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Lista de obras de Walter Kolch

A 19S proteasomal subunit cooperates with an ERK MAPK-regulated degron to regulate accumulation of Fra-1 in tumour cells.

artículo científico publicado en 2011

A Brain-Derived Neurotrophic Factor Mimetic Is Sufficient to Restore Cone Photoreceptor Visual Function in an Inherited Blindness Model.

artículo científico publicado en 2017

A Raf-1 mutant that dissociates MEK/extracellular signal-regulated kinase activation from malignant transformation and differentiation but not proliferation.

artículo científico publicado en 2003

A hidden oncogenic positive feedback loop caused by crosstalk between Wnt and ERK pathways.

artículo científico publicado en 2007

A microfluidic dual gradient generator for conducting cell-based drug combination assays

artículo científico publicado en 2015

Activation of bcl-2 suppressible 40 and 44 kDa p38-like kinases during apoptosis of early and late B lymphocytic cell lines

artículo científico publicado en 1998

Activation of protein kinase A (PKA) by 8-Cl-cAMP as a novel approach for antileukaemic therapy.

artículo científico publicado en 2004

Addressing the challenge of defining valid proteomic biomarkers and classifiers

artículo científico publicado en 2010

All over the place: deciphering HRAS signaling from different subcellular compartments

artículo científico publicado en 2019

An integrated Bayesian framework for identifying phosphorylation networks in stimulated cells

artículo científico publicado en 2012

Autophosphorylation on S614 inhibits the activity and the transforming potential of BRAF.

artículo científico publicado en 2016

Basic fibroblast growth factor modifies the hypoxic response of human bone marrow stromal cells by ERK-mediated enhancement of HIF-1α activity.

artículo científico publicado en 2014

Big signals from small particles: regulation of cell signaling pathways by nanoparticles

artículo científico publicado en 2013

Biology using engineering tools: the negative feedback amplifier

artículo científico publicado en 2011

Bistability in the Rac1, PAK, and RhoA Signaling Network Drives Actin Cytoskeleton Dynamics and Cell Motility Switches

artículo científico publicado en 2016

CE-MS analysis of the human urinary proteome for biomarker discovery and disease diagnostics

artículo científico publicado en 2008

Capillary electrophoresis-mass spectrometry as a powerful tool in clinical diagnosis and biomarker discovery

artículo científico publicado en 2005

Cell Type-Specific Activation of AKT and ERK Signaling Pathways by Small Negatively-Charged Magnetic Nanoparticles ⬇️

artículo científico publicado el 16 de noviembre de 2012

Cell fate decisions are specified by the dynamic ERK interactome

artículo científico publicado en 2009

Characterisation of HRas local signal transduction networks using engineered site-specific exchange factors

artículo científico publicado en 2017

Chip-based dynamic real-time quantification of drug-induced cytotoxicity in human tumor cells

scientific article published on August 2009

Clinical proteomics: A need to define the field and to begin to set adequate standards

artículo científico publicado en 2007

Clinical proteomics: a question of technology

artículo científico publicado en 2004

Comparison of anthracycline-induced death of human leukemia cells: programmed cell death versus necrosis

artículo científico publicado en 2002

Competing to coordinate cell fate decisions: the MST2-Raf-1 signaling device

artículo científico publicado en 2015

Computational approaches for analyzing information flow in biological networks

artículo científico publicado en 2012

Computational modelling of cancerous mutations in the EGFR/ERK signalling pathway

artículo científico publicado en 2009

Computational modelling of the receptor-tyrosine-kinase-activated MAPK pathway

artículo científico publicado en 2005

Conferring specificity on the ubiquitous Raf/MEK signalling pathway

artículo científico publicado en 2004

Control of the G-protein cascade dynamics by GDP dissociation inhibitors

artículo científico publicado en 2013

Coordinating ERK/MAPK signalling through scaffolds and inhibitors

artículo científico publicado en 2005

Crosstalk and signaling switches in mitogen-activated protein kinase cascades

artículo científico publicado en 2012

Cyclic AMP-dependent kinase regulates Raf-1 kinase mainly by phosphorylation of serine 259.

