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Lista de obras de Purificación Lopez-Garcia

"Deciphering Archaeal Communities" Omics Tools in the Study of Archaeal Communities

artículo científico publicado en 2016

16S rDNA-based analysis reveals cosmopolitan occurrence but limited diversity of two cyanobacterial lineages with contrasted patterns of intracellular carbonate mineralization

artículo científico publicado en 2014

5. Prebiotic Chemistry – Biochemistry – Emergence of Life (4.4–2 Ga)

A Phylogenomic Framework to Study the Diversity and Evolution of Stramenopiles (=Heterokonts).

artículo científico publicado en 2016

A new class of marine Euryarchaeota group II from the Mediterranean deep chlorophyll maximum

artículo científico publicado en 2014

A novel haloarchaeal-related lineage is widely distributed in deep oceanic regions

artículo científico publicado en 2001

Accuracy of protist diversity assessments: morphology compared with cloning and direct pyrosequencing of 18S rRNA genes and ITS regions using the conspicuous tintinnid ciliates as a case study

artículo científico publicado en 2012

An ACP-Independent Fatty Acid Synthesis Pathway in Archaea: Implications for the Origin of Phospholipids

scientific article published on 19 June 2012

An Early-Branching Freshwater Cyanobacterium at the Origin of Plastids.

artículo científico publicado en 2017

An early-branching microbialite cyanobacterium forms intracellular carbonates

artículo científico publicado en 2012

An updated view of kinetoplastid phylogeny using environmental sequences and a closer outgroup: proposal for a new classification of the class Kinetoplastea

artículo científico publicado en 2004

Analysis of a genome fragment of a deep-sea uncultivated Group II euryarchaeote containing 16S rDNA, a spectinomycin-like operon and several energy metabolism genes

artículo científico publicado en 2004

Ancestral lipid biosynthesis and early membrane evolution

artículo científico publicado en 2004

Archaeal and bacterial community composition of sediment and plankton from a suboxic freshwater pond

artículo científico publicado en 2007

Are hydrothermal vents oases for parasitic protists?

scientific article published on 01 December 2003

Autochthonous eukaryotic diversity in hydrothermal sediment and experimental microcolonizers at the Mid-Atlantic Ridge

artículo científico publicado en 2003

Bacterial Mode of Replication with Eukaryotic-Like Machinery in a Hyperthermophilic Archaeon

artículo científico publicado en 2000

Bacterial diversity and carbonate precipitation in the giant microbialites from the highly alkaline Lake Van, Turkey

artículo científico publicado en 2005

Bacterial diversity in hydrothermal sediment and epsilonproteobacterial dominance in experimental microcolonizers at the Mid-Atlantic Ridge

artículo científico publicado en 2003

Bacterial gene import and mesophilic adaptation in archaea

artículo científico publicado en 2015

Balechina and the new genus Cucumeridinium gen. nov. (Dinophyceae), unarmored dinoflagellates with thick cell coverings

artículo científico publicado en 2015

Biomarkers of Endolithic Communities within Gypsum Crusts (Southern Tunisia)

Biomineralization Patterns of Intracellular Carbonatogenesis in Cyanobacteria: Molecular Hypotheses

Biosignatures and Bacterial Diversity in Hydrothermal Deposits of Solfatara Crater, Italy

article

Combined cultivation and single-cell approaches to the phylogenomics of nucleariid amoebae, close relatives of fungi

artículo científico publicado en 2019

Comment on "The 1.2-megabase genome sequence of Mimivirus".

artículo científico publicado en 2005

Comparative Restriction Maps of the Archaeal Megaplasmid pHM300 in Different Haloferax mediterranei Strains

artículo científico publicado en 1995

Comparative analysis of a genome fragment of an uncultivated mesopelagic crenarchaeote reveals multiple horizontal gene transfers

artículo científico publicado en 2004

Comparative analysis of genome fragments of Acidobacteria from deep Mediterranean plankton

artículo científico publicado en 2008

Comparative metagenomics of bathypelagic plankton and bottom sediment from the Sea of Marmara

artículo científico publicado en 2010

Comparative metagenomics unveils functions and genome features of microbialite-associated communities along a depth gradient

artículo científico publicado en 2016

Complete-fosmid and fosmid-end sequences reveal frequent horizontal gene transfers in marine uncultured planktonic archaea

artículo científico publicado en 2011

Complex communities of small protists and unexpected occurrence of typical marine lineages in shallow freshwater systems

artículo científico publicado en 2014

Control of DNA topology during thermal stress in hyperthermophilic archaea: DNA topoisomerase levels, activities and induced thermotolerance during heat and cold shock in Sulfolobus

scientific article published on 01 August 1999

Core microbial communities of lacustrine microbialites sampled along an alkalinity gradient

scientific article published on 28 September 2020

Cyanobacterial formation of intracellular Ca-carbonates in undersaturated solutions

artículo científico publicado en 2017

DNA supercoiling and temperature adaptation: A clue to early diversification of life?

