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Lista de obras de Paul Keim

A Bacillus anthracis Genome Sequence from the Sverdlovsk 1979 Autopsy Specimens

artículo científico publicado en 2016

A North American Yersinia pestis draft genome sequence: SNPs and phylogenetic analysis

artículo científico publicado en 2007

A decade of plague in Mahajanga, Madagascar: insights into the global maritime spread of pandemic plague

artículo científico publicado en 2013

A genomic survey of positive selection in Burkholderia pseudomallei provides insights into the evolution of accidental virulence

artículo científico publicado en 2010

A global to local genomics analysis of Clostridioides difficile ST1/RT027 identifies cryptic transmission events in a northern Arizona healthcare network

scientific article published on 20 May 2019

A horizontal gene transfer event defines two distinct groups within Burkholderia pseudomallei that have dissimilar geographic distributions

artículo científico publicado en 2007

A review of methods for subtyping Yersinia pestis: From phenotypes to whole genome sequencing

artículo científico publicado en 2016

A single introduction of Yersinia pestis to Brazil during the 3rd plague pandemic

scientific article published in PLoS ONE

AOAC SMPR 2016.010.

artículo científico publicado en 2017

Accurate and rapid identification of the Burkholderia pseudomallei near-neighbour, Burkholderia ubonensis, using real-time PCR

artículo científico publicado en 2013

African Lineage Brucella melitensis Isolates from Omani Livestock.

artículo científico publicado en 2017

An Objective Approach for Burkholderia pseudomallei Strain Selection as Challenge Material for Medical Countermeasures Efficacy Testing ⬇️

artículo científico publicado el 26 de septiembre de 2012

An attenuated strain of Bacillus anthracis (CDC 684) has a large chromosomal inversion and altered growth kinetics

artículo científico publicado en 2011

An outbreak of respiratory tularemia caused by diverse clones of Francisella tularensis

artículo científico publicado en 2014

Anthrax molecular epidemiology and forensics: using the appropriate marker for different evolutionary scales

artículo científico publicado en 2004

Anthrax, but not Bacillus anthracis?

artículo científico publicado en 2006

Antibiotic susceptibility and molecular diversity of Bacillus anthracis strains in Chad: detection of a new phylogenetic subgroup

artículo científico publicado en 2006

Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

scientific article published on 01 September 2019

Bacillus anthracis comparative genome analysis in support of the Amerithrax investigation

artículo científico publicado en 2011

Bacillus anthracis in China and its relationship to worldwide lineages

artículo científico publicado en 2009

Bacillus anthracis incident, Kameido, Tokyo, 1993.

artículo científico publicado en 2004

Best practices for evaluating single nucleotide variant calling methods for microbial genomics

artículo científico publicado en 2015

Biodefense research: a win-win challenge

scientific article published on 01 December 2008

BurkDiff: a real-time PCR allelic discrimination assay for Burkholderia pseudomallei and B. mallei

artículo científico publicado en 2010

Burkholderia humptydooensis sp. nov., a new species related to Burkholderia thailandensis and the fifth member of the pseudomallei complex

artículo científico publicado en 2016

Burkholderia pseudomallei distribution in Australasia is linked to paleogeographic and anthropogenic history

artículo científico publicado en 2018

Burkholderia pseudomallei isolates from Sarawak, Malaysian Borneo, are predominantly susceptible to aminoglycosides and macrolides

artículo científico publicado en 2014

Burkholderia pseudomallei, the causative agent of melioidosis, is rare but ecologically established and widely dispersed in the environment in Puerto Rico

artículo científico publicado en 2019

Burkholderia stagnalis sp. nov. and Burkholderia territorii sp. nov., two novel Burkholderia cepacia complex species from environmental and human sources

artículo científico publicado en 2015

Castor bean organelle genome sequencing and worldwide genetic diversity analysis

artículo científico publicado en 2011

Characterization of Microsatellites in Pseudogymnoascus destructans for White-nose Syndrome Genetic Analysis

artículo científico publicado en 2017

Characterization of a Bacillus anthracis isolate causing a rare case of fatal anthrax in a 2-year-old boy from Hong Kong.

