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Lista de obras de William F. Martin

A briefly argued case that mitochondria and plastids are descendants of endosymbionts, but that the nuclear compartment is not

artículo científico publicado en 1999

A genome phylogeny for mitochondria among alpha-proteobacteria and a predominantly eubacterial ancestry of yeast nuclear genes.

artículo científico publicado en 2004

A hydrogen-dependent geochemical analogue of primordial carbon and energy metabolism

artículo científico publicado en 2020

A hydrogen-producing mitochondrion

artículo científico publicado en 1998

A machine learning approach to identify hydrogenosomal proteins in Trichomonas vaginalis

artículo científico publicado en 2011

A machine-learning approach reveals that alignment properties alone can accurately predict inference of lateral gene transfer from discordant phylogenies.

artículo científico publicado en 2009

A method for isolation of cDNA-quality mRNA from immature seeds of a gymnosperm rich in polyphenolics

article

A natural barrier to lateral gene transfer from prokaryotes to eukaryotes revealed from genomes: the 70 % rule

artículo científico publicado en 2016

A nuclear gene of eubacterial origin in Euglena gracilis reflects cryptic endosymbioses during protist evolution

artículo científico publicado en 1995

A physiological perspective on the origin and evolution of photosynthesis.

artículo científico publicado en 2017

A reality check for alignments and trees

article

A spectrum of verticality across genes

artículo científico publicado en 2020

Acceleration of genomic evolution caused by enhanced mutation rate in endocellular symbionts.

artículo científico publicado en 2002

Acetate:succinate CoA-transferase in the hydrogenosomes of Trichomonas vaginalis: identification and characterization.

artículo científico publicado en 2007

Acquisition of 1,000 eubacterial genes physiologically transformed a methanogen at the origin of Haloarchaea

artículo científico publicado en 2012

Algal endosymbionts in European Hydra strains reflect multiple origins of the zoochlorella symbiosis.

artículo científico publicado en 2015

An Algal Greening of Land

scientific article published on 01 July 2018

An Evolutionary Network of Genes Present in the Eukaryote Common Ancestor Polls Genomes on Eukaryotic and Mitochondrial Origin ⬇️

artículo científico publicado el 21 de febrero de 2012

An Overview of Endosymbiotic Models for the Origins of Eukaryotes, Their ATP-Producing Organelles (Mitochondria and Hydrogenosomes), and Their Heterotrophic Lifestyle ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2001

Anaerobic animals from an ancient, anoxic ecological niche ⬇️

artículo científico publicado en 2010

Anaerobic energy metabolism in unicellular photosynthetic eukaryotes

artículo científico publicado en 2012

Ancestral genome sizes specify the minimum rate of lateral gene transfer during prokaryote evolution.

artículo científico publicado en 2007

Animals, anoxic environments, and reasons to go deep

artículo científico publicado en 2016

Anthranilate synthase from Ruta graveolens. Duplicated AS alpha genes encode tryptophan-sensitive and tryptophan-insensitive isoenzymes specific to amino acid and alkaloid biosynthesis.

artículo científico publicado en 1996

Archaebacteria (Archaea) and the origin of the eukaryotic nucleus.

artículo científico publicado en 2005

Asking endosymbionts to do an enzyme's job

scientific article published on 03 May 2018

AstRoMap European Astrobiology Roadmap

artículo científico publicado en 2016

Automated glycopeptide analysis--review of current state and future directions ⬇️

artículo científico publicado el 27 de julio de 2012

Bacterial Vesicle Secretion and the Evolutionary Origin of the Eukaryotic Endomembrane System

artículo científico publicado en 2016

Bifunctional aldehyde/alcohol dehydrogenase (ADHE) in chlorophyte algal mitochondria.

artículo científico publicado en 2003

Biochemical fossils of the ancient transition from geoenergetics to bioenergetics in prokaryotic one carbon compound metabolism

artículo científico publicado en 2014

Biochemistry and evolution of anaerobic energy metabolism in eukaryotes

artículo científico publicado en 2012

Brain energy rescue: an emerging therapeutic concept for neurodegenerative disorders of ageing

scientific article published on 24 July 2020

Catalysts, autocatalysis and the origin of metabolism

artículo científico publicado en 2019

Characterization of a Multigene Family Encoding an Exopolygalacturonase in Maize

scientific article published on 01 February 1993

Chlorophyll Biosynthesis Gene Evolution Indicates Photosystem Gene Duplication, Not Photosystem Merger, at the Origin of Oxygenic Photosynthesis ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2013

Chloroplast class I and class II aldolases are bifunctional for fructose-1,6-biphosphate and sedoheptulose-1,7-biphosphate cleavage in the Calvin cycle

article

Chloroplast incorporation and long-term photosynthetic performance through the life cycle in laboratory cultures of Elysia timida (Sacoglossa, Heterobranchia)

artículo científico publicado en 2014

Chloroplast phosphoglycerate kinase from Euglena gracilis: endosymbiotic gene replacement going against the tide.

