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Lista de obras de Antoine Danchin

2-Ketobutyrate: a putative alarmone of Escherichia coli

artículo científico publicado en 1983

2-Ketoglutarate as a possible regulatory metabolite involved in cyclic AMP-dependent catabolite repression in Escherichia coli K12.

artículo científico publicado en 1986

3'-5' phosphoadenosine phosphate is an inhibitor of PARP-1 and a potential mediator of the lithium-dependent inhibition of PARP-1 in vivo

artículo científico publicado en 2012

3-phenylpropionate catabolism and the Escherichia coli oxidative stress response

artículo científico publicado en 2005

A New Transmission Route for the Propagation of the SARS-CoV-2 Coronavirus

artículo científico publicado en 2020

A Novel H-NS-like protein from an antarctic psychrophilic bacterium reveals a crucial role for the N-terminal domain in thermal stability

artículo científico publicado en 2003

A SeqA hyperstructure and its interactions direct the replication and sequestration of DNA.

artículo científico publicado en 2000

A TY1 element is inserted in the CYR1 control region of Saccharomyces cerevisiae strain AB320

artículo científico publicado en 1987

A Xanthomonas campestris pv. campestris protein similar to catabolite activation factor is involved in regulation of phytopathogenicity

artículo científico publicado en 1990

A brief history of genome research and bioinformatics in France

artículo científico publicado en 2000

A challenge to vaccinology: Living organisms trap information

artículo científico publicado en 2009

A double epidemic model for the SARS propagation

artículo científico publicado en 2003

A dynamic molecular model for transfer RNA

article

A gene encoding a tyrosine tRNA synthetase is located near sacS in Bacillus subtilis.

artículo científico publicado en 1991

A locus involved in kanamycin, chloramphenicol and L-serine resistance is located in the bglY-galU region of the Escherichia coli K12 chromosome

artículo científico publicado en 1989

A new method for specific labelling of tRNA : Preliminary results on yeast tRNAPhe ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1972

A new technique for selection of sensitive and auxotrophic mutants of E. coli: Isolation of a strain sensitive to an excess of one-carbon metabolites ⬇️

artículo científico publicado el 15 de febrero de 1977

A new transmission route for the propagation of the SARS-CoV-2 coronavirus

artículo científico publicado en 2020

A parasite vector-host epidemic model for TSE propagation.

artículo científico publicado en 2007

A path from predation to mutualism ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2010

A phylogenetic view of bacterial ribonucleases

artículo científico publicado en 2009

A pyruvate-stimulated adenylate cyclase has a sequence related to the fes/fps oncogenes and to eukaryotic cyclases

artículo científico publicado en 1991

A rapid test for the rel a mutation in E. coli

artículo científico publicado en 1976

A selective theory for the epigenetic specification of the monospecific antibody production in single cell lines

artículo científico publicado en 1976

A strand-specific model for chromosome segregation in bacteria.

artículo científico publicado en 2003

A tale of two oxidation states: bacterial colonization of arsenic-rich environments

artículo científico publicado en 2007

A theory of the epigenesis of neuronal networks by selective stabilization of synapses

artículo científico publicado en 1973

A variable gene in a conserved region of the Helicobacter pylori genome: isotopic gene replacement or rapid evolution?

artículo científico publicado en 2008

Adenylate Cyclases

Adenylyl cyclases: a heterogeneous class of ATP-utilizing enzymes.

artículo científico publicado en 1994

Aeromonas hydrophila adenylyl cyclase 2: a new class of adenylyl cyclases with thermophilic properties and sequence similarities to proteins from hyperthermophilic archaebacteria.

artículo científico publicado en 1998

Affinity labeling of rabbit muscle myosin with a cobalt (3)-adenosine triphosphate complex

artículo científico publicado en 1974

Affinity labeling of the adenosine 5'-monophosphate binding site of rabbit muscle glycogen phosphorylase b with an adenosine 5'-monophosphate-cobalt(3) complex

artículo científico publicado en 1973

An Interplay between Metabolic and Physicochemical Constraints: Lessons from the Psychrophilic Prokaryote Genomes

An analysis of determinants of amino acids substitution rates in bacterial proteins

artículo científico publicado en 2003

An updated metabolic view of the Bacillus subtilis 168 genome

artículo científico publicado en 2013

Anaerobic transcription activation in Bacillus subtilis: identification of distinct FNR-dependent and -independent regulatory mechanisms

artículo científico publicado en 1995

Analysis of a Bacillus subtilis genome fragment using a co-operative computer system prototype

artículo científico publicado en 1995

Analysis of long repeats in bacterial genomes reveals alternative evolutionary mechanisms in Bacillus subtilis and other competent prokaryotes

article

Analysis of the ptsH-ptsI-crr region in Escherichia coli K-12: evidence for the existence of a single transcriptional unit ⬇️

artículo científico publicado el 1 de diciembre de 1984

Analysis of the ptsH-ptsI-crr region in Escherichia coli K-12: nucleotide sequence of the ptsH gene

artículo científico publicado en 1985

Antibodies against a fused 'lacZ-yeast mitochondrial intron' gene product allow identification of the mRNA maturase encoded by the fourth intron of the yeast cob-box gene

artículo científico publicado en 1984

Antibodies against synthetic oligopeptides allow identification of the mRNA-maturase encoded by the second intron of the yeast cob-box gene.

artículo científico publicado en 1984

Antifragility and Tinkering in Biology (and in Business) Flexibility Provides an Efficient Epigenetic Way to Manage Risk

artículo científico publicado en 2011

Antisense expression at the ptsH-ptsI locus of Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1989

