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Lista de obras de Fernando de la Cruz

A bacterial TrwC relaxase domain contains a thermally stable alpha-helical core.

artículo científico publicado en 2003

A bacterial conjugation machinery recruited for pathogenesis

artículo científico publicado en 2003

A classification scheme for mobilization regions of bacterial plasmids.

artículo científico publicado en 2004

A degenerate primer MOB typing (DPMT) method to classify gamma-proteobacterial plasmids in clinical and environmental settings

artículo científico publicado en 2012

A high security double lock and key mechanism in HUH relaxases controls oriT-processing for plasmid conjugation

artículo científico publicado en 2014

A new domain of conjugative relaxase TrwC responsible for efficient oriT-specific recombination on minimal target sequences

artículo científico publicado en 2006

ATPase activity and oligomeric state of TrwK, the VirB4 homologue of the plasmid R388 type IV secretion system

artículo científico publicado en 2008

AcCNET (Accessory Genome Constellation Network): comparative genomics software for accessory genome analysis using bipartite networks.

artículo científico publicado en 2016

Analysis of ColE1 MbeC unveils an extended ribbon-helix-helix family of nicking accessory proteins.

artículo científico publicado en 2008

Analysis of DNA processing reactions in bacterial conjugation by using suicide oligonucleotides.

artículo científico publicado en 2007

ArdC, a ssDNA-binding protein with a metalloprotease domain, overpasses the recipient hsdRMS restriction system broadening conjugation host range

artículo científico publicado en 2020

Association of Composite IS 26-sul3 Elements with Highly Transmissible IncI1 Plasmids in Extended-Spectrum-β-Lactamase-Producing Escherichia coli Clones from Humans

artículo científico publicado el 22 de febrero de 2011

Autoinhibitory regulation of TrwK, an essential VirB4 ATPase in type IV secretion systems

artículo científico publicado en 2011

Bacterial computing with engineered populations

artículo científico

Biochemical interactions between LPS and LPS-binding molecules

scientific article published on 13 January 2020

Blueprint for a minimal photoautotrophic cell: conserved and variable genes in Synechococcus elongatus PCC 7942.

artículo científico publicado en 2011

Breaking and joining single-stranded DNA: the HUH endonuclease superfamily

artículo científico publicado en 2013

CRISPR-Cas systems preferentially target the leading regions of MOBF conjugative plasmids.

artículo científico publicado en 2013

Carriage of Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Plasmids Does Not Reduce Fitness but Enhances Virulence in Some Strains of Pandemic E. coli Lineages.

artículo científico publicado en 2016

Catalytic domain of plasmid pAD1 relaxase TraX defines a group of relaxases related to restriction endonucleases

artículo científico publicado en 2013

Changing the recognition site of a conjugative relaxase by rational design.

artículo científico publicado en 2009

Characterization of ATP and DNA Binding Activities of TrwB, the Coupling Protein Essential in Plasmid R388 Conjugation

scientific article published in Journal of Biological Chemistry

Characterization of the new insertion sequence IS91 from an alpha-hemolysin plasmid of Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1984

Comparative Genomics of the Conjugation Region of F-like Plasmids: Five Shades of F.

artículo científico publicado en 2016

Complementation of transposition of tnpA mutants of Tn3, Tn21, Tn501, and Tn1721

artículo científico publicado en 1982

Concerted action of NIC relaxase and auxiliary protein MobC in RA3 plasmid conjugation.

artículo científico publicado en 2016

Conjugation Inhibitors and Their Potential Use to Prevent Dissemination of Antibiotic Resistance Genes in Bacteria.

artículo científico publicado en 2017

Conjugation inhibitors compete with palmitic acid for binding to the conjugative traffic ATPase TrwD, providing a mechanism to inhibit bacterial conjugation

scientific article published on 10 September 2018

Conjugative DNA metabolism in Gram-negative bacteria

artículo científico publicado en 2010

Conjugative plasmid protein TrwB, an integral membrane type IV secretion system coupling protein. Detailed structural features and mapping of the active site cleft

artículo científico publicado en 2001

Conjugative transfer can be inhibited by blocking relaxase activity within recipient cells with intrabodies.