artículo científico publicado en 2005

Characterization of ceftazidime resistance mechanisms in clinical isolates of Burkholderia pseudomallei from Australia

artículo científico publicado en 2012

Community analysis of chronic wound bacteria using 16S rRNA gene-based pyrosequencing: impact of diabetes and antibiotics on chronic wound microbiota

artículo científico publicado en 2009

Community-integrated omics links dominance of a microbial generalist to fine-tuned resource usage

artículo científico publicado en 2014

Comparative analysis of subtyping methods against a whole-genome-sequencing standard for Salmonella enterica serotype Enteritidis

artículo científico publicado en 2014

Comparative genome sequencing for discovery of novel polymorphisms in Bacillus anthracis

artículo científico publicado en 2002

Comparative genomic analyses reveal broad diversity in botulinum-toxin-producing Clostridia

artículo científico publicado en 2016

Comparative genomic characterization of Francisella tularensis strains belonging to low and high virulence subspecies

artículo científico publicado en 2009

Comparative integrated omics: identification of key functionalities in microbial community-wide metabolic networks

artículo científico publicado en 2015

Comparative phylogenomics and evolution of the Brucellae reveal a path to virulence

artículo científico publicado en 2013

Comparison of TaqMan PCR assays for detection of the melioidosis agent Burkholderia pseudomallei in clinical specimens

artículo científico publicado en 2012

Comparison of two multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis methods for molecular strain typing of human Brucella melitensis isolates from the Middle East

artículo científico publicado en 2009

Complete Genome Sequence of the Encephalomyelitic Burkholderia pseudomallei Strain MSHR305

artículo científico publicado en 2013

Complete Genome Sequence of the Environmental Burkholderia pseudomallei Sequence Type 131 Isolate MSHR1435, Associated with a Chronic Melioidosis Infection

artículo científico publicado en 2018

Complete Genome Sequence of the Epidemic and Highly Virulent CTX-M-15-Producing H30-Rx Subclone of Escherichia coli ST131.

artículo científico publicado en 2013

Complete genomic characterization of a pathogenic A.II strain of Francisella tularensis subspecies tularensis

artículo científico publicado en 2007

Continuing evolution of Burkholderia mallei through genome reduction and large-scale rearrangements

artículo científico publicado en 2010

Correction for Johnson et al., Complete Genome Sequences for 59 Burkholderia Isolates, Both Pathogenic and Near Neighbor

artículo científico publicado en 2016

Correction: Pre-Columbian Origins for North American Anthrax.

artículo científico publicado en 2009

Cost-effective interrogation of single nucleotide polymorphisms using the mismatch amplification mutation assay and capillary electrophoresis

artículo científico publicado en 2010

Cryptococcus gattii in North American Pacific Northwest: whole-population genome analysis provides insights into species evolution and dispersal

artículo científico publicado en 2014

Cyclopropavir inhibits the normal function of the human cytomegalovirus UL97 kinase.

artículo científico publicado en 2011

Defining the Pandemic at the State Level: Sequence-Based Epidemiology of the SARS-CoV-2 virus by the Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU)

artículo científico publicado en 2020

Detection of Burkholderia pseudomallei O-antigen serotypes in near-neighbor species

artículo científico publicado en 2012

Detection of Low-Level Mixed-Population Drug Resistance in Mycobacterium tuberculosis Using High Fidelity Amplicon Sequencing

artículo científico publicado en 2015

Detection of diverse new Francisella-like bacteria in environmental samples

artículo científico publicado en 2005

Developing Inclusivity and Exclusivity Panels for Testing Diagnostic and Detection Tools Targeting Burkholderia pseudomallei, the Causative Agent of Melioidosis

artículo científico publicado en 2018

Development and validation of Burkholderia pseudomallei-specific real-time PCR assays for clinical, environmental or forensic detection applications

artículo científico publicado en 2012

Development of Immunoassays for Burkholderia pseudomallei Typical and Atypical Lipopolysaccharide Strain Typing

scientific article published on 19 December 2016

Development of a rapid, cost-effective TaqMan Real-Time PCR Assay for identification and differentiation of Coccidioides immitis and Coccidioides posadasii

artículo científico publicado en 2010

Development of a rapid, cost-effective TaqMan Real-Time PCR Assay for identification and differentiation of Coccidioides immitis and Coccidioides posadasii

article

Development of ceftazidime resistance in an acute Burkholderia pseudomallei infection

artículo científico publicado en 2012

Differential plague-transmission dynamics determine Yersinia pestis population genetic structure on local, regional, and global scales

