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Lista de obras de Margaret F Romine

A novel interferon-inducible domain: structural and functional analysis of the human interferon regulatory factor 1 gene promoter

artículo científico publicado en 1993

AMT tag approach to proteomic characterization of Deinococcus radiodurans and Shewanella oneidensis.

artículo científico publicado en 2006

Aromatic-degrading Sphingomonas isolates from the deep subsurface

artículo científico publicado en 1995

Changes in translational efficiency is a dominant regulatory mechanism in the environmental response of bacteria.

artículo científico publicado en 2013

Characterization of Purifiedc-Type Heme-Containing Peptides and Identification ofc-Type Heme-Attachment Sites inShewanellaoneidenisCytochromes Using Mass Spectrometry

scientific article published on 01 May 2005

Comparative genomic reconstruction of transcriptional networks controlling central metabolism in the Shewanella genus

artículo científico publicado en 2011

Comparative genomics and experimental characterization of N-acetylglucosamine utilization pathway of Shewanella oneidensis

artículo científico publicado en 2006

Comparative proteogenomics: combining mass spectrometry and comparative genomics to analyze multiple genomes

artículo científico publicado en 2008

Comparative systems biology across an evolutionary gradient within the Shewanella genus.

artículo científico publicado en 2009

Comparisons of Shewanella strains based on genome annotations, modeling, and experiments

artículo científico publicado en 2014

Complete sequence of a 184-kilobase catabolic plasmid from Sphingomonas aromaticivorans F199.

artículo científico publicado en 1999

Conservation of transcription start sites within genes across a bacterial genus

artículo científico publicado en 2014

Conserved synteny at the protein family level reveals genes underlying Shewanella species' cold tolerance and predicts their novel phenotypes

artículo científico publicado en 2009

Constraint-based model of Shewanella oneidensis MR-1 metabolism: a tool for data analysis and hypothesis generation

artículo científico publicado en 2010

Control of proteobacterial central carbon metabolism by the HexR transcriptional regulator: a case study in Shewanella oneidensis.

artículo científico publicado en 2011

Correlated atomic force microscopy and fluorescence lifetime imaging of live bacterial cells

artículo científico publicado en 2004

Current Production and Metal Oxide Reduction by Shewanella oneidensis MR-1 Wild Type and Mutants

artículo científico publicado en 2008

Current production and metal oxide reduction by Shewanella oneidensis MR-1 wild type and mutants

artículo científico publicado en 2007

Ecology, physiology, and phylogeny of deep subsurface Sphingomonas sp.

artículo científico publicado en 1999

Ecophysiology of an uncultivated lineage of Aigarchaeota from an oxic, hot spring filamentous 'streamer' community

artículo científico publicado en 2015

Electrically conductive bacterial nanowires produced by Shewanella oneidensis strain MR-1 and other microorganisms

artículo científico publicado en 2006

Electrokinesis is a microbial behavior that requires extracellular electron transport

artículo científico publicado en 2009

Extracellular polymeric substances from Shewanella sp. HRCR-1 biofilms: characterization by infrared spectroscopy and proteomics

artículo científico publicado en 2011

Fnr (EtrA) acts as a fine-tuning regulator of anaerobic metabolism in Shewanella oneidensis MR-1.

artículo científico publicado en 2011

Formaldehyde as a carbon and electron shuttle between autotroph and heterotroph populations in acidic hydrothermal vents of Norris Geyser Basin, Yellowstone National Park

artículo científico publicado en 2016

Functional roles of CymA and NapC in reduction of nitrate and nitrite by Shewanella putrefaciens W3-18-1.

artículo científico publicado en 2016

Genome Sequence of the Thermophilic Cyanobacterium Thermosynechococcus sp. Strain NK55a

artículo científico publicado en 2014

Genome-assisted analysis of dissimilatory metal-reducing bacteria

artículo científico publicado en 2005

Genome-wide protein localization prediction strategies for gram negative bacteria ⬇️

artículo científico publicado el 15 de junio de 2011

Genomic distribution of B-vitamin auxotrophy and uptake transporters in environmental bacteria from the Chloroflexi phylum

artículo científico publicado en 2014

Genomic encyclopedia of sugar utilization pathways in the Shewanella genus

artículo científico publicado en 2010

Genomic reconstruction of Shewanella oneidensis MR-1 metabolism reveals a previously uncharacterized machinery for lactate utilization

scholarly article

Geoarchaeota: a new candidate phylum in the Archaea from high-temperature acidic iron mats in Yellowstone National Park

artículo científico publicado en 2013

Geomicrobiology of high-level nuclear waste-contaminated vadose sediments at the hanford site, washington state

artículo científico publicado en 2004

Global analysis of the Deinococcus radiodurans proteome by using accurate mass tags

artículo científico publicado en 2002

Global detection and characterization of hypothetical proteins in Shewanella oneidensis MR-1 using LC-MS based proteomics

artículo científico publicado en 2005

Global profiling of Shewanella oneidensis MR-1: expression of hypothetical genes and improved functional annotations

artículo científico publicado en 2005

Global transcriptome analysis of Shewanella oneidensis MR-1 exposed to different terminal electron acceptors

artículo científico publicado en 2005

Halomonas campisalis sp. nov., a denitrifying, moderately haloalkaliphilic bacterium

artículo científico publicado en 1999

Homology between genes for aromatic hydrocarbon degradation in surface and deep-subsurface Sphingomonas strains

artículo científico publicado en 1996

Human interferon regulatory factor 1: intron-exon organization

artículo científico publicado en 1992

Hydrogenase- and outer membrane c-type cytochrome-facilitated reduction of technetium(VII) by Shewanella oneidensis MR-1.