artículo científico publicado en 2006

Construction and properties of a family of pACYC184-derived cloning vectors compatible with pBR322 and its derivatives

artículo científico publicado en 1991

Construction of a family of Mycobacterium/Escherichia coli shuttle vectors derived from pAL5000 and pACYC184: their use for cloning an antibiotic-resistance gene from Mycobacterium fortuitum.

artículo científico publicado en 1996

Correlation between hepatitis B viremia and the clinical and histological activity of chronic delta hepatitis

artículo científico publicado en 1994

DNA binding properties of protein TrwA, a possible structural variant of the Arc repressor superfamily

artículo científico publicado en 2004

Degenerate primer MOB typing of multiresistant clinical isolates of E. coli uncovers new plasmid backbones.

artículo científico publicado en 2014

Deletion of a single helix from the transmembrane domain causes large changes in membrane insertion properties and secondary structure of the bacterial conjugation protein TrwB.

artículo científico publicado en 2012

Design of Novel Relaxase Substrates Based on Rolling Circle Replicases for Bioconjugation to DNA Nanostructures

artículo científico publicado en 2016

Determination of conjugation rates on solid surfaces

artículo científico publicado en 2012

Different pathways to acquiring resistance genes illustrated by the recent evolution of IncW plasmids.

artículo científico publicado en 2008

Dissemination of cephalosporin resistance genes between Escherichia coli strains from farm animals and humans by specific plasmid lineages

artículo científico publicado en 2014

Distribution of IS91 family insertion sequences in bacterial genomes: evolutionary implications

artículo científico publicado en 2002

Dynamical Task Switching in Cellular Computers

artículo científico publicado en 2019

Dynamics of the IncW genetic backbone imply general trends in conjugative plasmid evolution.

artículo científico publicado en 2006

Ecology and evolution as targets: the need for novel eco-evo drugs and strategies to fight antibiotic resistance

scientific article published on 16 May 2011

Engineering the fatty acid synthesis pathway in PCC 7942 improves omega-3 fatty acid production

artículo científico publicado en 2018

Enzymology of type IV macromolecule secretion systems: the conjugative transfer regions of plasmids RP4 and R388 and the cag pathogenicity island of Helicobacter pylori encode structurally and functionally related nucleoside triphosphate hydrolases

artículo científico publicado en 2000

Escherichia coli alpha-haemolysin synthesis and export genes are flanked by a direct repetition of IS91-like elements

article

Escherichia coli genes affecting recipient ability in plasmid conjugation: are there any?

artículo científico publicado en 2009

Escherichia coli hha mutants, DNA supercoiling and expression of the haemolysin genes from the recombinant plasmid pANN202-312.

artículo científico publicado en 1993

Evolution of conjugation and type IV secretion systems

artículo científico publicado en 2012

Factors that affect transposition mediated by the Tn21 transposase

scientific article published on 01 July 1988

Four main virotypes among extended-spectrum-β-lactamase-producing isolates of Escherichia coli O25b:H4-B2-ST131: bacterial, epidemiological, and clinical characteristics.

artículo científico publicado en 2013

Functional dissection of the conjugative coupling protein TrwB.

artículo científico publicado en 2010

Functional domains in protein TrwC of plasmid R388: dissected DNA strand transferase and DNA helicase activities reconstitute protein function.

artículo científico publicado en 1996

Functional interactions between type IV secretion systems involved in DNA transfer and virulence

artículo científico publicado en 2005

Functional interactions of VirB11 traffic ATPases with VirB4 and VirD4 molecular motors in type IV secretion systems

artículo científico publicado en 2013

Genetic and biochemical characterization of MbeA, the relaxase involved in plasmid ColE1 conjugative mobilization

artículo científico publicado en 2003

Genetic evidence of a coupling role for the TraG protein family in bacterial conjugation

artículo científico publicado en 1997

Genetic organization of the conjugal DNA processing region of the IncW plasmid R388.

