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Lista de obras de Mitchell Sogin

A Global Census of Marine Microbes

article

A filtering method to generate high quality short reads using illumina paired-end technology

artículo científico publicado en 2013

A gene-targeted approach to investigate the intestinal butyrate-producing bacterial community

artículo científico publicado en 2013

A microbial signature approach to identify fecal pollution in the waters off an urbanized coast of Lake Michigan

artículo científico publicado en 2013

A single genus in the gut microbiome reflects host preference and specificity

artículo científico publicado en 2014

A spliceosomal intron in Giardia lamblia

artículo científico publicado en 2002

Accuracy and quality of massively parallel DNA pyrosequencing

artículo científico publicado en 2007

Analysis of Lung Microbiota in Bronchoalveolar Lavage, Protected Brush and Sputum Samples from Subjects with Mild-To-Moderate Cystic Fibrosis Lung Disease

artículo científico publicado en 2016

Annexin-like alpha giardins: a new cytoskeletal gene family in Giardia lamblia

artículo científico publicado en 2005

Anvi'o: an advanced analysis and visualization platform for 'omics data

artículo científico publicado en 2015

Association of Cesarean Delivery and Formula Supplementation With the Intestinal Microbiome of 6-Week-Old Infants

artículo científico publicado en 2016

Associations between Gut Microbial Colonization in Early Life and Respiratory Outcomes in Cystic Fibrosis

artículo científico publicado en 2015

Benthic eukaryotic diversity in the Guaymas Basin hydrothermal vent environment.

artículo científico publicado en 2002

Broadly sampled multigene analyses yield a well-resolved eukaryotic tree of life

artículo científico publicado en 2010

Characterization and quantification of the fungal microbiome in serial samples from individuals with cystic fibrosis

artículo científico publicado en 2014

Cloning and analysis of the CYP1A promoter from the atlantic killifish (Fundulus heteroclitus).

artículo científico publicado en 2004

Community structures of fecal bacteria in cattle from different animal feeding operations

artículo científico publicado en 2011

Comparison of Sewage and Animal Fecal Microbiomes by Using Oligotyping Reveals Potential Human Fecal Indicators in Multiple Taxonomic Groups

artículo científico publicado en 2015

Comparison of bacterial communities in sands and water at beaches with bacterial water quality violations

artículo científico publicado en 2014

Comparison of brush and biopsy sampling methods of the ileal pouch for assessment of mucosa-associated microbiota of human subjects

artículo científico publicado en 2014

Comparison of the microbial community structures of untreated wastewaters from different geographic locales

artículo científico publicado en 2013

Correction: Exploring Microbial Diversity and Taxonomy Using SSU rRNA Hypervariable Tag Sequencing.

artículo científico publicado en 2008

DRISEE overestimates errors in metagenomic sequencing data.

artículo científico publicado en 2013

Diversity and dynamics of rare and of resident bacterial populations in coastal sands

artículo científico publicado en 2011

Domain evolution and functional diversification of sulfite reductases

artículo científico publicado en 2005

Editorial: New Insights into Microbial Ecology through Subtle Nucleotide Variation.

artículo científico publicado en 2016

Effect of PCR amplicon size on assessments of clone library microbial diversity and community structure

artículo científico publicado en 2009

Evidence for lateral transfer of genes encoding ferredoxins, nitroreductases, NADH oxidase, and alcohol dehydrogenase 3 from anaerobic prokaryotes to Giardia lamblia and Entamoeba histolytica

artículo científico publicado en 2002

Evolution of eukaryotic transcription: insights from the genome of Giardia lamblia

artículo científico publicado en 2004

Evolutionary history of "early-diverging" eukaryotes: the excavate taxon Carpediemonas is a close relative of Giardia.