artículo científico publicado en 2002

Defining systems biology: through the eyes of a biochemist

scientific article published on 01 January 2008

Differential localization of A-Raf regulates MST2-mediated apoptosis during epithelial differentiation

artículo científico publicado en 2016

Differential role of protein kinase C in cytokine induced lymphocyte-endothelium interaction in vitro

artículo científico publicado en 1994

Discovery of biomarkers in human urine and cerebrospinal fluid by capillary electrophoresis coupled to mass spectrometry: towards new diagnostic and therapeutic approaches

artículo científico publicado en 2005

ERK2 drives tumour cell migration in three-dimensional microenvironments by suppressing expression of Rab17 and liprin-β2.

artículo científico publicado en 2012

Effects of RKIP Loss in Human and in Animal Models of Colorectal Cancer

Emergence of bimodal cell population responses from the interplay between analog single-cell signaling and protein expression noise ⬇️

artículo científico publicado el 24 de agosto de 2012

Engineering the serine/threonine protein kinase Raf-1 to utilise an orthogonal analogue of ATP substituted at the N6 position

artículo científico publicado en 2004

Epstein-Barr virus latent membrane protein-1 triggers AP-1 activity via the c-Jun N-terminal kinase cascade

artículo científico publicado en 1997

Eukaryotic translation initiation factor 3, subunit a, regulates the extracellular signal-regulated kinase pathway

scientific journal article

Evaluating strategies to normalise biological replicates of Western blot data

artículo científico publicado en 2014

Expression of human c-raf-1 oncogene proteins in E. coli

artículo científico publicado en 1988

Extensive rewiring of the EGFR network in colorectal cancer cells expressing transforming levels of KRASG13D

scientific article published on 24 January 2020

Extracellular signal-regulated kinase regulates RhoA activation and tumor cell plasticity by inhibiting guanine exchange factor H1 activity

artículo científico publicado en 2013

Frequent loss of RAF kinase inhibitor protein expression in acute myeloid leukemia

artículo científico publicado en 2012

Functional proteomics to dissect tyrosine kinase signalling pathways in cancer

artículo científico publicado en 2010

Functional roles of multiple feedback loops in extracellular signal-regulated kinase and Wnt signaling pathways that regulate epithelial-mesenchymal transition

artículo científico publicado en 2010

GSK3 inhibitors regulate MYCN mRNA levels and reduce neuroblastoma cell viability through multiple mechanisms, including p53 and Wnt signaling

artículo científico publicado en 2013

Giving Space to Cell Signaling

HGF induces epithelial-to-mesenchymal transition by modulating the mammalian hippo/MST2 and ISG15 pathways

artículo científico publicado en 2014

Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H blocks MST2-mediated apoptosis in cancer cells by regulating A-Raf transcription

artículo científico publicado en 2010

High-precision FLIM-FRET in fixed and living cells reveals heterogeneity in a simple CFP-YFP fusion protein

artículo científico publicado en 2007

Identification and analysis of phosphopeptides

artículo científico publicado en 2004

Identification of potential HLA class I and class II epitope precursors associated with heat shock protein 70 (HSPA)

artículo científico publicado en 2010

Identification of the mechanisms regulating the differential activation of the mapk cascade by epidermal growth factor and nerve growth factor in PC12 cells

artículo científico publicado en 2001

Identification of the primary growth response gene, ST2/T1, as a gene whose expression is differentially regulated by different protein kinase C isozymes

artículo científico publicado en 1995

Identification of the smooth muscle-specific protein, sm22, as a novel protein kinase C substrate using two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry

scientific article published on 01 July 2000

Imatinib-dependent tyrosine phosphorylation profiling of Bcr-Abl-positive chronic myeloid leukemia cells.

artículo científico publicado en 2012

Immunocytochemical localization of eight protein kinase C isozymes overexpressed in NIH 3T3 fibroblasts. Isoform-specific association with microfilaments, Golgi, endoplasmic reticulum, and nuclear and cell membranes

artículo científico publicado en 1995

In vitro study of the interaction of heregulin-functionalized magnetic-optical nanorods with MCF7 and MDA-MB-231 cells.