artículo científico publicado en 1999

DNA topology and the thermal stress response, a tale from mesophiles and hyperthermophiles

artículo científico publicado en 2000

DNA topology in hyperthermophilic archaea: reference states and their variation with growth phase, growth temperature, and temperature stresses

artículo científico publicado en 1997

Description of Gloeomargarita lithophora gen. nov., sp. nov., a thylakoid-bearing basal-branching cyanobacterium with intracellular carbonates, and proposal for Gloeomargaritales ord. nov.

artículo científico publicado en 2016

Different biogeographic patterns of prokaryotes and microbial eukaryotes in epilithic biofilms

artículo científico publicado en 2012

Diversity and vertical distribution of microbial eukaryotes in the snow, sea ice and seawater near the north pole at the end of the polar night

artículo científico publicado en 2011

Domain (Taxonomy)

Ecological and evolutionary significance of novel protist lineages

artículo científico publicado en 2016

Ectosymbiotic bacteria at the origin of magnetoreception in a marine protist

scientific article published on 29 April 2019

Environmental drivers of plankton protist communities along latitudinal and vertical gradients in the oldest and deepest freshwater lake

artículo científico publicado en 2020

Eukaryotic diversity and phylogeny using small- and large-subunit ribosomal RNA genes from environmental samples

artículo científico publicado en 2009

Eukaryotic diversity associated with carbonates and fluid-seawater interface in Lost City hydrothermal field

artículo científico publicado en 2007

Evolution of viruses and cells: do we need a fourth domain of life to explain the origin of eukaryotes?

artículo científico publicado en 2015

Evolution: King-Size Plastid Genomes in a New Red Algal Clade

artículo científico publicado en 2017

Evolutionary Genomics of Metchnikovella incurvata (Metchnikovellidae): An Early Branching Microsporidium

artículo científico publicado en 2018

Extending the conserved phylogenetic core of archaea disentangles the evolution of the third domain of life

artículo científico publicado en 2015

Extremophiles

Fe-bearing phases in modern lacustrine microbialites from Mexico

scholarly article

Fluorescence in situ hybridisation coupled to ultra small immunogold detection to identify prokaryotic cells using transmission and scanning electron microscopy

artículo científico publicado en 2005

Formation of low-T hydrated silicates in modern microbialites from Mexico and implications for microbial fossilization

article

Functional shifts in microbial mats recapitulate early Earth metabolic transitions

article

Genomes of Abundant and Widespread Viruses from the Deep Ocean

artículo científico publicado en 2016

Genomic organization of the halophilic archaeon Haloferax mediterranei: physical map of the chromosome

artículo científico publicado el 25 de mayo de 1992

Global dispersal and ancient cryptic species in the smallest marine eukaryotes

artículo científico publicado en 2005

Global eukaryote phylogeny: Combined small- and large-subunit ribosomal DNA trees support monophyly of Rhizaria, Retaria and Excavata

artículo científico publicado en 2007

Global transcriptome analysis of the aphelid Paraphelidium tribonemae supports the phagotrophic origin of fungi

artículo científico publicado en 2018

Habitability: the Point of View of a Biologist

Halobacterial megaplasmids are negatively supercoiled

artículo científico publicado en 1994

Highly diverse and seasonally dynamic protist community in a pristine peat bog.

artículo científico publicado en 2010

Hindsight in the relative abundance, metabolic potential and genome dynamics of uncultivated marine archaea from comparative metagenomic analyses of bathypelagic plankton of different oceanic regions

artículo científico publicado en 2008

Horizontal and endosymbiotic gene transfer in early plastid evolution

artículo científico publicado en 2019

Horizontal gene transfer and archaeal origin of deoxyhypusine synthase homologous genes in bacteria

artículo científico publicado en 2004

Horizontal gene transfer of a chloroplast DnaJ-Fer protein to Thaumarchaeota and the evolutionary history of the DnaK chaperone system in Archaea

artículo científico publicado en 2012

Hydrochemistry and microbialites of the alkaline crater lake Alchichica, Mexico

article

Hyperdiverse archaea near life limits at the polyextreme geothermal Dallol area

scientific article published on 28 October 2019

In vitro DNA binding of the archaeal protein Sso7d induces negative supercoiling at temperatures typical for thermophilic growth.