AstR-AstS, a new two-component signal transduction system, mediates swarming, adaptation to stationary phase and phenotypic variation in Photorhabdus luminescens

artículo científico publicado en 2004

Bacillus subtilis F0F1 ATPase: DNA sequence of the atp operon and characterization of atp mutants

artículo científico publicado en 1994

Bacillus subtilis, the model Gram-positive bacterium: 20 years of annotation refinement

artículo científico publicado en 2018

Bacteria as computers making computers

artículo científico publicado en 2008

Bacteria in the ageing gut: did the taming of fire promote a long human lifespan?

artículo científico publicado en 2018

Bacterial DNA strand compositional asymmetry: Response

article

Bacterial niche-specific genome expansion is coupled with highly frequent gene disruptions in deep-sea sediments

artículo científico publicado en 2011

Bacterial variations on the methionine salvage pathway

artículo científico publicado en 2004

Base composition bias might result from competition for metabolic resources

artículo científico publicado en 2002

Beneficial biological warfare.

artículo científico publicado en 2006

Bifunctional structure of two adenylyl cyclases from the myxobacterium Stigmatella aurantiaca

artículo científico publicado en 1997

Binding of 3'-anthraniloyl-2'-deoxy-ATP to calmodulin-activated adenylate cyclase from Bordetella pertussis and Bacillus anthracis

artículo científico publicado en 1990

Binding of metal ions to macromolecules through an NMR spectrometric method of investigation

artículo científico publicado en 1969

Biological macromolecules labelling with covalent complexes of magnesium analogs

scientific article published on 01 January 1973

Bordetella pertussis adenylate cyclase: the gene and the protein

artículo científico publicado en 1988

By way of introduction: Some constraints of the cell physics that are usually forgotten, but should be taken into account for in silico genome analysis

scientific article published on 01 January 1996

CMP kinase from Escherichia coli is structurally related to other nucleoside monophosphate kinases.

artículo científico publicado en 1996

Catabolite regulation of the pta gene as part of carbon flow pathways in Bacillus subtilis.

artículo científico publicado en 1999

Catabolite repression in Escherichia coli mutants lacking cyclic AMP receptor protein

artículo científico publicado en 1980

Cells need safety valves

artículo científico publicado en 2009

Characterization of Escherichia coli adenylate cyclase mutants with modified regulation

artículo científico publicado en 1990

Characterization of NrnA homologs from Mycobacterium tuberculosis and Mycoplasma pneumoniae

artículo científico publicado en 2011

Characterization of polyamine synthesis pathway in Bacillus subtilis 168

artículo científico publicado en 1998

Chemical reactivity drives spatiotemporal organisation of bacterial metabolism

artículo científico publicado en 2014

Cinnamic acid, an autoinducer of its own biosynthesis, is processed via Hca enzymes in Photorhabdus luminescens

artículo científico publicado en 2008

Classification between normal and tumor tissues based on the pair-wise gene expression ratio

artículo científico publicado en 2004

Cloning and assembly strategies in microbial genome projects.

artículo científico publicado en 1999

Cloning and characterization of the pH 2.5 acid phosphatase gene, appA: cyclic AMP mediated negative regulation

artículo científico publicado en 1987

Cloning and expression of mouse-brain calmodulin as an activator of Bordetella pertussis adenylate cyclase in Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1989

Cloning and expression of the calmodulin-sensitive Bacillus anthracis adenylate cyclase in Escherichia coli

artículo científico publicado en 1988

Cloning and sequence of the Bordetella bronchiseptica adenylate cyclase-hemolysin-encoding gene: comparison with the Bordetella pertussis gene

artículo científico publicado en 1995

Cloning of the second adenylate cyclase gene (cya2) from Rhizobium meliloti F34: sequence similarity to eukaryotic cyclases

artículo científico publicado en 1995

Codon usage and lateral gene transfer in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 1999

Codon usage domains over bacterial chromosomes

artículo científico publicado en 2006

Coenzyme B12 synthesis as a baseline to study metabolite contribution of animal microbiota

artículo científico publicado en 2017

Colibri: a functional data base for the Escherichia coli genome

artículo científico publicado en 1993

Comparative analysis of the cya locus in enterobacteria and related gram-negative facultative anaerobes

artículo científico publicado en 1996

Comparison Between the Escherichia coli and Bacillus subtilis Genomes Suggests That a Major Function of Polynucleotide Phosphorylase is to Synthesize CDP

artículo científico publicado en 1997

Conceptual sequel to biological expeditions at the time of global changes

artículo científico publicado en 2018

Confidence, tolerance, and allowance in biological engineering: the nuts and bolts of living things

artículo científico publicado en 2014

Conformational transitions within the calmodulin-binding site of Bordetella pertussis adenylate cyclase studied by time-resolved fluorescence of Trp242 and circular dichroism

artículo científico publicado en 1996

Consent insufficient for data release-Response

artículo científico publicado en 2019

Conserved genes in a path from commensalism to pathogenicity: comparative phylogenetic profiles of Staphylococcus epidermidis RP62A and ATCC12228.

artículo científico publicado en 2006

Conserved transcription factor binding sites of cancer markers derived from primary lung adenocarcinoma microarrays

artículo científico publicado en 2005

Conserved transcription factor binding sites of cancer markers derived from primary lung adenocarcinoma microarrays

artículo científico publicado en 2005

Control of bacterial motility by environmental factors in polarly flagellated and peritrichous bacteria isolated from Lake Baikal.

artículo científico publicado en 2001

Conversion of methionine to cysteine in Bacillus subtilis and its regulation

scientific journal article

Cooperative Binding of Manganese (II) to Transfer RNA

artículo científico publicado en 1970

Cooperative computer system for genome sequence analysis

scientific article published on 01 January 1995

Cooperative phenomena in binding and activation of Bordetella pertussis adenylate cyclase by calmodulin

artículo científico publicado en 1993

Coping with cold: the genome of the versatile marine Antarctica bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125

artículo científico publicado en 2005

Coping with inevitable accidents in metabolism

artículo científico publicado en 2016

Correlation between the serine sensitivity and the derepressibility of the ilv genes in Escherichia coli relA- mutants

artículo científico publicado en 1978

CotA of Bacillus subtilis is a copper-dependent laccase

scientific journal article

Cross-host evolution of severe acute respiratory syndrome coronavirus in palm civet and human

artículo científico publicado en 2005

Cyclic AMP as a modulator of polarity in polycistronic transcriptional units

scientific article published on July 1979

Cyclic AMP synthesis in Escherichia coli strains bearing known deletions in the pts phosphotransferase operon.

