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Lista de obras de Kenneth H. Wolfe

A burst of protein sequence evolution and a prolonged period of asymmetric evolution follow gene duplication in yeast

artículo científico publicado en 2007

A genome sequence survey shows that the pathogenic yeast Candida parapsilosis has a defective MTLa1 allele at its mating type locus

artículo científico publicado en 2005

A pipeline for automated annotation of yeast genome sequences by a conserved-synteny approach

artículo científico publicado en 2012

A recent polyploidy superimposed on older large-scale duplications in the Arabidopsis genome

artículo científico publicado en 2003

A subset of conserved tRNA genes in plastid DNA of nongreen plants.

artículo científico publicado en 1998

Accelerated evolution of sites undergoing mRNA editing in plant mitochondria and chloroplasts

artículo científico publicado en 1997

Additions, losses, and rearrangements on the evolutionary route from a reconstructed ancestor to the modern Saccharomyces cerevisiae genome

artículo científico publicado en 2009

Allele-specific transcript isoforms in human

artículo científico publicado en 2004

An Evolutionary Perspective on Yeast Mating-Type Switching

artículo científico publicado en 2017

Base composition skews, replication orientation, and gene orientation in 12 prokaryote genomes

artículo científico publicado en 1998

Birth of a metabolic gene cluster in yeast by adaptive gene relocation

artículo científico publicado en 2005

Carbon source requirements for mating and mating-type switching in the methylotrophic yeasts Ogataea (Hansenula) polymorpha and Komagataella phaffii (Pichia pastoris)

artículo científico publicado en 2020

Cdc42p-interacting protein Bem4p regulates the filamentous-growth mitogen-activated protein kinase pathway

artículo científico publicado en 2014

Centromeres of the Yeast Komagataella phaffii (Pichia pastoris) Have a Simple Inverted-Repeat Structure

artículo científico publicado en 2016

Changes in Alternative Splicing of Human and Mouse Genes Are Accompanied by Faster Evolution of Constitutive Exons

article

Chromosomal G + C content evolution in yeasts: systematic interspecies differences, and GC-poor troughs at centromeres

artículo científico publicado en 2010

Chromosomal location and evolutionary rate variation in enterobacterial genes

artículo científico publicado en 1989

Clade- and species-specific features of genome evolution in the Saccharomycetaceae

artículo científico publicado en 2015

Clusters of co-expressed genes in mammalian genomes are conserved by natural selection

artículo científico publicado en 2004

Codon usage patterns in Escherichia coli, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Drosophila melanogaster and Homo sapiens; a review of the considerable within-species diversity

artículo científico publicado en 1988

Comparative genome analysis and gene finding in Candida species using CGOB.

artículo científico publicado en 2013

Comparative genomics and genome evolution in yeasts

artículo científico publicado en 2006

Comparative genomics of biotechnologically important yeasts

artículo científico publicado en 2016

Complete DNA sequences of the mitochondrial genomes of the pathogenic yeasts Candida orthopsilosis and Candida metapsilosis: insight into the evolution of linear DNA genomes from mitochondrial telomere mutants

artículo científico publicado en 2006

Complete chloroplast genome sequence of a major allogamous forage species, perennial ryegrass (Lolium perenne L.).

artículo científico publicado en 2009

Congruence of tissue expression profiles from Gene Expression Atlas, SAGEmap and TissueInfo databases

artículo científico publicado en 2003

Consequences of genome duplication

artículo científico publicado en 2007

Consistent patterns of rate asymmetry and gene loss indicate widespread neofunctionalization of yeast genes after whole-genome duplication

artículo científico publicado en 2006

Coverage-Versus-Length Plots, a Simple Quality Control Step for Yeast Genome Sequence Assemblies

artículo científico publicado en 2019

Date of the monocot-dicot divergence estimated from chloroplast DNA sequence data

artículo científico publicado en 1989

Discovery of an unconventional centromere in budding yeast redefines evolution of point centromeres

artículo científico publicado en 2015

Divergence of spatial gene expression profiles following species-specific gene duplications in human and mouse

artículo científico publicado en 2004

Draft Genome Sequence of a Highly Heterozygous Yeast Strain from the Metschnikowia pulcherrima Subclade, UCD127.

