2018

The Double-Stranded DNA Virosphere as a Modular Hierarchical Network of Gene Sharing

artículo científico publicado en 2016

The Evolutionary History of Archaeal MCM Helicases: A Case Study of Vertical Evolution Combined with Hitchhiking of Mobile Genetic Elements

artículo científico publicado en 2010

The LUCA and its complex virome

artículo científico publicado en 2020

The Origin of Virions and Virocells: The Escape Hypothesis Revisited

The Sulfolobus rod-shaped virus 2 encodes a prominent structural component of the unique virion release system in Archaea.

artículo científico publicado en 2010

The depths of virus exaptation

The depths of virus exaptation

The enigmatic archaeal virosphere

artículo científico publicado en 2017

The logic of DNA replication in double-stranded DNA viruses: insights from global analysis of viral genomes

artículo científico publicado en 2016

The replication machinery of LUCA: common origin of DNA replication and transcription

artículo científico publicado en 2020

Three families of Asgard archaeal viruses identified in metagenome-assembled genomes

artículo científico publicado en 2022

Unification of the globally distributed spindle-shaped viruses of the Archaea

artículo científico publicado en 2013

Unique architecture of thermophilic archaeal virus APBV1 and its genome packaging.

artículo científico publicado en 2017

Varidnaviruses in the Human Gut: A Major Expansion of the Order Vinavirales

Vast diversity of prokaryotic virus genomes encoding double jelly-roll major capsid proteins uncovered by genomic and metagenomic sequence analysis

artículo científico publicado en 2018

Virology. A virus that infects a hyperthermophile encapsidates A-form DNA

artículo científico publicado en 2015

Virology. Revealing virus-host interplay

artículo científico publicado en 2011

Virology: A parasite's parasite saves host's neighbours

artículo científico publicado en 2016

Virophages or satellite viruses?

artículo científico publicado en 2011

Virus evolution: how far does the double beta-barrel viral lineage extend?

artículo científico publicado en 2008

Virus taxonomy and the role of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)

Virus-borne mini-CRISPR arrays are involved in interviral conflicts

scientific article published on 15 November 2019

Virus-mediated archaeal hecatomb in the deep seafloor

artículo científico publicado en 2016

Viruses Defined by the Position of the Virosphere within the Replicator Space

artículo científico publicado en 2021

Viruses of archaea: Structural, functional, environmental and evolutionary genomics.

artículo científico publicado en 2017

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