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Lista de obras de Jennifer R Wortman

1641. Treatment of Recurrent Clostridium difficile Infection With SER-109 Reduces Gastrointestinal Carriage of Antimicrobial Resistance Genes

article

621. Treatment of Recurrent Clostridium difficile Infection with SER-109 Increases the Concentration of Secondary Bile Acids in a Dose-Dependent Manner

A catalog of reference genomes from the human microbiome

artículo científico publicado en 2010

A comparison of whole-genome shotgun-derived mouse chromosome 16 and the human genome

artículo científico publicado en 2002

A data analysis and coordination center for the human microbiome project.

artículo científico publicado en 2010

A framework for human microbiome research

artículo científico publicado en 2012

A preliminary analysis of the process of protein secretion and the diversity of putative secreted hydrolases encoded in Aspergillus fumigatus: insights from the genome

artículo científico publicado en 2005

Analysis of the transcriptome of the protozoan Theileria parva using MPSS reveals that the majority of genes are transcriptionally active in the schizont stage

artículo científico publicado en 2005

Annotation of the Arabidopsis genome

scientific article published in 2003

Approaches to Fungal Genome Annotation

artículo científico publicado en 2011

Automated eukaryotic gene structure annotation using EVidenceModeler and the Program to Assemble Spliced Alignments

artículo científico publicado en 2008

Comparative analysis of programmed cell death pathways in filamentous fungi

artículo científico publicado en 2005

Comparative genomic analyses of the human fungal pathogens Coccidioides and their relatives

artículo científico publicado en 2009

Comparative genomics of Brassica oleracea and Arabidopsis thaliana reveal gene loss, fragmentation, and dispersal after polyploidy

article

Comparative genomics of enterococci: variation in Enterococcus faecalis, clade structure in E. faecium, and defining characteristics of E. gallinarum and E. casseliflavus

artículo científico publicado en 2012

Comparative genomics of recent Shiga toxin-producing Escherichia coli O104:H4: short-term evolution of an emerging pathogen

artículo científico publicado en 2013

Comparative genomics of the neglected human malaria parasite Plasmodium vivax

artículo científico publicado en 2008

Comparative genomics of trypanosomatid parasitic protozoa

artículo científico publicado en 2005

Comparative genomics of vancomycin-resistant Staphylococcus aureus strains and their positions within the clade most commonly associated with Methicillin-resistant S. aureus hospital-acquired infection in the United States

artículo científico publicado en 2012

Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus.

artículo científico publicado en 2017

Complete reannotation of the Arabidopsis genome: methods, tools, protocols and the final release

artículo científico publicado en 2005

Comprehensive annotation of secondary metabolite biosynthetic genes and gene clusters of Aspergillus nidulans, A. fumigatus, A. niger and A. oryzae

artículo científico publicado en 2013

DAGchainer: a tool for mining segmental genome duplications and synteny

artículo científico publicado en 2004

Draft genome of the filarial nematode parasite Brugia malayi

artículo científico publicado en 2007

Draft genome sequence of the oilseed species Ricinus communis

artículo científico publicado en 2010

Draft genome sequence of the sexually transmitted pathogen Trichomonas vaginalis

artículo científico publicado en 2007

Emergence of epidemic multidrug-resistant Enterococcus faecium from animal and commensal strains

scientific article published on 20 August 2013

Ergatis: a web interface and scalable software system for bioinformatics workflows

artículo científico publicado en 2010

Evolution of Extensively Drug-Resistant Tuberculosis over Four Decades: Whole Genome Sequencing and Dating Analysis of Mycobacterium tuberculosis Isolates from KwaZulu-Natal

artículo científico publicado en 2015

Evolution of extensively drug-resistant tuberculosis over four decades revealed by whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis from KwaZulu-Natal, South Africa

scholarly article by Keira A. Cohen et al published March 2015 in International journal of mycobacteriology

Gastrointestinal Tract Microbiome Dynamics Following Treatment with SER-109, an Investigational Oral Microbiome Therapeutic to Reduce the Recurrence of Clostridium difficile Infection (CDI).

artículo científico publicado en 2017

Genome Sequence of Theileria parva, a Bovine Pathogen That Transforms Lymphocytes

artículo científico publicado en 2005

Genome sequence of Aedes aegypti, a major arbovirus vector

artículo científico publicado en 2007

Genome sequence of Babesia bovis and comparative analysis of apicomplexan hemoprotozoa

artículo científico publicado en 2007

Genome sequencing and analysis of Aspergillus oryzae

artículo científico publicado en 2005

Genome sequencing and analysis of the filamentous fungus Penicillium chrysogenum

artículo científico publicado en 2008

Genome wide survey, discovery and evolution of repetitive elements in three Entamoeba species

artículo científico publicado en 2008

Genomic and functional analyses of Mycobacterium tuberculosis strains implicate ald in D-cycloserine resistance.