artículo científico publicado en 1998

Independent Size Expansions and Intron Proliferation in Red Algal Plastid and Mitochondrial Genomes

artículo científico publicado en 2022

Intra- and intergenomic variation of ribosomal RNA operons in concurrent Alteromonas macleodii strains

artículo científico publicado en 2012

Intracellular Ca-carbonate biomineralization is widespread in cyanobacteria

artículo científico publicado en 2014

Isolation of new plasmids from hyperthermophilic Archaea of the order Thermococcales

artículo científico publicado en 1997

Lateral Gene Transfer

article

Life cycle and molecular phylogeny of the dinoflagellates Chytriodinium and Dissodinium, ectoparasites of copepod eggs

artículo científico publicado en 2009

MOLECULAR PHYLOGENY OF DINOPHYSOID DINOFLAGELLATES: THE SYSTEMATIC POSITION OF OXYPHYSIS OXYTOXOIDES AND THE DINOPHYSIS HASTATA GROUP (DINOPHYSALES, DINOPHYCEAE)(1).

artículo científico publicado en 2011

Macrofilamentous microbial communities in the metal-rich and acidic River Tinto, Spain

artículo científico publicado en 2004

Major role of nitrite-oxidizing bacteria in dark ocean carbon fixation.

artículo científico publicado en 2017

Marked seasonality and high spatial variability of protist communities in shallow freshwater systems

artículo científico publicado en 2015

Meeting Report: Minutes from EMBO: Ten Years of Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms

artículo científico publicado en 2016

Metabolic symbiosis at the origin of eukaryotes.

artículo científico publicado en 1999

Metagenome of the Mediterranean deep chlorophyll maximum studied by direct and fosmid library 454 pyrosequencing

artículo científico publicado en 2010

Metagenome-based diversity analyses suggest a significant contribution of non-cyanobacterial lineages to carbonate precipitation in modern microbialites

artículo científico publicado en 2015

Metagenomic analysis of mesopelagic Antarctic plankton reveals a novel deltaproteobacterial group

artículo científico publicado en 2006

Metagenomics of the deep Mediterranean, a warm bathypelagic habitat

artículo científico publicado en 2007

Microbial diversity in the deep-subsurface hydrothermal aquifer feeding the giant gypsum crystal-bearing Naica Mine, Mexico

artículo científico publicado en 2013

Microbial eukaryotes in the suboxic chemosynthetic ecosystem of Movile Cave, Romania

artículo científico publicado en 2019

Microbial methane turnover at Marmara Sea cold seeps: a combined 16S rRNA and lipid biomarker investigation.

artículo científico publicado en 2012

Modern subsurface bacteria in pristine 2.7 Ga-old fossil stromatolite drillcore samples from the Fortescue Group, Western Australia

artículo científico publicado en 2009

Molecular Phylogeny of Paraphelidium letcheri sp. nov. (Aphelida, Opisthosporidia).

artículo científico publicado en 2016

Molecular and morphological characterization of four new ancyromonad genera and proposal for an updated taxonomy of the Ancyromonadida

artículo científico publicado en 2023

Molecular phylogeny and ultrastructure of Aphelidium aff. melosirae (Aphelida, Opisthosporidia)

artículo científico publicado en 2014

Molecular phylogeny of noctilucoid dinoflagellates (Noctilucales, Dinophyceae)

artículo científico publicado en 2010

Molecular phylogeny of the dinoflagellates Podolampas and Blepharocysta (Peridiniales, Dinophyceae)

scholarly article by Fernando Gómez et al published 3 May 2010 in Phycologia

Molecular phylogeny of the marine dinoflagellate genus Heterodinium (Dinophyceae)

scholarly article by Fernando Gómez et al published 10 April 2012 in European Journal of Phycology

Molecular phylogeny of the ocelloid-bearing dinoflagellates erythropsidinium and warnowia (warnowiaceae, dinophyceae).

artículo científico publicado en 2009

Molecular phylogeny of tintinnid ciliates (Tintinnida, Ciliophora).