artículo científico publicado en 1994

Genetics of the replication and maintenance functions of the hemolytic plasmid pSU316. Cloning of an IncFIII determinant

article

Genomic analysis of the emergence and evolution of multidrug resistance during a Klebsiella pneumoniae outbreak including carbapenem and colistin resistance.

artículo científico publicado en 2013

Genomic and metagenomic technologies to explore the antibiotic resistance mobilome

artículo científico publicado en 2016

Genomics of high molecular weight plasmids isolated from an on-farm biopurification system

artículo científico publicado en 2016

Heterologous expression of a thermophilic diacylglycerol acyltransferase triggers triglyceride accumulation in Escherichia coli.

artículo científico publicado en 2017

Horizontal gene transfer and the origin of species: lessons from bacteria.

artículo científico publicado en 2000

Host Range and Genetic Plasticity Explain the Coexistence of Integrative and Extrachromosomal Mobile Genetic Elements

artículo científico publicado en 2018

Host range and genetic plasticity explain the co-existence of integrative and extrachromosomal mobile genetic elements

scholarly article by Jean Cury published in June 2018

IS91 transposase is related to the rolling-circle-type replication proteins of the pUB110 family of plasmids

artículo científico publicado en 1992

Identification of Xenologs and Their Characteristic Low Expression Levels in the Cyanobacterium Synechococcus elongatus.

artículo científico publicado en 2015

Identification of bacterial plasmids based on mobility and plasmid population biology.

artículo científico publicado en 2011

In vivo transmission of a plasmid coharbouring bla and qnrB genes between Escherichia coli and Serratia marcescens.

artículo científico publicado en 2010

In-depth resistome analysis by targeted metagenomics.

artículo científico publicado en 2018

Incompatibility among alpha-hemolytic plasmids studied after inactivation of the alpha-hemolysin gene by transposition of Tn802.

artículo científico publicado en 1979

Interaction between relaxase MbeA and accessory protein MbeC of the conjugally mobilizable plasmid ColE1.

artículo científico publicado en 2012

Intramolecular transposition of insertion sequence IS91 results in second-site simple insertions.

artículo científico publicado en 1999

Junction sequences generated by 'one-ended transposition'.

artículo científico publicado en 1985

Membrane insertion stabilizes the structure of TrwB, the R388 conjugative plasmid coupling protein.

artículo científico publicado en 2011

Mobility of plasmids.

artículo científico publicado en 2010

Molecular epidemiology and virulence of Escherichia coli O16:H5-ST131: comparison with H30 and H30-Rx subclones of O25b:H4-ST131.

artículo científico publicado en 2014

Multicellular computing using conjugation for wiring

artículo científico publicado en 2013

Nanobiotechnology

scientific article published on 07 June 2012

Natural and Artificial Strategies To Control the Conjugative Transmission of Plasmids.

artículo científico publicado en 2018

Negative feedback and transcriptional overshooting in a regulatory network for horizontal gene transfer.

artículo científico publicado en 2014

Negative feedback increases information transmission, enabling bacteria to discriminate sublethal antibiotic concentrations

article

Numbers on the edges: A simplified and scalable method for quantifying the Gene Regulation Function

article

Orthogonal Protein Assembly on DNA Nanostructures Using Relaxases

artículo científico publicado en 2016

PLACNETw: a web-based tool for plasmid reconstruction from bacterial genomes

artículo científico publicado en 2017

Physical and genetic map of the IncW plasmid R388

artículo científico publicado en 1988

PifC and Osa, Plasmid Weapons against Rival Conjugative Coupling Proteins.

artículo científico publicado en 2017

PipX, the coactivator of NtcA, is a global regulator in cyanobacteria

artículo científico publicado en 2014

Plasmid Diversity and Adaptation Analyzed by Massive Sequencing of Escherichia coli Plasmids

artículo científico

Plasmid R6K contains two functional oriTs which can assemble simultaneously in relaxosomes in vivo

artículo científico publicado en 1996

Plasmid flux in Escherichia coli ST131 sublineages, analyzed by plasmid constellation network (PLACNET), a new method for plasmid reconstruction from whole genome sequences.