artículo científico publicado en 2004

Diverse Burkholderia Species Isolated from Soils in the Southern United States with No Evidence of B. pseudomallei

artículo científico publicado en 2015

Diverse Francisella tularensis strains and oropharyngeal tularemia, Turkey

artículo científico publicado en 2015

Diverse Genotypes of Yersinia pestis Caused Plague in Madagascar in 2007

artículo científico publicado en 2015

Diversity among French Bacillus anthracis isolates

artículo científico publicado en 2002

Diversity of 16S-23S rDNA internal transcribed spacer (ITS) reveals phylogenetic relationships in Burkholderia pseudomallei and its near-neighbors

artículo científico publicado en 2011

Diversity of Francisella tularensis subsp. holarctica lineages, China

artículo científico publicado en 2014

Domestic canines do not display evidence of gut microbial dysbiosis in the presence of Clostridioides (Clostridium) difficile, despite cellular susceptibility to its toxins

artículo científico publicado en 2019

Dominance of multidrug resistant CC271 clones in macrolide-resistant streptococcus pneumoniae in Arizona.

artículo científico publicado en 2012

Draft Genome Sequences of Two Bulgarian Bacillus anthracis Strains

artículo científico publicado en 2013

Effect of repeat copy number on variable-number tandem repeat mutations in Escherichia coli O157:H7.

artículo científico publicado en 2006

Effective Disinfectants for Coccidioides immitis and C. posadasii

artículo científico publicado en 2015

Effects of binge alcohol exposure on Burkholderia thailandensis-alveolar macrophage interaction.

artículo científico publicado en 2017

Eighteenth century Yersinia pestis genomes reveal the long-term persistence of an historical plague focus

artículo científico publicado en 2016

Eighteenth century Yersinia pestis genomes reveal the long-term persistence of an historical plague focus

Epidemiological tracking and population assignment of the non-clonal bacterium, Burkholderia pseudomallei

artículo científico publicado en 2011

Epidemiology and investigation of melioidosis, Southern Arizona

artículo científico publicado en 2011

Estimated herd prevalence and sequence types of Coxiella burnetii in bulk tank milk samples from commercial dairies in Indiana

artículo científico publicado en 2015

Evaluating the long-term persistence of Bacillus spores on common surfaces.

artículo científico publicado en 2018

Evolution of a pathogen: a comparative genomics analysis identifies a genetic pathway to pathogenesis in Acinetobacter

artículo científico publicado en 2013

False detection of Coxiella burnetii-what is the risk?

artículo científico publicado en 2016

Feral swine brucellosis in the United States and prospective genomic techniques for disease epidemiology.

artículo científico publicado en 2013

Fine-scale genetic diversity among Burkholderia pseudomallei soil isolates in northeast Thailand

artículo científico publicado en 2007

First draft genome sequence of a strain belonging to the Zoogloea genus and its gene expression in situ.

artículo científico publicado en 2017

Fluorescent amplified fragment length polymorphism analysis of Bacillus anthracis, Bacillus cereus, and Bacillus thuringiensis isolates

artículo científico publicado en 2004

Francisella tularensis in the United States

artículo científico publicado en 2005

Francisella tularensis subsp. novicida isolated from a human in Arizona

artículo científico publicado en 2009

Francisella tularensis subsp. tularensis group A.I, United States

artículo científico publicado en 2014

Genome Sequence of Bacillus anthracis STI, a Sterne-Like Georgian/Soviet Vaccine Strain

artículo científico publicado en 2014

Genome Sequence of Burkholderia pseudomallei NCTC 13392.

artículo científico publicado en 2013

Genome Sequence of Staphylococcus aureus Strain CA-347, a USA600 Methicillin-Resistant Isolate

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of "Candidatus Microthrix parvicella" Bio17-1, a long-chain-fatty-acid-accumulating filamentous actinobacterium from a biological wastewater treatment plant.

artículo científico publicado en 2012

Genomic Analysis of the Emergence and Rapid Global Dissemination of the Clonal Group 258 Klebsiella pneumoniae Pandemic

artículo científico publicado en 2015

Genomic characterization of Burkholderia pseudomallei isolates selected for medical countermeasures testing: comparative genomics associated with differential virulence

artículo científico publicado en 2015

Genomic characterization of Parengyodontium americanum sp. nov

artículo científico publicado en 2020

Genomic characterization of newly completed genomes of botulinum neurotoxin-producing species from Argentina, Australia and Africa

artículo científico publicado en 2020

Genomic epidemiology of the Haitian cholera outbreak: a single introduction followed by rapid, extensive, and continued spread characterized the onset of the epidemic.

