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Lista de obras de Jeremy Zucker

A Histoplasma capsulatum Lipid Metabolic Map Identifies Antifungal Targets

artículo científico publicado en 2021

A fragile metabolic network adapted for cooperation in the symbiotic bacterium Buchnera aphidicola

artículo científico publicado en 2009

A framework for human microbiome research

artículo científico publicado en 2012

ATLAS (Automatic Tool for Local Assembly Structures) - a comprehensive infrastructure for assembly, annotation, and genomic binning of metagenomic and metatranscriptomic data

artículo científico publicado en 2017

COVID-19 Disease Map, a computational knowledge repository of SARS-CoV-2 virus-host interaction mechanisms

COVID19 Disease Map, a computational knowledge repository of virus–host interaction mechanisms ⬇️

artículo científico

Comparative analysis of Mycobacterium and related Actinomycetes yields insight into the evolution of Mycobacterium tuberculosis pathogenesis

artículo científico publicado en 2012

Comparative and functional genomics of Rhodococcus opacus PD630 for biofuels development

artículo científico publicado en 2011

Comparative genomic analysis of human fungal pathogens causing paracoccidioidomycosis

artículo científico publicado en 2011

Comparative genomics of enterococci: variation in Enterococcus faecalis, clade structure in E. faecium, and defining characteristics of E. gallinarum and E. casseliflavus

artículo científico publicado en 2012

Computational Tools and Data Integration to Accelerate Vaccine Development: Challenges, Opportunities, and Future Directions

Preprint

Corrigendum: The BioPAX community standard for pathway data sharing

correction; published 7 December 2010

Cover Image, Volume 231, Number 11, November 2016.

artículo científico publicado en 2016

Do-calculus enables estimation of causal effects in partially observed biomolecular pathways

artículo científico publicado en 2022

Erratum: Corrigendum: The BioPAX community standard for pathway data sharing

scholarly article published in Nature Biotechnology

Genome-wide characterization of light-regulated genes in Neurospora crassa.

artículo científico publicado en 2014

Genomics of Loa loa, a Wolbachia-free filarial parasite of humans

artículo científico publicado en 2013

Inferring carbon sources from gene expression profiles using metabolic flux models

artículo científico publicado en 2012

Interpreting expression data with metabolic flux models: predicting Mycobacterium tuberculosis mycolic acid production

artículo científico publicado en 2009

Leveraging Structured Biological Knowledge for Counterfactual Inference: A Case Study of Viral Pathogenesis

artículo científico publicado en 2021

Leveraging Structured Biological Knowledge for Counterfactual Inference: a Case Study of Viral Pathogenesis ⬇️

preprint published on 14 January 2021

Metabolic reconstruction for metagenomic data and its application to the human microbiome

artículo científico publicado en 2012

Microbial Community Metabolic Modeling: A Community Data-Driven Network Reconstruction

artículo científico publicado en 2016

Moleculo Long-Read Sequencing Facilitates Assembly and Genomic Binning from Complex Soil Metagenomes

artículo científico publicado en 2016

Patterns and implications of gene gain and loss in the evolution of Prochlorococcus

artículo científico publicado en 2007

Prediction of Metabolite Concentrations, Rate Constants and Post-Translational Regulation Using Maximum Entropy-Based Simulations with Application to Central Metabolism of Neurospora crassa

Reconstruction and validation of a genome-scale metabolic model for the filamentous fungus Neurospora crassa using FARM

artículo científico publicado en 2013

Structure, function and diversity of the healthy human microbiome

artículo científico publicado en 2012

Summary of the DREAM8 Parameter Estimation Challenge: Toward Parameter Identification for Whole-Cell Models

artículo científico publicado en 2015

TB database 2010: overview and update

artículo científico publicado en 2010

The BioPAX community standard for pathway data sharing

artículo científico publicado en 2010

The Mycobacterium tuberculosis regulatory network and hypoxia

artículo científico publicado en 2013

Updating and curating metabolic pathways of TB.

artículo científico

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