artículo científico publicado en 2014

Plasmid r1 conjugative DNA processing is regulated at the coupling protein interface.

artículo científico publicado en 2009

Plasmid typing and genetic context of AmpC β-lactamases in Enterobacteriaceae lacking inducible chromosomal ampC genes: findings from a Spanish hospital 1999-2007.

artículo científico publicado en 2011

Plasmids containing one inverted repeat of Tn21 can fuse with other plasmids in the presence of Tn21 transposase

artículo científico publicado en 1984

Population genomics and antimicrobial resistance dynamics of Escherichia coli in wastewater and river environments

artículo científico publicado en 2021

Purification and biochemical characterization of TrwC, the helicase involved in plasmid R388 conjugal DNA transfer.

artículo científico publicado en 1994

Purification and properties of TrwB, a hexameric, ATP-binding integral membrane protein essential for R388 plasmid conjugation

artículo científico publicado en 2002

Purification of α-hemolysin from an overproducing E. coli strain

artículo científico publicado en 1985

Regulation of finP transcription by DNA adenine methylation in the virulence plasmid of Salmonella enterica

artículo científico publicado en 2005

Regulation of the type IV secretion ATPase TrwD by magnesium: implications for catalytic mechanism of the secretion ATPase superfamily.

artículo científico publicado en 2012

Relaxase DNA binding and cleavage are two distinguishable steps in conjugative DNA processing that involve different sequence elements of the nic site

artículo científico

Relaxases and Plasmid Transfer in Gram-Negative Bacteria.

artículo científico publicado en 2017

Release of lipid vesicle contents by the bacterial protein toxin alpha-haemolysin.

artículo científico publicado en 1993

Role of IncHI2 plasmids harbouring blaVIM-1, blaCTX-M-9, aac(6')-Ib and qnrA genes in the spread of multiresistant Enterobacter cloacae and Klebsiella pneumoniae strains in different units at Hospital Vall d'Hebron, Barcelona, Spain.

artículo científico publicado en 2012

Role of the transmembrane domain in the stability of TrwB, an integral protein involved in bacterial conjugation

artículo científico

Single-stranded DNA intermediates in IS91 rolling-circle transposition

artículo científico publicado en 2001

Site-specific recombination and shuffling of resistance genes in transposon Tn21

artículo científico publicado el 1 de julio de 1991

Specificity of insertion of IS91, an insertion sequence present in alpha-haemolysin plasmids of Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1989

Spread of bla(CTX-M-14) is driven mainly by IncK plasmids disseminated among Escherichia coli phylogroups A, B1, and D in Spain.

artículo científico publicado en 2009

Structural and functional analysis of the origin of conjugal transfer of the broad-host-range IncW plasmid R388 and comparison with the related IncN plasmid R46.

artículo científico publicado en 1991

Structural independence of conjugative coupling protein TrwB from its Type IV secretion machinery

artículo científico publicado en 2013

Structure and role of coupling proteins in conjugal DNA transfer.

artículo científico publicado en 2002

Subcellular location of the coupling protein TrwB and the role of its transmembrane domain

artículo científico publicado en 2013

Substrate translocation involves specific lysine residues of the central channel of the conjugative coupling protein TrwB.

artículo científico publicado en 2017

Synthetic Fatty Acids Prevent Plasmid-Mediated Horizontal Gene Transfer

artículo científico publicado en 2015

Tanzawaic Acids, a Chemically Novel Set of Bacterial Conjugation Inhibitors

artículo científico publicado en 2016

The ATPase activity of the DNA transporter TrwB is modulated by protein TrwA: implications for a common assembly mechanism of DNA translocating motors

artículo científico publicado en 2007

The Hha protein from Escherichia coli is highly homologous to the YmoA protein from Yersinia enterocolitica

artículo científico publicado en 1992

The bacterial conjugation protein TrwB resembles ring helicases and F1-ATPase

artículo científico publicado en 2001

The calcium-binding C-terminal domain of Escherichia coli alpha-hemolysin is a major determinant in the surface-active properties of the protein.