artículo científico publicado en 2014

Genomic islands from five strains of Burkholderia pseudomallei

artículo científico publicado en 2008

Genotyping and Axenic Growth of Coxiella burnetii Isolates Found in the United States Environment

artículo científico publicado en 2016

Genotyping of Brucella species using clade specific SNPs

artículo científico publicado en 2012

Genotyping of Burkholderia mallei from an outbreak of glanders in Bahrain suggests multiple introduction events ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Genotyping of Coxiella burnetii from domestic ruminants and human in Hungary: indication of various genotypes

artículo científico publicado en 2014

Global and regional dissemination and evolution of Burkholderia pseudomallei

artículo científico publicado en 2017

Global genetic population structure of Bacillus anthracis

artículo científico publicado en 2007

High Leptospira Diversity in Animals and Humans Complicates the Search for Common Reservoirs of Human Disease in Rural Ecuador

artículo científico publicado en 2016

High prevalence and two dominant host-specific genotypes of Coxiella burnetii in U.S. milk

artículo científico publicado en 2014

High-throughput extraction of arthropod vector and pathogen DNA using bead milling

artículo científico publicado en 2004

Highly sensitive quantitative PCR for the detection and differentiation of Pseudogymnoascus destructans and other Pseudogymnoascus species.

artículo científico publicado en 2013

Historical distribution and molecular diversity of Bacillus anthracis, Kazakhstan ⬇️

artículo científico publicado en 2010

Humans and evolutionary and ecological forces shaped the phylogeography of recently emerged diseases

scientific article published on 12 October 2009

Hypervirulent emm59 Clone in Invasive Group A Streptococcus Outbreak, Southwestern United States

artículo científico publicado en 2016

Identification of Burkholderia pseudomallei Near-Neighbor Species in the Northern Territory of Australia

artículo científico publicado en 2015

Identification of melioidosis outbreak by multilocus variable number tandem repeat analysis

scientific article published on February 2009

Identifying Sources of Human Exposure to Plague.

artículo científico publicado en 2005

Identifying experimental surrogates for Bacillus anthracis spores: a review ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2010

In vitro selection and characterization of Bacillus anthracis mutants with high-level resistance to ciprofloxacin

artículo científico publicado en 2003

In vitro system for modeling influenza A virus resistance under drug pressure

artículo científico publicado en 2010

Injectional anthrax in heroin users, Europe, 2000-2012.

artículo científico publicado en 2014

Insights to genetic characterization tools for epidemiological tracking of Francisella tularensis in Sweden

artículo científico publicado en 2014

Integrating Genome-based Informatics to Modernize Global Disease Monitoring, Information Sharing, and Response ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2012

Interactions between the yeast Ogataea pini and filamentous fungi associated with the western pine beetle.

artículo científico publicado en 2010

Investigation of Yersinia pestis Laboratory Adaptation through a Combined Genomics and Proteomics Approach

artículo científico publicado en 2015

KlebSeq, a Diagnostic Tool for Surveillance, Detection, and Monitoring of Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2016

Knockout and pullout recombineering for naturally transformable Burkholderia thailandensis and Burkholderia pseudomallei ⬇️

artículo científico publicado el 7 de julio de 2011

Leptospira in river and soil in a highly endemic area of Ecuador

artículo científico publicado en 2021

Linking soil bacterial biodiversity and soil carbon stability

artículo científico publicado en 2014

Local Population Structure and Patterns of Western Hemisphere Dispersal for Coccidioides spp., the Fungal Cause of Valley Fever

artículo científico publicado en 2016

Long-range dispersal moved Francisella tularensis into Western Europe from the East.

artículo científico publicado en 2016

Low cost, low tech SNP genotyping tools for resource-limited areas: Plague in Madagascar as a model

artículo científico publicado en 2017

Macroscale spatial variation in chronic wound microbiota: a cross-sectional study

artículo científico publicado en 2010

Male circumcision significantly reduces prevalence and load of genital anaerobic bacteria

artículo científico publicado en 2013

Mapping and comparing bacterial microbiota in the sinonasal cavity of healthy, allergic rhinitis, and chronic rhinosinusitis subjects.

