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Lista de obras de Gabriele Ausiello

3dLOGO: a web server for the identification, analysis and use of conserved protein substructures

artículo científico publicado en 2007

A Proteome-wide Domain-centric Perspective on Protein Phosphorylation

artículo científico publicado en 2014

A neural strategy for the inference of SH3 domain-peptide interaction specificity

artículo científico publicado en 2005

A novel approach to represent and compare RNA secondary structures

artículo científico publicado en 2014

Alternative splicing tends to avoid partial removals of protein-protein interaction sites

artículo científico publicado en 2013

B-Pred, a structure based B-cell epitopes prediction server

artículo científico publicado en 2012

BEAM web server: A tool for structural RNA motif discovery

artículo científico publicado en 2017

DBATE: database of alternative transcripts expression

artículo científico publicado en 2013

Development of computational tools for the inference of protein interaction specificity rules and functional annotation using structural information

artículo científico publicado en 2003

ELM server: A new resource for investigating short functional sites in modular eukaryotic proteins

artículo científico publicado en 2003

False occurrences of functional motifs in protein sequences highlight evolutionary constraints

artículo científico publicado en 2007

FunClust: a web server for the identification of structural motifs in a set of non-homologous protein structures

artículo científico publicado en 2008

Functional annotation by identification of local surface similarities: a novel tool for structural genomics

artículo científico publicado en 2005

Identification of binding pockets in protein structures using a knowledge-based potential derived from local structural similarities

artículo científico publicado en 2012

Identification of nucleotide-binding sites in protein structures: a novel approach based on nucleotide modularity

artículo científico publicado en 2012

Local comparison of protein structures highlights cases of convergent evolution in analogous functional sites

artículo científico publicado en 2007

Modular architecture of nucleotide-binding pockets.

artículo científico publicado en 2010

Nucleos: a web server for the identification of nucleotide-binding sites in protein structures

artículo científico publicado en 2013

PhosTryp: a phosphorylation site predictor specific for parasitic protozoa of the family trypanosomatidae

artículo científico publicado en 2011

Phosfinder: a web server for the identification of phosphate-binding sites on protein structures

artículo científico publicado en 2011

Phosphate binding sites identification in protein structures

artículo científico publicado en 2010

Phospho3D: a database of three-dimensional structures of protein phosphorylation sites

artículo científico publicado en 2006

Query3d: a new method for high-throughput analysis of functional residues in protein structures

artículo científico publicado en 2005

SH3-Hunter: discovery of SH3 domain interaction sites in proteins

artículo científico publicado en 2007

SURFACE: a database of protein surface regions for functional annotation

artículo científico publicado en 2004

Structural motifs recurring in different folds recognize the same ligand fragments

artículo científico publicado en 2009

Superpose3D: a local structural comparison program that allows for user-defined structure representations

artículo científico publicado en 2010

pdbFun: mass selection and fast comparison of annotated PDB residues

artículo científico publicado en 2005

webPDBinder: a server for the identification of ligand binding sites on protein structures

artículo científico publicado en 2013