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Lista de obras de Sylvain Brisse

"A re-evaluation of M. prototuberculosis": continuing the debate

artículo científico publicado en 2006

"Epidemic clones" of Listeria monocytogenes are widespread and ancient clonal groups

artículo científico publicado en 2013

1926-2016: 90 Years of listeriology

artículo científico publicado en 2016

A comprehensive resource for Bordetella genomic epidemiology and biodiversity studies

artículo científico publicado en 2022

A new perspective on Listeria monocytogenes evolution

artículo científico publicado en 2008

Acinetobacter seifertii sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex isolated from human clinical specimens

artículo científico publicado en 2015

Aedes albopictus Mosquito: The Main Vector of the 2007 Chikungunya Outbreak in Gabon

artículo científico publicado en 2009

AlienTrimmer removes adapter oligonucleotides with high sensitivity in short-insert paired-end reads. Commentary on Turner (2014) Assessment of insert sizes and adapter content in FASTQ data from NexteraXT libraries

artículo científico publicado en 2014

AlienTrimmer: a tool to quickly and accurately trim off multiple short contaminant sequences from high-throughput sequencing reads

artículo científico publicado en 2013

Ancient origin and gene mosaicism of the progenitor of Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2005

Animal and human pathogenic Escherichia coli strains share common genetic backgrounds ⬇️

artículo científico publicado el 13 de febrero de 2011

Application of whole genome sequencing to query a potential outbreak of Elizabethkingia anophelis in Ontario, Canada

scientific article published on 24 April 2019

Association of tellurite resistance with hypervirulent clonal groups of Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2015

Automated ribotyping of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates

artículo científico publicado en 2002

Azole preexposure affects the Aspergillus fumigatus population in patients

artículo científico publicado en 2012

Bacteremia: Clinical Expression and Bacterial Genomics

CRISPR typing and subtyping for improved laboratory surveillance of Salmonella infections

artículo científico publicado en 2012

Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae exhibit variability in capsular polysaccharide and capsule associated virulence traits

artículo científico publicado en 2014

Carriage of a Single Strain of Nontoxigenic Corynebacterium diphtheriae bv. Belfanti (Corynebacterium belfantii) in Four Patients with Cystic Fibrosis

scientific article published on 26 April 2019

Characterization of an extended-spectrum class A β-lactamase from a novel enterobacterial species taxonomically related to Rahnella spp./Ewingella spp.

artículo científico publicado en 2013

Characterization of the cryptic Escherichia lineages: rapid identification and prevalence

artículo científico publicado en 2011

Characterization of the novel Listeria monocytogenes PCR serogrouping profile IVb-v1.

artículo científico publicado en 2011

Chikungunya outbreaks

artículo científico publicado en 2007

Clonogrouping, a Rapid Multiplex PCR Method for Identification of Major Clones of Listeria monocytogenes

artículo científico publicado en 2015

Community-acquired meningitis caused by a CG86 hypervirulent Klebsiella pneumoniae strain: first case report in the Caribbean

artículo científico publicado en 2016

Comparative analysis of Klebsiella pneumoniae genomes identifies a phospholipase D family protein as a novel virulence factor

artículo científico publicado en 2014

Comparative evaluation of the BD Phoenix and VITEK 2 automated instruments for identification of isolates of the Burkholderia cepacia complex

artículo científico publicado en 2002

Comparative phylogenies of Burkholderia, Ralstonia, Comamonas, Brevundimonas and related organisms derived from rpoB, gyrB and rrs gene sequences

artículo científico publicado en 2007

Comparative phylogenomics of ESBL-, AmpC- and carbapenemase-producing <i>Klebsiella pneumoniae</i> originating from companion animals and humans

artículo científico publicado en 2022

Comparison of widely used Listeria monocytogenes strains EGD, 10403S, and EGD-e highlights genomic variations underlying differences in pathogenicity

artículo científico publicado en 2014

Complete Genome Sequences of Bordetella pertussis Clinical Isolate FR5810 and Reference Strain Tohama from Combined Oxford Nanopore and Illumina Sequencing

