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Lista de obras de Manimozhiyan Arumugam

A Previously Undescribed Highly Prevalent Phage Identified in a Danish Enteric Virome Catalog

artículo científico publicado en 2021

A catalog of the mouse gut metagenome

artículo científico publicado en 2015

A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing

artículo científico publicado en 2010

Amendments: Author Correction: A catalog of the mouse gut metagenome

artículo científico publicado en 2019

An Improved Method for High Quality Metagenomics DNA Extraction from Human and Environmental Samples

artículo científico publicado en 2016

An integrated catalog of reference genes in the human gut microbiome

artículo científico publicado en 2014

Antifibrotic and molecular aspects of rifaximin in alcoholic liver disease: study protocol for a randomized controlled trial.

artículo científico publicado en 2018

Assessment of metagenomic assembly using simulated next generation sequencing data

artículo científico publicado en 2012

Author Correction: Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation

scientific article published on 01 December 2019

Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

scientific article published on 01 September 2019

Bile microbiome varies by etiology of cholestatic liver disease

scientific article published on 03 September 2020

Butyrate producing colonic Clostridiales metabolise human milk oligosaccharides and cross feed on mucin via conserved pathways

artículo científico publicado en 2020

Circulating microbiome in blood of different circulatory compartments

article

Closing in on the C. elegans ORFeome by cloning TWINSCAN predictions

artículo científico publicado en 2005

Compartmentalization of Immune Response and Microbial Translocation in Decompensated Cirrhosis

artículo científico publicado en 2019

Complete Genome Sequences of emm111 Type Streptococcus pyogenes Strain GUR, with Antitumor Activity, and Its Derivative Strain GURSA1 with an Inactivated emm Gene

artículo científico publicado en 2017

Consistent mutational paths predict eukaryotic thermostability

artículo científico publicado en 2013

Corrigendum: Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

artículo científico publicado en 2017

Country-specific antibiotic use practices impact the human gut resistome

artículo científico publicado en 2013

Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

artículo científico publicado en 2015

Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition.

artículo científico publicado en 2017

Enterotypes of the human gut microbiome

artículo científico publicado en 2011

Enterotypes of the human gut microbiome

artículo científico publicado en 2011

Erratum: Addendum: Enterotypes of the human gut microbiome

artículo científico publicado en 2014

Genes controlling the activation of natural killer lymphocytes are epigenetically remodeled in intestinal cells from germ-free mice

article

Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution

artículo científico publicado en 2004

Genomic variation landscape of the human gut microbiome

artículo científico publicado en 2012

Gut microbiome development along the colorectal adenoma-carcinoma sequence

artículo científico publicado en 2015

High-fat feeding rather than obesity drives taxonomical and functional changes in the gut microbiota in mice

scientific article published on 08 April 2017

Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

artículo científico publicado en 2016

Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes

artículo científico publicado en 2014

Identification of rat genes by TWINSCAN gene prediction, RT-PCR, and direct sequencing

artículo científico publicado en 2004

Implementations of the chemical structural and compositional similarity metric in R and Python

artículo científico publicado en 2019

Individuality and temporal stability of the human gut microbiome.

artículo científico publicado en 2013

Insight into structure and assembly of the nuclear pore complex by utilizing the genome of a eukaryotic thermophile

artículo científico publicado en 2011

Interplay between FGF21 and insulin action in the liver regulates metabolism

artículo científico publicado en 2014

Interplay between FGF21 and insulin action in the liver regulates metabolism

artículo científico publicado en 2015

MOCAT: a metagenomics assembly and gene prediction toolkit

artículo científico publicado en 2012

Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer

artículo científico publicado en 2019

Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation

artículo científico publicado en 2019

Metagenomic analysis of faecal microbiome as a tool towards targeted non-invasive biomarkers for colorectal cancer

artículo científico publicado en 2015

Metagenomic species profiling using universal phylogenetic marker genes

artículo científico publicado en 2013

Minimum information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications

artículo científico publicado en 2011

Molecular properties of adult mouse gastric and intestinal epithelial progenitors in their niches

artículo científico publicado en 2006

Pairagon+N-SCAN_EST: a model-based gene annotation pipeline

artículo científico publicado en 2006

Pairagon: a highly accurate, HMM-based cDNA-to-genome aligner

artículo científico publicado en 2009

Publisher Correction: Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition

artículo científico publicado en 2018

QIIME 2: Reproducible, interactive, scalable, and extensible microbiome data science

Recovery of gut microbiota of healthy adults following antibiotic exposure

scientific article published on 22 October 2018

Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

artículo científico publicado en 2019

Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers

artículo científico publicado en 2013

Roux-en-Y gastric bypass surgery of morbidly obese patients induces swift and persistent changes of the individual gut microbiota

artículo científico publicado en 2016

SmashCell: a software framework for the analysis of single-cell amplified genome sequences

artículo científico publicado en 2010

SmashCommunity: a metagenomic annotation and analysis tool

artículo científico publicado en 2010

The Treeterbi and Parallel Treeterbi algorithms: efficient, optimal decoding for ordinary, generalized and pair HMMs

artículo científico publicado en 2007

The human small intestinal microbiota is driven by rapid uptake and conversion of simple carbohydrates

artículo científico publicado en 2012

The “Minimum Information about an ENvironmental Sequence” (MIENS) specification

The “Minimum Information about an ENvironmental Sequence” (MIENS) specification

Trans-ethnic gut microbiota signatures of type 2 diabetes in Denmark and India

artículo científico publicado en 2021

Transcriptome Complexity in a Genome-Reduced Bacterium

artículo científico publicado en 2009

Trust is good, control is better: technical considerations in blood microbiome analysis

artículo científico publicado en 2019

Utilizing the gut microbiome in decompensated cirrhosis and acute-on-chronic liver failure

artículo científico publicado en 2020

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