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Lista de obras de Nicholas J Loman

A complete bacterial genome assembled de novo using only nanopore sequencing data

artículo científico publicado en 2015

A cross-sectional survey of bacterial species in plaque from client owned dogs with healthy gingiva, gingivitis or mild periodontitis.

artículo científico publicado en 2013

A culture-independent sequence-based metagenomics approach to the investigation of an outbreak of Shiga-toxigenic Escherichia coli O104:H4.

artículo científico publicado en 2013

A disruptive sequencer meets disruptive publishing

artículo científico publicado en 2015

A reference bacterial genome dataset generated on the MinION™ portable single-molecule nanopore sequencer.

artículo científico publicado en 2014

APOBEC3 deaminase editing in mpox virus as evidence for sustained human transmission since at least 2016

artículo científico publicado en 2023

An abundance of bacterial ADP-ribosyltransferases--implications for the origin of exotoxins and their human homologues

artículo científico publicado en 2001

An amplicon-based sequencing framework for accurately measuring intrahost virus diversity using PrimalSeq and iVar

An amplicon-based sequencing framework for accurately measuring intrahost virus diversity using PrimalSeq and iVar

article published in 2018

Are diagnostic and public health bacteriology ready to become branches of genomic medicine? ⬇️

artículo científico publicado el 23 de agosto de 2011

Assessing transmissibility of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England

artículo científico publicado en 2021

Bacterial flagellar diversity and evolution: seek simplicity and distrust it?

artículo científico publicado en 2008

Binning metagenomic contigs by coverage and composition

artículo científico publicado en 2014

Biochemical and structural characterization of mycobacterial aspartyl-tRNA synthetase AspS, a promising TB drug target

artículo científico publicado en 2014

CLIMB-COVID: continuous integration supporting decentralised sequencing for SARS-CoV-2 genomic surveillance

publication published on 01 July 2021

Calculating orthologs in bacteria and Archaea: a divide and conquer approach

artículo científico publicado en 2011

Characterization of mutations in the PAS domain of the EvgS sensor kinase selected by laboratory evolution for acid resistance in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2014

Clinical utilization of genomics data produced by the international Pseudomonas aeruginosa consortium

artículo científico publicado en 2015

Clonal expansion within pneumococcal serotype 6C after use of seven-valent vaccine

artículo científico publicado en 2013

Clusters of genetically similar isolates of Pseudomonas aeruginosa from multiple hospitals in the UK.

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of the Crohn's disease-associated adherent-invasive Escherichia coli strain HM605

artículo científico publicado en 2011

Defining bacterial species in the genomic era: insights from the genus Acinetobacter

artículo científico publicado en 2012

Deletions in a ribosomal protein-coding gene are associated with tigecycline resistance in Enterococcus faecium

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Elizabethkingia meningoseptica Isolated from a Traumatic Wound

artículo científico publicado en 2014

Ebola Virus Persistence in Breast Milk After No Reported Illness: A Likely Source of Virus Transmission From Mother to Child

artículo científico publicado en 2016

Eighteenth-century genomes show that mixed infections were common at time of peak tuberculosis in Europe

artículo científico publicado en 2015

EntrezAJAX: direct web browser access to the Entrez Programming Utilities

artículo científico publicado en 2010

Epidemic establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas

artículo científico publicado en 2017

Epidemiological investigation of Pseudomonas aeruginosa isolates from a six-year-long hospital outbreak using high-throughput whole genome sequencing

artículo científico publicado en 2013

Erratum: A reference bacterial genome dataset generated on the MinION(TM) portable single-molecule nanopore sequencer

artículo científico publicado en 2015

Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas

artículo científico publicado en 2017

Establishment and lineage dynamics of the SARS-CoV-2 epidemic in the UK

artículo científico publicado en 2021

Extensive Modulation of the Fecal Metagenome in Children With Crohn's Disease During Exclusive Enteral Nutrition

artículo científico publicado en 2015

Extreme genetic fragility of the HIV-1 capsid.

artículo científico publicado en 2013

First Complete Genome Sequences of Zika Virus Isolated from Febrile Patient Sera in Ecuador

artículo científico publicado en 2017

Genome analysis of a highly virulent serotype 1 strain of Streptococcus pneumoniae from West Africa

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the emerging pathogen Helicobacter canadensis

artículo científico publicado en 2009

Genome sequences of three Acinetobacter baumannii strains assigned to the multilocus sequence typing genotypes ST2, ST25, and ST78.

artículo científico publicado en 2011

Genomic assessment of invasion dynamics of SARS-CoV-2 Omicron BA.1

artículo científico publicado en 2023

Genomic epidemiology reveals multiple introductions of Zika virus into the United States ⬇️

artículo científico publicado en 2017

High-throughput bacterial genome sequencing: an embarrassment of choice, a world of opportunity.

