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Lista de obras de Duncan Odom

A CTCF-independent role for cohesin in tissue-specific transcription

artículo científico publicado en 2010

A CpG mutational hotspot in a ONECUT binding site accounts for the prevalent variant of hemophilia B Leyden

artículo científico publicado en 2013

A feedback loop between the liver-enriched transcription factor network and miR-122 controls hepatocyte differentiation

artículo científico publicado en 2011

A high-content RNAi screen reveals multiple roles for long noncoding RNAs in cell division

artículo científico publicado en 2020

A hypothesis-based approach for identifying the binding specificity of regulatory proteins from chromatin immunoprecipitation data.

artículo científico publicado en 2005

AHT-ChIP-seq: a completely automated robotic protocol for high-throughput chromatin immunoprecipitation

artículo científico publicado en 2013

Aberrant methylation of tRNAs links cellular stress to neuro-developmental disorders

artículo científico publicado en 2014

Ageing-associated DNA methylation dynamics are a molecular readout of lifespan variation among mammalian species.

artículo científico publicado en 2018

Aging increases cell-to-cell transcriptional variability upon immune stimulation

artículo científico publicado en 2017

Bookmarking by Non-pioneer Transcription Factors during Liver Development Establishes Competence for Future Gene Activation

artículo científico publicado en 2020

CTCF and cohesin: linking gene regulatory elements with their targets

artículo científico publicado en 2013

CTCF maintains regulatory homeostasis of cancer pathways

scientific article published on 07 August 2018

Cell cycle genes are the evolutionarily conserved targets of the E2F4 transcription factor.

artículo científico publicado en 2007

ChIP-seq: using high-throughput sequencing to discover protein-DNA interactions

artículo científico publicado en 2009

Charge transport through DNA four-way junctions

artículo científico publicado en 2001

Charting the transcriptional regulatory changes in mouse liver during fasting

artículo científico publicado en 2017

Chromosome assembly of large and complex genomes using multiple references

scientific article published on 19 October 2018

Clustered CTCF binding is an evolutionary mechanism to maintain topologically associating domains

scientific article published on 07 January 2020

Co-binding by YY1 identifies the transcriptionally active, highly conserved set of CTCF-bound regions in primate genomes

artículo científico publicado en 2013

Codon-Driven Translational Efficiency Is Stable across Diverse Mammalian Cell States.

artículo científico publicado en 2016

Cohesin regulates tissue-specific expression by stabilizing highly occupied cis-regulatory modules

scientific journal article

Cohesin's role as an active chromatin domain anchorage revealed

artículo científico publicado en 2013

Comparative Genomics: One for all.

artículo científico

Comparative Hi-C reveals that CTCF underlies evolution of chromosomal domain architecture

artículo científico publicado en 2015

Complexity and conservation of regulatory landscapes underlie evolutionary resilience of mammalian gene expression

artículo científico publicado en 2017

Control of developmental regulators by Polycomb in human embryonic stem cells

artículo científico publicado en 2006

Control of pancreas and liver gene expression by HNF transcription factors

artículo científico publicado en 2004

Cooperativity and rapid evolution of cobound transcription factors in closely related mammals

artículo científico publicado en 2013

Core transcriptional regulatory circuitry in human hepatocytes

artículo científico publicado en 2006

Crisflash: open-source software to generate CRISPR guide RNAs against genomes annotated with individual variation

scientific article published on 01 September 2019

Decoupling of evolutionary changes in transcription factor binding and gene expression in mammals

artículo científico publicado en 2014

Enhancer evolution across 20 mammalian species

artículo científico publicado en 2015

Epigenetic conservation at gene regulatory elements revealed by non-methylated DNA profiling in seven vertebrates

artículo científico publicado en 2013

Epigenetic predictors of maximum lifespan and other life history traits in mammals

artículo científico publicado en 2021

Evolution of transcription factor binding in metazoans - mechanisms and functional implications

artículo científico publicado en 2014

Evolution of transcriptional control in mammals

artículo científico publicado en 2009

Extensive compensatory cis-trans regulation in the evolution of mouse gene expression

artículo científico publicado en 2012

Five-vertebrate ChIP-seq reveals the evolutionary dynamics of transcription factor binding

artículo científico publicado en 2010

Generalizing complexity: a fruitful partnership of functional genomics and systems biology

artículo científico publicado el 20 de febrero de 2012

Genome-scale validation of deep-sequencing libraries

artículo científico publicado en 2008

Genome-wide analysis of cAMP-response element binding protein occupancy, phosphorylation, and target gene activation in human tissues

artículo científico publicado en 2005

Genome-wide analysis of menin binding provides insights into MEN1 tumorigenesis

artículo científico publicado en 2006

Gibbon genome and the fast karyotype evolution of small apes

artículo científico publicado en 2014

Global gene expression profiling reveals SPINK1 as a potential hepatocellular carcinoma marker

artículo científico publicado en 2013

Global impact of RNA polymerase II elongation inhibition on alternative splicing regulation

artículo científico publicado en 2010

High-resolution mapping of transcriptional dynamics across tissue development reveals a stable mRNA-tRNA interface

artículo científico publicado en 2014

How to evaluate a graduate studentship, or choosing the right doctoral advisor

artículo científico publicado el 29 de abril de 2013

IL-7-dependent compositional changes within the γδ T cell pool in lymph nodes during ageing lead to an unbalanced anti-tumour response

artículo científico publicado en 2019

Identification of Transcription Factor–DNA Interactions In Vivo

artículo científico publicado el 1 de enero de 2011

Independence of repressive histone marks and chromatin compaction during senescent heterochromatic layer formation

artículo científico publicado en 2012

Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence

artículo científico publicado en 2012

Integrative detection and analysis of structural variation in cancer genomes

artículo científico publicado en 2018

Interplay of cis and trans mechanisms driving transcription factor binding and gene expression evolution.

