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Lista de obras de Stephen H Bryant

A comparison of position‐specific score matrices based on sequence and structure alignments ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 2002

A novel method for mining highly imbalanced high-throughput screening data in PubChem

artículo científico publicado en 2009

A retrospective analysis of CASP2 threading predictions

article

A structure-based method for protein sequence alignment

artículo científico publicado en 2004

An overview of the PubChem BioAssay resource

artículo científico publicado en 2010

Annotation of functional sites with the Conserved Domain Database

artículo científico publicado en 2012

Assessment of conformational ensemble sizes necessary for specific resolutions of coverage of conformational space

artículo científico publicado en 2007

Automated annotation of chemical names in the literature with tunable accuracy

artículo científico publicado en 2011

Automatic annotation of experimentally derived, evolutionarily conserved post-translational modifications onto multiple genomes

artículo científico publicado en 2011

Binary classification of aqueous solubility using support vector machines with reduction and recombination feature selection

artículo científico publicado en 2011

Biological Assembly Comparison with VAST

artículo científico publicado en 2020

CD-Search: protein domain annotations on the fly

artículo científico publicado en 2004

CDD/SPARCLE: functional classification of proteins via subfamily domain architectures

artículo científico publicado en 2016

CDD: NCBI's conserved domain database

artículo científico publicado en 2015

CDD: a Conserved Domain Database for protein classification

artículo científico publicado en 2005

CDD: a Conserved Domain Database for the functional annotation of proteins

artículo científico publicado en 2011

CDD: a conserved domain database for interactive domain family analysis

artículo científico publicado en 2007

CDD: conserved domains and protein three-dimensional structure

artículo científico publicado en 2012

CDD: specific functional annotation with the Conserved Domain Database

artículo científico publicado en 2009

Caught in self-interaction: evolutionary and functional mechanisms of protein homooligomerization

artículo científico publicado en 2011

Characterizing protein domain associations by Small-molecule ligand binding ⬇️

artículo científico publicado el 3 de diciembre de 2012

Cheminformatics analysis of the AR agonist and antagonist datasets in PubChem

artículo científico publicado en 2016

Comparison of sequence and structure alignments for protein domains.

artículo científico publicado en 2002

Computational analysis of the cathepsin B inhibitors activities through LR-MMPBSA binding affinity calculation based on docked complex

artículo científico publicado en 2009

Database resources of the National Center for Biotechnology Information

artículo científico publicado en 2012

Database resources of the National Center for Biotechnology Information

artículo científico publicado en 2011

Database resources of the National Center for Biotechnology Information

artículo científico publicado en 2010

Database resources of the National Center for Biotechnology Information

artículo científico publicado en 2007

Database resources of the National Center for Biotechnology Information

artículo científico publicado en 2005

Database resources of the National Center for Biotechnology Information

artículo científico publicado en 2006

Developing and validating predictive decision tree models from mining chemical structural fingerprints and high-throughput screening data in PubChem

artículo científico publicado en 2008

Evolution of protein binding modes in homooligomers

artículo científico publicado en 2009

Exploring functional roles of multibinding protein interfaces

artículo científico publicado en 2009

FSelector: a Ruby gem for feature selection

artículo científico publicado en 2012

Fast 3D shape screening of large chemical databases through alignment-recycling

artículo científico publicado en 2007

Finding biologically relevant protein domain interactions: conserved binding mode analysis

artículo científico publicado en 2005

Functional specificity lies within the properties and evolutionary changes of amino acids

artículo científico publicado en 2007

Functional states of homooligomers: insights from the evolution of glycosyltransferases

artículo científico publicado en 2010

High-Throughput Screening Assay Datasets from the PubChem Database

Homology Inference of Protein-Protein Interactions via Conserved Binding Sites ⬇️

artículo científico publicado el 31 de enero de 2012

IBIS (Inferred Biomolecular Interaction Server) reports, predicts and integrates multiple types of conserved interactions for proteins

artículo científico publicado en 2011

Increasing peptide identifications and decreasing search times for ETD spectra by pre-processing and calculation of parent precursor charge ⬇️

artículo científico publicado el 9 de febrero de 2012

Inferred Biomolecular Interaction Server--a web server to analyze and predict protein interacting partners and binding sites

artículo científico publicado en 2010

Knowledge-based annotation of small molecule binding sites in proteins

artículo científico publicado en 2010

Literature information in PubChem: associations between PubChem records and scientific articles

artículo científico publicado en 2016

MMDB and VAST+: tracking structural similarities between macromolecular complexes.

