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Lista de obras de Petra Van Damme

A Role for Human N-alpha Acetyltransferase 30 (Naa30) in Maintaining Mitochondrial Integrity

artículo científico publicado en 2016

A Saccharomyces cerevisiae model reveals in vivo functional impairment of the Ogden syndrome N-terminal acetyltransferase NAA10 Ser37Pro mutant

artículo científico publicado en 2014

A la carte proteomics with an emphasis on gel-free techniques

artículo científico publicado en 2007

A proteogenomics approach integrating proteomics and ribosome profiling increases the efficiency of protein identification and enables the discovery of alternative translation start sites

artículo científico publicado en 2014

A review of COFRADIC techniques targeting protein N-terminal acetylation

artículo científico publicado en 2009

Ablation of elongation factor 2 kinase enhances heat-shock protein 90 chaperone expression and protects cells under proteotoxic stress

artículo científico publicado en 2019

Abolition of stress-induced protein synthesis sensitizes leukemia cells to anthracycline-induced death

artículo científico publicado en 2008

Absence of N-terminal acetyltransferase diversification during evolution of eukaryotic organisms

artículo científico publicado en 2016

AggA is required for aggregation and increased biofilm formation of a hyper-aggregating mutant of Shewanella oneidensis MR-1.

artículo científico publicado en 2006

An organellar nα-acetyltransferase, naa60, acetylates cytosolic N termini of transmembrane proteins and maintains Golgi integrity

scientific journal article

Analysis of protein processing by N-terminal proteomics reveals novel species-specific substrate determinants of granzyme B orthologs

artículo científico publicado en 2008

Antigenic peptides: Reviving nuclear translation

artículo científico publicado en 2013

Applications of diagonal chromatography for proteome-wide characterization of protein modifications and activity-based analyses.

artículo científico publicado en 2007

Biochemical and cellular analysis of Ogden syndrome reveals downstream Nt-acetylation defects

artículo científico publicado en 2014

C-terminomics screen for natural substrates of cytosolic carboxypeptidase 1 reveals processing of acidic protein C termini

artículo científico publicado en 2014

C-terminomics: Targeted analysis of natural and posttranslationally modified protein and peptide C-termini

artículo científico publicado en 2014

Caspase substrates: easily caught in deep waters?

artículo científico publicado en 2009

Caspase-14 is required for filaggrin degradation to natural moisturizing factors in the skin

artículo científico publicado en 2011

Caspase-14 protects against epidermal UVB photodamage and water loss

artículo científico publicado en 2007

Caspase-specific and nonspecific in vivo protein processing during Fas-induced apoptosis.

artículo científico publicado en 2005

Complementary positional proteomics for screening substrates of endo- and exoproteases

artículo científico publicado en 2010

Conservation of the extended substrate specificity profiles among homologous granzymes across species

artículo científico publicado en 2013

Contemporary positional proteomics strategies to study protein processing

artículo científico publicado en 2013

Deep proteome coverage based on ribosome profiling aids mass spectrometry-based protein and peptide discovery and provides evidence of alternative translation products and near-cognate translation initiation events

artículo científico publicado en 2013

Degradomics reveals that cleavage specificity profiles of caspase-2 and effector caspases are alike

artículo científico publicado en 2012

Diagonal reverse-phase chromatography applications in peptide-centric proteomics: ahead of catalogue-omics?

artículo científico publicado en 2005

Disentanglement of protease substrate repertoires

artículo científico publicado en 2008

Dissecting apoptosis the omics way.

artículo científico publicado en 2013

Distinct dynamics and proximity networks of hub proteins at the prey-invading cell pole in a predatory bacterium

artículo científico publicado en 2024

Granzyme M targets topoisomerase II alpha to trigger cell cycle arrest and caspase-dependent apoptosis

artículo científico publicado en 2013

HPLC-based quantification of in vitro N-terminal acetylation

artículo científico publicado en 2013

Holistic view on the extended substrate specificities of orthologous granzymes

artículo científico

Human and mouse granzyme M display divergent and species-specific substrate specificities

artículo científico publicado en 2011

Identification of Carboxypeptidase Substrates by C-Terminal COFRADIC.

artículo científico publicado en 2017

Identification of Serpinb6b as a species-specific mouse granzyme A inhibitor suggests functional divergence between human and mouse granzyme A.

artículo científico publicado en 2014

Importance of extended protease substrate recognition motifs in steering BNIP-2 cleavage by human and mouse granzymes B.

artículo científico publicado en 2014

Improved recovery of proteome-informative, protein N-terminal peptides by combined fractional diagonal chromatography (COFRADIC).

artículo científico publicado en 2008

In-gel N-acetylation for the quantification of the degree of protein in vivo N-terminal acetylation

artículo científico publicado en 2013

Keeping in Touch with Type-III Secretion System Effectors: Mass Spectrometry-Based Proteomics to Study Effector-Host Protein-Protein Interactions

scientific article published on 19 September 2020

MS-driven protease substrate degradomics

artículo científico publicado en 2010

Mechanisms of Congenital Heart Disease Caused by NAA15 Haploinsufficiency

artículo científico publicado en 2021

N-terminal Acetylation Levels Are Maintained During Acetyl-CoA Deficiency in

scientific article published on 27 August 2018

N-terminal Proteomics Assisted Profiling of the Unexplored Translation Initiation Landscape in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2017