artículo científico publicado en 2017

Mapping the Evolution of Hypervirulent Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2015

Mass spectrometry provides accurate characterization of two genetic marker types in Bacillus anthracis

artículo científico publicado en 2004

Massive dispersal of Coxiella burnetii among cattle across the United States

artículo científico publicado en 2016

Medical therapy reduces microbiota diversity and evenness in surgically recalcitrant chronic rhinosinusitis.

artículo científico publicado en 2013

Melt analysis of mismatch amplification mutation assays (Melt-MAMA): a functional study of a cost-effective SNP genotyping assay in bacterial models

artículo científico publicado en 2012

Meta-analysis to estimate the load of Leptospira excreted in urine: beyond rats as important sources of transmission in low-income rural communities

artículo científico publicado en 2017

MetaGeniE: characterizing human clinical samples using deep metagenomic sequencing

artículo científico publicado en 2014

Microarrays for global expression constructed with a low redundancy set of 27,500 sequenced cDNAs representing an array of developmental stages and physiological conditions of the soybean plant

artículo científico publicado en 2004

Microbial forensics: DNA fingerprinting of Bacillus anthracis (anthrax).

artículo científico publicado en 2008

Microevolution and history of the plague bacillus, Yersinia pestis

artículo científico publicado en 2004

Molecular analysis of rifampin resistance in Bacillus anthracis and Bacillus cereus

artículo científico publicado en 2002

Molecular basis of rare aminoglycoside susceptibility and pathogenesis of Burkholderia pseudomallei clinical isolates from Thailand ⬇️

artículo científico publicado en 2009

Molecular characterization of clinical Burkholderia pseudomallei isolates from India

artículo científico publicado en 2011

Molecular diversity of Bacillus anthracis in Italy

artículo científico publicado en 2005

Molecular epidemiologic investigation of an anthrax outbreak among heroin users, Europe

artículo científico publicado en 2012

Molecular epidemiology of anthrax cases associated with recreational use of animal hides and yarn in the United States

artículo científico publicado en 2011

Molecular epidemiology of glanders, Pakistan

artículo científico publicado en 2009

Molecular epidemiology, evolution, and ecology of Francisella

artículo científico publicado en 2007

Molecular evolutionary consequences of niche restriction in Francisella tularensis, a facultative intracellular pathogen

artículo científico publicado en 2009

Molecular genotyping of Acinetobacter spp. isolated in Arizona, USA, using multilocus PCR and mass spectrometry.

artículo científico publicado en 2013

Molecular investigations of a locally acquired case of melioidosis in Southern AZ, USA

artículo científico publicado en 2011

Molecular phylogeny of Burkholderia pseudomallei from a remote region of Papua New Guinea

artículo científico publicado en 2011

Molecular typing of Mycobacterium tuberculosis by using nine novel variable-number tandem repeats across the Beijing family and low-copy-number IS6110 isolates

artículo científico publicado en 2003

More than 50% of Clostridium difficile Isolates from Pet Dogs in Flagstaff, USA, Carry Toxigenic Genotypes

artículo científico publicado en 2016

Multidrug-Resistant Staphylococcus aureus in US Meat and Poultry

artículo científico publicado en 2011

Multiple phylogenetically-diverse, differentially-virulent Burkholderia pseudomallei isolated from a single soil sample collected in Thailand

artículo científico publicado en 2022

Mutations, mutation rates, and evolution at the hypervariable VNTR loci of Yersinia pestis

artículo científico publicado en 2006

NASP: an accurate, rapid method for the identification of SNPs in WGS datasets that supports flexible input and output formats.

artículo científico publicado en 2016

Next-Generation Sequencing of Coccidioides immitis Isolated during Cluster Investigation ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 2011

No resistance plasmid in Yersinia pestis, North America.