artículo científico publicado en 1990

CymR, the master regulator of cysteine metabolism in Staphylococcus aureus, controls host sulphur source utilization and plays a role in biofilm formation.

artículo científico publicado en 2009

Cytoplasmic and periplasmic proteomic signatures of exponentially growing cells of the psychrophilic bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125.

artículo científico publicado en 2010

Cytosine methylation is not the major factor inducing CpG dinucleotide deficiency in bacterial genomes

artículo científico publicado en 2004

Deciphering global gene expression and regulation strategy in Escherichia coli during carbon limitation

artículo científico publicado en 2018

Decrypting the H-NS-dependent regulatory cascade of acid stress resistance in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2010

Degradation of nanoRNA is performed by multiple redundant RNases in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2009

Denaturation of UGA suppressor tRNATrp from E. coli

artículo científico publicado en 1974

Description and application of a rapid method for genomic DNA direct sequencing

artículo científico publicado en 2001

Detecting and analyzing DNA sequencing errors: toward a higher quality of the Bacillus subtilis genome sequence

artículo científico publicado en 1999

Detection of new genes in a bacterial genome using Markov models for three gene classes

artículo científico publicado en 1995

Differences in binding of oligo C to charged and uncharged tRNA

artículo científico publicado en 1970

Distinct co-evolution patterns of genes associated to DNA polymerase III DnaE and PolC.

artículo científico publicado en 2012

Does formylation of initiator tRNA act as a regulatory signal in E. coli?

scientific article published on 01 August 1973

Effect of an intramolecular cross-link on reversible denaturation in tryptophan transfer ribonucleic acid from Escherichia coli

scientific article published in 1973

Effect of mild acid pH on the functioning of bacterial membranes in Vibrio cholerae

artículo científico publicado en 2002

Effects of Site-Directed Mutagenesis of Protolytic Residues in Subunit I ofBacillus subtilis aa3-600 Quinol Oxidase. Role of Lysine 304 in Proton Translocation†

artículo científico publicado en 1999

Escherichia coli UMP-kinase, a member of the aspartokinase family, is a hexamer regulated by guanine nucleotides and UTP

artículo científico publicado en 1995

Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae adenylate cyclases: a case of phylogenetic convergence?

artículo científico publicado en 1987

Escherichia coli molecular genetic map (1000 kbp): update I.

artículo científico publicado en 1990

Escherichia coli molecular genetic map (1500 kbp): update II.

artículo científico publicado en 1991

Escherichia coli response to exogenous pyrophosphate and analogs

artículo científico publicado en 2003

Essential Bacillus subtilis genes

artículo científico publicado en 2003

Essentiality, not expressiveness, drives gene-strand bias in bacteria

artículo científico publicado en 2003

Evaluating the probability of CRISPR-based gene drive contaminating another species

scientific article published on 17 April 2020

Evidence for horizontal gene transfer in Escherichia coli speciation

artículo científico publicado en 1991

Evolutionary role of restriction/modification systems as revealed by comparative genome analysis

artículo científico publicado en 2001

Explanation of Benveniste

artículo científico publicado en 1988

Exploring the Penicillium marneffei genome

artículo científico publicado en 2003

Expression profiling in reference bacteria: dreams and reality

artículo científico publicado en 2000

Extracting biological information from DNA arrays: an unexpected link between arginine and methionine metabolism in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2001

Filling the gap between hns and adhE in Escherichia coli K12.

artículo científico publicado en 1995

Fluorescence of tryptophanyl-tRNATrp from E. coli ; An interaction between the indole and tRNA and its dependence on tRNA conformation

artículo científico publicado en 1973

Formylation of initiator tRNA methionine in procaryotic protein synthesis: in vivo polarity in lactose operon expression

artículo científico publicado en 1978

From a consortium sequence to a unified sequence: the Bacillus subtilis 168 reference genome a decade later

artículo científico publicado en 2009

From adenylate cyclase to guanylate cyclase

scientific article published on 01 June 1992

From chemical metabolism to life: the origin of the genetic coding process

artículo científico publicado en 2017

From data banks to data bases

artículo científico publicado en 1991

From dirt to industrial applications: Pseudomonas putida as a Synthetic Biology chassis for hosting harsh biochemical reactions

artículo científico publicado en 2016

From essential to persistent genes: a functional approach to constructing synthetic life.

artículo científico publicado en 2012

From function to structure take the archaeal TRAM

artículo científico publicado en 2016

From mitochondria to nuclei: regulation of split genes expression

article

From protein sequence to function

artículo científico publicado en 1999

Fructose catabolism in Xanthomonas campestris pv. campestris. Sequence of the PTS operon, characterization of the fructose-specific enzymes

artículo científico publicado en 1991

Fructose phosphotransferase system of Xanthomonas campestris pv. campestris: characterization of the fruB gene

artículo científico publicado en 1995

Functional analysis of subunits III and IV of Bacillus subtilis aa3-600 quinol oxidase by in vitro mutagenesis and gene replacement

article

Functional and evolutionary roles of long repeats in prokaryotes.

