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Lista de obras de Martijn P van Iersel

Bioinformatics for the NuGO proof of principle study: analysis of gene expression in muscle of ApoE3*Leiden mice on a high-fat diet using PathVisio

artículo científico publicado en 2008

BridgeDb app: unifying identifier mapping services for Cytoscape

artículo científico

CellNOptR: a flexible toolkit to train protein signaling networks to data using multiple logic formalisms

artículo científico publicado en 2012

Corrigendum: The BioPAX community standard for pathway data sharing

correction; published 7 December 2010

CySBGN: a Cytoscape plug-in to integrate SBGN maps

artículo científico publicado en 2013

Data integration with biological pathways ⬇️

PhD thesis of Martijn van Iersel

Distinct gene expression profiles in adult rat brains after acute MK-801 and cocaine treatments

artículo científico publicado en 2005

Erratum: Corrigendum: The BioPAX community standard for pathway data sharing

scholarly article published in Nature Biotechnology

Integrated visualization of a multi-omics study of starvation in mouse intestine

artículo científico

Mining biological pathways using WikiPathways web services

artículo científico publicado en 2009

Path2Models: large-scale generation of computational models from biochemical pathway maps

artículo científico publicado en 2013

PathVisio 3: an extendable pathway analysis toolbox

artículo científico publicado en 2015

PathVisio-Faceted Search: an exploration tool for multi-dimensional navigation of large pathways

artículo científico publicado en 2013

PathVisio-MIM: PathVisio plugin for creating and editing Molecular Interaction Maps (MIMs)

artículo científico publicado en 2011

PathVisio-Validator: a rule-based validation plugin for graphical pathway notations ⬇️

artículo científico publicado el 22 de diciembre de 2011

Presenting and exploring biological pathways with PathVisio

artículo científico publicado en 2008

Regulation of developmental rate and germ cell proliferation in Caenorhabditis elegans by the p53 gene network

artículo científico publicado en 2006

SBML qualitative models: a model representation format and infrastructure to foster interactions between qualitative modelling formalisms and tools

artículo científico publicado en 2013

Software support for SBGN maps: SBGN-ML and LibSBGN.

artículo científico publicado en 2012

The BioPAX community standard for pathway data sharing

artículo científico publicado en 2010

The BridgeDb framework: standardized access to gene, protein and metabolite identifier mapping services

artículo científico publicado en 2010

The Importance of Modularity in Bioinformatics Tools

The systems biology format converter

artículo científico publicado en 2016

WikiPathways: building research communities on biological pathways

artículo científico publicado en 2012

WikiPathways: pathway editing for the people

artículo científico

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