artículo científico publicado en 2013

MMDB: 3D structures and macromolecular interactions

artículo científico publicado en 2012

MMDB: Entrez's 3D-structure database

artículo científico publicado en 2002

MMDB: Entrez's 3D-structure database.

artículo científico publicado en 2003

MMDB: annotating protein sequences with Entrez's 3D-structure database

artículo científico publicado en 2006

Measures of threading specificity and accuracy

scholarly article by Aron Marchler-Bauer published in January 1997

Modeling the evolution of protein domain architectures using maximum parsimony

artículo científico publicado en 2006

Modulating Protein–Protein Interactions with Small Molecules: The Importance of Binding Hotspots ⬇️

artículo científico publicado el 16 de diciembre de 2011

Multi-conformation 3D QSAR study of benzenesulfonyl-pyrazol-ester compounds and their analogs as cathepsin B inhibitors ⬇️

artículo científico publicado el 7 de julio de 2011

PUG-SOAP and PUG-REST: web services for programmatic access to chemical information in PubChem

artículo científico publicado en 2015

Pharmacophore and 3D-QSAR Characterization of 6-Arylquinazolin-4-amines as Cdc2-like Kinase 4 (Clk4) and Dual Specificity Tyrosine-phosphorylation-regulated Kinase 1A (Dyrk1A) Inhibitors ⬇️

artículo científico publicado el 4 de abril de 2013

Prediction of functional sites by analysis of sequence and structure conservation

artículo científico publicado en 2004

Protein homologous cores and loops: important clues to evolutionary relationships between structurally similar proteins

artículo científico publicado en 2007

PubChem BioAssay: 2017 update

artículo científico publicado en 2017

PubChem BioAssay: A Decade's Development toward Open High-Throughput Screening Data Sharing

article

PubChem Substance and Compound databases

artículo científico publicado en 2016

PubChem applications in drug discovery: a bibliometric analysis

artículo científico publicado en 2014

PubChem as a public resource for drug discovery

artículo científico publicado en 2010

PubChem atom environments

artículo científico publicado en 2015

PubChem structure–activity relationship (SAR) clusters

artículo científico publicado en 2015

PubChem's BioAssay Database

artículo científico publicado en 2011

PubChem3D: Biologically relevant 3-D similarity

artículo científico publicado en 2011

PubChem3D: Conformer generation

artículo científico publicado en 2011

PubChem3D: Diversity of shape

artículo científico publicado en 2011

PubChem3D: Shape compatibility filtering using molecular shape quadrupoles

artículo científico publicado en 2011

PubChem3D: Similar conformers

artículo científico publicado en 2011

PubChem3D: a new resource for scientists

artículo científico publicado en 2011

PubChem3D: conformer ensemble accuracy

artículo científico publicado en 2013

QSAR models for predicting cathepsin B inhibition by small molecules--continuous and binary QSAR models to classify cathepsin B inhibition activities of small molecules

artículo científico publicado en 2010

Similar compounds versus similar conformers: complementarity between PubChem 2-D and 3-D neighboring sets

artículo científico publicado en 2016

Structure-based virtual screening for drug discovery: a problem-centric review

artículo científico publicado en 2012

Supporting precision medicine by data mining across multi-disciplines: an integrative approach for generating comprehensive linkages between single nucleotide variants (SNVs) and drug-binding sites

artículo científico publicado en 2017

Target enhanced 2D similarity search by using explicit biological activity annotations and profiles

artículo científico publicado en 2015

The NCBI BioSystems database

artículo científico publicado en 2009

The PubChem chemical structure sketcher

artículo científico publicado en 2009

Threading with explicit models for evolutionary conservation of structure and sequence

scholarly article by Anna Panchenko published in January 1999

iCn3D, a web-based 3D viewer for sharing 1D/2D/3D representations of biomolecular structures

scientific article published on 01 January 2020

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