Complete nucleotide sequence of the first KPC-2- and SHV-12-encoding IncX plasmid, pKpS90, from Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2012

Complete nucleotide sequence of two multidrug-resistant IncR plasmids from Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2014

Correction: Aedes albopictus Mosquito: The Main Vector of the 2007 Chikungunya Outbreak in Gabon

artículo científico publicado en 2009

Corrigendum: Uncovering Listeria monocytogenes hypervirulence by harnessing its biodiversity

artículo científico publicado en 2017

Deciphering bartonella diversity, recombination, and host specificity in a rodent community

artículo científico publicado en 2013

Description of Klebsiella africanensis sp. nov., Klebsiella variicola subsp. tropicalensis subsp. nov. and Klebsiella variicola subsp. variicola subsp. nov

preprint

Description of Klebsiella grimontii sp. nov.

artículo científico publicado en 2017

Description of Klebsiella quasipneumoniae sp. nov., isolated from human infections, with two subspecies, Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae subsp. nov. and Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae subsp. nov., and demonstrat

artículo científico publicado en 2014

Detection of OXA-48 carbapenemase in the pandemic clone Escherichia coli O25b:H4-ST131 in the course of investigation of an outbreak of OXA-48-producing Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2012

Development of variable number of tandem repeats typing schemes for Ralstonia solanacearum, the agent of bacterial wilt, banana Moko disease and potato brown rot.

artículo científico publicado en 2013

Diagnosis in France of a Non-Toxigenic tox Gene-Bearing Strain of Corynebacterium diphtheriae in a Young Male Back From Senegal

artículo científico publicado en 2017

Differential contribution of AcrAB and OqxAB efflux pumps to multidrug resistance and virulence in Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2014

Discrimination of Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca phylogenetic groups and other Klebsiella species by use of amplified fragment length polymorphism

artículo científico publicado en 2004

Diversity of aminoglycoside-resistance genes and their association with class 1 integrons among strains of pan-European Acinetobacter baumannii clones

artículo científico publicado en 2004

Diversity, virulence, and antimicrobial resistance of the KPC-producing Klebsiella pneumoniae ST307 clone

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequence of Campylobacter coli Strain IPSID-1 Isolated from a Patient with Immunoproliferative Small Intestinal Disease

artículo científico publicado en 2014

Emergence of carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii in the Czech Republic is associated with the spread of multidrug-resistant strains of European clone II.

artículo científico publicado en 2008

Emerging severe and fatal infections due to Klebsiella pneumoniae in two university hospitals in France

artículo científico publicado en 2011

Erratum: Global phylogeography and evolutionary history of Shigella dysenteriae type 1

article

Erratum: Uncovering Listeria monocytogenes hypervirulence by harnessing its biodiversity

artículo científico publicado en 2017

Evaluation of high-throughput sequencing for identifying known and unknown viruses in biological samples

artículo científico

Evaluation of the Etest ESBL and the BD Phoenix, VITEK 1, and VITEK 2 automated instruments for detection of extended-spectrum beta-lactamases in multiresistant Escherichia coli and Klebsiella spp.

artículo científico publicado en 2002

Evaluation of the polymorphisms associated with tandem repeats for Pseudomonas aeruginosa strain typing

artículo científico publicado en 2003

Evidence for genetic exchange and hybridization in Trypanosoma cruzi based on nucleotide sequences and molecular karyotype

artículo científico publicado en 2003

Evolution and population structure of Salmonella enterica serovar Newport

artículo científico publicado en 2010

Evolutionary history of Helicobacter pylori sequences reflect past human migrations in Southeast Asia

artículo científico publicado en 2011

Evolutionary history of Salmonella Typhi illustrates a new pattern of epidemiologic dynamics

artículo científico publicado en 2007

Evolutionary history of Salmonella typhi

artículo científico publicado en 2006

Expansion of European vacA and cagA alleles to East-Asian Helicobacter pylori strains in Cambodia

artículo científico publicado en 2011

First neisseria gonorrhoeae genotyping analysis in france: identification of a strain cluster with reduced susceptibility to Ceftriaxone

