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Lista de obras de Matteo Brilli

A highly specific microRNA-mediated mechanism silences LTR retrotransposons of strawberry.

artículo científico publicado en 2016

A multi-omics study of the grapevine-downy mildew (Plasmopara viticola) pathosystem unveils a complex protein coding- and noncoding-based arms race during infection

artículo científico publicado en 2018

Analysis of plasmid genes by phylogenetic profiling and visualization of homology relationships using Blast2Network

artículo científico publicado en 2008

Analysis of the CtrA pathway in Magnetospirillum reveals an ancestral role in motility in alphaproteobacteria

artículo científico publicado en 2012

Antagonistic interactions between psychrotrophic cultivable bacteria isolated from Antarctic sponges: a preliminary analysis

artículo científico publicado en 2008

Bacterium-bacterium inhibitory interactions among psychrotrophic bacteria isolated from Antarctic seawater (Terra Nova Bay, Ross Sea).

artículo científico publicado en 2007

Biodiversity of cultivable psychrotrophic marine bacteria isolated from Terra Nova Bay (Ross Sea, Antarctica).

artículo científico publicado en 2004

Black Soldier Fly Larvae Adapt to Different Food Substrates through Morphological and Functional Responses of the Midgut

scientific article published on 13 July 2020

COLOMBOS v3.0: leveraging gene expression compendia for cross-species analyses

artículo científico publicado en 2015

Cell Cycle Control by the Master Regulator CtrA in Sinorhizobium meliloti.

artículo científico publicado en 2015

Comparative genomics of VirR regulons in Clostridium perfringens strains

artículo científico publicado en 2010

Current trends in the bioinformatic sequence analysis of metabolic pathways in prokaryotes

artículo científico publicado en 2007

DNA binding of the cell cycle transcriptional regulator GcrA depends on N6-adenosine methylation in Caulobacter crescentus and other Alphaproteobacteria

artículo científico publicado en 2013

Dissecting the Effect of a 3D Microscaffold on the Transcriptome of Neural Stem Cells with Computational Approaches: A Focus on Mechanotransduction

scientific article published on 15 September 2020

Draft Genome Sequence of Chromate-Resistant and Biofilm-Producing Strain Pseudomonas alcaliphila 34.

artículo científico publicado en 2013

Evolution of Intra-specific Regulatory Networks in a Multipartite Bacterial Genome

artículo científico publicado en 2015

Exploring the evolutionary dynamics of plasmids: the Acinetobacter pan-plasmidome

artículo científico publicado en 2010

Exploring the symbiotic pangenome of the nitrogen-fixing bacterium Sinorhizobium meliloti ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Fatal respiratory infection due to ST308 VIM-1-producing Pseudomonas aeruginosa in a lung transplant recipient: case report and review of the literature

scientific article published on 26 August 2020

Fine-tuning of the flavonoid and monolignol pathways during apple early fruit development.

artículo científico publicado en 2017

First Report of an ST410 OXA-181 and CTX-M-15 Coproducing Escherichia coli Clone in Italy: A Whole-Genome Sequence Characterization.

artículo científico publicado en 2018

Flooding Responses on Grapevine: A Physiological, Transcriptional, and Metabolic Perspective

article

Gene expression and metabolite accumulation during strawberry (Fragaria × ananassa) fruit development and ripening

artículo científico publicado en 2018

Identification of blaVIM-1 Gene in ST307 and ST661 Klebsiella pneumoniae Clones in Italy: Old Acquaintances for New Combinations

scientific article published on 27 December 2018

Identification of metabolic network models from incomplete high-throughput datasets ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Identification of variable sites in Sars-CoV-2 and their abundance profiles in time

artículo científico publicado en 2020

Inference from proteobacterial operons shows piecewise organization: a reply to Price et al

artículo científico publicado en 2006

Molecular evolution of hisB genes

artículo científico publicado en 2004

Morphological and molecular insights into the diversity of Leptoconops biting midges from a heavily infested Mediterranean area

artículo científico publicado en 2023

MotifScorer: using a compendium of microarrays to identify regulatory motifs

artículo científico publicado en 2006

Non-coding RNAs Potentially Controlling Cell Cycle in the Model Caulobacter crescentus: A Bioinformatic Approach.

artículo científico publicado en 2018

Novel Aspects on The Interaction Between Grapevine and Plasmopara viticola: Dual-RNA-Seq Analysis Highlights Gene Expression Dynamics in The Pathogen and The Plant During The Battle For Infection

artículo científico publicado en 2020

On the identifiability of metabolic network models

artículo científico publicado en 2012

On the origin and evolution of biosynthetic pathways: integrating microarray data with structure and organization of the Common Pathway genes

artículo científico publicado en 2007

Peptidoglycan in obligate intracellular bacteria

artículo científico publicado en 2017

Permanent draft genome sequences of the symbiotic nitrogen fixing Ensifer meliloti strains BO21CC and AK58

artículo científico publicado en 2013

Relations between Effects and Structure of Small Bicyclic Molecules on the Complex Model System Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2017

SeqDeχ: A Sequence Deconvolution Tool for Genome Separation of Endosymbionts From Mixed Sequencing Samples

scientific article published on 19 September 2019

Short and long-term genome stability analysis of prokaryotic genomes

artículo científico publicado en 2013

Structural and dynamical analysis of biological networks

artículo científico publicado en 2012

Structural, evolutionary and genetic analysis of the histidine biosynthetic "core" in the genus Burkholderia

artículo científico publicado en 2009

Targeted genotyping by sequencing: a new way to genome profile the cat

artículo científico publicado en 2019

The CAI Analyser Package: inferring gene expressivity from raw genomic data

artículo científico publicado en 2007

The DivJ, CbrA and PleC system controls DivK phosphorylation and symbiosis in Sinorhizobium meliloti

artículo científico publicado en 2013

The diversity and evolution of cell cycle regulation in alpha-proteobacteria: a comparative genomic analysis

artículo científico publicado en 2010

The genome sequence and transcriptome of Potentilla micrantha and their comparison to Fragaria vesca (the woodland strawberry).

artículo científico publicado en 2018

The noncoding RNA CcnA modulates the master cell cycle regulators CtrA and GcrA in Caulobacter crescentus

artículo científico publicado en 2022

The nucleoid as a scaffold for the assembly of bacterial signaling complexes.

artículo científico publicado en 2017

The origin and evolution of eucaryal HIS7 genes: from metabolon to bifunctional proteins?

artículo científico publicado en 2004

The origin and evolution of operons: the piecewise building of the proteobacterial histidine operon

artículo científico publicado en 2005

The primordial metabolism: an ancestral interconnection between leucine, arginine, and lysine biosynthesis

artículo científico publicado en 2007

The role of gene fusions in the evolution of metabolic pathways: the histidine biosynthesis case

artículo científico publicado en 2007

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