artículo científico publicado en 2004

Concatenated alignments and the case of the disappearing tree

artículo científico publicado en 2014

Conservation of Transit Peptide-Independent Protein Import into the Mitochondrial and Hydrogenosomal Matrix.

artículo científico publicado en 2015

Cryptic diversity of cellulose-degrading gut bacteria in industrialized humans

artículo científico publicado en 2024

Deep sequencing of Trichomonas vaginalis during the early infection of vaginal epithelial cells and amoeboid transition

artículo científico publicado en 2013

Directed networks reveal genomic barriers and DNA repair bypasses to lateral gene transfer among prokaryotes

artículo científico publicado en 2011

Does endo-symbiosis explain the origin of the nucleus?

article

ERAD components in organisms with complex red plastids suggest recruitment of a preexisting protein transport pathway for the periplastid membrane.

artículo científico publicado en 2010

EVOLUTIONARY BIOLOGY:A Powerhouse Divided

artículo científico publicado en 2000

Early Microbial Evolution: The Age of Anaerobes

artículo científico

Early evolution comes full circle

artículo científico publicado en 2004

Endosymbiotic gene transfer from prokaryotic pangenomes: Inherited chimerism in eukaryotes

artículo científico publicado en 2015

Endosymbiotic origin and differential loss of eukaryotic genes

artículo científico publicado en 2015

Endosymbiotic theories for eukaryote origin

artículo científico publicado en 2015

Endosymbiotic theory for organelle origins

artículo científico publicado en 2014

Energy for two: New archaeal lineages and the origin of mitochondria.

artículo científico publicado en 2016

Energy in Ancient Metabolism

artículo científico publicado en 2017

Energy, genes and evolution: introduction to an evolutionary synthesis

artículo científico publicado en 2013

Eubacterial origin of nuclear genes for chloroplast and cytosolic glucose-6-phosphate isomerase from spinach: sampling eubacterial gene diversity in eukaryotic chromosomes through symbiosis.

artículo científico publicado en 1998

Euglena gracilisRibonucleotide Reductase

scientific article published in Journal of Biological Chemistry

Eukaryote lateral gene transfer is Lamarckian

artículo científico publicado en 2018

Eukaryotes really are special, and mitochondria are why

artículo científico publicado en 2015

Eukaryotic evolution, changes and challenges

artículo científico publicado en 2006

Evidence for a chimeric nature of nuclear genomes: eubacterial origin of eukaryotic glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase genes.

artículo científico publicado en 1993

Evolution of the Rubisco operon from prokaryotes to algae: structure and analysis of the rbcS gene of the brown alga Pylaiella littoralis.

artículo científico publicado en 1991

Evolution of the enzymes of the citric acid cycle and the glyoxylate cycle of higher plants. A case study of endosymbiotic gene transfer.

artículo científico publicado en 2002

Evolution. Energy at life's origin

artículo científico publicado en 2014

Evolutionary analysis of 58 proteins encoded in six completely sequenced chloroplast genomes: Revised molecular estimates of two seed plant divergence times

article

Evolutionary biology: essence of mitochondria.

artículo científico publicado en 2003

Evolutionary origins of metabolic compartmentalization in eukaryotes.

artículo científico publicado en 2010

Expression of nucleus-encoded genes for chloroplast proteins in the flagellate Euglena gracilis.

artículo científico publicado en 2009

Failure to Recover Major Events of Gene Flux in Real Biological Data Due to Method Misapplication.

artículo científico publicado en 2018

Five identical intron positions in ancient duplicated genes of eubacterial origin.

artículo científico publicado en 1994

Functional conservation of calreticulin in Euglena gracilis.

artículo científico publicado en 1998

Functional studies of chloroplast glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase subunits A and B expressed in Escherichia coli: formation of highly active A4 and B4 homotetramers and evidence that aggregation of the B4 complex is mediated by the B subuni

artículo científico publicado en 1996

Gene Transfer from Organelles to the Nucleus: How Much, What Happens, and Why?

article

Gene structure, expression in Escherichia coli and biochemical properties of the NAD+-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from Pinus sylvestris chloroplasts ⬇️

artículo científico publicado el 16 de marzo de 1998

Genetics and geography of wild cereal domestication in the near east.

artículo científico publicado en 2002

Genome history in the symbiotic hybrid Euglena gracilis

article

Genome networks root the tree of life between prokaryotic domains

artículo científico publicado en 2010

Genomes of Stigonematalean cyanobacteria (subsection V) and the evolution of oxygenic photosynthesis from prokaryotes to plastids

artículo científico publicado en 2013

Getting a better picture of evolution

article

Haplotype structure at seven barley genes: relevance to gene pool bottlenecks, phylogeny of ear type and site of barley domestication.