artículo científico publicado en 2012

High-throughput sequencing and clinical microbiology: progress, opportunities and challenges

scientific article published on 16 September 2010

High-throughput whole-genome sequencing to dissect the epidemiology of Acinetobacter baumannii isolates from a hospital outbreak

scientific article published on 17 March 2010

Identification of KasA as the cellular target of an anti-tubercular scaffold

artículo científico publicado en 2016

Identification of novel imidazo[1,2-a]pyridine inhibitors targeting M. tuberculosis QcrB

artículo científico publicado en 2012

Improvements to the ARTIC multiplex PCR method for SARS-CoV-2 genome sequencing using nanopore

scientific article published on 04 September 2020

Microbial TIR domains: not necessarily agents of subversion?

artículo científico publicado en 2009

Mobile real-time surveillance of Zika virus in Brazil

artículo científico publicado en 2016

Multiple introductions of Zika virus into the United States revealed through genomic epidemiology

artículo científico publicado en 2017

Multiplex PCR method for MinION and Illumina sequencing of Zika and other virus genomes directly from clinical samples

artículo científico publicado en 2017

Multiplex PCR method for MinION and Illumina sequencing of Zika and other virus genomes directly from clinical samples.

artículo científico publicado en 2017

Mycobacterial dihydrofolate reductase inhibitors identified using chemogenomic methods and in vitro validation

artículo científico publicado en 2015

Next-generation sequencing--the promise and perils of charting the great microbial unknown.

artículo científico publicado en 2008

Open-Source Genomic Analysis of Shiga-Toxin–Producing E. coli O104:H4

artículo científico publicado en 2011

Parallel evolutionary pathways to antibiotic resistance selected by biocide exposure.

artículo científico publicado en 2015

Performance comparison of benchtop high-throughput sequencing platforms

artículo científico publicado en 2012

Phylogenetic structure of European Salmonella Enteritidis outbreak correlates with national and international egg distribution network

artículo científico publicado en 2016

Poretools: a toolkit for analyzing nanopore sequence data

artículo científico publicado en 2014

Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations. ⬇️

artículo científico publicado en 2020

Pseudomonas aeruginosa adaptation in the nasopharyngeal reservoir leads to migration and persistence in the lungs

artículo científico publicado en 2014

Rapid draft sequencing and real-time nanopore sequencing in a hospital outbreak of Salmonella

artículo científico publicado en 2015

Reagent and laboratory contamination can critically impact sequence-based microbiome analyses

artículo científico publicado en 2014

Real-time, portable genome sequencing for Ebola surveillance

artículo científico publicado en 2016

Resurgence of Ebola Virus Disease in Guinea Linked to a Survivor With Virus Persistence in Seminal Fluid for More Than 500 Days

artículo científico publicado en 2016

Role of Faecalibacterium prausnitzii in Crohn's Disease: friend, foe, or does not really matter?

artículo científico publicado en 2014

STOP-Colitis pilot trial protocol: a prospective, open-label, randomised pilot study to assess two possible routes of faecal microbiota transplant delivery in patients with ulcerative colitis

scientific article published on 11 November 2019

Seeking the source of Pseudomonas aeruginosa infections in a recently opened hospital: an observational study using whole-genome sequencing

artículo científico publicado en 2014

Simple sequence repeats in Helicobacter canadensis and their role in phase variable expression and C-terminal sequence switching

artículo científico publicado en 2010

So you want to be a computational biologist?

artículo científico publicado en 2013

Staphylococcal species heterogeneity in the nasal microbiome following antibiotic prophylaxis revealed by tuf gene deep sequencing

artículo científico publicado en 2016

Successful test launch for nanopore sequencing

artículo científico publicado en 2015

Tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide and N-benzyl-6',7'-dihydrospiro[piperidine-4,4'-thieno[3,2-c]pyran] analogues with bactericidal efficacy against Mycobacterium tuberculosis targeting MmpL3

artículo científico publicado en 2013

The TCA cycle is not required for selection or survival of multidrug-resistant Salmonella

artículo científico publicado en 2011

The complete genome and proteome of Laribacter hongkongensis reveal potential mechanisms for adaptations to different temperatures and habitats

artículo científico publicado en 2009

The distinct features of microbial 'dysbiosis' of Crohn's disease do not occur to the same extent in their unaffected, genetically-linked kindred

artículo científico publicado en 2017

The effect of DNA extraction methodology on gut microbiota research applications.

artículo científico publicado en 2016

Transmission of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 in England: Insights from linking epidemiological and genetic data

artículo científico publicado en 2021

Tricorn-like proteases in bacteria

artículo científico publicado en 2001

Twenty years of bacterial genome sequencing

artículo científico publicado en 2015

Unusual Ebola Virus Chain of Transmission, Conakry, Guinea, 2014-2015

artículo científico publicado en 2016

Videos, photographs, and patient consent. Medical educationalists can free themselves from constraints of "real world" images

artículo científico publicado en 1998

Virus genomes reveal factors that spread and sustained the Ebola epidemic

artículo científico publicado en 2017

XDR-TB genome sequencing: a glimpse of the microbiology of the future

artículo científico publicado en 2008

xBASE2: a comprehensive resource for comparative bacterial genomics.

artículo científico publicado en 2007

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