artículo científico publicado en 1999

Functional consequences of single amino acid substitutions in calmodulin-activated adenylate cyclase of Bordetella pertussis

artículo científico publicado en 1991

GadE (YhiE): a novel activator involved in the response to acid environment in Escherichia coli

article

Gene essentiality determines chromosome organisation in bacteria

artículo científico publicado en 2003

Generation of immune specificity: a working hypothesis

artículo científico publicado en 1981

Generation of mutation hotspots in ageing bacterial colonies

artículo científico publicado en 2016

Genetics of the PTS components in Escherichia coli K-12.

artículo científico publicado en 1989

Genome Diversity: A Grammar of Microbial Genomes

Genome-based analysis of virulence genes in a non-biofilm-forming Staphylococcus epidermidis strain (ATCC 12228).

artículo científico publicado en 2003

Genomes and evolution

scientific article published on 01 April 2003

Genomes are covered with ubiquitous 11 bp periodic patterns, the "class A flexible patterns".

artículo científico publicado en 2005

Genomic changes in nucleotide and dinucleotide frequencies in Pasteurella multocida cultured under high temperature

artículo científico publicado en 2002

Genomic characterization of symbiotic mycoplasmas from the stomach of deep-sea isopod bathynomus sp.

artículo científico publicado en 2016

Genomic encyclopedia of bacteria and archaea: sequencing a myriad of type strains

artículo científico publicado en 2014

Genomics of an extreme psychrophile, Psychromonas ingrahamii

artículo científico publicado en 2008

Global analysis of genomic texts: the distribution of AGCT tetranucleotides in the Escherichia coli and Bacillus subtilis genomes predicts translational frameshifting and ribosomal hopping in several genes

artículo científico publicado en 1998

Global control of cysteine metabolism by CymR in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2006

Global expression profile of Bacillus subtilis grown in the presence of sulfate or methionine

artículo científico publicado en 2002

Guanylate Cyclases

H-NS and H-NS-like proteins in Gram-negative bacteria and their multiple role in the regulation of bacterial metabolism

artículo científico publicado en 2001

Homeotopic transformation and the origin of translation

artículo científico publicado en 1989

Hon-yaku: a biology-driven Bayesian methodology for identifying translation initiation sites in prokaryotes

artículo científico publicado en 2007

How essential are nonessential genes?

artículo científico publicado en 2005

Hydrothermally generated aromatic compounds are consumed by bacteria colonizing in Atlantis II Deep of the Red Sea.

artículo científico publicado en 2011

Hypothesis, analysis and synthesis, it's all Greek to me

artículo científico publicado en 2019

Identification and isolation of a gene required for nitrate assimilation and anaerobic growth of Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 1995

Identification of Bacillus subtilis CysL, a regulator of the cysJI operon, which encodes sulfite reductase

artículo científico publicado en 2002

Identification of a common domain in calmodulin-activated eukaryotic and bacterial adenylate cyclases

artículo científico publicado en 1989

Identification of a novel nanoRNase in Bartonella

artículo científico publicado en 2012

Identification of genes and proteins involved in the pleiotropic response to arsenic stress in Caenibacter arsenoxydans, a metalloresistant beta-proteobacterium with an unsequenced genome

article

Identification of residues essential for catalysis and binding of calmodulin in Bordetella pertussis adenylate cyclase by site-directed mutagenesis

artículo científico publicado en 1989

Identification of the Escherichia coli cya gene product as authentic adenylate cyclase

article

Identification of two fructose transport and phosphorylation pathways in Xanthomonas campestris pv. campestris

artículo científico publicado en 1991

Identification of yrrU as the Methylthioadenosine Nucleosidase Gene in Bacillus subtilis

article

Identification, characterization, and regulation of a cluster of genes involved in carbapenem biosynthesis in Photorhabdus luminescens

artículo científico publicado en 2002

Imagene: an integrated computer environment for sequence annotation and analysis

artículo científico publicado en 1999

Immunity after COVID-19: protection or sensitization ?

scientific article published on 23 May 2020

Immunochemical analysis of UMP kinase from Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1999

Implication of gene distribution in the bacterial chromosome for the bacterial cell factory

artículo científico publicado en 2000

In vivo positive effects of exogenous pyrophosphate on Escherichia coli cell growth and stationary phase survival.

artículo científico publicado en 1996

Indigo: a World-Wide-Web review of genomes and gene functions

artículo científico publicado en 1998

Inert Co(III) complexes as reagents for nucleotide binding sites

artículo científico publicado en 1977

Infection of society. As diseases have evolved to exploit the holes in our defences, including weaknesses in society, we have to reconsider our way of life, otherwise they will continue to haunt us.

artículo científico publicado en 2003

Information of the chassis and information of the program in synthetic cells

artículo científico publicado en 2009

Interpretable and accurate prediction models for metagenomics data

Intrinsic fluorescence of a truncated Bordetella pertussis adenylate cyclase expressed in Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1990

Involvement of cyclic AMP and its receptor protein in the sensitivity of Escherichia coli K 12 toward serine: excretion of 2-ketobutyrate, a precursor of isoleucine

artículo científico publicado en 1979

Is a metabolic control for the doubling of the macromolecule synthesizing machinery possible ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1979

Isobiology: A Variational Principle for Exploring Synthetic Life

artículo científico publicado en 2020

Isolation and characterization of an Escherichia coli mutant affected in the regulation of adenylate cyclase

artículo científico publicado en 1981

Isolation and characterization of catalytic and calmodulin-binding domains of Bordetella pertussis adenylate cyclase

artículo científico publicado en 1991

Isolation and characterization of vicH, encoding a new pleiotropic regulator in Vibrio cholerae.

artículo científico publicado en 2000

Labeling and inhibition of myosin by 'in situ-oxidized' and presynthesized Co(III) complexes

artículo científico publicado en 1977

Labelling of biological macromolecules with covalent analogs of Magnesium. II. - Features of the chromic Cr (III) ion.

artículo científico publicado en 1975

Large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene expression by the prokaryotic nucleoid-associated protein, H-NS.

artículo científico

Les gènes du démon de Maxwell : est-il possible de construire une usine cellulaire ?