artículo científico publicado en 2002

Exploring microbial diversity and taxonomy using SSU rRNA hypervariable tag sequencing

artículo científico publicado en 2008

Fetal exposures and perinatal influences on the stool microbiota of premature infants

artículo científico publicado en 2014

From Genes to Genomes: Beyond Biodiversity in Spain’s Rio Tinto ⬇️

artículo científico publicado el 1 de abril de 2003

Genetic code supports targeted insertion of two amino acids by one codon

artículo científico publicado en 2009

Genetic exchange within and between assemblages of Giardia duodenalis

artículo científico publicado en 2009

Genomic Markers of Ancient Anaerobic Microbial Pathways: Sulfate Reduction, Methanogenesis, and Methane Oxidation ⬇️

artículo científico publicado el 1 de abril de 2003

Giardia lamblia RNA polymerase II: amanitin-resistant transcription.

artículo científico publicado en 2003

Giardia lamblia: identification and characterization of Rab and GDI proteins in a genome survey of the ER to Golgi endomembrane system.

artículo científico publicado en 2002

Global distribution and diversity of marine Verrucomicrobia

artículo científico publicado en 2012

Global patterns of bacterial beta-diversity in seafloor and seawater ecosystems

artículo científico publicado en 2011

Gut microbial colonisation in premature neonates predicts neonatal sepsis

artículo científico publicado en 2012

Heterotrophic Archaea dominate sedimentary subsurface ecosystems off Peru

artículo científico publicado en 2006

Host-specificity among abundant and rare taxa in the sponge microbiome

artículo científico publicado en 2014

Identification and Removal of Contaminant Sequences From Ribosomal Gene Databases: Lessons From the Census of Deep Life.

artículo científico publicado en 2018

Identification of Specialists and Abundance-Occupancy Relationships among Intestinal Bacteria of Aves, Mammalia, and Actinopterygii

artículo científico publicado en 2015

Inferring protein function from genomic sequence: Giardia lamblia expresses a phosphatidylinositol kinase-related kinase similar to yeast and mammalian TOR.

artículo científico publicado en 2002

Iron supplementation does not worsen respiratory health or alter the sputum microbiome in cystic fibrosis

artículo científico publicado en 2013

Iron-dependent hydrogenases of Entamoeba histolytica and Giardia lamblia: activity of the recombinant entamoebic enzyme and evidence for lateral gene transfer

artículo científico publicado en 2003

Ironing out the wrinkles in the rare biosphere through improved OTU clustering

artículo científico publicado en 2010

Isolated communities of Epsilonproteobacteria in hydrothermal vent fluids of the Mariana Arc seamounts

artículo científico publicado en 2010

Macroecological patterns of marine bacteria on a global scale

article by Anthony S. Amend et al published 7 November 2012 in Journal of Biogeography

Marine bacteria exhibit a bipolar distribution

artículo científico publicado en 2013

Metagenomic analysis of the medicinal leech gut microbiota

artículo científico publicado en 2014

Methanogen diversity evidenced by molecular characterization of methyl coenzyme M reductase A (mcrA) genes in hydrothermal sediments of the Guaymas Basin

artículo científico publicado en 2005

Microbial community composition in sediments resists perturbation by nutrient enrichment

artículo científico publicado en 2011

Microbial diversity in the deep sea and the underexplored "rare biosphere"

artículo científico publicado en 2006

Microbial diversity of hydrothermal sediments in the Guaymas Basin: evidence for anaerobic methanotrophic communities

artículo científico publicado en 2002

Microbial population structures in the deep marine biosphere

artículo científico publicado en 2007

Microbiome profiling in extremely acidic soils affected by hydrothermal fluids: the case of the Solfatara Crater (Campi Flegrei, southern Italy)

scientific article published on 01 December 2018

Millions of reads, thousands of taxa: microbial community structure and associations analyzed via marker genes

artículo científico publicado en 2016

Minimum entropy decomposition: unsupervised oligotyping for sensitive partitioning of high-throughput marker gene sequences

artículo científico publicado en 2015

Molecular Characterization of Sulfate-Reducing Bacteria in the Guaymas Basin ⬇️

artículo científico publicado el 1 de mayo de 2003

Molecular characterization of Giardia intestinalis haplotypes in marine animals: variation and zoonotic potential

artículo científico publicado en 2008

Molecular phylogenies of Blastocystis isolates from different hosts: implications for genetic diversity, identification of species, and zoonosis

artículo científico publicado en 2005

Molecular phylogeny of parabasalids inferred from small subunit rRNA sequences, with emphasis on the Devescovinidae and Calonymphidae (Trichomonadea).

