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Lista de obras de Aleksandar Milosavljevic

A genome-wide search for promoters that respond to increased MYCN reveals both new oncogenic and tumor suppressor microRNAs associated with aggressive neuroblastoma

artículo científico publicado en 2011

A high-resolution map of synteny disruptions in gibbon and human genomes

artículo científico publicado en 2006

A metagenomic approach to characterization of the vaginal microbiome signature in pregnancy

artículo científico publicado en 2012

A sequence-level map of chromosomal breakpoints in the MCF-7 breast cancer cell line yields insights into the evolution of a cancer genome

artículo científico publicado en 2009

Abundance and length of simple repeats in vertebrate genomes are determined by their structural properties

artículo científico publicado en 2008

Allele-specific epigenome maps reveal sequence-dependent stochastic switching at regulatory loci

artículo científico publicado en 2018

An integrative variant analysis suite for whole exome next-generation sequencing data ⬇️

artículo científico publicado el 12 de enero de 2012

Analysis of MicroRNA Expression in the Prepubertal Testis ⬇️

artículo científico publicado el 29 de diciembre de 2010

Analysis of interactions between the epigenome and structural mutability of the genome using Genboree Workbench tools

artículo científico publicado en 2014

Atlas2 Cloud: a framework for personal genome analysis in the cloud ⬇️

artículo científico publicado el 26 de octubre de 2012

CDKN2D-WDFY2 is a cancer-specific fusion gene recurrent in high-grade serous ovarian carcinoma.

artículo científico publicado en 2014

CTD: An information-theoretic algorithm to interpret sets of metabolomic and transcriptomic perturbations in the context of graphical models

artículo científico publicado en 2021

Centromere remodeling in Hoolock leuconedys (Hylobatidae) by a new transposable element unique to the gibbons.

artículo científico publicado en 2012

ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia

artículo científico publicado en 2012

Characterization of single-nucleotide variation in Indian-origin rhesus macaques (Macaca mulatta)

artículo científico publicado en 2011

ClinGen Allele Registry links information about genetic variants

artículo científico publicado en 2018

ClinGen Pathogenicity Calculator: a configurable system for assessing pathogenicity of genetic variants

artículo científico publicado en 2017

Clone-array pooled shotgun mapping and sequencing: design and analysis of experiments.

artículo científico publicado en 2003

Comparison and quantitative verification of mapping algorithms for whole-genome bisulfite sequencing.

artículo científico publicado en 2014

Comparison of sequencing-based methods to profile DNA methylation and identification of monoallelic epigenetic modifications.

artículo científico publicado en 2010

Confounding by repetitive elements and CpG islands does not explain the association between hypomethylation and genomic instability

artículo científico publicado en 2013

Discovering functional modules by identifying recurrent and mutually exclusive mutational patterns in tumors ⬇️

artículo científico publicado el 14 de abril de 2011

Emerging patterns of epigenomic variation ⬇️

artículo científico publicado el 18 de abril de 2011

Epigenomic Deconvolution of Breast Tumors Reveals Metabolic Coupling between Constituent Cell Types

artículo científico publicado en 2016

Epigenomic footprints across 111 reference epigenomes reveal tissue-specific epigenetic regulation of lincRNAs.

artículo científico publicado en 2015

Evolutionary and Biomedical Insights from the Rhesus Macaque Genome

artículo científico publicado en 2007

Evolutionary breakpoints in the gibbon suggest association between cytosine methylation and karyotype evolution

artículo científico publicado en 2009

Extending gene ontology in the context of extracellular RNA and vesicle communication

artículo científico publicado en 2016

Functional annotation of the human brain methylome identifies tissue-specific epigenetic variation across brain and blood

artículo científico publicado en 2012

Gastrointestinal microbiome signatures of pediatric patients with irritable bowel syndrome.

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution

artículo científico publicado en 2004

Genomic hypomethylation in the human germline associates with selective structural mutability in the human genome

artículo científico publicado en 2012

Histoepigenetic analysis of the mesothelin network within pancreatic ductal adenocarcinoma cells reveals regulation of retinoic acid receptor gamma and AKT by mesothelin

artículo científico publicado en 2020

Integrating Genomic Resources with Electronic Health Records using the HL7 Infobutton Standard

scientific article published on 31 August 2016

Integration of extracellular RNA profiling data using metadata, biomedical ontologies and Linked Data technologies

artículo científico publicado en 2015

Intermediate DNA methylation is a conserved signature of genome regulation

artículo científico publicado en 2015

Long-range massively parallel mate pair sequencing detects distinct mutations and similar patterns of structural mutability in two breast cancer cell lines

artículo científico publicado en 2011

MicroRNA transcriptome in the newborn mouse ovaries determined by massive parallel sequencing

artículo científico publicado en 2010

NAHR-mediated copy-number variants in a clinical population: mechanistic insights into both genomic disorders and Mendelizing traits

artículo científico publicado en 2013

Pash 3.0: A versatile software package for read mapping and integrative analysis of genomic and epigenomic variation using massively parallel DNA sequencing

artículo científico publicado en 2010

Pash: efficient genome-scale sequence anchoring by Positional Hashing

artículo científico publicado en 2004

Performance of ACMG-AMP Variant-Interpretation Guidelines among Nine Laboratories in the Clinical Sequencing Exploratory Research Consortium

artículo científico publicado en 2016

Pooled genomic indexing of rhesus macaque

artículo científico publicado en 2005

Proinflammatory role for let-7 microRNAS in experimental asthma

artículo científico publicado en 2010

ReadDepth: A Parallel R Package for Detecting Copy Number Alterations from Short Sequencing Reads ⬇️

artículo científico publicado el 31 de enero de 2011

Recurrent BCAM-AKT2 fusion gene leads to a constitutively activated AKT2 fusion kinase in high-grade serous ovarian carcinoma

artículo científico publicado en 2015

Somatic mutations affect key pathways in lung adenocarcinoma

artículo científico publicado en 2008

Song exposure regulates known and novel microRNAs in the zebra finch auditory forebrain

artículo científico publicado en 2011

Spark: a navigational paradigm for genomic data exploration

artículo científico publicado en 2012

The DNA sequence, annotation and analysis of human chromosome 3

artículo científico publicado en 2006

The Genboree Microbiome Toolset and the analysis of 16S rRNA microbial sequences

artículo científico publicado en 2012

The NIH Roadmap Epigenomics Mapping Consortium

artículo científico publicado en 2010

The finished DNA sequence of human chromosome 12

artículo científico publicado en 2006

The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus

artículo científico publicado en 2006

Use of array CGH to detect exonic copy number variants throughout the genome in autism families detects a novel deletion in TMLHE

artículo científico publicado en 2011

mtDNA haplogroup and single nucleotide polymorphisms structure human microbiome communities

artículo científico publicado en 2014

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