artículo científico publicado en 2010

Out of the ground: aerial and exotic habitats of the melioidosis bacterium Burkholderia pseudomallei in grasses in Australia ⬇️

artículo científico publicado el 19 de diciembre de 2011

Pangenome Analysis of Burkholderia pseudomallei: Genome Evolution Preserves Gene Order despite High Recombination Rates

artículo científico publicado en 2015

Pathogenomic Sequence Analysis of and Isolates Closely Related to

artículo científico publicado en 2006

Pathogenomic Sequence Analysis of Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis Isolates Closely Related to Bacillus anthracis

artículo científico publicado en 2006

Penile Microbiota and Female Partner Bacterial Vaginosis in Rakai, Uganda

artículo científico publicado en 2015

Performance Standards for Biological Threat Agent Assays for Department of Defense Applications

artículo científico publicado en 2018

Persistence of Burkholderia thailandensis E264 in lung tissue after a single binge alcohol episode

scientific article published on 10 December 2019

Persistence of category A select agents in the environment

artículo científico publicado en 2008

Phenotypic and functional characterization of Bacillus anthracis biofilms

artículo científico publicado en 2007

Phylogenetic Analysis of Francisella tularensis Group A.II Isolates from 5 Patients with Tularemia, Arizona, USA, 2015-2017

scholarly article by Dawn N Birdsell et al published May 2019 in Emerging Infectious Diseases

Phylogenetic analysis of West Nile Virus in Maricopa County, Arizona: Evidence for dynamic behavior of strains in two major lineages in the American Southwest

artículo científico publicado en 2018

Phylogenetic discovery bias in Bacillus anthracis using single-nucleotide polymorphisms from whole-genome sequencing

scholarly article

Phylogenetic understanding of clonal populations in an era of whole genome sequencing

artículo científico publicado en 2009

Phylogenetically typing bacterial strains from partial SNP genotypes observed from direct sequencing of clinical specimen metagenomic data.

artículo científico publicado en 2015

Phylogeographic reconstruction of a bacterial species with high levels of lateral gene transfer

artículo científico publicado en 2009

Phylogeographic, genomic, and meropenem susceptibility analysis of Burkholderia ubonensis

artículo científico publicado en 2017

Phylogeography and molecular epidemiology of Yersinia pestis in Madagascar

artículo científico publicado en 2011

Phylogeography of Bacillus anthracis in the country of Georgia shows evidence of population structuring and is dissimilar to other regional genotypes

artículo científico publicado en 2014

Phylogeography of Francisella tularensis subsp. holarctica, Europe

artículo científico publicado en 2012

Phylogeography of Francisella tularensis subspecies holarctica from the country of Georgia

artículo científico publicado en 2011

Phylogeography of Francisella tularensis: global expansion of a highly fit clone

artículo científico publicado en 2009

Policy: Adaptations of avian flu virus are a cause for concern

artículo científico publicado en 2012

Population differences in host immune factors may influence survival of Gunnison's prairie dogs (Cynomys gunnisoni) during plague outbreaks

artículo científico publicado en 2011

Population genetics of Vibrio cholerae from Nepal in 2010: evidence on the origin of the Haitian outbreak

artículo científico publicado en 2011

Pre-Columbian origins for North American anthrax

artículo científico publicado en 2009

Protein abundances can distinguish between naturally-occurring and laboratory strains of Yersinia pestis, the causative agent of plague

artículo científico publicado en 2017

Proteomic analysis of four Clostridium botulinum strains identifies proteins that link biological responses to proteomic signatures

artículo científico publicado en 2018

Public health and biosecurity. Adaptations of avian flu virus are a cause for concern

artículo científico publicado en 2012

QIIME 2: Reproducible, interactive, scalable, and extensible microbiome data science

QIIME 2: Reproducible, interactive, scalable, and extensible microbiome data science

Rapid and robust phylotyping of spa t003, a dominant MRSA clone in Luxembourg and other European countries

artículo científico publicado en 2013

Rapid quantification of single-nucleotide mutations in mixed influenza A viral populations using allele-specific mixture analysis

artículo científico publicado en 2009

Rapid typing of Coxiella burnetii

artículo científico publicado en 2011

Real-Time PCR Assays of Single-Nucleotide Polymorphisms Defining the Major Clades

artículo científico publicado en 2008

Real-time PCR assays for genotyping of Cryptococcus gattii in North America

artículo científico publicado en 2014

Real-time PCR assays of single-nucleotide polymorphisms defining the major Brucella clades

artículo científico publicado en 2007

Redaction of sensitive data in the publication of dual use research of concern

artículo científico publicado en 2013

Redefining the differences in gene content between Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis using large-scale comparative genomics

artículo científico publicado en 2015

Reply to "South Asia instead of Nepal may be the origin of the Haitian cholera outbreak strain".

