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Lista de obras de Jennifer Harrow

A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function

artículo científico publicado en 2011

AnnoTrack - a tracking system for genome annotation ⬇️

artículo científico publicado el 5 de octubre de 2010

Assessment of transcript reconstruction methods for RNA-seq

artículo científico publicado en 2013

Combining RT-PCR-seq and RNA-seq to catalog all genic elements encoded in the human genome

artículo científico publicado en 2012

Comparative analysis of pseudogenes across three phyla

artículo científico publicado en 2014

Comparative analysis of the transcriptome across distant species

artículo científico publicado en 2014

Comparative proteomics reveals a significant bias toward alternative protein isoforms with conserved structure and function

artículo científico publicado en 2012

Comparison of GENCODE and RefSeq gene annotation and the impact of reference geneset on variant effect prediction

artículo científico publicado en 2015

Creating reference gene annotation for the mouse C57BL6/J genome assembly

artículo científico publicado en 2015

DNA sequence of human chromosome 17 and analysis of rearrangement in the human lineage

artículo científico publicado en 2006

Defining the human reference protein-coding gene set.

artículo científico publicado en 2010

Determination and validation of principal gene products.

artículo científico publicado en 2007

Devising a Consensus Framework for Validation of Novel Human Coding Loci

artículo científico publicado en 2015

Discovery of candidate disease genes in ENU-induced mouse mutants by large-scale sequencing, including a splice-site mutation in nucleoredoxin

artículo científico publicado en 2009

EGASP: the human ENCODE Genome Annotation Assessment Project

artículo científico publicado en 2006

ELIXIR Software Management Plan for Life Sciences

ELIXIR-EXCELERATE: establishing Europe's data infrastructure for the life science research of the future

artículo científico publicado en 2021

ELIXIR: Providing a Sustainable Infrastructure for Life Science Data at European Scale

artículo científico publicado en 2021

Efficient targeted transcript discovery via array-based normalization of RACE libraries

artículo científico publicado en 2008

Ensembl 2012

artículo científico publicado en 2012

Ensembl 2013

artículo científico publicado en 2013

Ensembl 2014

artículo científico publicado en 2014

Ensembl 2015

artículo científico publicado en 2015

Ensembl 2016

artículo científico publicado en 2016

Erratum: Corrigendum: The zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome

scientific article published in Nature

Evidence for transcript networks composed of chimeric RNAs in human cells

artículo científico publicado en 2012

Expert curation of the human and mouse olfactory receptor gene repertoires identifies conserved coding regions split across two exons

artículo científico publicado en 2020

Extension of human lncRNA transcripts by RACE coupled with long-read high-throughput sequencing (RACE-Seq).

artículo científico publicado en 2016

From identification to validation to gene count.

artículo científico publicado en 2010

Functional transcriptomics in the post-ENCODE era

artículo científico publicado en 2013

GENCODE pseudogenes

artículo científico publicado en 2014

GENCODE: producing a reference annotation for ENCODE

artículo científico publicado en 2006

GENCODE: the reference human genome annotation for The ENCODE Project

artículo científico publicado en 2012

Gene inactivation and its implications for annotation in the era of personal genomics

artículo científico publicado en 2011

Genome annotation for clinical genomic diagnostics: strengths and weaknesses

artículo científico publicado en 2017

Genome-wide association meta-analysis of human longevity identifies a novel locus conferring survival beyond 90 years of age.

artículo científico publicado en 2014

Genomic anatomy of the Tyrp1 (brown) deletion complex

artículo científico publicado en 2006

High-throughput annotation of full-length long noncoding RNAs with capture long-read sequencing

artículo científico publicado en 2017

Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project

artículo científico publicado en 2007

Identification and analysis of unitary pseudogenes: historic and contemporary gene losses in humans and other primates

artículo científico publicado en 2010

Identifying protein-coding genes in genomic sequences

artículo científico publicado en 2009

Improving GENCODE reference gene annotation using a high-stringency proteogenomics workflow

artículo científico publicado en 2016

MHC-linked and un-linked class I genes in the wallaby

artículo científico publicado en 2009

Measuring outcomes and impact from the BioHackathon Europe

Meeting report: a workshop on Best Practices in Genome Annotation

artículo científico publicado en 2010

Multiple evidence strands suggest that there may be as few as 19,000 human protein-coding genes

artículo científico publicado en 2014

Multiple laboratory mouse reference genomes define strain specific haplotypes and novel functional loci

Performance assessment of promoter predictions on ENCODE regions in the EGASP experiment

artículo científico publicado en 2006

Prominent use of distal 5' transcription start sites and discovery of a large number of additional exons in ENCODE regions

artículo científico publicado en 2007

Pseudogenes in the ENCODE regions: consensus annotation, analysis of transcription, and evolution

artículo científico publicado en 2007

Pseudogenes in the mouse lineage: transcriptional activity and strain-specific history

RNAcentral: A vision for an international database of RNA sequences

artículo científico publicado en 2011

RNAcentral: an international database of ncRNA sequences

artículo científico publicado en 2014

Re-annotation of 191 developmental and epileptic encephalopathy-associated genes unmasks de novo variants in SCN1A

artículo científico publicado en 2019

Shotgun proteomics aids discovery of novel protein-coding genes, alternative splicing, and "resurrected" pseudogenes in the mouse genome

artículo científico publicado en 2011

Sixteen diverse laboratory mouse reference genomes define strain-specific haplotypes and novel functional loci

scientific article published on 01 October 2018

Systematic evaluation of spliced alignment programs for RNA-seq data

artículo científico publicado en 2013

The DNA sequence and biological annotation of human chromosome

artículo científico publicado en 2006

The GENCODE pseudogene resource

artículo científico publicado en 2012

The GENCODE v7 catalog of human long noncoding RNAs: analysis of their gene structure, evolution, and expression

artículo científico publicado en 2012

The consensus coding sequence (CCDS) project: Identifying a common protein-coding gene set for the human and mouse genomes

artículo científico publicado en 2009

The implications of alternative splicing in the ENCODE protein complement

artículo científico publicado en 2007

The importance of identifying alternative splicing in vertebrate genome annotation

artículo científico publicado en 2012

The origins, evolution, and functional potential of alternative splicing in vertebrates

artículo científico publicado en 2011

The tammar wallaby major histocompatibility complex shows evidence of past genomic instability

artículo científico publicado en 2011

Towards FAIR principles for research software

article published in 2019

Tracking and coordinating an international curation effort for the CCDS Project

artículo científico publicado en 2012

Transcriptional activity and strain-specific history of mouse pseudogenes

artículo científico publicado en 2020

Transcriptome analysis of human tissues and cell lines reveals one dominant transcript per gene

artículo científico publicado en 2013

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