article

Life in the cold: a proteomic study of cold-repressed proteins in the antarctic bacterium pseudoalteromonas haloplanktis TAC125

artículo científico publicado en 2011

Life's demons: information and order in biology. What subcellular machines gather and process the information necessary to sustain life?

artículo científico publicado en 2011

Linking selenium biogeochemistry to the sulfur-dependent biological detoxification of arsenic

artículo científico publicado en 2012

METALGEN.DB: metabolism linked to the genome of Escherichia coli, a graphics-oriented database.

artículo científico publicado en 1993

Mapping of repetitive and non-repetitive DNA probes to chromosomes of the microsporidian Encephalitozoon cuniculi

artículo científico publicado en 1997

Mapping of sequenced genes (700 kbp) in the restriction map of the Escherichia coli chromosome

artículo científico publicado en 1990

Mapping the bacterial cell architecture into the chromosome

artículo científico publicado en 2000

Membrane integration of carbohydrate transport in bacteria

artículo científico publicado en 1987

Metabolic alterations mediated by 2-ketobutyrate in Escherichia coli K12.

artículo científico publicado en 1984

Microbial Biotechnology-2020.

artículo científico publicado en 2016

Modulation of the lactose operon mRNA turnover by inhibitors of dihydrofolate reductase

artículo científico publicado en 1978

Molecular characterization of two cya mutations, cya-854 and cyaR1.

artículo científico publicado en 1989

Molecular cloning, sequencing, and physiological characterization of the qox operon from Bacillus subtilis encoding the aa3-600 quinol oxidase

artículo científico publicado en 1992

Molecular diagnosis of human cancer type by gene expression profiles and independent component analysis

artículo científico publicado en 2005

Motivated research

artículo científico publicado en 2010

Mta, a global MerR-type regulator of the Bacillus subtilis multidrug-efflux transporters

scientific article published on 01 March 1999

MtnK, methylthioribose kinase, is a starvation-induced protein in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2001

Multiple IS insertion sequences near the replication terminus in Escherichia coli K-12.

artículo científico publicado en 1991

Multiple control of flagellum biosynthesis in Escherichia coli: role of H-NS protein and the cyclic AMP-catabolite activator protein complex in transcription of the flhDC master operon

artículo científico publicado en 1999

Multiple states in macromolecules I. Qualitative model for a single nucleation process

article

Multiple states in macromolecules II. Entropic behaviour of tRNA degraded by polynucleotide phosphorylase

artículo científico publicado en 1972

Mutational analysis of UMP kinase from Escherichia coli

artículo científico publicado en 1998

Mutational analysis of the enzyme IIIGlc of the phosphoenolpyruvate phosphotransferase system in Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1992

Mutations in bglY, the structural gene for the DNA-binding protein H1 of Escherichia coli, increase the expression of the kanamycin resistance gene carried by plasmid pGR71.

artículo científico publicado en 1992

Mutations in bglY, the structural gene for the DNA-binding protein H1, affect expression of several Escherichia coli genes

artículo científico publicado en 1990

Mutations in the Global Transcription Factor CRP/CAP: Insights from Experimental Evolution and Deep Sequencing

artículo científico publicado en 2019

Mutations in the bglY gene increase the frequency of spontaneous deletions in Escherichia coli K-12

artículo científico publicado en 1990

MvaT proteins in Pseudomonas spp.: a novel class of H-NS-like proteins

artículo científico publicado en 2003

Myopic selection of novel information drives evolution

artículo científico publicado en 2009

Natural selection and immortality

artículo científico publicado en 2008

Nature or manufacture: What should we fear most?

artículo científico publicado en 2016

Nature, artifice and emerging diseases

artículo científico publicado en 2009

No wisdom in the crowd: genome annotation in the era of big data - current status and future prospects.

artículo científico publicado en 2018

Not every truth is good. The dangers of publishing knowledge about potential bioweapons

artículo científico publicado en 2002

Nucleotide sequence database policies

artículo científico publicado en 2002

Nucleotide sequence of a tRNA(leu)CAG gene from Rhizobium meliloti

artículo científico publicado en 1987

Oligonucleotide bias in Bacillus subtilis: general trends and taxonomic comparisons

artículo científico publicado en 1998

Oligoribonuclease is a common downstream target of lithium-induced pAp accumulation in Escherichia coli and human cells

artículo científico publicado en 2006

Omnipresent Maxwell's demons orchestrate information management in living cells

artículo científico publicado en 2019

On our tiniest foes

artículo científico publicado en 2001

On proteins of the microsporidian invasive apparatus: complete sequence of a polar tube protein of Encephalitozoon cuniculi

artículo científico publicado en 1998

On the binding of tRNA to Escherichia coli RNA polymerase

artículo científico publicado en 1979

One-carbon metabolism, folate, zinc and translation

artículo científico publicado en 2020

Ongoing evolution of strand composition in bacterial genomes

artículo científico publicado en 2001

Open-Source Genomic Analysis of Shiga-Toxin–Producing E. coli O104:H4

artículo científico publicado en 2011

Organised genome dynamics in the Escherichia coli species results in highly diverse adaptive paths

artículo científico publicado en 2009

Organization of the European Bacillus subtilis genome sequencing project

scientific article published on 01 February 1995

Parallel evolution of non-homologous isofunctional enzymes in methionine biosynthesis

artículo científico publicado en 2017

Paralogous metabolism: S-alkyl-cysteine degradation in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2013

Perfect time or perfect crime?