artículo científico publicado en 2018

Draft Genome Sequence of a Red Basidiomycete Yeast, Symmetrospora coprosmae Strain UCD350, Isolated from Soil in Ireland

scientific article published on 31 October 2019

Draft Genome Sequence of the Birch Tree Fungal Pathogen Taphrina betulina UCD315

scientific article published on 27 November 2019

Draft Genome Sequence of the Yeast Nadsonia starkeyi-henricii UCD142, Isolated from Forest Soil in Ireland

artículo científico publicado en 2018

Draft Genome Sequences of Two Isolates of the Yeast Kazachstania servazzii Recovered from Soil in Ireland

artículo científico publicado en 2019

Draft Genome Sequences of Two Natural Isolates of the Yeast Barnettozyma californica from Ireland, UCD09 and UCD89.

artículo científico publicado en 2018

Ebb and flow of the chloroplast inverted repeat

artículo científico publicado en 1996

Elaboration, diversification and regulation of the Sir1 family of silencing proteins in Saccharomyces.

scientific article published on 26 January 2009

Elusive origins of the extra genes in Aspergillus oryzae

artículo científico publicado en 2008

Estimation of synteny conservation and genome compaction between pufferfish (Fugu) and human

artículo científico publicado en 2000

Eukaryote genome duplication - where's the evidence?

artículo científico publicado en 1998

Evidence for a High Frequency of Simultaneous Double-Nucleotide Substitutions

scientific article published in Science

Evidence for horizontal transfer of a secondary metabolite gene cluster between fungi

artículo científico publicado en 2008

Evidence from comparative genomics for a complete sexual cycle in the 'asexual' pathogenic yeast Candida glabrata

artículo científico publicado en 2003

EvoChromo: towards a synthesis of chromatin biology and evolution

scientific article published on 26 September 2019

Evolution of Mating in the Saccharomycotina

artículo científico publicado en 2017

Evolution of gene order and chromosome number in Saccharomyces, Kluyveromyces and related fungi

artículo científico publicado en 1998

Evolution of the MAT locus and its Ho endonuclease in yeast species

artículo científico publicado en 2004

Evolution of the plastid ribosomal RNA operon in a nongreen parasitic plant: accelerated sequence evolution, altered promoter structure, and tRNA pseudogenes

artículo científico publicado en 1992

Evolutionary Mobility of the Ribosomal DNA Array in Yeasts

artículo científico publicado el 1 de enero de 2013

Evolutionary Origins of the Fumonisin Secondary Metabolite Gene Cluster in Fusarium verticillioides and Aspergillus niger

artículo científico publicado en 2011

Evolutionary biology: Speciation reversal

artículo científico publicado en 2003

Evolutionary capture of viral and plasmid DNA by yeast nuclear chromosomes

artículo científico publicado en 2009

Evolutionary erosion of yeast sex chromosomes by mating-type switching accidents

artículo científico publicado en 2011

Evolutionary genomics: yeasts accelerate beyond BLAST.

artículo científico publicado en 2004

Evolutionary instability of CUG-Leu in the genetic code of budding yeasts.

artículo científico publicado en 2018

Evolutionary re-organisation of a large operon in adzuki bean chloroplast DNA caused by inverted repeat movement

artículo científico publicado en 2002

Evolutionary restoration of fertility in an interspecies hybrid yeast, by whole-genome duplication after a failed mating-type switch.

