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Lista de obras de Timothy J. Donohue

A Cardiolipin-Deficient Mutant of Rhodobacter sphaeroides Has an Altered Cell Shape and Is Impaired in Biofilm Formation.

artículo científico publicado en 2015

A Conserved Structural Module Regulates Transcriptional Responses to Diverse Stress Signals in Bacteria

artículo científico publicado en 2007

A Rhodobacter sphaeroides protein mechanistically similar to Escherichia coli DksA regulates photosynthetic growth

artículo científico publicado en 2014

A bacterial biosynthetic pathway for methylated furan fatty acids

scientific article published on 20 May 2020

A broad specificity β-propeller enzyme from Rhodopseudomonas palustris that hydrolyzes many lactones including γ-valerolactone

artículo científico publicado en 2023

A computational strategy to analyze label-free temporal bottom-up proteomics data

artículo científico publicado en 2008

A group of sequence-related sphingomonad enzymes catalyzes cleavage of β-aryl ether linkages in lignin β-guaiacyl and β-syringyl ether dimers

artículo científico publicado en 2014

A heterodimeric glutathione S-transferase that stereospecifically breaks lignin's β(R)-aryl ether bond reveals the diversity of bacterial β-etherases

scientific article published on 12 December 2018

A majority of Rhodobacter sphaeroides promoters lack a crucial RNA polymerase recognition feature, enabling coordinated transcription activation

artículo científico publicado en 2020

A transcriptional response to singlet oxygen, a toxic byproduct of photosynthesis

artículo científico publicado en 2005

Activation of the cycA P2 promoter for the Rhodobacter sphaeroides cytochrome c2 gene by the photosynthesis response regulator

artículo científico publicado en 1999

Activation of the global gene regulator PrrA (RegA) from Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 2006

Activity of Rhodobacter sphaeroides RpoHII, a second member of the heat shock sigma factor family.

artículo científico publicado en 2006

An insect herbivore microbiome with high plant biomass-degrading capacity

artículo científico publicado en 2010

An integrated approach to reconstructing genome-scale transcriptional regulatory networks

artículo científico publicado en 2015

Anaerobic Degradation of Syringic Acid by an Adapted Strain of Rhodopseudomonas palustris

artículo científico publicado en 2020

Application of the accurate mass and time tag approach to the proteome analysis of sub-cellular fractions obtained from Rhodobacter sphaeroides 2.4.1. Aerobic and photosynthetic cell cultures

artículo científico publicado en 2006

Aromatic Dimer Dehydrogenases from <i>Novosphingobium aromaticivorans</i> Reduce Monoaromatic Diketones

artículo científico publicado en 2021

Bacterial responses to photo-oxidative stress

artículo científico publicado en 2009

Benzoyl Coenzyme A Pathway-Mediated Metabolism of meta -Hydroxy-Aromatic Acids in Rhodopseudomonas palustris ⬇️

artículo científico publicado el 12 de julio de 2013

Biosynthesis of the photosynthetic membranes of Rhodopseudomonas sphaeroides

artículo científico publicado en 1983

COnTORT: COmprehensive Transcriptomic ORganizational Tool for Simultaneously Retrieving and Organizing Numerous Gene Expression Data Sets from the NCBI Gene Expression Omnibus Database

scientific article published on 18 June 2020

CceR and AkgR regulate central carbon and energy metabolism in alphaproteobacteria

artículo científico publicado en 2015

Characterization of Rhodobacter sphaeroides cytochrome c(2) proteins with altered heme attachment sites

artículo científico publicado en 2001

Chemistry and combustion of fit-for-purpose biofuels.

artículo científico publicado en 2013

Combining Genome-Scale Experimental and Computational Methods To Identify Essential Genes in Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 2017

Comparison of aerobic and photosynthetic Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 proteomes

artículo científico publicado en 2006

Conservation of thiol-oxidative stress responses regulated by SigR orthologues in actinomycetes.