artículo científico publicado en 2016

Genomic epidemiology of the Escherichia coli O104:H4 outbreaks in Europe, 2011.

artículo científico publicado en 2012

Genomic insights into the Ixodes scapularis tick vector of Lyme disease

artículo científico publicado en 2016

Genomic islands in the pathogenic filamentous fungus Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2008

Genomic sequence of the pathogenic and allergenic filamentous fungus Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2005

Genomics of Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2005

Genomics of Loa loa, a Wolbachia-free filarial parasite of humans

artículo científico publicado en 2013

Identification and characterization of a p53 homologue in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2000

Identification of 50 class D β-lactamases and 65 Acinetobacter-derived cephalosporinases in Acinetobacter spp.

artículo científico publicado en 2013

Illumina identification of RsrA, a conserved C2H2 transcription factor coordinating the NapA mediated oxidative stress signaling pathway in Aspergillus

artículo científico publicado en 2014

Improving the Arabidopsis genome annotation using maximal transcript alignment assemblies

artículo científico publicado en 2003

Kinannote, a computer program to identify and classify members of the eukaryotic protein kinase superfamily

artículo científico publicado en 2013

Macronuclear genome sequence of the ciliate Tetrahymena thermophila, a model eukaryote

artículo científico publicado en 2006

Minimum information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications

artículo científico publicado en 2011

New resources for functional analysis of omics data for the genus Aspergillus

artículo científico publicado en 2011

Pilon: an integrated tool for comprehensive microbial variant detection and genome assembly improvement

artículo científico publicado en 2014

Refined annotation and assembly of the Tetrahymena thermophila genome sequence through EST analysis, comparative genomic hybridization, and targeted gap closure

artículo científico publicado en 2008

Reply to Guy et al.: Support for a bottleneck in the 2011 Escherichia coli O104:H4 outbreak in Germany

artículo científico publicado en 2012

Revitalization of a Forward Genetic Screen Identifies Three New Regulators of Fungal Secondary Metabolism in the Genus Aspergillus

artículo científico publicado en 2017

Sequence, annotation, and analysis of synteny between rice chromosome 3 and diverged grass species

artículo científico publicado en 2005

Sequencing of Aspergillus nidulans and comparative analysis with A. fumigatus and A. oryzae

artículo científico publicado en 2005

Sequencing of Culex quinquefasciatus establishes a platform for mosquito comparative genomics

artículo científico publicado en 2010

Standardized metadata for human pathogen/vector genomic sequences

artículo científico publicado en 2014

Structural, Functional, and Comparative Annotation of Plant Genomes

article

Structure, function and diversity of the healthy human microbiome

artículo científico publicado en 2012

Sybil: methods and software for multiple genome comparison and visualization

artículo científico publicado en 2007

The 2008 update of the Aspergillus nidulans genome annotation: a community effort

artículo científico publicado en 2008

The Aspergillus Genome Database (AspGD): recent developments in comprehensive multispecies curation, comparative genomics and community resources

artículo científico publicado en 2011

The Aspergillus Genome Database, a curated comparative genomics resource for gene, protein and sequence information for the Aspergillus research community

artículo científico publicado en 2009

The Aspergillus Genome Database: multispecies curation and incorporation of RNA-Seq data to improve structural gene annotations

artículo científico publicado en 2013

The Gene Ontology (GO) database and informatics resource

artículo científico publicado en 2004

The Genome Sequence DataBase: towards an integrated functional genomics resource

artículo científico publicado en 1999

The Genome Sequence of Trypanosoma cruzi, Etiologic Agent of Chagas Disease

artículo científico publicado en 2005

The Genome Sequence of the Malaria Mosquito Anopheles gambiae

artículo científico publicado en 2002

The IGS Standard Operating Procedure for Automated Prokaryotic Annotation ⬇️

artículo científico publicado en 2011

The TIGR Rice Genome Annotation Resource: improvements and new features

artículo científico publicado en 2006

The ergosterol biosynthesis pathway, transporter genes, and azole resistance in Aspergillus fumigatus.

artículo científico publicado en 2005

The genome of the basidiomycetous yeast and human pathogen Cryptococcus neoformans

artículo científico publicado en 2005

The genome of the blood fluke Schistosoma mansoni

artículo científico publicado en 2009

The genome sequence of Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2000

The genomic diversification of the whole Acinetobacter genus: origins, mechanisms, and consequences

artículo científico publicado en 2014

The institute for genomic research Osa1 rice genome annotation database

artículo científico

Toward a standard in structural genome annotation for prokaryotes

artículo científico publicado en 2015

Transcriptional regulation of chemical diversity in Aspergillus fumigatus by LaeA

artículo científico publicado en 2007

Unraveling the genomic diversity of small eukaryotes

artículo científico publicado en 2009

What can comparative genomics tell us about species concepts in the genus Aspergillus?

artículo científico publicado en 2007

Whole genome shotgun sequencing of Brassica oleracea and its application to gene discovery and annotation in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2005

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