artículo científico publicado en 2009

From local surveys to global surveillance: three high-throughput genotyping methods for epidemiological monitoring of Xanthomonas citri pv. citri pathotypes

artículo científico publicado en 2008

From molecular to genomic epidemiology: transforming surveillance and control of infectious diseases ⬇️

artículo científico publicado el 24 de enero de 2013

Genome microevolution of chikungunya viruses causing the Indian Ocean outbreak

artículo científico publicado en 2006

Genome-wide mosaicism within Mycobacterium abscessus: evolutionary and epidemiological implications

artículo científico publicado en 2016

Genomic Sequencing of Bordetella pertussis for Epidemiology and Global Surveillance of Whooping Cough

artículo científico publicado en 2018

Genomic analysis of diversity, population structure, virulence, and antimicrobial resistance in Klebsiella pneumoniae, an urgent threat to public health

artículo científico publicado en 2015

Genomic analysis of smooth tubercle bacilli provides insights into ancestry and pathoadaptation of Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2013

Genomic definition of hypervirulent and multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae clonal groups.

artículo científico publicado en 2014

Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (forme

artículo científico publicado en 2011

Global phylogeography and evolutionary history of Shigella dysenteriae type 1.

artículo científico publicado en 2016

High prevalence of the arginine catabolic mobile element in carriage isolates of methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis

artículo científico publicado en 2010

High resolution typing of <i>Staphylococcus epidermidis</i> based on cgMLST to investigate the hospital spread of multidrug resistant clones

artículo científico publicado en 2020

Human Leptospira Isolates Circulating in Mayotte (Indian Ocean) Have Unique Serological and Molecular Features ⬇️

artículo científico publicado el 7 de diciembre de 2011

Identification and antimicrobial susceptibility of 100 Klebsiella animal clinical isolates

artículo científico publicado en 2005

Identification of Acinetobacter species and genotyping of Acinetobacter baumannii by multilocus PCR and mass spectrometry

artículo científico

Identification of Klebsiella oxytoca using a specific PCR assay targeting the polygalacturonase pehX gene

artículo científico publicado en 2003

Identification of and Related Phylogroups by MALDI-TOF Mass Spectrometry

artículo científico publicado en 2018

In silico analysis of usher encoding genes in Klebsiella pneumoniae and characterization of their role in adhesion and colonization

artículo científico publicado en 2015

In vitro and in silico parameters for precise cgMLST typing of Listeria monocytogenes

artículo científico publicado en 2022

In-vivo loss of carbapenem resistance by extensively drug-resistant Klebsiella pneumoniae during treatment via porin expression modification

artículo científico publicado en 2017

Inter-hospital outbreak of Klebsiella pneumoniae producing KPC-2 carbapenemase in Ireland

artículo científico publicado en 2012

Klebsiella pneumoniae carriage in low-income countries: antimicrobial resistance, genomic diversity and risk factors

artículo científico publicado en 2020

Klebsiella pneumoniae resistant to third-generation cephalosporins in five African and two Vietnamese major towns: multiclonal population structure with two major international clonal groups, CG15 and CG258 ⬇️

artículo científico publicado el 5 de marzo de 2012

Klebsiella variicola is a frequent cause of bloodstream infection in the stockholm area, and associated with higher mortality compared to K. pneumoniae

artículo científico publicado en 2014

Lactobacillus paracasei comparative genomics: towards species pan-genome definition and exploitation of diversity

artículo científico publicado en 2013

Leptospira mayottensis sp. nov., a pathogenic species of the genus Leptospira isolated from humans

artículo científico publicado en 2014

LiSEQ - whole-genome sequencing of a cross-sectional survey of Listeria monocytogenes in ready-to-eat foods and human clinical cases in Europe

article published in 2019

Liver Abscess Caused by Infection with Community-Acquired Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae

artículo científico publicado en 2016

Metabolic diversity of the emerging pathogenic lineages of Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2017

