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Lista de obras de Kimmen Sjölander

Active site prediction using evolutionary and structural information

artículo científico publicado en 2010

Arabidopsis downy mildew resistance gene RPP27 encodes a receptor-like protein similar to CLAVATA2 and tomato Cf-9.

artículo científico publicado en 2004

Arabidopsis thaliana PGR7 encodes a conserved chloroplast protein that is necessary for efficient photosynthetic electron transport

artículo científico publicado en 2010

Automated protein subfamily identification and classification

artículo científico publicado en 2007

Berkeley PHOG: PhyloFacts orthology group prediction web server

artículo científico publicado en 2009

Berkeley Phylogenomics Group web servers: resources for structural phylogenomic analysis

artículo científico publicado en 2007

Distribution and Properties of the Genes Encoding the Biosynthesis of the Bacterial Cofactor, Pyrroloquinoline Quinone ⬇️

artículo científico publicado el 9 de marzo de 2012

FlowerPower: clustering proteins into domain architecture classes for phylogenomic inference of protein function

artículo científico publicado en 2007

From endonucleases to transcription factors: evolution of the AP2 DNA binding domain in plants

artículo científico publicado en 2004

Functional classification using phylogenomic inference

artículo científico publicado en 2006

Getting started in structural phylogenomics

artículo científico publicado en 2010

INTREPID--INformation-theoretic TREe traversal for Protein functional site IDentification

artículo científico publicado en 2008

INTREPID: a web server for prediction of functionally important residues by evolutionary analysis

scientific article published on 13 May 2009

ModBase, a database of annotated comparative protein structure models, and associated resources

artículo científico publicado en 2011

Molecular characterization of proteolytic cleavage sites of the Pseudomonas syringae effector AvrRpt2.

artículo científico publicado en 2005

Ortholog identification in the presence of domain architecture rearrangement ⬇️

artículo científico publicado el 28 de junio de 2011

PhyloFacts: an online structural phylogenomic encyclopedia for protein functional and structural classification

artículo científico publicado en 2006

Phylogenomic inference of protein molecular function: advances and challenges

artículo científico publicado en 2004

Predicted hexameric structure of the Agrobacterium VirB4 C terminus suggests VirB4 acts as a docking site during type IV secretion

artículo científico publicado en 2005

Proteome analysis of the rice etioplast: metabolic and regulatory networks and novel protein functions

artículo científico publicado en 2005

ResBoost: characterizing and predicting catalytic residues in enzymes

artículo científico publicado en 2009

SATCHMO-JS: a webserver for simultaneous protein multiple sequence alignment and phylogenetic tree construction

artículo científico publicado en 2010

Simultaneous sequence alignment and tree construction using hidden Markov models.

artículo científico publicado en 2003

Standardized benchmarking in the quest for orthologs

artículo científico publicado en 2016

Subfamily hmms in functional genomics.

artículo científico publicado en 2005

Taking the first steps towards a standard for reporting on phylogenies: Minimum Information About a Phylogenetic Analysis (MIAPA)

artículo científico publicado en 2006

The COMBREX project: design, methodology, and initial results

artículo científico publicado en 2013

The Generation Challenge Programme comparative plant stress-responsive gene catalogue

artículo científico publicado en 2007

The PhyloFacts FAT-CAT web server: ortholog identification and function prediction using fast approximate tree classification

artículo científico publicado en 2013

The interface of protein structure, protein biophysics, and molecular evolution

artículo científico publicado en 2012

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