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Lista de obras de Albin Sandelin

3-methylcholanthrene induces differential recruitment of aryl hydrocarbon receptor to human promoters

A code for transcription initiation in mammalian genomes

artículo científico publicado en 2008

A conceptual framework for the identification of candidate drugs and drug targets in acute promyelocytic leukemia

artículo científico publicado en 2010

A global genomic transcriptional code associated with CNS-expressed genes

article

A new generation of JASPAR, the open-access repository for transcription factor binding site profiles

artículo científico publicado en 2006

A promoter-level mammalian expression atlas

artículo científico publicado en 2014

A unified architecture of transcriptional regulatory elements

artículo científico

Abstract 2897: Recurrent transcriptome alterations across multiple cancer types

Acute genome-wide effects of rosiglitazone on PPARγ transcriptional networks in adipocytes

artículo científico publicado en 2013

An atlas of active enhancers across human cell types and tissues

artículo científico publicado en 2014

An integrated expression atlas of miRNAs and their promoters in human and mouse.

artículo científico publicado en 2017

Analysis of the DNA methylome and transcriptome in granulopoiesis reveals timed changes and dynamic enhancer methylation

artículo científico publicado en 2014

Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNAs

artículo científico publicado en 2002

Applied bioinformatics for the identification of regulatory elements

artículo científico publicado en 2004

Arrays of ultraconserved non-coding regions span the loci of key developmental genes in vertebrate genomes

artículo científico publicado en 2004

Biogenic mechanisms and utilization of small RNAs derived from human protein-coding genes

article

CAGE-defined promoter regions of the genes implicated in Rett Syndrome.

artículo científico publicado en 2014

Cancer Cell Acid Adaptation Gene Expression Response Is Correlated to Tumor-Specific Tissue Expression Profiles and Patient Survival

artículo científico publicado en 2020

Characterization of the enhancer and promoter landscape of inflammatory bowel disease from human colon biopsies.

artículo científico publicado en 2018

ConSite: web-based prediction of regulatory elements using cross-species comparison

artículo científico publicado en 2004

Constrained binding site diversity within families of transcription factors enhances pattern discovery bioinformatics

artículo científico publicado en 2004

Corrigendum: Genome-wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution

scholarly article published in Nature Genetics

Cross species comparison of C/EBPα and PPARγ profiles in mouse and human adipocytes reveals interdependent retention of binding sites

artículo científico publicado en 2011

Cross-species ChIP-seq studies provide insights into regulatory strategies of PPARγ in adipocytes

artículo científico publicado en 2012

Deep transcriptome profiling of mammalian stem cells supports a regulatory role for retrotransposons in pluripotency maintenance

artículo científico publicado en 2014

Detection of reverse transcriptase termination sites using cDNA ligation and massive parallel sequencing

artículo científico publicado en 2013

Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements

scientific article published on 11 October 2019

Dioxin increases the interaction between aryl hydrocarbon receptor and estrogen receptor alpha at human promoters

artículo científico publicado en 2009

Discovery of regulatory elements is improved by a discriminatory approach

artículo científico publicado en 2009

Dynamic usage of transcription start sites within core promoters

artículo científico publicado en 2006

Evolutionary turnover of mammalian transcription start sites

artículo científico publicado en 2006

Exploring hepatic hormone actions using a compilation of gene expression profiles

artículo científico publicado en 2005

GMD: measuring the distance between histograms with applications on high-throughput sequencing reads

artículo científico publicado en 2012

Gateways to the FANTOM5 promoter level mammalian expression atlas

artículo científico publicado en 2015

Gene expression analysis of the emergence of epileptiform activity after focal injection of kainic acid into mouse hippocampus

artículo científico publicado en 2010

Genome-wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution

artículo científico publicado en 2006

Genome-wide detection and analysis of hippocampus core promoters using DeepCAGE.

artículo científico publicado en 2008

Genome-wide identification of estrogen receptor alpha-binding sites in mouse liver

artículo científico publicado en 2007

Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome

artículo científico publicado en 2014

Genomic and chromatin signals underlying transcription start-site selection

artículo científico publicado el 15 de septiembre de 2011

Hidden layers of human small RNAs

artículo científico publicado en 2008

Human Gene Promoters Are Intrinsically Bidirectional

artículo científico publicado en 2015

Human nonsense-mediated RNA decay initiates widely by endonucleolysis and targets snoRNA host genes

artículo científico publicado en 2014

Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project

artículo científico publicado en 2007

Identification of Gene Transcription Start Sites and Enhancers Responding to Pulmonary Carbon Nanotube Exposure in Vivo

artículo científico publicado en 2017

Identification of TNF-α-responsive promoters and enhancers in the intestinal epithelial cell model Caco-2.

artículo científico publicado en 2014

Identification of a Nuclear Exosome Decay Pathway for Processed Transcripts

artículo científico publicado en 2016

Identification of conserved regulatory elements by comparative genome analysis

artículo científico publicado en 2003

Integrated analysis of yeast regulatory sequences for biologically linked clusters of genes

artículo científico publicado en 2003

Interaction of antidepressants with the serotonin and norepinephrine transporters: mutational studies of the S1 substrate binding pocket

artículo científico publicado en 2012

IsoformSwitchAnalyzeR: Analysis of changes in genome-wide patterns of alternative splicing and its functional consequences