artículo científico publicado en 2011

Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

artículo científico publicado en 2019

Reproducibly sampling SARS-CoV-2 genomes across time, geography, and viral diversity

scientific article published on 28 October 2020

Selective isolation of Yersinia pestis from plague-infected fleas

artículo científico publicado en 2010

Single nucleotide polymorphism typing of Bacillus anthracis from Sverdlovsk tissue

artículo científico publicado en 2008

Single nucleotide polymorphisms for assessing genetic diversity in castor bean (Ricinus communis).

artículo científico publicado en 2010

Spatial analysis and identification of high risk plague regions in Pakistan based on associated rodent species distribution

artículo científico publicado en 2016

Specific detection of bacillus anthracis using a TaqMan mismatch amplification mutation assay

artículo científico publicado en 2005

St. Louis Encephalitis Virus in the Southwestern United States: A Phylogeographic Case for a Multi-Variant Introduction Event ⬇️

artículo científico publicado en 2021

Staphylococcus aureus CC398: Host Adaptation and Emergence of Methicillin Resistance in Livestock

article

Staphylococcus aureus CC398: host adaptation and emergence of methicillin resistance in livestock

artículo científico publicado en 2012

Strain typing of Borrelia burgdorferi, Borrelia afzelii, and Borrelia garinii by using multiple-locus variable-number tandem repeat analysis

artículo científico publicado en 2002

Strain-specific single-nucleotide polymorphism assays for the Bacillus anthracis Ames strain

artículo científico publicado en 2006

Structural characterization of polysaccharides expressed by Burkholderia oklahomensis E0147.

artículo científico publicado en 2013

Tandem repeat regions within the Burkholderia pseudomallei genome and their application for high resolution genotyping

artículo científico publicado en 2007

TaqMan real-time PCR assays for single-nucleotide polymorphisms which identify Francisella tularensis and its subspecies and subpopulations

artículo científico publicado en 2014

Temporal phylogeography of Yersinia pestis in Madagascar: Insights into the long-term maintenance of plague.

artículo científico publicado en 2017

Texas isolates closely related to Bacillus anthracis Ames

artículo científico publicado en 2008

The "nuclearization" of biology is a threat to health and security

artículo científico publicado en 2009

The Effects of Signal Erosion and Core Genome Reduction on the Identification of Diagnostic Markers

artículo científico publicado en 2016

The International Bacillus anthracis, B. cereus, and B. thuringiensis Conference, "Bacillus-ACT05".

artículo científico publicado en 2006

The Mountain Meadows Massacre and "poisoned springs": scientific testing of the more recent, anthrax theory

artículo científico publicado en 2013

The Phylogeny of Bacillus cereus sensu lato

artículo científico publicado en 2016

The complete genome sequence of Bacillus anthracis Ames "Ancestor".

artículo científico publicado en 2008

The complete genome sequence of Bacillus thuringiensis Al Hakam

artículo científico publicado en 2007

The effects of circumcision on the penis microbiome

artículo científico publicado en 2010

The epidemic of extended-spectrum-β-lactamase-producing Escherichia coli ST131 is driven by a single highly pathogenic subclone, H30-Rx

artículo científico publicado en 2013

The genetic and molecular basis of O-antigenic diversity in Burkholderia pseudomallei lipopolysaccharide

artículo científico publicado en 2012

The genome and variation of Bacillus anthracis

artículo científico publicado en 2009

The innate immune response may be important for surviving plague in wild Gunnison's prairie dogs

artículo científico publicado en 2013

The large-scale blast score ratio (LS-BSR) pipeline: a method to rapidly compare genetic content between bacterial genomes

artículo científico publicado en 2014

The otologic microbiome: a study of the bacterial microbiota in a pediatric patient with chronic serous otitis media using 16SrRNA gene-based pyrosequencing

artículo científico publicado en 2011

The toxin/immunity network of Burkholderia pseudomallei contact‐dependent growth inhibition (CDI) systems ⬇️

artículo científico publicado el 4 de abril de 2012

Towards a rapid molecular diagnostic for melioidosis: Comparison of DNA extraction methods from clinical specimens ⬇️

artículo científico publicado el 12 de noviembre de 2011

Tracing melioidosis back to the source: using whole-genome sequencing to investigate an outbreak originating from a contaminated domestic water supply

artículo científico publicado en 2015

Triple combination antiviral drug (TCAD) composed of amantadine, oseltamivir, and ribavirin impedes the selection of drug-resistant influenza A virus

artículo científico publicado en 2011

Triple combination of oseltamivir, amantadine, and ribavirin displays synergistic activity against multiple influenza virus strains in vitro.