artículo científico publicado en 2012

Monophyletic

article in Encyclopedia of Astrobiology

Morphological and Genetic Diversity of Opisthosporidia: New Aphelid Paraphelidium tribonemae gen. et sp. nov.

artículo científico publicado en 2016

Morphological and molecular characterization of a new member of the phylum Rhodelphidia

artículo científico publicado en 2023

Morphological and phylogenetic diversity of thermophilic cyanobacteria in Algerian hot springs

artículo científico publicado en 2014

Nanoscale detection of organic signatures in carbonate microbialites

artículo científico publicado en 2006

Neoceratium gen. nov., a new genus for all marine species currently assigned to Ceratium (Dinophyceae).

artículo científico publicado en 2009

New Member of Gromochytriales (Chytridiomycetes)— Apiochytrium granulosporum nov. gen. et sp

artículo científico publicado en 2018

New haptophyte lineages and multiple independent colonizations of freshwater ecosystems

artículo científico publicado en 2013

New insights into marine group III Euryarchaeota, from dark to light

artículo científico publicado en 2017

New insights into the phylogenetic position of diplonemids: G+C content bias, differences of evolutionary rate and a new environmental sequence

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2001

Open Questions on the Origin of Eukaryotes

artículo científico publicado en 2015

Pan-oceanic distribution of new highly diverse clades of deep-sea diplonemids

artículo científico publicado en 2008

Pangenome evidence for extensive interdomain horizontal transfer affecting lineage core and shell genes in uncultured planktonic thaumarchaeota and euryarchaeota

artículo científico publicado en 2014

Paralogous Gene

scholarly article

Parvularia atlantis gen. et sp. nov., a Nucleariid Filose Amoeba (Holomycota, Opisthokonta).

artículo científico publicado en 2017

Performance of the melting seawater-ice elution method on the metabarcoding characterization of benthic protist communities

artículo científico publicado en 2020

Phylogenetic analysis of eukaryotic thiolases suggests multiple proteobacterial origins

artículo científico publicado en 2005

Phylogenetic and ecological diversity of apusomonads, a lineage of deep-branching eukaryotes.

artículo científico publicado en 2016

Phylogenomic analysis of kinetoplastids supports that trypanosomatids arose from within bodonids

artículo científico publicado en 2010

Phylogenomic investigation of phospholipid synthesis in archaea

artículo científico publicado en 2012

Phylotype

Phylum

Physical connections: prokaryotes parasitizing their kin

artículo científico publicado en 2020

Physicochemical Conditions and Microbial Diversity Associated with the Evaporite Deposits in the Laguna de la Piedra (Salar de Atacama, Chile)

article

Phytoplankton diversity and cyanobacterial dominance in a hypereutrophic shallow lake with biologically produced alkaline pH.

artículo científico publicado en 2003

Planktonic microbial communities from microbialite‐bearing lakes sampled along a salinity‐alkalinity gradient

scientific article published in 2022

Plasmid pGS5 from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus profundus is negatively supercoiled.

artículo científico publicado en 2000

Polyclonality of concurrent natural populations of Alteromonas macleodii

artículo científico publicado en 2012

Polyubiquitin insertions and the phylogeny of Cercozoa and Rhizaria

artículo científico publicado en 2005

Present status of the molecular ecology of kathablepharids

artículo científico publicado en 2006

Prokaryotes, Origin of

scholarly article

Prokaryotic and eukaryotic community structure in field and cultured microbialites from the alkaline Lake Alchichica (Mexico)

artículo científico publicado en 2011

Protist Evolution: Stealing Genes to Gut It Out.

artículo científico publicado en 2017

Protocols for the Study of Microbe–Mineral Interactions in Modern Microbialites

Re-evaluation of Amphidiniopsis (Dinophyceae) Morphogroups Based On Phylogenetic Relationships, and Description of Three New Sand-dwelling Species From the NW Mediterranean

artículo científico publicado en 2019

Resilience of Freshwater Communities of Small Microbial Eukaryotes Undergoing Severe Drought Events

artículo científico publicado en 2016

Rooting the domain archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota

artículo científico publicado en 2015

Seasonal dynamics of free-living tintinnid ciliate communities revealed by environmental sequences from the North-West Mediterranean Sea.