artículo científico publicado en 2014

Induction of apoptosis by protein kinase C delta is independent of its kinase activity

artículo científico publicado en 2002

Inferring signaling pathway topologies from multiple perturbation measurements of specific biochemical species

artículo científico publicado en 2010

Integrating Bayesian variable selection with Modular Response Analysis to infer biochemical network topology

artículo científico publicado en 2013

Integrative omics reveals MYCN as a global suppressor of cellular signalling and enables network-based therapeutic target discovery in neuroblastoma

artículo científico

Investigating dynamics of inhibitory and feedback loops in ERK signalling using power-law models

artículo científico publicado en 2010

Investigating the correspondence between transcriptomic and proteomic expression profiles using coupled cluster models

artículo científico publicado en 2008

It takes two to tango--signalling by dimeric Raf kinases

artículo científico publicado en 2013

LPS resistance in monocytic cells caused by reverse signaling through transmembrane TNF (mTNF) is mediated by the MAPK/ERK pathway

artículo científico publicado en 2003

Lab-on-a-chip technologies for proteomic analysis from isolated cells

artículo científico publicado en 2008

Lapatinib potentiates cytotoxicity of  YM155 in neuroblastoma via inhibition of the ABCB1 efflux transporter

artículo científico publicado en 2017

Ligands working as receptors: reverse signaling by members of the TNF superfamily enhance the plasticity of the immune system

artículo científico publicado en 2004

Linear approaches to intramolecular Förster resonance energy transfer probe measurements for quantitative modeling

artículo científico publicado en 2011

MAP kinase signalling pathways in cancer

artículo científico publicado en 2007

MAPK kinase signalling dynamics regulate cell fate decisions and drug resistance

artículo científico publicado en 2016

MST kinases monitor actin cytoskeletal integrity and signal via c-Jun N-terminal kinase stress-activated kinase to regulate p21Waf1/Cip1 stability

artículo científico publicado en 2009

Mammalian protein expression noise: scaling principles and the implications for knockdown experiments

artículo científico publicado en 2012

Mammalian sterile 20-like kinases in tumor suppression: an emerging pathway

artículo científico publicado en 2005

Mapping of signaling pathways by functional interaction proteomics

artículo científico publicado en 2008

Mathematical Modeling of the Influence of RKIP on the ERK Signaling Pathway

Meaningful relationships: the regulation of the Ras/Raf/MEK/ERK pathway by protein interactions

artículo científico publicado en 2000

Measuring Transcription Rate Changes via Time-Course 4-Thiouridine Pulse-Labelling Improves Transcriptional Target Identification

artículo científico publicado en 2015

Mechanism of suppression of the Raf/MEK/extracellular signal-regulated kinase pathway by the raf kinase inhibitor protein

artículo científico publicado en 2000

Mechanochemical stimulation of MCF7 cells with rod-shaped Fe-Au Janus particles induces cell death through paradoxical hyperactivation of ERK.

artículo científico publicado en 2014

Mesenchymal Stromal Cells Protect Endothelial Cells from Cytotoxic T Lymphocyte-Induced Lysis

artículo científico publicado en 2016

Metabolic stress regulates ERK activity by controlling KSR-RAF heterodimerization

artículo científico publicado en 2017

Mice lacking the Raf-1 kinase inhibitor protein exhibit exaggerated hypoxia-induced pulmonary hypertension

artículo científico publicado en 2011

Microarray-formatted clinical biomarker assay development using peptide aptamers to anterior gradient-2.

