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Lista de obras de Francesco Ferrari

"Jump start and gain" model for dosage compensation in Drosophila based on direct sequencing of nascent transcripts

artículo científico publicado en 2013

A MicroRNA targeting dicer for metastasis control

artículo científico publicado en 2010

A comparison of genetically matched cell lines reveals the equivalence of human iPSCs and ESCs

artículo científico publicado en 2015

A computational procedure to identify significant overlap of differentially expressed and genomic imbalanced regions in cancer datasets

artículo científico publicado en 2009

A-MADMAN: annotation-based microarray data meta-analysis tool

artículo científico publicado en 2009

Ascorbic acid prevents loss of Dlk1-Dio3 imprinting and facilitates generation of all-iPS cell mice from terminally differentiated B cells

artículo científico publicado en 2012

CXCR3 Identifies Human Naive CD8+ T Cells with Enhanced Effector Differentiation Potential

artículo científico publicado en 2019

Comment on "Drosophila dosage compensation involves enhanced Pol II recruitment to male X-linked promoters".

artículo científico publicado en 2013

Comparative analysis of metazoan chromatin organization

artículo científico publicado en 2014

Comparison of computational methods for Hi-C data analysis

artículo científico publicado en 2017

Complete gene expression profiling of Saccharopolyspora erythraea using GeneChip DNA microarrays

artículo científico publicado en 2007

Comprehensive analysis of promoter-proximal RNA polymerase II pausing across mammalian cell types

artículo científico publicado en 2016

Expression profiling of FSHD-1 and FSHD-2 cells during myogenic differentiation evidences common and distinctive gene dysregulation patterns

artículo científico publicado en 2011

Genome-wide chromatin interactions of the Nanog locus in pluripotency, differentiation, and reprogramming

artículo científico publicado en 2013

Genomic expression during human myelopoiesis

artículo científico publicado en 2007

Global chromatin conformation differences in the Drosophila dosage compensated chromosome X

artículo científico publicado en 2019

Hallmarks of pluripotency

artículo científico

Hi-C analysis: from data generation to integration.

artículo científico publicado en 2018

High-dimensional single cell analysis identifies stem-like cytotoxic CD8+ T cells infiltrating human tumors

scientific article published on 28 August 2018

Htt CAG repeat expansion confers pleiotropic gains of mutant huntingtin function in chromatin regulation

artículo científico publicado en 2015

Impact of sequencing depth in ChIP-seq experiments.

artículo científico publicado en 2014

Integrated analysis of microRNA and mRNA expression profiles in physiological myelopoiesis: role of hsa-mir-299-5p in CD34+ progenitor cells commitment

artículo científico publicado en 2010

Integrative genomics analyses reveal molecularly distinct subgroups of B-cell chronic lymphocytic leukemia patients with 13q14 deletion.

artículo científico publicado en 2010

KDM2B promotes pancreatic cancer via Polycomb-dependent and -independent transcriptional programs

artículo científico publicado en 2013

Leveraging three-dimensional chromatin architecture for effective reconstruction of enhancer-target gene regulatory interactions

artículo científico publicado en 2021

Microarray data mining using Bioconductor packages.

artículo científico publicado en 2009

Motif discovery in promoters of genes co-localized and co-expressed during myeloid cells differentiation

artículo científico publicado en 2008

Novel definition files for human GeneChips based on GeneAnnot

artículo científico publicado en 2007

PPARdelta is a ligand-dependent negative regulator of vitamin D3-induced monocyte differentiation

artículo científico publicado en 2008

PREDA: an R-package to identify regional variations in genomic data.

artículo científico publicado en 2011

Phenotypes and gene expression profiles of Saccharopolyspora erythraea rifampicin-resistant (rif) mutants affected in erythromycin production

scientific article published on 30 March 2009

Rearranging the chromatin for pluripotency

artículo científico publicado en 2013

SAMMY-seq reveals early alteration of heterochromatin and deregulation of bivalent genes in Hutchinson-Gilford Progeria Syndrome

artículo científico publicado en 2020

The Lkb1 metabolic sensor maintains haematopoietic stem cell survival

artículo científico publicado en 2010

The histone chaperone CAF-1 safeguards somatic cell identity

artículo científico publicado en 2015

The reconstruction of transcriptional networks reveals critical genes with implications for clinical outcome of multiple myeloma

artículo científico publicado en 2011

Transcriptional control of a whole chromosome: emerging models for dosage compensation

artículo científico publicado en 2014

Transcriptional profiles underlying vulnerability and resilience in rats exposed to an acute unavoidable stress

artículo científico publicado en 2012

Transcriptional profiling in response to terminal drought stress reveals differential responses along the wheat genome

artículo científico publicado en 2009

Valproic acid triggers erythro/megakaryocyte lineage decision through induction of GFI1B and MLLT3 expression

artículo científico publicado en 2012

WoPPER: Web server for Position Related data analysis of gene Expression in Prokaryotes

artículo científico publicado en 2017

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