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Lista de obras de Bastien Boussau

A branch-heterogeneous model of protein evolution for efficient inference of ancestral sequences

artículo científico publicado en 2013

A mixture model and a hidden markov model to simultaneously detect recombination breakpoints and reconstruct phylogenies.

artículo científico publicado en 2009

A phylogenomic approach to vertebrate phylogeny supports a turtle-archosaur affinity and a possible paraphyletic lissamphibia

artículo científico publicado en 2012

Accounting for horizontal gene transfers explains conflicting hypotheses regarding the position of aquificales in the phylogeny of Bacteria

artículo científico publicado en 2008

Accurate Detection of Convergent Amino-Acid Evolution with PCOC

scientific article published on 01 September 2018

Adaptation to host cell environment during experimental evolution of Zika virus

artículo científico publicado en 2022

An evaluation of the hybrid speciation hypothesis for Xiphophorus clemenciae based on whole genome sequences

artículo científico publicado en 2012

Assessing approaches for inferring species trees from multi-copy genes

artículo científico publicado en 2014

Bio++: efficient extensible libraries and tools for computational molecular evolution.

artículo científico publicado en 2013

CAARS: comparative assembly and annotation of RNA-Seq data

artículo científico publicado en 2019

Computational inference of scenarios for alpha-proteobacterial genome evolution

artículo científico publicado en 2004

Detecting adaptive convergent amino acid evolution.

artículo científico publicado en 2019

Detecting convergent adaptive amino acid evolution: Supplementary material

Drift and genome complexity revisited.

artículo científico publicado en 2011

Efficient Gene Tree Correction Guided by Genome Evolution

artículo científico publicado en 2016

Efficient exploration of the space of reconciled gene trees

artículo científico publicado en 2013

Efficient likelihood computations with nonreversible models of evolution

artículo científico publicado en 2006

Efficient selection of branch-specific models of sequence evolution

artículo científico publicado en 2012

Evidence for GC-biased gene conversion as a driver of between-lineage differences in avian base composition

artículo científico publicado en 2014

Evolution of gene neighborhoods within reconciled phylogenies

artículo científico publicado en 2012

Fast and robust characterization of time-heterogeneous sequence evolutionary processes using substitution mapping

artículo científico publicado en 2012

Gene Acquisitions from Bacteria at the Origins of Major Archaeal Clades Are Vastly Overestimated

artículo científico publicado en 2015

Gene transfers can date the tree of life

article

Gene transfers, like fossils, can date the Tree of Life

article

Genome-scale coestimation of species and gene trees.

artículo científico publicado en 2012

Genome-scale phylogenetic analysis finds extensive gene transfer among fungi

artículo científico publicado en 2015

Genomes as documents of evolutionary history

artículo científico publicado en 2009

Integrative modeling of gene and genome evolution roots the archaeal tree of life

artículo científico publicado en 2017

Mesophilic Crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota

artículo científico publicado en 2008

Non-homogeneous models of sequence evolution in the Bio++ suite of libraries and programs

artículo científico publicado en 2008

Nonadaptive evolution of mitochondrial genome size

artículo científico publicado en 2011

Origins of major archaeal clades do not correspond to gene acquisitions from bacteria

article

Parallel adaptations to high temperatures in the Archaean eon.

artículo científico publicado en 2008

Phylogenetic dating and characterization of gene duplications in vertebrates: the cartilaginous fish reference

artículo científico publicado en 2003

Phylogenetic modeling of lateral gene transfer reconstructs the pattern and relative timing of speciations

artículo científico publicado en 2012

Probabilistic graphical model representation in phylogenetics

artículo científico publicado en 2014

RecPhyloXML: a format for reconciled gene trees

article

Response to Comment on "Statistical binning enables an accurate coalescent-based estimation of the avian tree".

artículo científico publicado en 2015

RevBayes: Bayesian Phylogenetic Inference Using Graphical Models and an Interactive Model-Specification Language

artículo científico publicado en 2016

Statistical binning enables an accurate coalescent-based estimation of the avian tree

artículo científico publicado en 2014

Strepsiptera, phylogenomics and the long branch attraction problem

artículo científico publicado en 2014

The fate of the duplicated androgen receptor in fishes: a late neofunctionalization event?

artículo científico publicado en 2008

The inference of gene trees with species trees

artículo científico publicado en 2014

The molecular signal for the adaptation to cold temperature during early life on Earth

artículo científico publicado en 2013

Treerecs: an integrated phylogenetic tool, from sequences to reconciliations

scientific article published on 16 July 2020

Weighted Statistical Binning: Enabling Statistically Consistent Genome-Scale Phylogenetic Analyses

artículo científico publicado en 2015

Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds

artículo científico publicado en 2014

The era of reference genomes in conservation genomics

artículo científico publicado en 2022

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