artículo científico publicado en 2007

Microfluidic single cell arrays to interrogate signalling dynamics of individual, patient-derived hematopoietic stem cells

artículo científico publicado en 2009

Mig-6 participates in the regulation of cell senescence and retinoblastoma protein phosphorylation

artículo científico publicado en 2014

Mitogen-Inducible Gene-6 Mediates Feedback Inhibition from Mutated BRAF towards the Epidermal Growth Factor Receptor and Thereby Limits Malignant Transformation

artículo científico publicado en 2015

Modeling and simulation of intracellular dynamics: choosing an appropriate framework

artículo científico publicado en 2004

Molecular mechanisms of asymmetric RAF dimer activation

artículo científico publicado en 2014

Multiple roles of the NF-kappaB signaling pathway regulated by coupled negative feedback circuits

artículo científico publicado en 2009

Mutant K-Ras activation of the proapoptotic MST2 pathway is antagonized by wild-type K-Ras

artículo científico publicado en 2011

Mutationally activated K-ras 4A and 4B both mediate lung carcinogenesis

artículo científico publicado en 2007

Mutations of beta-arrestin 2 that limit self-association also interfere with interactions with the beta2-adrenoceptor and the ERK1/2 MAPKs: implications for beta2-adrenoceptor signalling via the ERK1/2 MAPKs

artículo científico publicado en 2008

Naturally occurring human urinary peptides for use in diagnosis of chronic kidney disease

artículo científico publicado en 2010

Navigating the multilayered organization of eukaryotic signaling: a new trend in data integration

artículo científico publicado en 2014

Nerve Growth Factor-mediated Activation of the Mitogen-activated Protein (MAP) Kinase Cascade Involves a Signaling Complex Containing B-Raf and HSP90

artículo científico publicado en 1996

Network-based identification of feedback modules that control RhoA activity and cell migration

artículo científico publicado en 2015

News

scientific article published on 01 June 2005

Nonlinear signalling networks and cell-to-cell variability transform external signals into broadly distributed or bimodal responses

artículo científico publicado en 2014

On-beads digestion in conjunction with data-dependent mass spectrometry: a shortcut to quantitative and dynamic interaction proteomics

artículo científico publicado en 2014

On-chip immunoprecipitation for protein purification

artículo científico publicado en 2010

Oncogenic B-Raf mutations: crystal clear at last

artículo científico publicado en 2004

Oncogenic K-RAS is required to maintain changes in cytoskeletal organization, adhesion, and motility in colon cancer cells

artículo científico publicado en 2005

One Hippo and many masters: differential regulation of the Hippo pathway in cancer

artículo científico publicado en 2014

PI3K/Akt-sensitive MEK-independent compensatory circuit of ERK activation in ER-positive PI3K-mutant T47D breast cancer cells

artículo científico publicado en 2010

Pachinko biology: Gambling on single cells

Personalized Computational Models as Biomarkers

artículo científico

Phosphodiesterase-8A binds to and regulates Raf-1 kinase

scientific journal article

Phosphorylation of RAF Kinase Dimers Drives Conformational Changes that Facilitate Transactivation

artículo científico publicado en 2015

Positive- and negative-feedback regulations coordinate the dynamic behavior of the Ras-Raf-MEK-ERK signal transduction pathway

artículo científico publicado en 2009

Preparation of raf-oncogene-specific antiserum with raf protein produced in E. coli

artículo científico publicado en 1988

Proapoptotic kinase MST2 coordinates signaling crosstalk between RASSF1A, Raf-1, and Akt

artículo científico publicado en 2010

Prolactin-stimulated activation of ERK1/2 mitogen-activated protein kinases is controlled by PI3-kinase/Rac/PAK signaling pathway in breast cancer cells

artículo científico publicado en 2011

Protein interaction switches coordinate Raf-1 and MST2/Hippo signalling

artículo científico publicado en 2014

Protein–protein interactions generate hidden feedback and feed-forward loops to trigger bistable switches, oscillations and biphasic dose–responses

article

Proteomic analysis of phosphorylation, oxidation and nitrosylation in signal transduction

artículo científico publicado en 2006

Proteomics and phosphoproteomics for the mapping of cellular signalling networks

artículo científico publicado en 2008

Pseudophosphatase STYX modulates cell-fate decisions and cell migration by spatiotemporal regulation of ERK1/2

artículo científico publicado en 2013

Quantification of functionalised gold nanoparticle-targeted knockdown of gene expression in HeLa cells

artículo científico publicado en 2014

RAF kinase inhibitory protein (RKIP) modulates cell cycle kinetics and motility

artículo científico publicado en 2010

RAN GTPase is a RASSF1A effector involved in controlling microtubule organization