artículo científico publicado en 2013

Secondary Plastids of Euglenids and Chlorarachniophytes Function with a Mix of Genes of Red and Green Algal Ancestry

artículo científico publicado en 2018

Selective forces for the origin of the eukaryotic nucleus

artículo científico publicado en 2006

Silicified Biota in High-Altitude, Geothermally Influenced Ignimbrites at El Tatio Geyser Field, Andean Cordillera (Chile)

article

Sinophysis and Pseudophalacroma are Distantly Related to Typical Dinophysoid Dinoflagellates (Dinophysales, Dinophyceae)

scientific article published on 05 December 2011

Sizing chromosomes and megaplasmids in haloarchaea

artículo científico publicado en 1996

Solenicola setigera is the first characterized member of the abundant and cosmopolitan uncultured marine stramenopile group MAST-3.

artículo científico publicado en 2010

Specific carbonate-microbe interactions in the modern microbialites of Lake Alchichica (Mexico)

artículo científico publicado en 2013

Sunlight-exposed biofilm microbial communities are naturally resistant to chernobyl ionizing-radiation levels

artículo científico publicado en 2011

Symbiosis between methanogenic archaea and delta-proteobacteria as the origin of eukaryotes: the syntrophic hypothesis

artículo científico publicado en 1998

Symbiosis in eukaryotic evolution.

artículo científico publicado en 2017

Ten reasons to exclude viruses from the tree of life

artículo científico publicado en 2009

The Chytrid-like Parasites of Algae Amoeboradix gromovi gen. et sp. nov. and Sanchytrium tribonematis Belong to a New Fungal Lineage.

artículo científico publicado en 2017

The Last Common Ancestor of Modern Cells

The Syntrophy hypothesis for the origin of eukaryotes revisited

scientific article published on 27 April 2020

The Ultrastructure of Sanchytrium tribonematis (Sanchytriaceae, Fungi incertae sedis) Confirms its Close Relationship to Amoeboradix

scientific article published on 31 May 2019

The aphelid-like phagotrophic origins of fungi

The crustacean parasites Ellobiopsis Caullery, 1910 and Thalassomyces Niezabitowski, 1913 form a monophyletic divergent clade within the Alveolata

artículo científico publicado en 2009

The early evolution of lipid membranes and the three domains of life

artículo científico publicado en 2012

The enigmatic SAR202 cluster up close: shedding light on a globally distributed dark ocean lineage involved in sulfur cycling

artículo científico publicado en 2017

The environmental clade LKM11 and Rozella form the deepest branching clade of fungi

artículo científico publicado en 2009

The extent of protist diversity: insights from molecular ecology of freshwater eukaryotes

artículo científico publicado en 2005

The molecular ecology of microbial eukaryotes unveils a hidden world

artículo científico publicado en 2002

The nucleolar proteome and the (endosymbiotic) origin of the nucleus

scientific article published on 01 October 2004

The place of viruses in biology in light of the metabolism- versus-replication-first debate.

artículo científico publicado en 2012

The rise and fall of Picobiliphytes: how assumed autotrophs turned out to be heterotrophs

artículo científico publicado en 2014

Thermophilic lifestyle for an uncultured archaeon from hydrothermal vents: evidence from environmental genomics

artículo científico publicado en 2006

Time series are critical to understand microbial plankton diversity and ecology

scientific article published on 01 March 2019

Toward the monophyly of Haeckel's radiolaria: 18S rRNA environmental data support the sisterhood of polycystinea and acantharea

artículo científico publicado en 2002

Tracking microbial biodiversity through molecular and genomic ecology

artículo científico publicado en 2007

Unarmoured dinoflagellates with a small hyposome: Torodinium and Lebouridinium gen. nov. for Katodinium glaucum (Gymnodiniales, Dinophyceae)

artículo científico publicado en 2016

Uncultured Archaea in a hydrothermal microbial assemblage: phylogenetic diversity and characterization of a genome fragment from a euryarchaeote

artículo científico publicado en 2006

Unexpected diversity of small eukaryotes in deep-sea Antarctic plankton

artículo científico publicado en 2001

Unveiling microbial interactions in stratified mat communities from a warm saline shallow pond.

artículo científico publicado en 2017

Viruses in Biology

Wide bacterial diversity associated with tubes of the vent worm Riftia pachyptila

artículo científico publicado en 2002

Yet viruses cannot be included in the tree of life

scientific article published in 2009

Young Sun, Early Earth and the Origins of Life

“Missing” protists: a molecular prospective

“Missing” protists: a molecular prospective