artículo científico publicado en 2012

Convergence of the transcriptional responses to heat shock and singlet oxygen stresses

artículo científico publicado en 2012

Development of a GC/Quadrupole-Orbitrap mass spectrometer, part I: design and characterization

artículo científico publicado en 2014

Development of a solar-powered microbial fuel cell

artículo científico publicado en 2007

Development of the bacterial photosynthetic apparatus

artículo científico publicado en 2006

Diagnosing and Predicting Mixed-Culture Fermentations with Unicellular and Guild-Based Metabolic Models

artículo científico publicado en 2020

Differences in two Pseudomonas aeruginosa cbb3 cytochrome oxidases

scientific journal article

Different Functions of Phylogenetically Distinct Bacterial Complex I Isozymes

artículo científico publicado en 2016

Discovery of the extracytoplasmic function σ factors

artículo científico publicado en 2019

Electron Partitioning During Light- and Nutrient-Powered Hydrogen Production by Rhodobacter sphaeroides

article

Engineering <i>Novosphingobium aromaticivorans</i> to produce <i>cis,cis</i> -muconic acid from biomass aromatics

artículo científico publicado en 2024

Exploring the Meta-regulon of the CRP/FNR Family of Global Transcriptional Regulators in a Partial-Nitritation Anammox Microbiome

artículo científico publicado en 2021

Extracytoplasmic function σ factors of the widely distributed group ECF41 contain a fused regulatory domain

artículo científico publicado en 2012

Features of Rhodobacter sphaeroides CcmFH.

artículo científico publicado en 2003

Features of Rhodobacter sphaeroides ChrR required for stimuli to promote the dissociation of σ(E)/ChrR complexes

artículo científico publicado en 2011

Function of a glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase in Rhodobacter sphaeroides formaldehyde oxidation and assimilation

artículo científico publicado en 1998

Genetic and physical mapping of the Rhodobacter sphaeroides photosynthetic gene cluster from R-prime pWS2

artículo científico publicado en 1991

Genome-Wide Identification of Transcription Start Sites in Two Alphaproteobacteria, Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 and Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444

scientific article published on 03 September 2020

Global analysis of photosynthesis transcriptional regulatory networks.

artículo científico publicado en 2014

Global insights into energetic and metabolic networks in Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 2013

Hierarchical regulation of photosynthesis gene expression by the oxygen-responsive PrrBA and AppA-PpsR systems of Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 2008

Identification of genes required for recycling reducing power during photosynthetic growth.

artículo científico publicado en 2005

Identification of proteins involved in formaldehyde metabolism by Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 2008

Imaging of the Temporomandibular Joint in Juvenile Idiopathic Arthritis: How Does Quantitative Compare to Semiquantitative MRI Scoring?

scientific article published on 11 December 2018

In vitro enzymatic depolymerization of lignin with release of syringyl, guaiacyl, and tricin units

artículo científico publicado en 2017

Interactions between the Rhodobacter sphaeroides ECF sigma factor, sigma(E), and its anti-sigma factor, ChrR.

artículo científico publicado en 2004

Link between the membrane-bound pyridine nucleotide transhydrogenase and glutathione-dependent processes in Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 2002

Maximizing reductant flow into microbial H2 production.

artículo científico publicado en 2011

Medium-Chain Fatty Acid Synthesis by "Candidatus Weimeria bifida" gen. nov., sp. nov., and "Candidatus Pseudoramibacter fermentans" sp. nov

scientific article published on 21 January 2020

Metagenome-Assembled Genomes from a Microbiome Converting Xylose to Medium-Chain Carboxylic Acids

publication published on 28 March 2022

Metagenome-Assembled Genomes from a Microbiome Grown in Dairy Manure Hydrolysate

artículo científico publicado en 2022

Metagenomes and Metagenome-Assembled Genomes from Microbial Communities Fermenting Ultrafiltered Milk Permeate

artículo científico publicado en 2022

Metagenomes and Metagenome-Assembled Genomes from Microbiomes Metabolizing Thin Stillage from an Ethanol Biorefinery

artículo científico publicado en 2022

Metatranscriptomic and Thermodynamic Insights into Medium-Chain Fatty Acid Production Using an Anaerobic Microbiome

artículo científico publicado en 2018

Microbes in the energy grid

artículo científico publicado en 2008

Microorganisms and clean energy

artículo científico publicado en 2006

Molecular phylogeny of Archaea from soil.

artículo científico publicado en 1997

Mutational analysis of the C-terminal domain of the Rhodobacter sphaeroides response regulator PrrA.

artículo científico publicado en 2005

Mutations That Alter the Bacterial Cell Envelope Increase Lipid Production.

artículo científico publicado en 2017

Novosphingobium aromaticivorans uses a Nu-class glutathione-S-transferase as a glutathione lyase in breaking the β-aryl ether bond of lignin

artículo científico publicado en 2018

Oxygen-dependent regulation of bacterial lipid production

artículo científico publicado en 2015

Pathways for transcriptional activation of a glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase gene

artículo científico publicado en 1998

Pathways involved in reductant distribution during photobiological H(2) production by Rhodobacter sphaeroides.