artículo científico publicado en 2010

Permanence and Change

Persistence drives gene clustering in bacterial genomes

artículo científico publicado en 2008

Persistent biases in the amino acid composition of prokaryotic proteins

artículo científico publicado en 2006

Phylogeny of adenylyl cyclases

artículo científico publicado en 1993

Phylogeny of metabolic pathways: O-acetylserine sulphydrylase A is homologous to the tryptophan synthase beta subunit

artículo científico publicado en 1988

Pleiotropic expression of catabolic operons in the absence of the cAMP-CAP complex: the case of the maltose regulon

artículo científico publicado el 1 de enero de 1982

Pleiotropic role of quorum-sensing autoinducer 2 in Photorhabdus luminescens

artículo científico publicado en 2006

Positive regulation of the expression of the Escherichia coli pts operon. Identification of the regulatory regions

artículo científico publicado en 1992

Positive regulation of the pts operon of Escherichia coli: genetic evidence for a signal transduction mechanism

artículo científico publicado en 1991

Potent and selective inhibitors of Staphylococcus epidermidis tryptophanyl-tRNA synthetase

artículo científico publicado en 2007

Problèmes techniques de la résonance magnétique nucléaire des acides nucléiques

artículo científico publicado en 1975

Protein export in prokaryotes and eukaryotes: indications of a difference in the mechanism of exportation.

artículo científico publicado en 1986

Proteome analysis of the phenotypic variation process in Photorhabdus luminescens

artículo científico publicado en 2006

Proteomic identification of a two-component regulatory system in Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125.

artículo científico publicado en 2006

Proteomics of life at low temperatures: trigger factor is the primary chaperone in the Antarctic bacteriumPseudoalteromonas haloplanktisTAC125

artículo científico publicado en 2010

Proton magnetic relaxation studies of manganous complexes of transfer RNA and related compounds

artículo científico publicado en 1969

Proton magnetic relaxation study of the manganese-transfer-RNA complex.

artículo científico publicado en 1970

Proton magnetic resonance studies on 5′- AMP site in glycogen phosphorylase b

scientific article published on 01 May 1972

PssA is required for -amylase secretion in Antarctic Pseudoalteromonas haloplanktis

artículo científico publicado en 2009

Pyrophosphate increases the efficiency of enterobactin-dependent iron uptake in Escherichia coli

artículo científico publicado en 1999

RcsB plays a central role in H-NS-dependent regulation of motility and acid stress resistance in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2010

Re-annotation of genome microbial coding-sequences: finding new genes and inaccurately annotated genes

artículo científico publicado en 2002

Re: request from the International Advisory Committee to DDBJ/EMBL/GenBank

artículo científico publicado en 2006

Regulation of Escherichia coli adenylate cyclase activity during hexose phosphate transport

artículo científico publicado en 1996

Regulation of adenylate cyclase synthesis in Escherichia coli: nucleotide sequence of the control region.

artículo científico publicado en 1983

Regulation of bacterial motility in response to low pH in Escherichia coli: the role of H-NS protein.

artículo científico publicado en 2002

Regulation of galactose operon expression: glucose effects and role of cyclic adenosine 3',5'-monophosphate

artículo científico publicado en 1981

Regulation of the Bacillus subtilis ytmI operon, involved in sulfur metabolism

artículo científico publicado en 2005

Regulation of the early steps of 3-phenylpropionate catabolism in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2001

Regulatory features of tRNA Leu I expression in Escherichia coli K12.

artículo científico publicado en 1979

Regulatory role of UvrY in adaptation of Photorhabdus luminescens growth inside the insect

artículo científico publicado en 2008

Relationship of SARS-CoV to other pathogenic RNA viruses explored by tetranucleotide usage profiling

artículo científico publicado en 2003

Reminder to deposit DNA sequences

artículo científico publicado en 2016

Repulsion and metabolic switches in the collective behavior of bacterial colonies

scientific article published on August 2009

Request from the International Advisory Committee to DDBJ/EMBL/GenBank

artículo científico publicado en 2006

Restriction map of the cya region of the Escherichia coli K12 chromosome

scientific article published on 01 August 1981

Reversibleinactivation of phenylalanine acceptor activity of yeast tRNAphe by sodium borohydride

artículo científico publicado en 1970

Revisiting the methionine salvage pathway and its paralogues

artículo científico publicado en 2018

Rhizobium meliloti adenylate cyclase is related to eucaryotic adenylate and guanylate cyclases.

artículo científico publicado en 1990

Rhizobium meliloti adenylate cyclase: probing of a NTP-binding site common to cyclases and cation transporters

artículo científico publicado en 1993

Role of 2-ketobutyrate as an alarmone in E. coli K12: inhibition of adenylate cyclase activity mediated by the phosphoenolpyruvate: glycose phosphotransferase transport system

artículo científico publicado en 1984

Role of Escherichia coli histone-like nucleoid-structuring protein in bacterial metabolism and stress response--identification of targets by two-dimensional electrophoresis.

artículo científico publicado en 1997

Role of cyclic AMP in regulatory mechanisms in bacteria

article by Agnes Ullman & Antoine Danchin published April 1980 in Trends in Biochemical Sciences

RuBisCO-like proteins as the enolase enzyme in the methionine salvage pathway: functional and evolutionary relationships between RuBisCO-like proteins and photosynthetic RuBisCO.

artículo científico publicado en 2008

S-adenosylmethionine decarboxylase of Bacillus subtilis is closely related to archaebacterial counterparts

artículo científico publicado en 2000

S-box and T-box riboswitches and antisense RNA control a sulfur metabolic operon of Clostridium acetobutylicum

artículo científico publicado en 2008

SARS-CoV-2 variants: relevance for symptom granularity, epidemiology, immunity (herd, vaccines), virus origin and containment?

scientific article published on 04 May 2020

Saurons-nous construire une bactérie synthétique ?