artículo científico publicado en 2007

The conjugative DNA translocase TrwB is a structure-specific DNA-binding protein

artículo científico

The hexameric structure of a conjugative VirB4 protein ATPase provides new insights for a functional and phylogenetic relationship with DNA translocases

artículo científico publicado en 2012

The hha gene modulates haemolysin expression in Escherichia coli

artículo científico publicado en 1991

The relaxase of the Rhizobium etli symbiotic plasmid shows nic site cis-acting preference.

artículo científico

The stb operon balances the requirements for vegetative stability and conjugative transfer of plasmid R388

artículo científico publicado en 2011

The transmembrane domain of the T4SS coupling protein TrwB and its role in protein-protein interactions

artículo científico publicado en 2013

The transmembrane domain provides nucleotide binding specificity to the bacterial conjugation protein TrwB

scientific article published on 27 April 2006

Tn5tac1 insertion polarity in Escherichia coli

artículo científico publicado en 1991

Toward minimal bacterial cells: evolution vs. design

artículo científico publicado en 2008

Towards a taxonomy of conjugative plasmids.

artículo científico publicado en 2017

Towards an integrated model of bacterial conjugation

artículo científico publicado en 2014

Transcription factor-based biosensors enlightened by the analyte

artículo científico publicado en 2015

Transcription modulation of Salmonella enterica serovar Typhimurium promoters by sub-MIC levels of rifampin

artículo científico publicado en 2006

Transposon Tn21 encodes a RecA-independent site-specific integration system

scientific article published on 01 February 1988

TrwB: an F(1)-ATPase-like molecular motor involved in DNA transport during bacterial conjugation.

artículo científico publicado en 2005

TrwD, a protein encoded by the IncW plasmid R388, displays an ATP hydrolase activity essential for bacterial conjugation

artículo científico publicado en 1997

TrwD, the hexameric traffic ATPase encoded by plasmid R388, induces membrane destabilization and hemifusion of lipid vesicles

artículo científico publicado en 2002

Two active-site tyrosyl residues of protein TrwC act sequentially at the origin of transfer during plasmid R388 conjugation

artículo científico

Two atypical mobilization proteins are involved in plasmid CloDF13 relaxation

artículo científico publicado en 2001

Type IV traffic ATPase TrwD as molecular target to inhibit bacterial conjugation

artículo científico publicado en 2016

Unsaturated fatty acids are inhibitors of bacterial conjugation

artículo científico publicado en 2005

Unveiling the molecular mechanism of a conjugative relaxase: The structure of TrwC complexed with a 27-mer DNA comprising the recognition hairpin and the cleavage site.

artículo científico

Use of limited proteolysis and mutagenesis to identify folding domains and sequence motifs critical for wax ester synthase/acyl coenzyme A:diacylglycerol acyltransferase activity

artículo científico publicado en 2013

Viral replication in patients with concomitant hepatitis B and C virus infections

artículo científico publicado en 1997

Whole genome sequencing, molecular typing and in vivo virulence of OXA-48-producing Escherichia coli isolates including ST131 H30-Rx, H22 and H41 subclones

artículo científico publicado en 2017

Why is entry exclusion an essential feature of conjugative plasmids?

artículo científico publicado en 2008

fabH deletion increases DHA production in Escherichia coli expressing Pfa genes.

artículo científico publicado en 2018

oriT-processing and regulatory roles of TrwA protein in plasmid R388 conjugation.

artículo científico publicado en 1997

pACYC184-derived cloning vectors containing the multiple cloning site and lacZ alpha reporter gene of pUC8/9 and pUC18/19 plasmids

artículo científico publicado en 1988

α-Haemolysin from E. coli purification and self-aggregation properties

artículo científico publicado en 1991