artículo científico publicado en 2009

RASSF1A Tumour Suppressor: Target the Network for Effective Cancer Therapy

scientific article published on 17 January 2020

RASSF1A elicits apoptosis through an MST2 pathway directing proapoptotic transcription by the p73 tumor suppressor protein

artículo científico publicado en 2007

RASSF2 associates with and stabilizes the proapoptotic kinase MST2

artículo científico publicado en 2009

ROCK activity and the Gβγ complex mediate chemotactic migration of mouse bone marrow-derived stromal cells

artículo científico publicado en 2015

Raf family kinases: old dogs have learned new tricks

artículo científico publicado en 2011

Raf kinase inhibitor protein RKIP enhances signaling by glycogen synthase kinase-3β.

artículo científico publicado en 2011

Raf kinase inhibitor protein expression combined with peritoneal involvement and lymphovascular invasion predicts prognosis in Dukes' B colorectal cancer patients

artículo científico publicado en 2013

Raf kinase inhibitor protein expression in a survival analysis of colorectal cancer patients

artículo científico publicado en 2006

Raf kinase inhibitor protein interacts with NF-kappaB-inducing kinase and TAK1 and inhibits NF-kappaB activation

artículo científico publicado en 2001

Raf kinase inhibitor protein regulation of raf and MAPK signaling

artículo científico publicado en 2006

Raf kinase inhibitor protein: mechanism of loss of expression and association with genomic instability

artículo científico publicado en 2008

Raf-1 and B-Raf promote protein kinase C theta interaction with BAD.

artículo científico publicado en 2006

Raf-1-associated Protein Phosphatase 2A as a Positive Regulator of Kinase Activation

artículo científico publicado en 2000

Ras/Raf signalling and emerging pharmacotherapeutic targets

artículo científico publicado en 2002

Recommendations for biomarker identification and qualification in clinical proteomics

artículo científico publicado en 2010

Reduction in Raf kinase inhibitor protein expression is associated with increased Ras-extracellular signal-regulated kinase signaling in melanoma cell lines.

artículo científico publicado en 2004

Reduction of Raf-1 kinase inhibitor protein expression correlates with breast cancer metastasis

artículo científico publicado en 2005

Regulation and role of Raf-1/B-Raf heterodimerization

artículo científico publicado en 2006

Regulation of RKIP binding to the N-region of the Raf-1 kinase

artículo científico publicado en 2006

Regulation of Raf-1 activation and signalling by dephosphorylation

artículo científico publicado en 2002

Regulation of Raf-1 kinase by TNF via its second messenger ceramide and cross-talk with mitogenic signalling

artículo científico publicado en 1998

Regulation of human myoblast differentiation by PEBP4

artículo científico publicado en 2009

Regulation of the MAPK pathway by raf kinase inhibitory protein

artículo científico publicado en 2014

Regulation of the Raf-MEK-ERK pathway by protein phosphatase 5

scientific journal article

Regulation of the expression of the VEGF/VPS and its receptors: role in tumor angiogenesis

artículo científico publicado en 1995

Report on EU-USA workshop: how systems biology can advance cancer research (27 October 2008)

artículo científico publicado en 2008

Robustness and evolvability of the human signaling network

artículo científico publicado en 2014

Role of inhibitory proteins as modulators of oscillations in NFB signalling

artículo científico publicado en 2009

Role of the kinase MST2 in suppression of apoptosis by the proto-oncogene product Raf-1.

artículo científico publicado en 2004

Signaling pathway models as biomarkers: Patient-specific simulations of JNK activity predict the survival of neuroblastoma patients

artículo científico publicado en 2015

Signalling ballet in space and time

artículo científico publicado en 2010

Signalling mechanisms regulating phenotypic changes in breast cancer cells

artículo científico publicado en 2015

Silence on the relevant literature and errors in implementation

artículo científico publicado en 2015

Snail is a repressor of RKIP transcription in metastatic prostate cancer cells

artículo científico

Spatial regulation of ARAF controls the MST2-Hippo pathway.