artículo científico publicado en 2009

Tularemia in Alaska, 1938 - 2010

artículo científico publicado en 2011

Universal method for producing ROX-labeled size standards suitable for automated genotyping

artículo científico publicado en 2004

Unprecedented Melioidosis Cases in Northern Australia Caused by an Asian Burkholderia pseudomallei Strain Identified by Using Large-Scale Comparative Genomics

artículo científico publicado en 2015

Use of a real-time PCR TaqMan assay for rapid identification and differentiation of Burkholderia pseudomallei and Burkholderia mallei

artículo científico publicado en 2005

Use of single nucleotide polymorphisms in the plcR gene for specific identification of Bacillus anthracis

artículo científico publicado en 2005

Using Whole Genome Analysis to Examine Recombination across Diverse Sequence Types of Staphylococcus aureus

artículo científico publicado en 2015

VNTR analysis of selected outbreaks of Burkholderia pseudomallei in Australia

artículo científico publicado en 2006

VNTR diversity in Yersinia pestis isolates from an animal challenge study reveals the potential for in vitro mutations during laboratory cultivation

artículo científico publicado en 2016

Valley fever: finding new places for an old disease: Coccidioides immitis found in Washington State soil associated with recent human infection

artículo científico publicado en 2014

Water as Source of Francisella tularensis Infection in Humans, Turkey.

artículo científico publicado en 2015

When outgroups fail; phylogenomics of rooting the emerging pathogen, Coxiella burnetii

artículo científico publicado en 2013

Whole Genome Analysis of Injectional Anthrax Identifies Two Disease Clusters Spanning More Than 13 Years

artículo científico publicado en 2015

Whole Genome Sequence Typing to Investigate the Apophysomyces Outbreak following a Tornado in Joplin, Missouri, 2011 ⬇️

artículo científico publicado el 27 de noviembre de 2012

Whole genome SNP typing to investigate methicillin-resistant Staphylococcus aureus carriage in a health-care provider as the source of multiple surgical site infections

artículo científico publicado en 2016

Whole genome sequence analysis of Cryptococcus gattii from the Pacific Northwest reveals unexpected diversity

artículo científico publicado en 2011

Whole-genome analysis of Exserohilum rostratum from an outbreak of fungal meningitis and other infections

artículo científico publicado en 2014

Whole-genome sequencing investigation of animal-skin-drum-associated UK anthrax cases reveals evidence of mixed populations and relatedness to a US case

artículo científico publicado en 2015

Whole-genome sequencing of Burkholderia pseudomallei isolates from an unusual melioidosis case identifies a polyclonal infection with the same multilocus sequence type

artículo científico publicado en 2014

Whole-genome-based phylogeny and divergence of the genus Brucella

artículo científico publicado en 2009

Within-host evolution of Brucella canis during a canine brucellosis outbreak in a kennel

artículo científico publicado en 2013

Within-host evolution of Burkholderia pseudomallei in four cases of acute melioidosis

artículo científico publicado en 2010

Within-host evolution of Burkholderia pseudomallei over a twelve-year chronic carriage infection

artículo científico publicado en 2013

Worldwide genetic relationships among Francisella tularensis isolates determined by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis

scientific article published on September 2004

Worldwide genotyping of castor bean germplasm (Ricinus communis L.) using AFLPs and SSRs

artículo científico publicado en 2007

Yersinia pestis DNA from skeletal remains from the 6(th) century AD reveals insights into Justinianic Plague

artículo científico publicado en 2013

Yersinia pestis and the plague of Justinian 541-543 AD: a genomic analysis.

artículo científico publicado en 2014

Yersinia pestis and the three plague pandemics--authors' reply

artículo científico publicado en 2014

Yersinia pestis evolution on a small timescale: comparison of whole genome sequences from North America

artículo científico publicado en 2007

Yersinia pestis genome sequencing identifies patterns of global phylogenetic diversity

artículo científico publicado en 2010

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