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Lista de obras de Andrzej Dziembowski

5' and 3' modifications controlling RNA degradation: from safeguards to executioners

scientific article published on 05 November 2018

A long noncoding RNA promotes parasite differentiation in African trypanosomes

artículo científico publicado en 2022

A new strategy for gene targeting and functional proteomics using the DT40 cell line

artículo científico publicado en 2013

A short splicing isoform of HBS1L links the cytoplasmic exosome and SKI complexes in humans

artículo científico publicado en 2017

A single subunit, Dis3, is essentially responsible for yeast exosome core activity

artículo científico publicado en 2007

Analysis of 3' and 5' ends of RNA by solid-phase S1 nuclease mapping

artículo científico publicado en 2001

Architecture and nucleic acids recognition mechanism of the THO complex, an mRNP assembly factor

artículo científico publicado en 2012

Beyond the known functions of the CCR4-NOT complex in gene expression regulatory mechanisms: New structural insights to unravel CCR4-NOT mRNA processing machinery

artículo científico publicado en 2016

Biochemical and structural bioinformatics studies of fungal CutA nucleotidyltransferases explain their unusual specificity toward CTP and increased tendency for cytidine incorporation at the 3'-terminal positions of synthesized tails

artículo científico publicado en 2017

Biochemistry and Function of RNA Exosomes

artículo científico publicado en 2012

C16orf57, a gene mutated in poikiloderma with neutropenia, encodes a putative phosphodiesterase responsible for the U6 snRNA 3' end modification

artículo científico publicado en 2012

Catalytic properties of the eukaryotic exosome

artículo científico publicado en 2011

Catalytic properties of the eukaryotic exosome.

artículo científico publicado en 2010

Characterization of the mycobacterial acyl-CoA carboxylase holo complexes reveals their functional expansion into amino acid catabolism

artículo científico publicado en 2015

Comparative analysis of deep sequenced methanogenic communities: identification of microorganisms responsible for methane production

artículo científico publicado en 2018

Comprehensive structural and substrate specificity classification of the Saccharomyces cerevisiae methyltransferome

artículo científico publicado en 2011

Controlling the mitochondrial antisense - role of the SUV3-PNPase complex and its co-factor GRSF1 in mitochondrial RNA surveillance

artículo científico publicado en 2018

Culturable bacteria from pesticides contaminated soils in Poland

artículo científico publicado en 2011

Cytoplasmic RNA decay pathways - Enzymes and mechanisms

artículo científico publicado en 2016

Cytoplasmic polyadenylation by TENT5A is required for proper bone formation

artículo científico publicado en 2021

DIS3 shapes the RNA polymerase II transcriptome in humans by degrading a variety of unwanted transcripts

artículo científico publicado en 2015

DNA Ligase C and Prim-PolC participate in base excision repair in mycobacteria

artículo científico publicado en 2017

Dedicated surveillance mechanism controls G-quadruplex forming non-coding RNAs in human mitochondria

artículo científico publicado en 2018

Dominant ELOVL1 mutation causes neurological disorder with ichthyotic keratoderma, spasticity, hypomyelination and dysmorphic features

artículo científico publicado en 2018

Draft Genome Sequence of the Type Strain Pseudomonas jessenii DSM 17150.

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequence of the Type Strain Pseudomonas umsongensis DSM 16611.

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequence of the Type Strain Sphingopyxis bauzanensis DSM 22271

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequence of the Type Strain Sphingopyxis witflariensis DSM 14551.

artículo científico publicado en 2017

Elimination of 01/A'-A0 pre-rRNA processing by-product in human cells involves cooperative action of two nuclear exosome-associated nucleases: RRP6 and DIS3.

artículo científico publicado en 2018

Endonucleolytic RNA cleavage by a eukaryotic exosome

artículo científico publicado en 2008

Exonuclease hDIS3L2 specifies an exosome-independent 3'-5' degradation pathway of human cytoplasmic mRNA

artículo científico publicado en 2013

Filaggrin inhibits generation of CD1a neolipid antigens by house dust mite-derived phospholipase

artículo científico publicado en 2016

Functions and mechanisms of RNA tailing by metazoan terminal nucleotidyltransferases

artículo científico publicado en 2020

Genetic and Biochemical Approaches for Analysis of Mitochondrial Degradosome from Saccharomyces cerevisiae

article

Genomic Analysis of γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Sphingopyxis lindanitolerans WS5A3p Strain in the Context of the Pangenome of Sphingopyxis

scientific article published on 06 September 2019

Genomic and Functional Characterization of Environmental Strains of SDS-Degrading spp., Providing a Source of New Sulfatases

artículo científico publicado en 2018

Global view on the metabolism of RNA poly(A) tails in yeast Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2021