Microbial molecular markers and epidemiological surveillance in the era of high throughput sequencing: an update from the IMMEM-10 conference

artículo científico publicado en 2014

Microbiological and clinical characteristics of bacteraemia caused by the hypermucoviscosity phenotype of Klebsiella pneumoniae in Korea

artículo científico publicado en 2013

Molecular Epidemiology of Colonizing and Infecting Isolates of Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2016

Molecular and epidemiological characterization of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in Norway, 2007 to 2014.

artículo científico publicado en 2017

Molecular epidemiology of carbapenem non-susceptible Acinetobacter baumannii in France

artículo científico publicado en 2014

Molecular epidemiology of extended-spectrum beta-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae strains in a university hospital in Tunis, Tunisia, 1999-2005.

artículo científico publicado en 2009

Molecular serotyping of Klebsiella species isolates by restriction of the amplified capsular antigen gene cluster

artículo científico publicado en 2004

Multilocus VNTR analysis of Mycobacterium ulcerans strains isolated in Côte d'Ivoire.

artículo científico publicado en 2011

Multilocus sequence analysis of the genus Citrobacter and description of Citrobacter pasteurii sp. nov.

artículo científico publicado en 2015

Multilocus sequence typing analysis of Staphylococcus lugdunensis implies a clonal population structure

artículo científico publicado en 2012

Multilocus sequence typing as a replacement for serotyping in Salmonella enterica

artículo científico publicado en 2012

Multilocus sequence typing of Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates

artículo científico publicado en 2005

Multilocus sequence typing of Lactobacillus casei reveals a clonal population structure with low levels of homologous recombination

artículo científico publicado en 2007

Multilocus sequence typing scheme for the Mycobacterium abscessus complex

artículo científico publicado en 2013

Multiplex PCR for detection of seven virulence factors and K1/K2 capsular serotypes of Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2014

Neutral genomic microevolution of a recently emerged pathogen, Salmonella enterica serovar Agona

artículo científico publicado en 2013

New Bacteriophages against Emerging Lineages ST23 and ST258 of Klebsiella pneumoniae and Efficacy Assessment in Galleria mellonella Larvae

scientific article published on 03 May 2019

Occurrence and spread of SHV extended-spectrum beta-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae isolates in Curacao

artículo científico publicado en 2003

Optimized Multilocus variable-number tandem-repeat analysis assay and its complementarity with pulsed-field gel electrophoresis and multilocus sequence typing for Listeria monocytogenes clone identification and surveillance

artículo científico publicado en 2013

Origin, spread and demography of the Mycobacterium tuberculosis complex

artículo científico publicado en 2008

Outbreak of Invasive Wound Mucormycosis in a Burn Unit Due to Multiple Strains of Mucor circinelloides f. circinelloides Resolved by Whole-Genome Sequencing

artículo científico publicado en 2018

PCR-based identification of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis, the agent of rhinoscleroma

artículo científico publicado en 2011

Patterns of selection on Plasmodium falciparum erythrocyte-binding antigens after the colonization of the New World

artículo científico publicado en 2014

Phages against Noncapsulated Klebsiella pneumoniae: Broader Host range, Slower Resistance

artículo científico publicado en 2023

Phages against non-capsulated Klebsiella pneumoniae : broader host range, slower resistance

artículo científico publicado en 2022

Phylogenetic and genomic diversity of human bacteremic Escherichia coli strains

artículo científico publicado en 2008

Phylogenetic distribution of CTX-M- and non-extended-spectrum-β-lactamase-producing Escherichia coli isolates: group B2 isolates, except clone ST131, rarely produce CTX-M enzymes.

artículo científico publicado en 2012

Phylogeny and identification of Pantoea species and typing of Pantoea agglomerans strains by multilocus gene sequencing

artículo científico publicado en 2009

Population Genetic Structure of Anopheles gambiae and Anopheles arabiensis in Niger

