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Lista de obras de Shaun Jackman

A robust benchmark for detection of germline large deletions and insertions

artículo científico publicado en 2020

ABySS-Explorer: visualizing genome sequence assemblies

artículo científico publicado en 2009

ABySS: a parallel assembler for short read sequence data

artículo científico publicado en 2009

Assemblathon 1: a competitive assessment of de novo short read assembly methods

artículo científico publicado en 2011

Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species

artículo científico publicado en 2013

Assembling genomes using short-read sequencing technology.

artículo científico publicado en 2010

Assembly of the Complete Sitka Spruce Chloroplast Genome Using 10X Genomics' GemCode Sequencing Data.

artículo científico publicado en 2016

Author Correction: A robust benchmark for detection of germline large deletions and insertions

artículo científico publicado en 2020

Barnacle: detecting and characterizing tandem duplications and fusions in transcriptome assemblies

artículo científico publicado en 2013

BioBloom tools: fast, accurate and memory-efficient host species sequence screening using bloom filters.

artículo científico publicado en 2014

DIDA: Distributed Indexing Dispatched Alignment.

artículo científico publicado en 2015

De novo assembly and analysis of RNA-seq data.

artículo científico publicado en 2010

De novo transcriptome assembly with ABySS.

artículo científico publicado en 2009

Draft genome of the mountain pine beetle, Dendroctonus ponderosae Hopkins, a major forest pest

artículo científico publicado en 2013

Frequent mutation of histone-modifying genes in non-Hodgkin lymphoma

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae strain M1601.

artículo científico publicado en 2011

Improved white spruce (Picea glauca) genome assemblies and annotation of large gene families of conifer terpenoid and phenolic defense metabolism

artículo científico publicado en 2015

KLEAT: CLEAVAGE SITE ANALYSIS OF TRANSCRIPTOMES

article published in 2014

Konnector v2.0: pseudo-long reads from paired-end sequencing data

artículo científico publicado en 2015

Konnector: Connecting paired-end reads using a bloom filter de Bruijn graph

On the Representation of de Bruijn Graphs

artículo científico publicado en 2014

On the representation of de Bruijn graphs

artículo científico publicado en 2015

Organellar Genomes of White Spruce (Picea glauca): Assembly and Annotation

artículo científico publicado en 2015

Sealer: a scalable gap-closing application for finishing draft genomes.

artículo científico publicado en 2015

Spaced Seed Data Structures for De Novo Assembly.

artículo científico publicado en 2015

Spaced seed data structures

Subgroup-specific structural variation across 1,000 medulloblastoma genomes

artículo científico publicado en 2012

The Genome of the Steller Sea Lion (Eumetopias jubatus)

artículo científico publicado en 2019

The genome and transcriptome of the pine saprophyte Ophiostoma piceae, and a comparison with the bark beetle-associated pine pathogen Grosmannia clavigera

artículo científico publicado en 2013

Tigmint: correcting assembly errors using linked reads from large molecules

artículo científico publicado en 2018

UniqTag: Content-Derived Unique and Stable Identifiers for Gene Annotation

artículo científico publicado en 2015

UniqTag: Content-derived unique and stable identifiers for gene annotation

article

Updated genome assembly and annotation of Paenibacillus larvae, the agent of American foulbrood disease of honey bees

artículo científico publicado en 2011

Whole genome duplication and enrichment of metal cation transporters revealed by de novo genome sequencing of extremely halotolerant black yeast Hortaea werneckii

artículo científico publicado en 2013

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