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Lista de obras de Samuel V Angiuoli

A comparative genomic analysis of diverse clonal types of enterotoxigenic Escherichia coli reveals pathovar-specific conservation

artículo científico publicado en 2010

A machine learning approach for somatic mutation discovery

artículo científico publicado en 2018

CloVR-ITS: Automated internal transcribed spacer amplicon sequence analysis pipeline for the characterization of fungal microbiota

scientific article published on 04 February 2013

CloVR: a virtual machine for automated and portable sequence analysis from the desktop using cloud computing

artículo científico publicado en 2011

Comparative genomics of emerging human ehrlichiosis agents

artículo científico publicado en 2006

Comparative genomics of the neglected human malaria parasite Plasmodium vivax

artículo científico publicado en 2008

Comparative genomics of trypanosomatid parasitic protozoa

artículo científico publicado en 2005

Direct detection of early-stage cancers using circulating tumor DNA.

artículo científico publicado en 2017

Draft genome of the filarial nematode parasite Brugia malayi

artículo científico publicado en 2007

Ergatis: a web interface and scalable software system for bioinformatics workflows

artículo científico publicado en 2010

GeMInA, Genomic Metadata for Infectious Agents, a geospatial surveillance pathogen database

artículo científico publicado en 2009

Gene synteny and evolution of genome architecture in trypanosomatids

article

Genome Sequence of Theileria parva, a Bovine Pathogen That Transforms Lymphocytes

artículo científico publicado en 2005

Genome analysis of multiple pathogenic isolates of Streptococcus agalactiae: implications for the microbial "pan-genome"

artículo científico publicado en 2005

Genome degradation in Brucella ovis corresponds with narrowing of its host range and tissue tropism

artículo científico publicado en 2009

Genome sequence and comparative analysis of the model rodent malaria parasite Plasmodium yoelii yoelii

artículo científico publicado en 2002

Genomic analyses of gynaecologic carcinosarcomas reveal frequent mutations in chromatin remodelling genes

artículo científico publicado en 2014

Global Phylogeny of Mycobacterium tuberculosis Based on Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Analysis: Insights into Tuberculosis Evolution, Phylogenetic Accuracy of Other DNA Fingerprinting Systems, and Recommendations for a Minimal Standard SNP Set

scholarly article by Ingrid Filliol et al published 3 April 2006 in Journal of Bacteriology

Global phylogeny of Mycobacterium tuberculosis based on single nucleotide polymorphism (SNP) analysis: insights into tuberculosis evolution, phylogenetic accuracy of other DNA fingerprinting systems, and recommendations for a minimal standard SNP se

artículo científico publicado en 2006

Improving pan-genome annotation using whole genome multiple alignment

artículo científico publicado en 2011

Insights on Evolution of Virulence and Resistance from the Complete Genome Analysis of an Early Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Strain and a Biofilm-Producing Methicillin-Resistant Staphylococcus epidermidis Strain

artículo científico publicado en 2005

Integrated next-generation sequencing and avatar mouse models for personalized cancer treatment

artículo científico publicado en 2014

Meeting report: the fifth Genomic Standards Consortium (GSC) workshop

artículo científico publicado en 2008

Meeting report: the fourth Genomic Standards Consortium (GSC) workshop

artículo científico publicado en 2008

Mugsy: fast multiple alignment of closely related whole genomes ⬇️

artículo científico publicado el 9 de diciembre de 2010

Neisseria meningitidis is structured in clades associated with restriction modification systems that modulate homologous recombination

artículo científico publicado en 2011

Notch1 mutations are drivers of oral tumorigenesis

artículo científico publicado en 2014

Personalized genomic analyses for cancer mutation discovery and interpretation

artículo científico publicado en 2015

Progresses in the pursuit of aldose reductase inhibitors: The structure-based lead optimization step

artículo científico publicado en 2012

Resources and costs for microbial sequence analysis evaluated using virtual machines and cloud computing

artículo científico publicado en 2011

Structure and dynamics of the pan-genome of Streptococcus pneumoniae and closely related species

artículo científico publicado en 2010

Sybil: methods and software for multiple genome comparison and visualization

artículo científico publicado en 2007

The IGS Standard Operating Procedure for Automated Prokaryotic Annotation ⬇️

artículo científico publicado en 2011

The Princeton Protein Orthology Database (P-POD): a comparative genomics analysis tool for biologists

artículo científico publicado en 2007

The genome sequence of Bacillus cereus ATCC 10987 reveals metabolic adaptations and a large plasmid related to Bacillus anthracis pXO1

artículo científico publicado en 2004

The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification

artículo científico publicado en 2008

Toward a standards-compliant genomic and metagenomic publication record

artículo científico publicado en 2008

Toward an online repository of Standard Operating Procedures (SOPs) for (meta)genomic annotation

artículo científico publicado en 2008

Two new complete genome sequences offer insight into host and tissue specificity of plant pathogenic Xanthomonas spp.

artículo científico publicado en 2011

Using Sybil for interactive comparative genomics of microbes on the web.

artículo científico publicado en 2011

Whole genome comparisons of serotype 4b and 1/2a strains of the food-borne pathogen Listeria monocytogenes reveal new insights into the core genome components of this species

artículo científico publicado en 2004

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