IsoformSwitchAnalyzeR: analysis of changes in genome-wide patterns of alternative splicing and its functional consequences

artículo científico publicado en 2019

JASPAR 2010: the greatly expanded open-access database of transcription factor binding profiles

artículo científico publicado en 2010

JASPAR 2014: an extensively expanded and updated open-access database of transcription factor binding profiles

artículo científico publicado en 2013

JASPAR 2016: a major expansion and update of the open-access database of transcription factor binding profiles

artículo científico publicado en 2016

JASPAR 2018: update of the open-access database of transcription factor binding profiles and its web framework

artículo científico publicado en 2017

JASPAR 2018: update of the open-access database of transcription factor binding profiles and its web framework

scholarly article by Aziz Khan et al published 4 January 2018 in Nucleic Acids Research

JASPAR 2022: the 9th release of the open-access database of transcription factor binding profiles

artículo científico publicado en 2021

JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles

artículo científico publicado en 2023

JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update

artículo científico publicado en 2008

JASPAR: an open-access database for eukaryotic transcription factor binding profiles

artículo científico publicado en 2004

Lactobacillus rhamnosus GG Genomic and Phenotypic Stability in an Industrial Production Process

artículo científico publicado en 2020

Mammalian RNA polymerase II core promoters: insights from genome-wide studies

artículo científico publicado en 2007

Mesenchymal-epithelial crosstalk shapes intestinal regionalisation via Wnt and Shh signalling

artículo científico publicado en 2022

Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation

artículo científico publicado en 2012

Modeling promoter grammars with evolving hidden Markov models.

artículo científico

Molecular architecture of transcription factor hotspots in early adipogenesis.

artículo científico publicado en 2014

Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements

artículo científico publicado en 2010

New histone supply regulates replication fork speed and PCNA unloading

artículo científico publicado en 2013

Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species

artículo científico publicado en 2014

On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase

artículo científico publicado en 2016

PLZF targets developmental enhancers for activation during osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells

artículo científico publicado en 2019

PROMoter uPstream Transcripts share characteristics with mRNAs and are produced upstream of all three major types of mammalian promoters

artículo científico publicado en 2011

Personalized B cell response to the <i>Lactobacillus rhamnosus GG</i> probiotic in healthy human subjects: a randomized trial

artículo científico publicado en 2020

Polyadenylation site-induced decay of upstream transcripts enforces promoter directionality.

artículo científico publicado en 2013

Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data

artículo científico publicado en 2011

Prediction of Regulatory Elements

Prediction of nuclear hormone receptor response elements

artículo científico publicado en 2004

Principles for RNA metabolism and alternative transcription initiation within closely spaced promoters

artículo científico publicado en 2016

Regulating retrotransposon activity through the use of alternative transcription start sites

artículo científico publicado en 2016

Regulation of Laminin γ2 Expression by CDX2 in Colonic Epithelial Cells Is Impaired During Active Inflammation

artículo científico publicado en 2016

Relation between NOD2 genotype and changes in innate signaling in Crohn's disease on mRNA and miRNA levels

artículo científico publicado en 2017

Remodeling of retrotransposon elements during epigenetic induction of adult visual cortical plasticity by HDAC inhibitors

artículo científico publicado en 2015

Shared activity patterns arising at genetic susceptibility loci reveal underlying genomic and cellular architecture of human disease.

artículo científico publicado en 2018

Systematic clustering of transcription start site landscapes

artículo científico publicado en 2011

Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis

artículo científico publicado en 2011

The Adipose Transcriptional Response to Insulin Is Determined by Obesity, Not Insulin Sensitivity.

artículo científico

The Landscape of Isoform Switches in Human Cancers

artículo científico publicado en 2017

The RNA exosome contributes to gene expression regulation during stem cell differentiation

article

The complexity of the mammalian transcriptome

artículo científico publicado en 2006

The frequent evolutionary birth and death of functional promoters in mouse and human

artículo científico publicado en 2015

The genome landscape of ERalpha- and ERbeta-binding DNA regions

artículo científico publicado en 2008

The transcriptional landscape of the mammalian genome

artículo científico publicado en 2005

The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line.

artículo científico publicado en 2009

Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells

artículo científico publicado en 2015

Transcriptional Dynamics During Human Adipogenesis and Its Link to Adipose Morphology and Distribution.

artículo científico publicado en 2016

Transcriptional and structural impact of TATA-initiation site spacing in mammalian core promoters

artículo científico publicado en 2006

Transcriptional profiling of the human fibrillin/LTBP gene family, key regulators of mesenchymal cell functions.

artículo científico publicado en 2013

Transcriptional regulation of gene expression clusters in motor neurons following spinal cord injury

artículo científico publicado en 2010

Transcriptome Analysis of Recurrently Deregulated Genes across Multiple Cancers Identifies New Pan-Cancer Biomarkers

artículo científico publicado en 2015

Update of the FANTOM web resource: high resolution transcriptome of diverse cell types in mammals

artículo científico publicado en 2016

spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data

artículo científico publicado en 2014

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