Human mitochondrial RNA decay mediated by PNPase-hSuv3 complex takes place in distinct foci

artículo científico publicado en 2012

Human polynucleotide phosphorylase, hPNPase, is localized in mitochondria

artículo científico publicado en 2003

Identification of a novel human mitochondrial endo-/exonuclease Ddk1/c20orf72 necessary for maintenance of proper 7S DNA levels

artículo científico publicado en 2013

Identification of a novel human nuclear-encoded mitochondrial poly(A) polymerase

artículo científico publicado en 2004

Identification of protein partners in mycobacteria using a single-step affinity purification method

artículo científico publicado en 2014

Immunoglobulin expression and the humoral immune response is regulated by the non-canonical poly(A) polymerase TENT5C

artículo científico publicado en 2020

Interaction Analysis

chapter of a scientific book

Interaction profiling identifies the human nuclear exosome targeting complex

artículo científico publicado en 2011

Intrinsically disordered N-terminal domain of the Helicoverpa armigera Ultraspiracle stabilizes the dimeric form via a scorpion-like structure

artículo científico publicado en 2018

Isolation and Characterization of Pseudomonas spp. Strains That Efficiently Decompose Sodium Dodecyl Sulfate

artículo científico publicado en 2017

Landscape of functional interactions of human processive ribonucleases revealed by high-throughput siRNA screenings

artículo científico publicado en 2021

Linear mtDNA fragments and unusual mtDNA rearrangements associated with pathological deficiency of MGME1 exonuclease

artículo científico publicado en 2014

Localisation of the human hSuv3p helicase in the mitochondrial matrix and its preferential unwinding of dsDNA

artículo científico publicado en 2002

Measuring the tail: Methods for poly(A) tail profiling

artículo científico publicado en 2022

Mechanisms of RNA degradation by the eukaryotic exosome

artículo científico publicado en 2010

Mistargeted mitochondrial proteins activate a proteostatic response in the cytosol

artículo científico publicado en 2015

Mitochondrial double-stranded RNA triggers antiviral signalling in humans

artículo científico publicado en 2018

Mitochondrial protein biogenesis in the synapse is supported by local translation

scientific article published on 18 June 2020

Multiple myeloma-associated hDIS3 mutations cause perturbations in cellular RNA metabolism and suggest hDIS3 PIN domain as a potential drug target

artículo científico publicado en 2013

Novel endoribonucleases as central players in various pathways of eukaryotic RNA metabolism

artículo científico publicado en 2010

Nucleoplasmin-like domain of FKBP39 from Drosophila melanogaster forms a tetramer with partly disordered tentacle-like C-terminal segments.

artículo científico publicado en 2017

Perlman syndrome nuclease DIS3L2 controls cytoplasmic non-coding RNAs and provides surveillance pathway for maturing snRNAs

scientific article published on 18 July 2016

PlasFlow: predicting plasmid sequences in metagenomic data using genome signatures

artículo científico publicado en 2018

Probabilistic approach to predicting substrate specificity of methyltransferases

artículo científico publicado en 2014

Proteins involved in the degradation of cytoplasmic mRNA in the major eukaryotic model systems

artículo científico publicado en 2014

Proteomic analysis identifies a new complex required for nuclear pre-mRNA retention and splicing

artículo científico publicado en 2004

Proteomic and transcriptomic experiments reveal an essential role of RNA degradosome complexes in shaping the transcriptome of Mycobacterium tuberculosis.

artículo científico publicado en 2019

Pseudomonas laurylsulfatovorans sp. nov., sodium dodecyl sulfate degrading bacteria, isolated from the peaty soil of a wastewater treatment plant

artículo científico publicado en 2018

Pseudomonas silesiensis sp. nov. strain A3(T) isolated from a biological pesticide sewage treatment plant and analysis of the complete genome sequence

artículo científico publicado en 2017

Purification of Eukaryotic Exoribonucleases Following Heterologous Expression in Bacteria and Analysis of Their Biochemical Properties by In Vitro Enzymatic Assays