artículo científico publicado en 2017

Extensive genomic duplication during early chordate evolution

artículo científico publicado en 2002

Extent of genomic rearrangement after genome duplication in yeast

artículo científico publicado en 1998

Flip/flop mating-type switching in the methylotrophic yeast Ogataea polymorpha is regulated by an Efg1-Rme1-Ste12 pathway

artículo científico publicado en 2017

Fourfold faster rate of genome rearrangement in nematodes than in Drosophila

artículo científico publicado en 2002

Function and evolution of a minimal plastid genome from a nonphotosynthetic parasitic plant

artículo científico publicado el 15 de noviembre de 1992

Functional divergence of duplicated genes formed by polyploidy during Arabidopsis evolution

artículo científico publicado en 2004

Functional partitioning of yeast co-expression networks after genome duplication

artículo científico publicado en 2006

Gene Duplication and Gene Conversion in the Caenorhabditis elegans Genome

article

Gene duplication, exon gain and neofunctionalization of OEP16-related genes in land plants

artículo científico publicado en 2006

Gene order evolution and paleopolyploidy in hemiascomycete yeasts

artículo científico publicado en 2002

Genome Sequence of Torulaspora microellipsoides CLIB 830T.

artículo científico publicado en 2018

Genome survey sequencing of the wine spoilage yeast Dekkera (Brettanomyces) bruxellensis

artículo científico publicado en 2007

GenomeVx: simple web-based creation of editable circular chromosome maps

artículo científico publicado en 2008

Genomic differences between Candida glabrata and Saccharomyces cerevisiae around the MRPL28 and GCN3 loci

artículo científico publicado en 2002

Genomic diversity and meiotic recombination among isolates of the biotech yeast Komagataella phaffii (Pichia pastoris)

scientific article published on 04 December 2019

Genomic islands in the pathogenic filamentous fungus Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2008

Giant GAL gene clusters for the melibiose-galactose pathway in Torulaspora

artículo científico publicado en 2020

Identification of a Candida utilis gene encoding ribosomal protein L7: evidence for two divergent subclasses of the eukaryotic ribosomal protein L7 family

artículo científico publicado en 1993

Identification of functional open reading frames in chloroplast genomes

artículo científico publicado en 1988

Increased glycolytic flux as an outcome of whole-genome duplication in yeast

artículo científico publicado en 2007

Increased glycolytic flux as an outcome of whole-genome duplication in yeast.

artículo científico publicado en 2008

Independent sorting-out of thousands of duplicated gene pairs in two yeast species descended from a whole-genome duplication

artículo científico publicado en 2007

Initial sequencing and analysis of the human genome

artículo científico publicado en 2001

Ins and outs of plastid genome evolution

artículo científico publicado en 1991

Lack of a functional plastid tRNA(Cys) gene is associated with loss of photosynthesis in a lineage of parasitic plants

artículo científico publicado en 1991

Localized hypermutation and associated gene losses in legume chloroplast genomes

artículo científico publicado en 2010

Loss of lager specific genes and subtelomeric regions define two different Saccharomyces cerevisiae lineages for Saccharomyces pastorianus Group I and II strains

artículo científico publicado en 2015

Mammalian DNA replication: mutation biases and the mutation rate

artículo científico publicado en 1991

Mammalian gene evolution: nucleotide sequence divergence between mouse and rat

artículo científico publicado en 1993

Many Parallel Losses of infA from Chloroplast DNA during Angiosperm Evolution with Multiple Independent Transfers to the Nucleus

artículo científico publicado en 2001

Mating-type switching by chromosomal inversion in methylotrophic yeasts suggests an origin for the three-locus Saccharomyces cerevisiae system

artículo científico publicado en 2014

Mechanisms of Chromosome Number Evolution in Yeast

artículo científico publicado el 21 de julio de 2011

Molecular cloning of multiple bovine aspartyl protease genes

artículo científico publicado en 1988

Molecular evidence for an ancient duplication of the entire yeast genome

artículo científico publicado en 1997

Molecular evolution meets the genomics revolution

artículo científico publicado en 2003

Multiple Origins of the Pathogenic Yeast Candida orthopsilosis by Separate Hybridizations between Two Parental Species