N-terminal acetylation and other functions of Nα-acetyltransferases

artículo científico publicado en 2012

N-terminal acetylation modulates Bax targeting to mitochondria

artículo científico publicado en 2017

N-terminal acetylome analyses and functional insights of the N-terminal acetyltransferase NatB.

artículo científico publicado en 2012

N-terminal acetylome analysis reveals the specificity of Naa50 (Nat5) and suggests a kinetic competition between N-terminal acetyltransferases and methionine aminopeptidases

artículo científico publicado en 2015

N-terminal proteomics and ribosome profiling provide a comprehensive view of the alternative translation initiation landscape in mice and men

artículo científico publicado en 2014

NatF contributes to an evolutionary shift in protein N-terminal acetylation and is important for normal chromosome segregation

artículo científico publicado en 2011

Noncoding after All: Biases in Proteomics Data Do Not Explain Observed Absence of lncRNA Translation Products

artículo científico publicado en 2017

Omics assisted N-terminal proteoform and protein expression profiling upon methionine aminopeptidase 1 (MetAP1) deletion

artículo científico publicado en 2018

PROTEOFORMER 2.0: Further Developments in the Ribosome Profiling-assisted Proteogenomic Hunt for New Proteoforms

artículo científico publicado en 2019

PROTEOFORMER: deep proteome coverage through ribosome profiling and MS integration

artículo científico publicado en 2014

Poly-beta-hydroxybutyrate-accumulating bacteria protect gnotobiotic Artemia franciscana from pathogenic Vibrio campbellii

artículo científico publicado en 2007

Preparation of Arabidopsis thaliana Seedling Proteomes for Identifying Metacaspase Substrates by N-terminal COFRADIC

artículo científico publicado en 2014

Probing the efficiency of proteolytic events by positional proteomics

artículo científico publicado en 2010

Protease Substrate Profiling by N-Terminal COFRADIC.

artículo científico publicado en 2017

Protein N-terminal acetyltransferases act as N-terminal propionyltransferases in vitro and in vivo

artículo científico publicado en 2013

Protein alpha-N-acetylation studied by N-terminomics

artículo científico publicado en 2011

Protein processing and other modifications analyzed by diagonal peptide chromatography

artículo científico publicado en 2006

Protein processing characterized by a gel-free proteomics approach

artículo científico publicado en 2008

Proteogenomics in Aid of Host-Pathogen Interaction Studies: A Bacterial Perspective

artículo científico publicado en 2017

Proteome-derived peptide libraries allow detailed analysis of the substrate specificities of N(alpha)-acetyltransferases and point to hNaa10p as the post-translational actin N(alpha)-acetyltransferase

artículo científico publicado en 2011

Proteome-derived peptide libraries to study the substrate specificity profiles of carboxypeptidases.

artículo científico publicado en 2013

Proteome-wide Identification of HtrA2/Omi Substrates

artículo científico publicado en 2007

Proteome-wide substrate analysis indicates substrate exclusion as a mechanism to generate caspase-7 versus caspase-3 specificity

scientific journal article

Proteomic Identification of Cysteine Cathepsin Substrates Shed from the Surface of Cancer Cells.

artículo científico

Proteomics analyses reveal the evolutionary conservation and divergence of N-terminal acetyltransferases from yeast and humans

artículo científico publicado en 2009

REPARATION: ribosome profiling assisted (re-)annotation of bacterial genomes

artículo científico publicado en 2017

Ribosome signatures aid bacterial translation initiation site identification

artículo científico publicado en 2017

Selecting protein N-terminal peptides by combined fractional diagonal chromatography

artículo científico publicado en 2011

Stable isotopic labeling in proteomics

artículo científico publicado en 2008

Structure of granzyme C reveals an unusual mechanism of protease autoinhibition

artículo científico publicado en 2009

Substrate specificities of the granzyme tryptases A and K.

artículo científico publicado en 2014

T-cell receptor-induced JNK activation requires proteolytic inactivation of CYLD by MALT1.

artículo científico publicado en 2011

Targeted peptidecentric proteomics reveals caspase-7 as a substrate of the caspase-1 inflammasomes

artículo científico publicado en 2008

The Arabidopsis metacaspase9 degradome

artículo científico publicado en 2013

The Online Protein Processing Resource (TOPPR): a database and analysis platform for protein processing events

artículo científico publicado en 2013

The chaperone-like protein HYPK acts together with NatA in cotranslational N-terminal acetylation and prevention of Huntingtin aggregation

artículo científico publicado en 2010

The human N-alpha-acetyltransferase 40 (hNaa40p/hNatD) is conserved from yeast and N-terminally acetylates histones H2A and H4

artículo científico publicado en 2011

The human platelet proteome mapped by peptide-centric proteomics: a functional protein profile

artículo científico publicado en 2005

The proteome under translational control

artículo científico publicado en 2014

The substrate specificity profile of human granzyme A.

artículo científico publicado en 2010

Transcriptional activation of the NF-kappaB p65 subunit by mitogen- and stress-activated protein kinase-1 (MSK1)

artículo científico publicado en 2003

Use of Hybrid Data-Dependent and -Independent Acquisition Spectral Libraries Empowers Dual-Proteome Profiling

artículo científico publicado en 2021

eIF1 modulates the recognition of suboptimal translation initiation sites and steers gene expression via uORFs

artículo científico publicado en 2017

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