Scaling up synthetic biology: Do not forget the chassis ⬇️

artículo científico publicado el 2 de enero de 2012

Selective stabilisation of developing synapses as a mechanism for the specification of neuronal networks

artículo científico publicado en 1976

Serine sensitivity of Escherichia coli K 12: partial characterization of a serine resistnat mutant that is extremely sensitive to 2-ketobutyrate

artículo científico publicado en 1980

Small noncoding RNA GcvB is a novel regulator of acid resistance in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2009

Specialized microbial databases for inductive exploration of microbial genome sequences

artículo científico publicado en 2005

Specific interaction of cobaltic complexes with myosin

artículo científico publicado en 1974

Specification of the immune response: Its suppression induced by chloramphenicol in vitro

article

Split genes

article

Spx mediates oxidative stress regulation of the methionine sulfoxide reductases operon in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2008

Structural and catalytic characteristics of Escherichia coli adenylate kinase.

artículo científico publicado en 1987

Structural and exchange properties of "Co(III)-phenanthroline-ATP": a labeling reagent for the active site of ATPases

artículo científico publicado en 1978

Structural and functional relationships between Pasteurella multocida and enterobacterial adenylate cyclases

artículo científico publicado en 1991

Structural and functional similarities between a ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCO)-like protein from Bacillus subtilis and photosynthetic RuBisCO.

artículo científico publicado en 2009

Structural and physico-chemical characteristics of Bordetella pertussis adenylate kinase, a tryptophan-containing enzyme

artículo científico publicado en 1993

Structural flexibility of the calmodulin-binding locus in Bordetella pertussis adenylate cyclase. Reconstitution of catalytically active species from fragments or inactive forms of the enzyme

artículo científico publicado en 1993

Structural homology between virulence-associated bacterial adenylate cyclases

artículo científico publicado en 1988

Structure and evolution of bacterial adenylate cyclase: comparison between Escherichia coli and Erwinia chrysanthemi.

artículo científico publicado en 1988

Structure-based discovery of inhibitors of the YycG histidine kinase: new chemical leads to combat Staphylococcus epidermidis infections

artículo científico publicado en 2006

SubtiList: a relational database for the Bacillus subtilis genome

artículo científico publicado en 1995

SubtiList: the reference database for the Bacillus subtilis genome

artículo científico publicado en 2002

Sulfur metabolism in Escherichia coli and related bacteria: facts and fiction.

artículo científico publicado en 2000

Sulfur-limitation-regulated proteins in Bacillus subtilis: a two-dimensional gel electrophoresis study

artículo científico publicado en 2001

Sulphur islands in the Escherichia coli genome: markers of the cell's architecture?

artículo científico publicado en 2000

Synthetic biology's flywheel ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 2012

Synthetic biology: discovering new worlds and new words

artículo científico publicado en 2008

Temporal evolution of master regulator Crp identifies pyrimidines as catabolite modulator factors

artículo científico publicado en 2021

Testing the hypothesis of a recombinant origin of the SARS-associated coronavirus

artículo científico publicado en 2004

The Bacillus subtilis genome from gerBC (311 degrees) to licR (334 degrees).

artículo científico publicado en 1997

The Cellular Chassis as the Basis for New Functionalities: Shortcomings and Requirements

The CymR regulator in complex with the enzyme CysK controls cysteine metabolism in Bacillus subtilis

scientific journal article

The DB case: pattern matching evidence is not significant. MicroCorrespondence

article

The DNA secondary structure of theBacillus subtilisgenome

scientific article published on 01 January 2003

The Delphic boat or what the genomic texts tell us ⬇️

artículo científico publicado el 1 de junio de 1998

The Emergence of the First Cells

The Enigmatic Genome of an Obligate Ancient Spiroplasma Symbiont in a Hadal Holothurian

artículo científico publicado en 2017

The Escherichia coli DNA-binding protein H-NS is one of the first proteins to be synthesized after a nutritional upshift

article

The European Bacillus subtilis genome sequencing project: current status and accessibility of the data from a new World Wide Web site

artículo científico publicado en 1996

The H-NS protein is involved in the biogenesis of flagella in Escherichia coli

artículo científico publicado en 1994

The H-NS protein modulates the activation of the ilvIH operon of Escherichia coli K12 by Lrp, the leucine regulatory protein.

artículo científico publicado en 1994

The HcaR regulatory protein of Photorhabdus luminescens affects the production of proteins involved in oxidative stress and toxemia

artículo científico publicado en 2007

The Importance Of Naturally Attenuated Sars-Cov-2 In The Fight Against Covid-19

scientific article published on 28 April 2020

The International Nucleotide Sequence Database Collaboration

artículo científico publicado en 2012

The PatB protein of Bacillus subtilis is a C-S-lyase.

artículo científico publicado en 2005

The PhoP-PhoQ two-component regulatory system of Photorhabdus luminescens is essential for virulence in insects

artículo científico publicado en 2004

The SARS Case Study: An Alarm Clock?

artículo de enciclopedia

The Trw type IV secretion system of Bartonella mediates host-specific adhesion to erythrocytes

artículo científico publicado en 2010

The absence of the Queuosine tRNA modification leads to pleiotropic phenotypes revealing perturbations of metal and oxidative stress homeostasis in <i>Escherichia coli</i> K12

artículo científico publicado en 2022

The adenylate cyclase catalytic domain of Streptomyces coelicolor is carboxy-terminal

artículo científico publicado en 1993

The bag or the spindle: the cell factory at the time of systems' biology

artículo científico publicado en 2004

The calmodulin-sensitive adenylate cyclase of Bordetella pertussis: cloning and expression in Escherichia coli

artículo científico publicado en 1988

The catalytic domain of Escherichia coli K-12 adenylate cyclase as revealed by deletion analysis of the cya gene

article

The complete genome sequence of the gram-positive bacterium Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 1997