artículo científico publicado en 2017

LINE retrotransposons characterize mammalian tissue-specific and evolutionarily dynamic regulatory regions

artículo científico publicado en 2021

Latent regulatory potential of human-specific repetitive elements

artículo científico publicado en 2012

Long-range oxidative damage in DNA/RNA duplexes

artículo científico publicado en 2001

Mitochondrial heteroplasmy in vertebrates using ChIP-sequencing data

artículo científico publicado en 2016

Multi-species, multi-transcription factor binding highlights conserved control of tissue-specific biological pathways

artículo científico publicado en 2014

Mutational landscape of a chemically-induced mouse model of liver cancer

artículo científico publicado en 2018

NOTCH1 directly regulates c-MYC and activates a feed-forward-loop transcriptional network promoting leukemic cell growth

artículo científico publicado en 2006

NSun2-mediated cytosine-5 methylation of vault noncoding RNA determines its processing into regulatory small RNAs

artículo científico publicado en 2013

Nuclear transcription factors in mammalian mitochondria

artículo científico publicado en 2010

Oxidative Repair of a Thymine Dimer in DNA from a Distance by a Covalently Linked Organic Intercalator

article

Pervasive lesion segregation shapes cancer genome evolution

artículo científico publicado en 2020

Pol III binding in six mammals shows conservation among amino acid isotypes despite divergence among tRNA genes.

artículo científico publicado en 2011

Protection of CpG islands from DNA methylation is DNA-encoded and evolutionarily conserved

artículo científico publicado en 2016

Proteogenomics and Hi-C reveal transcriptional dysregulation in high hyperdiploid childhood acute lymphoblastic leukemia

artículo científico publicado en 2019

Rapid turnover of long noncoding RNAs and the evolution of gene expression

artículo científico publicado en 2012

Recognition and reaction of metallointercalators with DNA.

artículo científico publicado en 1999

Regulatory Divergence of Transcript Isoforms in a Mammalian Model System

artículo científico publicado en 2015

Repeat associated mechanisms of genome evolution and function revealed by the Mus caroli and Mus pahari genomes

artículo científico publicado en 2018

Replication-timing boundaries facilitate cell-type and species-specific regulation of a rearranged human chromosome in mouse

artículo científico publicado en 2012

Robust charge transport in DNA double crossover assemblies

artículo científico publicado en 2000

Site-specific inhibition of transcription factor binding to DNA by a metallointercalator

artículo científico publicado en 1999

Sixteen diverse laboratory mouse reference genomes define strain-specific haplotypes and novel functional loci

scientific article published on 01 October 2018

Species-specific transcription in mice carrying human chromosome 21

artículo científico publicado en 2008

Specificity of RNAi, LNA and CRISPRi as loss-of-function methods in transcriptional analysis

artículo científico publicado en 2018

Staged developmental mapping and X chromosome transcriptional dynamics during mouse spermatogenesis

artículo científico publicado en 2019

Successful transmission and transcriptional deployment of a human chromosome via mouse male meiosis

artículo científico publicado en 2016

Survival strategies for choosing the right postdoc position

artículo científico publicado en 2014

Synthesis and characterization of magnesium and zinc complexes of 1,4,7-triazacyclononane-N-acetate. Potential models for the active site of RuBisCo

scholarly article by Duncan Odom et al published January 2000 in Inorganica Chimica Acta

The Evolutionary Fates of a Large Segmental Duplication in Mouse

artículo científico publicado en 2016

The emergence of piRNAs against transposon invasion to preserve mammalian genome integrity

artículo científico publicado en 2017

The evolutionary landscape of alternative splicing in vertebrate species

artículo científico publicado en 2012

The mechanisms shaping the single-cell transcriptional landscape.

artículo científico publicado en 2016

The opposing transcriptional functions of Sin3a and c-Myc are required to maintain tissue homeostasis

artículo científico publicado en 2011

Tissue-specific transcriptional regulation has diverged significantly between human and mouse

artículo científico publicado en 2007

Transcriptional activity and strain-specific history of mouse pseudogenes

artículo científico publicado en 2020

Transcriptional regulatory networks downstream of TAL1/SCL in T-cell acute lymphoblastic leukemia

artículo científico publicado en 2006

Transcriptional regulatory networks in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2002

Transcriptional role of cyclin D1 in development revealed by a genetic-proteomic screen.

artículo científico

Transcriptional silencing of long noncoding RNA GNG12-AS1 uncouples its transcriptional and product-related functions

artículo científico publicado en 2016

Transducin-like enhancer protein 1 mediates estrogen receptor binding and transcriptional activity in breast cancer cells

artículo científico publicado en 2011

Unwinding Limb Development

article

Variations in DNA Charge Transport with Nucleotide Composition and Sequence

article

Waves of Retrotransposon Expansion Remodel Genome Organization and CTCF Binding in Multiple Mammalian Lineages

artículo científico publicado en 2012

Waves of retrotransposon expansion remodel genome organization and CTCF binding in multiple mammalian lineages

scientific article (publication date: 20 January 2012)

When the Snake Lost Its Limbs, What Did the Mouse and Lizard Say?

artículo científico publicado en 2015

Zebrafish promoter microarrays identify actively transcribed embryonic genes.

artículo científico publicado en 2006