artículo científico publicado en 2016

Multiple Reinventions of Mating-type Switching during Budding Yeast Evolution

scientific article published on 25 July 2019

Multiple rounds of speciation associated with reciprocal gene loss in polyploid yeasts

artículo científico publicado en 2006

Mutation rates differ among regions of the mammalian genome

artículo científico publicado en 1989

Ninety extra nucleotide in ndhF gene of tobacco chloroplast DNA: a summary of revisions to the 1986 genome sequence

artículo científico publicado en 1993

No rosetta stone for a sense-antisense origin of aminoacyl tRNA synthetase classes

artículo científico publicado en 2008

Not Born Equal: Increased Rate Asymmetry in Relocated and Retrotransposed Rodent Gene Duplicates

article

Nucleotide Substitution Rates in Legume Chloroplast DNA Depend on the Presence of the Inverted Repeat

article

Origin of Lactose Fermentation in Kluyveromyces lactis by Interspecies Transfer of a Neo-functionalized Gene Cluster during Domestication

artículo científico publicado en 2019

Origin of the Yeast Whole-Genome Duplication

artículo científico publicado en 2015

Origins of recently gained introns in Caenorhabditis

scholarly article

Physiological and metabolic diversity in the yeast Kluyveromyces marxianus

artículo científico publicado en 2011

Plastid translation and transcription genes in a non-photosynthetic plant: intact, missing and pseudo genes

artículo científico publicado en 1991

Ploidy Variation in Kluyveromyces marxianus Separates Dairy and Non-dairy Isolates

artículo científico publicado en 2018

Polymorphic centromere locations in the pathogenic yeast Candida parapsilosis

scientific article published on 18 May 2020

Population genomics shows no distinction between pathogenic Candida krusei and environmental Pichia kudriavzevii: One species, four names

artículo científico publicado en 2018

Positive darwinian selection at the imprinted MEDEA locus in plants

artículo científico publicado en 2007

Positive selection and subfunctionalization of duplicated CCT chaperonin subunits

artículo científico publicado en 2003

Preferential subfunctionalization of slow-evolving genes after allopolyploidization in Xenopus laevis

artículo científico publicado en 2008

Prevalence of small inversions in yeast gene order evolution

artículo científico publicado en 2000

Probabilistic cross-species inference of orthologous genomic regions created by whole-genome duplication in yeast

artículo científico publicado en 2008

Proteinases and associated genes of parasitic helminths

artículo científico publicado en 1999

PubCrawler: keeping up comfortably with PubMed and GenBank

artículo científico publicado en 2004

RNAi in budding yeast

artículo científico publicado en 2009

Rapid evolution of the plastid translational apparatus in a nonphotosynthetic plant: loss or accelerated sequence evolution of tRNA and ribosomal protein genes

artículo científico publicado en 1992

Rate asymmetry after genome duplication causes substantial long-branch attraction artifacts in the phylogeny of Saccharomyces species

artículo científico publicado en 2005

Rearrangement rate following the whole-genome duplication in teleosts

artículo científico publicado en 2007

Recent allopolyploid origin of Zygosaccharomyces rouxii strain ATCC 42981

artículo científico publicado en 2008

Reciprocal gene loss between Tetraodon and zebrafish after whole genome duplication in their ancestor

article

Reconstruction of phylogenetic trees and estimation of divergence times under nonconstant rates of evolution

artículo científico publicado en 1987

Relationship of codon bias to mRNA concentration and protein length in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2000

Rewiring the transcriptional regulatory circuits of cells

artículo científico publicado en 2004

SMBE proposal to the government of Japan

scientific article published in 2012

SMURF: Genomic mapping of fungal secondary metabolite clusters

artículo científico publicado en 2010

SearchDOGS bacteria, software that provides automated identification of potentially missed genes in annotated bacterial genomes

artículo científico publicado en 2014

Sequence and analysis of the genome of the pathogenic yeast Candida orthopsilosis

artículo científico publicado en 2012

Sequence around the centromere of Saccharomyces cerevisiae chromosome II: similarity of CEN2 to CEN4.