Quantitative proteomics revealed C6orf203/MTRES1 as a factor preventing stress-induced transcription deficiency in human mitochondria.

artículo científico publicado en 2019

RNA channelling by the archaeal exosome

artículo científico publicado en 2007

RNA channelling by the eukaryotic exosome

artículo científico publicado en 2010

RNA decay machines: the exosome

artículo científico

RNA degradation in yeast and human mitochondria

artículo científico publicado en 2004

Rbs1, a new protein implicated in RNA polymerase III biogenesis in yeast Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2015

Recent developments in the analysis of protein complexes

artículo científico publicado en 2004

Reproducible and efficient new method of RNA 3'-end labelling by CutA nucleotidyltransferase-mediated CC-tailing

artículo científico publicado en 2021

Sphingopyxis lindanitolerans sp. nov. strain WS5A3p enriched from a pesticide disposal site

artículo científico publicado en 2018

Strategies for the structural analysis of multi-protein complexes: lessons from the 3D-Repertoire project

artículo científico publicado en 2011

Structural analysis of mtEXO mitochondrial RNA degradosome reveals tight coupling of nuclease and helicase components.

artículo científico publicado en 2018

Structural and biochemical insights to the role of the CCR4-NOT complex and DDX6 ATPase in microRNA repression

artículo científico publicado en 2014

Structure and mechanism of CutA, RNA nucleotidyl transferase with an unusual preference for cytosine

artículo científico publicado en 2020

Structure of the active subunit of the yeast exosome core, Rrp44: diverse modes of substrate recruitment in the RNase II nuclease family

artículo científico publicado en 2008

Structure of the yeast Pml1 splicing factor and its integration into the RES complex

artículo científico publicado en 2009

Subunit architecture of multimeric complexes isolated directly from cells

artículo científico publicado en 2006

Systematic bioinformatics and experimental validation of yeast complexes reduces the rate of attrition during structural investigations

artículo científico publicado en 2010

TENT5 cytoplasmic noncanonical poly(A) polymerases regulate the innate immune response in animals

artículo científico publicado en 2022

Terminal nucleotidyl transferases (TENTs) in mammalian RNA metabolism

artículo científico publicado en 2018

The RNA exosome complex central channel controls both exonuclease and endonuclease Dis3 activities in vivo and in vitro

artículo científico publicado en 2013

The TUTase URT1 connects decapping activators and prevents the accumulation of excessively deadenylated mRNAs to avoid siRNA biogenesis

artículo científico publicado en 2021

The architecture of the Schizosaccharomyces pombe CCR4-NOT complex

artículo científico publicado en 2016

The eukaryotic RNA exosome: same scaffold but variable catalytic subunits

artículo científico publicado en 2011

The human core exosome interacts with differentially localized processive RNases: hDIS3 and hDIS3L

artículo científico publicado en 2010

The human nuclear exosome targeting complex is loaded onto newly synthesized RNA to direct early ribonucleolysis

artículo científico publicado en 2015

The non-canonical poly(A) polymerase FAM46C acts as an onco-suppressor in multiple myeloma

artículo científico publicado en 2017

The yeast THO complex forms a 5-subunit assembly that directly interacts with active chromatin

artículo científico

The yeast mitochondrial degradosome. Its composition, interplay between RNA helicase and RNase activities and the role in mitochondrial RNA metabolism

artículo científico publicado en 2003

The yeast nuclear gene DSS1, which codes for a putative RNase II, is necessary for the function of the mitochondrial degradosome in processing and turnover of RNA.

artículo científico publicado en 1998

Three-layered control of mRNA poly(A) tail synthesis in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>

artículo científico publicado en 2021

Two novel C-terminal frameshift mutations in the β-globin gene lead to rapid mRNA decay

artículo científico publicado en 2017

U6 RNA biogenesis and disease association ⬇️

artículo científico publicado el 14 de junio de 2013

Uridylation by TUT4/7 Restricts Retrotransposition of Human LINE-1s

artículo científico publicado en 2018

Versatile approach for functional analysis of human proteins and efficient stable cell line generation using FLP-mediated recombination system

artículo científico publicado en 2018

Yeast nuclear PET127 gene can suppress deletions of the SUV3 or DSS1 genes: an indication of a functional interaction between 3' and 5' ends of mitochondrial mRNAs.

artículo científico publicado en 1998

hUTP24 is essential for processing of the human rRNA precursor at site A1, but not at site A0

artículo científico publicado en 2015

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