artículo científico publicado en 2011

Phenotypic and genetic characterization of cytochrome c2 deficient mutants of Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 1988

Phylogenomic analysis and predicted physiological role of the proton-translocating NADH:quinone oxidoreductase (complex I) across bacteria

artículo científico publicado en 2015

Policy proposal for publication of papers with data sets from genome-wide studies

artículo científico publicado en 2004

Positive and negative transcriptional regulators of glutathione-dependent formaldehyde metabolism

artículo científico publicado en 2004

Production of carotenoids from aromatics and pretreated lignocellulosic biomass by <i>Novosphingobium aromaticivorans</i>

artículo científico publicado en 2023

Promoter Architecture Differences among <i>Alphaproteobacteria</i> and Other Bacterial Taxa

artículo científico publicado en 2021

Proteomic characterization of the Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 photosynthetic membrane: identification of new proteins

artículo científico publicado en 2007

Pseudomonas aeruginosa RoxR, a response regulator related to Rhodobacter sphaeroides PrrA, activates expression of the cyanide-insensitive terminal oxidase

scientific journal article

Purification and characterization of an N-acylphosphatidylserine from Rhodopseudomonas sphaeroides

artículo científico publicado en 1982

Purification of Rhodobacter sphaeroides RNA polymerase and its sigma factors

artículo científico publicado en 2003

Quantifying the effects of light intensity on bioproduction and maintenance energy during photosynthetic growth of Rhodobacter sphaeroides

artículo científico publicado en 2014

Reactions of isocytochrome c2 in the photosynthetic electron transfer chain of Rhodobacter sphaeroides

scientific article published on 01 January 1997

Reconstruction of the core and extended regulons of global transcription factors

artículo científico publicado en 2010

Regulation of a cytochrome c2 isoform in wild-type and cytochrome c2 mutant strains of Rhodobacter sphaeroides ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 1992

Rewiring the specificity of extracytoplasmic function sigma factors

artículo científico publicado en 2020

Roles for the Rhodobacter sphaeroides CcmA and CcmG proteins

artículo científico publicado en 2001

Shedding light on a Group IV (ECF11) alternative σ factor

scientific article published on 31 May 2019

Signal correlations in ecological niches can shape the organization and evolution of bacterial gene regulatory networks

artículo científico publicado en 2012

Specificity of the attenuation response of the threonine operon of Escherichia coli is determined by the threonine and isoleucine codons in the leader transcript

artículo científico publicado en 1987

Stereochemical features of glutathione-dependent enzymes in the Sphingobium sp. strain SYK-6 β-aryl etherase pathway.

artículo científico publicado en 2014

Synthesis and scavenging role of furan fatty acids.

artículo científico publicado en 2014

Targeted sigma factor turnover inserts negative control into a positive feedback loop

artículo científico publicado en 2009

The NtrYX Two-Component System Regulates the Bacterial Cell Envelope

scientific article published on 19 May 2020

The Rhodobacter sphaeroides ECF sigma factor, sigma(E), and the target promoters cycA P3 and rpoE P1

artículo científico publicado en 1999

The home stretch, a first analysis of the nearly completed genome of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1.

artículo científico publicado en 2001

The importance of zinc-binding to the function of Rhodobacter sphaeroides ChrR as an anti-sigma factor

artículo científico publicado en 2001

The puf operon region of Rhodobacter sphaeroides

artículo científico

The role of CenKR in the coordination of <i>Rhodobacter sphaeroides</i> cell elongation and division

artículo científico publicado en 2023

Toward a Predictive Understanding of Earth's Microbiomes to Address 21st Century Challenges

artículo científico publicado en 2016

Transcriptional activation of the Rhodobacter sphaeroides cytochrome c(2) gene P2 promoter by the response regulator PrrA

artículo científico publicado en 2002

Use of an adenosine triphosphate analog, adenylyl imidodiphosphate, to evaluate adenosine triphosphate-dependent reactions in mitochondria

artículo científico publicado en 1976

delta-Aminolevulinate couples cycA transcription to changes in heme availability in Rhodobacter sphaeroides.

artículo científico publicado en 1992

iRsp1095: a genome-scale reconstruction of the Rhodobacter sphaeroides metabolic network

artículo científico publicado en 2011

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