artículo científico publicado en 2007

Identification and Resolution of Microdiversity through Metagenomic Sequencing of Parallel Consortia

artículo científico publicado en 2015

Identification and analysis of a highly conserved chemotaxis gene cluster in Shewanella species

artículo científico publicado en 2007

Identification of diverse carbon utilization pathways in Shewanella oneidensis MR-1 via expression profiling.

artículo científico publicado en 2007

Identification of mobile elements and pseudogenes in the Shewanella oneidensis MR-1 genome

artículo científico publicado en 2008

Identification of nicotinamide mononucleotide deamidase of the bacterial pyridine nucleotide cycle reveals a novel broadly conserved amidohydrolase family

artículo científico publicado en 2011

Impacts of Shewanella oneidensis c-type cytochromes on aerobic and anaerobic respiration

artículo científico publicado en 2010

Induction of aromatic catabolic activity in Sphingomonas aromaticivorans strain F199.

artículo científico publicado en 1999

Inference of interactions in cyanobacterial-heterotrophic co-cultures via transcriptome sequencing

artículo científico publicado en 2014

Investigations of structure and metabolism within Shewanella oneidensis MR-1 biofilms

artículo científico publicado en 2008

Live Cell Discovery of Microbial Vitamin Transport and Enzyme-Cofactor Interactions

artículo científico publicado en 2015

Live cell chemical profiling of temporal redox dynamics in a photoautotrophic cyanobacterium

artículo científico publicado en 2013

Mapping the subcellular proteome of Shewanella oneidensis MR-1 using sarkosyl-based fractionation and LC-MS/MS protein identification

artículo científico publicado en 2010

MetFish: a Metabolomics Pipeline for Studying Microbial Communities in Chemically Extreme Environments

artículo científico publicado en 2021

Microbial genomics: the floodgates open

artículo científico publicado en 1997

Multi-Omic Dynamics Associate Oxygenic Photosynthesis with Nitrogenase-Mediated H2 Production in Cyanothece sp. ATCC 51142

artículo científico publicado en 2015

N-terminal protein processing: a comparative proteogenomic analysis

artículo científico publicado en 2012

Oxygen-dependent autoaggregation in Shewanella oneidensis MR-1.

artículo científico publicado en 2008

Physical mapping and characterization of a catabolic plasmid from the deep-subsurface bacterium Sphingomonas sp. strain F199.

artículo científico publicado en 1995

Pyrobaculum yellowstonensis Strain WP30 Respires on Elemental Sulfur and/or Arsenate in Circumneutral Sulfidic Geothermal Sediments of Yellowstone National Park

artículo científico publicado en 2015

Quantitative analysis of cell surface membrane proteins using membrane-impermeable chemical probe coupled with 18O labeling.

artículo científico publicado en 2010

Recruitment and expression of toluene/trichloroethylene biodegradation genes in bacteria native to deep-subsurface sediments

artículo científico publicado en 1996

Reduction of nitrate in Shewanella oneidensis depends on atypical NAP and NRF systems with NapB as a preferred electron transport protein from CymA to NapA.

artículo científico publicado en 2009

Role of outer membrane c-type cytochromes MtrC and OmcA in Shewanella oneidensis MR-1 cell production, accumulation, and detachment during respiration on hematite

artículo científico publicado en 2012

SENTRA, a database of signal transduction proteins

artículo científico publicado en 2000

Shewanella knowledgebase: integration of the experimental data and computational predictions suggests a biological role for transcription of intergenic regions

artículo científico publicado en 2010

Shewanella oneidensis MR-1 nanowires are outer membrane and periplasmic extensions of the extracellular electron transport components

artículo científico publicado en 2014

Shewregdb: database and visualization environment for experimental and predicted regulatory information in Shewanella oneidensis mr-1.

artículo científico publicado en 2009

Taxonomic study of aromatic-degrading bacteria from deep-terrestrial-subsurface sediments and description of Sphingomonas aromaticivorans sp. nov., Sphingomonas subterranea sp. nov., and Sphingomonas stygia sp. nov.

artículo científico publicado en 1997

The octahaem SirA catalyses dissimilatory sulfite reduction in Shewanella oneidensis MR-1

scientific journal article

Towards environmental systems biology of Shewanella

artículo científico publicado en 2008

Trichloroethene reductive dehalogenase from Dehalococcoides ethenogenes: sequence of tceA and substrate range characterization

artículo científico publicado en 2000

Unlocking the Constraints of Cyanobacterial Productivity: Acclimations Enabling Ultrafast Growth

artículo científico publicado en 2016

Utilization of DNA as a sole source of phosphorus, carbon, and energy by Shewanella spp.: ecological and physiological implications for dissimilatory metal reduction

artículo científico publicado en 2007

Validation of Shewanella oneidensis MR-1 small proteins by AMT tag-based proteome analysis

artículo científico publicado en 2004

Whole proteome analysis of post-translational modifications: applications of mass-spectrometry for proteogenomic annotation

artículo científico publicado en 2007

c-Type cytochrome-dependent formation of U(IV) nanoparticles by Shewanella oneidensis

artículo científico publicado en 2006

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