artículo científico publicado en 2002

Monopylocystis visvesvarai n. gen., n. sp. and Sawyeria marylandensis n. gen., n. sp.: two new amitochondrial heterolobosean amoebae from anoxic environments

artículo científico publicado en 2003

Multiphasic analysis of the temporal development of the distal gut microbiota in patients following ileal pouch anal anastomosis

artículo científico publicado en 2013

Oligotyping: Differentiating between closely related microbial taxa using 16S rRNA gene data.

artículo científico publicado en 2013

Patient-Specific Bacteroides Genome Variants in Pouchitis

artículo científico publicado en 2016

Pelobionts are degenerate protists: insights from molecules and morphology.

artículo científico publicado en 2002

Phylogenetic analysis of Blastocystis isolates from different hosts based on the comparison of small-subunit rRNA gene sequences

artículo científico publicado en 2003

Phylogeny of Opisthokonta and the evolution of multicellularity and complexity in Fungi and Metazoa

article

Profiling of Bacterial and Fungal Microbial Communities in Cystic Fibrosis Sputum Using RNA

scholarly article by Nora Grahl et al published 8 August 2018 in mSphere

Reproducible community dynamics of the gastrointestinal microbiota following antibiotic perturbation

artículo científico publicado en 2009

Salt marsh sediment diversity: a test of the variability of the rare biosphere among environmental replicates

artículo científico publicado en 2012

Seasonal Succession and Spatial Patterns of Synechococcus Microdiversity in a Salt Marsh Estuary Revealed through 16S rRNA Gene Oligotyping

artículo científico publicado en 2017

Serial analysis of V6 ribosomal sequence tags (SARST-V6): a method for efficient, high-throughput analysis of microbial community composition.

artículo científico publicado en 2005

Sewage reflects the distribution of human faecal Lachnospiraceae.

artículo científico publicado en 2013

Sewage reflects the microbiomes of human populations.

artículo científico publicado en 2015

Sex-specific associations of infants' gut microbiome with arsenic exposure in a US population

artículo científico publicado en 2018

Shifts in the microbial community composition of Gulf Coast beaches following beach oiling

artículo científico publicado en 2013

The identification of a new Giardia duodenalis assemblage in marine vertebrates and a preliminary analysis of G. duodenalis population biology in marine systems

artículo científico publicado en 2010

The microbiome in pediatric cystic fibrosis patients: the role of shared environment suggests a window of intervention

artículo científico publicado en 2014

The microbiota regulates susceptibility to Fas-mediated acute hepatic injury

artículo científico publicado en 2014

The pervasive effects of an antibiotic on the human gut microbiota, as revealed by deep 16S rRNA sequencing

artículo científico publicado en 2008

The premature infant gut microbiome during the first 6 weeks of life differs based on gestational maturity at birth

scientific article published on 23 May 2018

The rare biosphere: sorting out fact from fiction

artículo científico publicado en 2010

Two new small-subunit ribosomal RNA gene lineages within the subclass gymnamoebia

artículo científico publicado en 2003

Unique microbial communities persist in individual cystic fibrosis patients throughout a clinical exacerbation

artículo científico publicado en 2013

VAMPS: a website for visualization and analysis of microbial population structures

artículo científico publicado en 2014

Water mass-specificity of bacterial communities in the North Atlantic revealed by massively parallel sequencing.

artículo científico publicado en 2010

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