artículo científico publicado en 1994

Sequence of 29 kb around the PDR10 locus on the right arm of Saccharomyces cerevisiae chromosome XV: similarity to part of chromosome I.

artículo científico publicado en 1996

Significance of positive selection and gene duplication in adaptive evolution: in memory of Austin L. Hughes

artículo científico publicado en 2016

Similarity between putative ATP-binding sites in land plant plastid ORF2280 proteins and the FtsH/CDC48 family of ATPases

artículo científico publicado en 1994

Small single-copy region of plastid DNA in the non-photosynthetic angiosperm Epifagus virginiana contains only two genes. Differences among dicots, monocots and bryophytes in gene organization at a non-bioenergetic locus

artículo científico publicado en 1992

Snf2 controls pulcherriminic acid biosynthesis and antifungal activity of the biocontrol yeast Metschnikowia pulcherrima

scientific article published on 20 May 2019

Structure and evolution of the largest chloroplast gene (ORF2280): internal plasticity and multiple gene loss during angiosperm evolution

artículo científico publicado en 1994

Systematic discovery of unannotated genes in 11 yeast species using a database of orthologous genomic segments

artículo científico publicado en 2011

TPP riboswitch-dependent regulation of an ancient thiamin transporter in Candida

artículo científico publicado en 2018

The 2R hypothesis and the human genome sequence

artículo científico publicado en 2003

The CYPome of the model xenobiotic-biotransforming fungus Cunninghamella elegans

scientific article published on 25 June 2019

The Genomic Aftermath of Hybridization in the Opportunistic Pathogen Candida metapsilosis

artículo científico publicado en 2015

The Methylotroph Gene Order Browser (MGOB) reveals conserved synteny and ancestral centromere locations in the yeast family Pichiaceae

scientific article published on 01 September 2019

The gene duplication that greased society's wheels

artículo científico publicado en 2005

The reported point centromeres of Scheffersomyces stipitis are retrotransposon long terminal repeats

artículo científico publicado en 2019

The site of deletion of the inverted repeat in pea chloroplast DNA contains duplicated gene fragments

artículo científico publicado el 1 de enero de 1988

The yeast mating-type switching endonuclease HO is a domesticated member of an unorthodox homing genetic element family

scientific article published on 27 April 2020

Transcription, splicing and editing of plastid RNAs in the nonphotosynthetic plant Epifagus virginiana

artículo científico publicado en 1995

Transcriptional response to lactic acid stress in the hybrid yeast Zygosaccharomyces parabailii.

artículo científico publicado en 2017

Turning a hobby into a job: how duplicated genes find new functions

artículo científico publicado en 2008

Updated map of duplicated regions in the yeast genome

artículo científico publicado en 1999

Visualizing syntenic relationships among the hemiascomycetes with the Yeast Gene Order Browser

artículo científico publicado en 2006

When gene marriages don't work out: divorce by subfunctionalization

artículo científico publicado en 2007

Widespread paleopolyploidy in model plant species inferred from age distributions of duplicate genes

artículo científico publicado en 2004

Wrapping up BLAST and other applications for use on Unix clusters

artículo científico publicado en 2003

Yeast genome evolution in the post-genome era.

artículo científico publicado en 1999

Yeast genome evolution--the origin of the species

artículo científico publicado en 2007

Yeast homologue of mammalian Ran binding protein 1.

artículo científico publicado en 1994

Zinc finger transcription factors displaced SREBP proteins as the major Sterol regulators during Saccharomycotina evolution

artículo científico publicado en 2014

Zygosaccharomyces pseudobailii, another yeast interspecies hybrid that regained fertility by damaging one of its MAT loci

article by Stephanie Braun-Galleani et al published 1 November 2018 in FEMS Yeast Research