artículo científico publicado en 2006

Higher-plant chloroplast and cytosolic 3-phosphoglycerate kinases: a case of endosymbiotic gene replacement.

artículo científico publicado en 1996

How many genes in Arabidopsis come from cyanobacteria? An estimate from 386 protein phylogenies

artículo científico publicado en 2001

Hydrogen, metals, bifurcating electrons, and proton gradients: The early evolution of biological energy conservation ⬇️

artículo científico publicado el 9 de marzo de 2012

Identification of prokaryotic homologues indicates an endosymbiotic origin for the alternative oxidases of mitochondria (AOX) and chloroplasts (PTOX)

artículo científico publicado en 2004

Independent Wheat B and G Genome Origins in Outcrossing Aegilops Progenitor Haplotypes

article published in 2006

Interspecific evolution: microbial symbiosis, endosymbiosis and gene transfer.

artículo científico publicado en 2003

Intron conservation across the prokaryote-eukaryote boundary: structure of the nuclear gene for chloroplast glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from maize

artículo científico publicado en 1988

Intron-dependent transient expression of the maize GapA1 gene

article

Is ftsH the key to plastid longevity in sacoglossan slugs?

artículo científico publicado en 2013

Isoprenoid biosynthesis: the evolution of two ancient and distinct pathways across genomes.

artículo científico publicado en 2000

Knockout of the abundant Trichomonas vaginalis hydrogenosomal membrane protein TvHMP23 increases hydrogenosome size but induces no compensatory up-regulation of paralogous copies.

artículo científico publicado en 2013

Late Mitochondrial Origin Is an Artifact

artículo científico publicado en 2017

Lokiarchaeon is hydrogen dependent.

artículo científico publicado en 2016

Massively convergent evolution for ribosomal protein gene content in plastid and mitochondrial genomes

artículo científico publicado en 2013

Microbiology. Seeing green and red in diatom genomes

artículo científico publicado en 2009

Microsequencing and cDNA cloning of the Calvin cycle/OPPP enzyme ribose-5-phosphate isomerase (EC 5.3.1.6) from spinach chloroplasts.

artículo científico publicado en 1996

Mitochondria, complexity, and evolutionary deficit spending.

artículo científico publicado en 2016

Mitochondria, the Cell Cycle, and the Origin of Sex via a Syncytial Eukaryote Common Ancestor

artículo científico publicado en 2016

Molecular characterization of a novel, nuclear-encoded, NAD+-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase in plastids of the gymnosperm Pinus sylvestris L

article

Molecular evolution: Lateral gene transfer and other possibilities

article

Molecular poltergeists: mitochondrial DNA copies (numts) in sequenced nuclear genomes

artículo científico publicado en 2010

Mosses do express conventional, distantly B-type-related phytochromes. Phytochrome of Physcomitrella patens (Hedw.).

artículo científico publicado en 1993

Mutational decay and age of chloroplast and mitochondrial genomes transferred recently to angiosperm nuclear chromosomes

artículo científico publicado en 2005

Native metals, electron bifurcation, and CO2 reduction in early biochemical evolution.

artículo científico publicado en 2018

Networks of lexical borrowing and lateral gene transfer in language and genome evolution.

artículo científico publicado en 2013

Of early animals, anaerobic mitochondria, and a modern sponge.

artículo científico

On Being the Right Size as an Animal with Plastids

artículo científico publicado en 2017

On the Origin of Heterotrophy.

artículo científico publicado en 2015

On the origin of biochemistry at an alkaline hydrothermal vent

artículo científico publicado en 2007

On the origins of cells: a hypothesis for the evolutionary transitions from abiotic geochemistry to chemoautotrophic prokaryotes, and from prokaryotes to nucleated cells

artículo científico publicado en 2003

One step beyond a ribosome: The ancient anaerobic core

artículo científico publicado en 2016

Origins of major archaeal clades correspond to gene acquisitions from bacteria

artículo científico publicado en 2014

Out of thin air

artículo científico publicado en 2007

Pathogenic archaebacteria: do they not exist because archaebacteria use different vitamins?

article

Phylogenetic analyses with systematic taxon sampling show that mitochondria branch within Alphaproteobacteria

scientific article published on 13 July 2020

Phylogenomics of the reproductive parasite Wolbachia pipientis wMel: a streamlined genome overrun by mobile genetic elements

artículo científico publicado en 2004

Physiological evolution: Genomic redox footprints

artículo científico publicado en 2017

Physiology, anaerobes, and the origin of mitosing cells 50 years on.