The complete nucleotide sequence of the adenylate cyclase gene of Escherichia coli

artículo científico publicado en 1984

The cya locus of escherichia coli K12: Organization and gene products

article

The extant core bacterial proteome is an archive of the origin of life

artículo científico publicado en 2007

The genome sequence of the entomopathogenic bacterium Photorhabdus luminescens

artículo científico publicado en 2003

The logic of metabolism

The logic of metabolism and its fuzzy consequences

artículo científico publicado en 2013

The map of the cell is in the chromosome

artículo científico publicado en 1997

The mechanisms responsible for 2-dimensional pattern formation in bacterial macrofiber populations grown on solid surfaces: fiber joining and the creation of exclusion zones

artículo científico publicado en 2002

The metIC operon involved in methionine biosynthesis in Bacillus subtilis is controlled by transcription antitermination.

artículo científico publicado en 2002

The metNPQ operon of Bacillus subtilis encodes an ABC permease transporting methionine sulfoxide, D- and L-methionine

artículo científico publicado en 2004

The methionine salvage pathway in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2002

The ptsH, ptsI, and crr genes of the Escherichia coli phosphoenolpyruvate-dependent phosphotransferase system: a complex operon with several modes of transcription.

artículo científico publicado en 1988

The regulation of Enzyme IIA(Glc) expression controls adenylate cyclase activity in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2002

The revisited genome of Pseudomonas putida KT2440 enlightens its value as a robust metabolic chassis

artículo científico publicado en 2016

The role of H-NS in one carbon metabolism.

artículo científico publicado en 1994

The role of histidine 63 in the catalytic mechanism of Bordetella pertussis adenylate cyclase

artículo científico publicado en 1992

The secE gene of Helicobacter pylori

artículo científico publicado en 2002

The significance of split genes to developmental genetics

artículo científico publicado en 1987

The specification of the immune response revisited ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1982

The specification of the immune response: A general selective model ⬇️

artículo científico publicado el 1 de julio de 1979

The structural and functional organization of H-NS-like proteins is evolutionarily conserved in gram-negative bacteria

artículo científico publicado en 1999

The structure of the promoter and amino terminal region of the pH 2.5 acid phosphatase structural gene (appA) of E. coli: a negative control of transcription mediated by cyclic AMP.

artículo científico publicado en 1987

The ten grand challenges of synthetic life

artículo científico publicado en 2011

The two authentic methionine aminopeptidase genes are differentially expressed in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2005

The urgent need for microbiology literacy in society

artículo científico publicado en 2019

The viral transmembrane superfamily: possible divergence of Arenavirus and Filovirus glycoproteins from a common RNA virus ancestor

artículo científico publicado en 2001

Three different systems participate in L-cystine uptake in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2004

Toward an understanding of the formylation of initiator tRNA methionine in prokaryotic protein synthesis. I. In vitro studies of the 30S and 70S ribosomal-tRNA complex

artículo científico publicado en 1976

Toward an understanding of the formylation of initiator tRNA methionine in prokaryotic protein synthesis. II. A two-state model for the 70S ribosome

artículo científico publicado en 1976

Toward unrestricted use of public genomic data:

artículo científico publicado en 2019

Transcription - translation coupling and polarity : A possible role of cyclic AMP

artículo científico publicado en 1981

Transcription regulation coupling of the divergent argG and metY promoters in Escherichia coli K-12.

artículo científico publicado en 2003

Transcriptional control of polarity in Escherichia coli by cAMP

artículo científico publicado en 1984

Translation in Bacillus subtilis: roles and trends of initiation and termination, insights from a genome analysis

artículo científico publicado en 1999

Two functional domains in adenylate cyclase of Escherichia coli

scientific article published on 01 March 1983

Two-component regulatory proteins ResD-ResE are required for transcriptional activation of fnr upon oxygen limitation in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 1996

UMP kinase from the Gram-positive bacterium Bacillus subtilis is strongly dependent on GTP for optimal activity.

artículo científico publicado en 2003

Uneven distribution of GATC motifs in the Escherichia coli chromosome, its plasmids and its phages

artículo científico publicado en 1996

Unique physiological and pathogenic features of Leptospira interrogans revealed by whole-genome sequencing

artículo científico publicado en 2003

Universal biases in protein composition of model prokaryotes.

artículo científico publicado en 2005

Universal replication biases in bacteria

article

Unknown unknowns: essential genes in quest for function

artículo científico publicado en 2016

Use of a riboswitch-controlled conditional hypomorphic mutation to uncover a role for the essential csrA gene in bacterial autoaggregation.

artículo científico publicado en 2009

Using codon usage to predict genes origin: is the Escherichia coli outer membrane a patchwork of products from different genomes?

artículo científico publicado en 1997

Vectors for high conditional expression of cloned genes

article

Visualizing the proteome of Escherichia coli: an efficient and versatile method for labeling chromosomal coding DNA sequences (CDSs) with fluorescent protein genes

artículo científico publicado en 2007

Was photosynthetic RuBisCO recruited by acquisitive evolution from RuBisCO-like proteins involved in sulfur metabolism?

artículo científico publicado en 2005

Why Nature Chose Potassium

scientific article published on 28 October 2019

Why sequence genomes? The Escherichia coli imbroglio

artículo científico publicado en 1995

Yeast adenylate cyclase catalytic domain is carboxy terminal

artículo científico publicado en 1986

YtqI from Bacillus subtilis has both oligoribonuclease and pAp-phosphatase activity

artículo científico publicado en 2007

Zinc, an unexpected integrator of metabolism?

artículo científico publicado en 2020

[A biochemical mechanism for the epigenesis of the neuromuscular junction]

scientific article published on 01 February 1981

[An immunoenzyme technic for demonstrating the molecular hybridization of nucleic acids]

artículo científico publicado en 1983

[Labelling of nucleic acids by non exchangeable ions]

scientific article published on 01 November 1971

[The origin of life revisited: from metabolites to cells]

scientific article published on 01 November 2018

mRNA turnover and DNA synthesis: a lesson from bacterial genome comparisons

artículo científico publicado en 1996

tRNA structure and binding sites for cations ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1972

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