artículo científico publicado en 2017

Splicing factor hnRNP A2 activates the Ras-MAPK-ERK pathway by controlling A-Raf splicing in hepatocellular carcinoma development

artículo científico publicado en 2014

Stabilization of C-RAF:KSR1 complex by DiRas3 reduces availability of C-RAF for dimerization with B-RAF.

artículo científico publicado en 2016

Studies of perinuclear and nuclear translocation of the Raf-1 protein in rodent fibroblasts

artículo científico publicado en 1998

Suppression of Raf-1 kinase activity and MAP kinase signalling by RKIP

artículo científico publicado en 1999

Switches, excitable responses and oscillations in the Ring1B/Bmi1 ubiquitination system

artículo científico publicado en 2011

Systems biology-embedded target validation: improving efficacy in drug discovery

artículo científico publicado en 2013

Systems medicine: helping us understand the complexity of disease

artículo científico publicado en 2013

Systems medicine: opportunities and challenges for systems biology approaches

artículo científico publicado en 2013

Targeting MAPK Signaling in Cancer: Mechanisms of Drug Resistance and Sensitivity

scientific article published on 07 February 2020

Targeting MAPK signalling: Prometheus' fire or Pandora's box?

artículo científico publicado en 2004

Technical, bioinformatical and statistical aspects of liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) and capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) based clinical proteomics: a critical assessment

artículo científico publicado en 2008

The APC network regulates the removal of mutated cells from colonic crypts

artículo científico publicado en 2014

The C-terminus of Raf-1 acts as a 14-3-3-dependent activation switch

artículo científico publicado en 2009

The PKC targeting protein RACK1 interacts with the Epstein-Barr virus activator protein BZLF1

artículo científico publicado en 2000

The Parkinson disease causing LRRK2 mutation I2020T is associated with increased kinase activity

artículo científico publicado en 2006

The RASSF8 candidate tumor suppressor inhibits cell growth and regulates the Wnt and NF-kappaB signaling pathways.

artículo científico publicado en 2010

The RKIP (Raf-1 Kinase Inhibitor Protein) conserved pocket binds to the phosphorylated N-region of Raf-1 and inhibits the Raf-1-mediated activated phosphorylation of MEK.

artículo científico publicado en 2008

The Renilla luciferase gene as a reference gene for normalization of gene expression in transiently transfected cells

artículo científico publicado en 2010

The differential effects of wild-type and mutated K-Ras on MST2 signaling are determined by K-Ras activation kinetics

artículo científico publicado en 2013

The dynamic control of signal transduction networks in cancer cells

artículo científico publicado en 2015

The future of genomics in Ireland – focus on genomics for health

artículo científico publicado en 2020

The kinase domain of MEKK1 induces apoptosis by dysregulation of MAP kinase pathways

artículo científico publicado en 2003

The mammalian MAPK/ERK pathway exhibits properties of a negative feedback amplifier

artículo científico publicado en 2010

The molecular make-up of a tumour: proteomics in cancer research

artículo científico publicado en 2005

The secret life of kinases: functions beyond catalysis

artículo científico publicado en 2011

The topology design principles that determine the spatiotemporal dynamics of G-protein cascades

article

Theoretical and experimental analysis links isoform-specific ERK signalling to cell fate decisions

artículo científico publicado en 2009

To be or not to be: a question of B-Raf?

artículo científico publicado en 2001

Transcriptional repression of telomerase RNA gene expression by c-Jun-NH2-kinase and Sp1/Sp3.

artículo científico publicado en 2006

Unique reporter-based sensor platforms to monitor signalling in cells

artículo científico publicado en 2012

Untying the regulation of the Raf-1 kinase

artículo científico publicado en 2002

Urinary Proteomic Biomarkers in Coronary Artery Disease

artículo científico publicado en 2007

When kinases meet mathematics: the systems biology of MAPK signalling

artículo científico publicado en 2005

When ubiquitination meets phosphorylation: a systems biology perspective of EGFR/MAPK signalling ⬇️

artículo científico publicado el 31 de julio de 2013

c-Myc regulates RNA splicing of the A-Raf kinase and its activation of the ERK pathway

artículo científico publicado en 2011

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