artículo científico publicado en 2017

Physiology, phylogeny, and LUCA

artículo científico publicado en 2016

Physiology, phylogeny, early evolution, and GAPDH

artículo científico publicado en 2017

Planctomycetes and eukaryotes: a case of analogy not homology

artículo científico publicado en 2011

Plastid origin: who, when and why?

article

Plastid-bearing sea slugs fix CO2 in the light but do not require photosynthesis to survive.

artículo científico publicado en 2013

Protein import and the origin of red complex plastids

artículo científico publicado en 2015

Purification and cDNA cloning of anthranilate synthase from Ruta graveolens: modes of expression and properties of native and recombinant enzymes.

artículo científico publicado en 1995

Quantifying the number of independent organelle DNA insertions in genome evolution and human health.

artículo científico publicado en 2017

Rate and polarity of gene fusion and fission in Oryza sativa and Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2006

Reading the entrails of chickens: molecular timescales of evolution and the illusion of precision

artículo científico publicado en 2004

Realistic Gene Transfer to Gene Duplication Ratios Identify Different Roots in the Bacterial Phylogeny Using a Tree Reconciliation Method

scientific article published on 05 July 2022

Red and Problematic Green Phylogenetic Signals among Thousands of Nuclear Genes from the Photosynthetic and Apicomplexa-Related Chromera velia ⬇️

artículo científico publicado el 28 de septiembre de 2011

Reply to 'Is LUCA a thermophilic progenote?'

artículo científico publicado en 2016

SMBE Satellite meeting on reticulated microbial evolution 2014--meeting report

artículo científico publicado en 2014

Sequences of rDNA internal transcribed spacers from the chloroplast DNA of 26 bryophytes: properties and phylogenetic utility.

artículo científico publicado en 1998

Serpentinization as a source of energy at the origin of life

artículo científico publicado en 2010

Structure and Evolution of the Archaeal Lipid Synthesis Enzyme sn-Glycerol-1-phosphate Dehydrogenase

artículo científico publicado en 2015

Structure and Properties of an Engineered Transketolase from Maize

artículo científico publicado en 2003

Subcellular targeting of proteins and pathways during evolution

article

Sulfide : quinone oxidoreductase (SQR) from the lugworm Arenicola marina shows cyanide- and thioredoxin-dependent activity.

artículo científico publicado en 2008

Supertrees and symbiosis in eukaryote genome evolution

article

Testing hypotheses without considering predictions

article

The Entner-Doudoroff pathway is an overlooked glycolytic route in cyanobacteria and plants

artículo científico publicado en 2016

The Mitochondrion of Euglena gracilis

artículo científico publicado en 2017

The N-Terminal Sequences of Four Major Hydrogenosomal Proteins Are Not Essential for Import into Hydrogenosomes of Trichomonas vaginalis

article

The Origin of Membrane Bioenergetics ⬇️

artículo científico publicado el 21 de diciembre de 2012

The Physiology of Phagocytosis in the Context of Mitochondrial Origin.

artículo científico publicado en 2017

The Ribofilm as a Concept for Life's Origins.

artículo científico publicado en 2015

The actin-based machinery of Trichomonas vaginalis mediates flagellate-amoeboid transition and migration across host tissue.

artículo científico publicado en 2013

The difference between organelles and endosymbionts

article

The energetics of genome complexity

artículo científico publicado en 2010

The evolution of the Calvin cycle from prokaryotic to eukaryotic chromosomes: a case study of functional redundancy in ancient pathways through endosymbiosis.

artículo científico publicado en 1997

The hydrogen hypothesis for the first eukaryote ⬇️

artículo científico publicado el 5 de marzo de 1998

The metabolic network of the last bacterial common ancestor

artículo científico publicado en 2021

The missing link between hydrogenosomes and mitochondria

artículo científico publicado en 2005

The origin of mitochondria in light of a fluid prokaryotic chromosome model.

artículo científico publicado en 2007

The physiology and habitat of the last universal common ancestor

artículo científico publicado en 2016

The rocky roots of the acetyl-CoA pathway

artículo científico publicado en 2004

The smoking gun of gene transfer

article

The tree of one percent.

artículo científico publicado en 2006

Transformation and conjugal transfer of foreign genes into the filamentous multicellular cyanobacteria (subsection V) Fischerella and Chlorogloeopsis

artículo científico publicado en 2012

Transketolase from Cyanophora paradoxa: in vitro import into cyanelles and pea chloroplasts and a complex history of a gene often, but not always, transferred in the context of secondary endosymbiosis.

artículo científico publicado en 2009

Unmiraculous facultative anaerobes (comment on DOI 10.1002/bies.201600174)

artículo científico publicado en 2017

Variability of wax ester fermentation in natural and bleached Euglena gracilis Strains in response to oxygen and the elongase inhibitor flufenacet.

artículo científico publicado en 2009

cDNA cloning of a Sec61 homologue from the cryptomonad alga Pyrenomonas salina

article

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