Population genetic structure of 4,12:a:- Salmonella enterica strains from harbor porpoises

artículo científico publicado en 2012

Population genetic structure of Anopheles gambiae and Anopheles arabiensis in Niger

artículo científico publicado en 2010

Population genomics and antimicrobial resistance in Corynebacterium diphtheriae

artículo científico publicado en 2020

Probable zoonotic leprosy in the southern United States

artículo científico publicado en 2011

Psychrobacter pasteurii and Psychrobacter piechaudii sp. nov., two novel species within the genus Psychrobacter

artículo científico publicado en 2017

Rapid genotyping of Achromobacter xylosoxidans, Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and Stenotrophomonas maltophilia isolates using melting curve analysis of RAPD-generated DNA fragments (McRAPD).

artículo científico publicado en 2011

Rare meningitis case in a Danish male

artículo científico publicado en 2018

Real-Time Whole-Genome Sequencing for Surveillance of Listeria monocytogenes, France

artículo científico publicado en 2017

Recombining population structure of Plesiomonas shigelloides (Enterobacteriaceae) revealed by multilocus sequence typing

artículo científico publicado en 2007

Reconstructed ancestral sequences improve pathogen identification using resequencing DNA microarrays

artículo científico publicado en 2010

Regional occurrence of plasmid-mediated carbapenem-hydrolyzing oxacillinase OXA-58 in Acinetobacter spp. in Europe

artículo científico publicado en 2005

Repetitive-DNA-element PCR fingerprinting and antibiotic resistance of pan-European multi-resistant Acinetobacter baumannii clone III strains

artículo científico publicado en 2005

Resequencing microarray technology for genotyping human papillomavirus in cervical smears

artículo científico publicado en 2014

Revisiting the taxonomy of the genus Elizabethkingia using whole-genome sequencing, optical mapping, and MALDI-TOF, along with proposal of three novel Elizabethkingia species: Elizabethkingia bruuniana sp. nov., Elizabethkingia ursingii sp. nov., an

artículo científico publicado en 2017

Rhinoscleroma pathogenesis: The type K3 capsule of Klebsiella rhinoscleromatis is a virulence factor not involved in Mikulicz cells formation

artículo científico publicado en 2018

Six groups of the OXY beta-Lactamase evolved over millions of years in Klebsiella oxytoca

artículo científico publicado en 2005

Species delineation and clonal diversity in four Bifidobacterium species as revealed by multilocus sequencing

artículo científico publicado en 2010

Species distribution and ribotype diversity of Burkholderia cepacia complex isolates from French patients with cystic fibrosis

artículo científico publicado en 2004

Taxonomic status of Corynebacterium diphtheriae biovar Belfanti and proposal of Corynebacterium belfantii sp. nov

artículo científico publicado en 2018

The Genus Klebsiella

The ZKIR Assay, a Real-Time PCR Method for the Detection of Klebsiella pneumoniae and Closely Related Species in Environmental Samples

artículo científico publicado en 2020

The population structure of Acinetobacter baumannii: expanding multiresistant clones from an ancestral susceptible genetic pool

artículo científico publicado en 2010

Tracking Nosocomial Klebsiella pneumoniae Infections and Outbreaks by Whole-Genome Analysis: Small-Scale Italian Scenario within a Single Hospital

artículo científico publicado en 2015

Tracking key virulence loci encoding aerobactin and salmochelin siderophore synthesis in Klebsiella pneumoniae

Uncovering Listeria monocytogenes hypervirulence by harnessing its biodiversity

artículo científico publicado en 2016

Uneven distribution of mating types among genotypes of Candida glabrata isolates from clinical samples

artículo científico publicado en 2009

Variants of the Klebsiella pneumoniae OKP chromosomal beta-lactamase are divided into two main groups, OKP-A and OKP-B.

artículo científico publicado en 2005

Virulent clones of Klebsiella pneumoniae: identification and evolutionary scenario based on genomic and phenotypic characterization

artículo científico publicado en 2009

Whole genome-based population biology and epidemiological surveillance of Listeria monocytogenes

artículo científico publicado en 2016

Worldwide distribution of major clones of Listeria monocytogenes

artículo científico publicado en 2011

wzi Gene sequencing, a rapid method for determination of capsular type for Klebsiella strains

artículo científico publicado en 2013

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